Paracrocinitomix mangrovi: K6119_18705
Help
Entry
K6119_18705 CDS
T07876
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
crm
Paracrocinitomix mangrovi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
Reelin_subrepeat-B
CHU_C
PKD_4
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKN01759
LinkDB
All DBs
Position
4198915..4205118
Genome browser
AA seq
2067 aa
AA seq
DB search
MKKLSLILVAFSLIGLGQVFGQATITVGANPLTLPCGGGNVNLTALGNSSVPVFGDNFNN
GTVAPGWSATAAAQFNNPCGASVDGTTYLWMGSGTSAPREMTTAPVDVSCGGTVCFDFKF
VCEQCGDSAPCEGADLYNEGVSLQCSTNGGATWTDFAYFAPNGDVLTAYPGGVTQPSASG
NTPFTTWQNYCFTIPAGCETANTMFQLHQWGSSGSNYDHWGIDNFYVYADPCAPYYYDWD
HIPGAPDAPDVTTNITQTTTFTCCYTNGTDAACESVTVVVDVLPDAVVSLIYAPSCFGAS
DGGVTIDNPGGQGPYNVVVTGPVTASYTEGNGPPDALDIDDLPAGTYTYTTTQQNGSCTN
TGTFTIPDGPPCCEITATATDVICNGGSTGVGNSTVVDGIAPYSFQWNDGGNQTTQSASG
LSAGNYSVILTDGIGCQDTAFITVGEPTAVSGSITNSTNPLCLNSCDGTITASGSGGAGG
YTYSLNGQAFQASGNYTGLCAGNYTIVVQDAAGCQFTLAPVTLTNPTDVTLVEVSTTPAT
CGGSDGIAEVLAGGGTPPYDYDIGGASQTSPIFTGLSAGSYTVTVTDDNGCTETVNVTIV
DAAGPTLVVDSQTNVNCAGAPTGSVTLGVVGGTGPFTYSIDGVNFQASNTFTGLLPTPVV
HTFTVEDNFGCTATVDVTLSQNPPLQIISEVVTDPLCTDDCNGQLTIGVSGGQGPYTYSK
NGVIFQASNTLTGLCPGLQGYVVQDVNGCLINGDENIPNPPPLTLTPTYTEPSCHGLADG
SITFAGAGGNPAYQYSVDDGATFGFIDPVNGIAAGFYELTIMDANGCQTDDTLTVTEPAP
FTFVYVYNDPSNCGSNDGAFEITAVNGFPNYTYHIGNGVPDQVNNGNFTGLFSGLYQLIV
TDQNGCQDSTFQALSDNVMTTQTDFIQPATCFNSCDGGAIVSQINGQSPYTYEINTSTAP
PQAFGVFTNLCAGQHFITIHDNGSCIGIEEINIPQPDSILFDLAADSVSCPDGADGQITI
SNVTGGDTVNGYTYSIDGVNFQASPIFPGLTSGNYVLWVQDANGCLGSDDIDIFEPAPWD
IGILEVDVTCNGGNTGFAQVVADPNGATDPFSYDLNGTVNVSGQFPLLTAGVYPVTITDA
NNCTFDTIATINEPTPVDANLVATNPLCFGSADGTITVTASGGTPGTPAYMYSADGGTTW
SSNNVLSGLTDGCYDVVVEDDNSCTYTENICITEPAEVTLSFTFVEETCGAGNGEINMTG
AGGDGNFLYSINGGALSPSGSFLSLSAGNFILYVEDGNGCFADSAFTLTAFDQPLIDNVT
FTDPSCATFTDGDIEVFASGGLAPYGYSITGAAPFQLPSTFAGIGAGVYTVAVQDANGCI
VTSQITLTDPAVLTLNTNVTDLFCNGDNTGQLELVGGGGTLPYMYSINGGALQGGGTFSG
LAAGNYTTHVEDAQGCVVDANEVINEPAPMVFDSFVITDPTCFNDCDGQVAIQVSGGQGA
ATYTYNWSGNIAGPNDATATGVCAGTYSVYITDGNNCTLDSVDFVVNNPAQFVANGLTTT
DVLCYGGNTGTITVTLPVTGTPTYQYSINGGAPQASNVFGDVNGGTITAGNYDITIIDAD
GCEALTNTTIYQPSELYALAPSDWTSCYNEIAVVQGFVNGGEQPYTYEWTNDVNATIENT
LLFNHVVTQPITFTLVVTDDNGCVAPAVSYTITPTPPLQLDLLTTNDTTICEGDSTTLGI
SVSGGQMIDFGNYMGYSYSWDTGIPGDTLSDVTVGPMTTTTYTVTVTDLCGEVADTSITV
TVYPNPVVPYLGDFYGCEPATFDFDISADIPAGYTFNWNLGNGSSATNPVVSNASYPNAG
YYEMSLEITSDQGCVSTSASAGGVYVNEPPVPGFYFDPYSPSVLEPTVQINDYSEGGTSW
YYTFEDYGSSSQQEPEVTFNVEEETTIYVCQYVTSDDGCEASVCAPLVIHEEIIFYVPNV
VTPDGDLFNEVFYPVFTSGVDPYDYHLTIFNRWGEVVFESYDFTKGWNCHYGDGGLVQDG
VYVWQIEFGEKLTDKKQTHRGHVTVLK
NT seq
6204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaagtctaatattagttgcgttctccttaataggccttggacaggttttt
ggacaagctactatcacggttggggctaaccctcttacattgccgtgtggtggaggaaac
gtgaatcttacagcattaggaaatagttctgttcctgtgtttggagataattttaataat
ggtacggtggcacctggttggtcagctactgcggcagcacaatttaataatccttgtggt
gcttctgtagacggaactacctatttatggatggggtcaggtacttcagctcctagagag
atgacaacagctcctgtagatgtttcttgtggaggtacagtttgttttgattttaagttc
gtttgtgaacaatgtggtgactctgctccatgtgaaggtgctgacctttacaatgagggg
gtgagtttgcaatgttcaactaacggtggagctacctggacagattttgcatatttcgcg
ccaaatggagatgtattaactgcgtatccagggggtgttactcaaccttctgctagtggg
aatacgccttttactacttggcaaaattactgttttaccattcctgcaggatgtgaaacg
gcaaacacaatgttccaattgcatcaatggggttcttcagggtctaactatgaccactgg
ggaattgataacttctatgtttatgcagatccatgtgcaccttattactatgactgggat
catatcccaggagcgccggatgcaccggatgtaactactaatattactcaaacaacaact
tttacttgttgttatacaaatggtactgacgcagcatgtgagtctgttactgtagttgtt
gatgtattaccggatgcagttgtatcattgatttatgctccttcttgttttggagcttct
gatggtggtgttacaattgataatccaggaggccaaggaccttataatgttgttgtaact
ggtccggttactgcatcttatactgaaggtaatggaccaccggatgctttagatattgat
gatttacctgcaggaacatatacgtatactactacgcaacagaatgggtcttgtactaat
acaggtacattcaccatccctgatggacctccatgttgtgaaattactgcaacagcaact
gatgttatttgtaatggtggttctaccggagttggtaactctacagtggttgatggtata
gctccgtattcattccaatggaatgatggtggtaaccaaactacacaatctgctagtgga
ttatcggccggaaactactcagtaattttaactgatggtataggatgtcaagatactgct
ttcattactgttggagagcctactgctgtaagtggaagtatcactaactcaactaaccca
ctttgtttaaactcttgtgatggaacaatcacggcttctggatcaggtggtgccggaggg
tatacttatagtttaaatggtcaggcttttcaagctagtggaaactacactggattgtgt
gcaggaaattatactattgttgttcaagacgcagcaggttgtcaatttacattagcacct
gttaccttaacaaatccaactgatgttactttggttgaagtgtcaacaactccggcaact
tgtggtggttcagatggaatcgctgaagtgttagctggtggtggtactcctccttatgat
tatgatattggtggtgcttctcaaacttctccaatttttacaggtttgtcagcaggatct
tatacggttactgtgactgatgataatggatgtacagaaactgtaaacgttactattgtt
gatgcagcaggacctaccttggttgtggattctcaaacaaatgttaactgtgcaggtgca
cctaccggttcggtaactttaggagttgttggaggtacaggtccatttacttatagcatt
gatggtgtgaatttccaggctagtaatacttttacaggtttattacctactcctgttgta
catacttttacagttgaagataattttggatgtacggctacagtggacgttactttgtca
caaaatccaccattgcaaattatttctgaagtggtaactgatccactttgtacagatgat
tgtaatggtcaattaacaataggagtttctggtggtcaaggaccatatacttactctaaa
aatggtgttattttccaggcttctaatacacttacaggtttgtgccctggattacaaggg
tacgttgtacaggatgttaacggatgtttgatcaatggtgatgaaaatattccaaatcca
ccgcctttaacattgactccaacttatactgagccttcatgtcatggtttggctgacggt
tctattacttttgccggagctggaggtaatcctgcttatcaatatagtgttgatgatggc
gcaacattcggttttattgatccggttaatggtatagcagctggcttctatgaattaact
attatggatgctaatgggtgtcaaactgatgatacgctaactgttactgagccagctcca
tttacattcgtgtatgtatataatgatccttctaactgtgggtcaaatgacggtgctttt
gagattactgcagttaatggattccctaactatacttatcatattggaaatggtgtgcct
gatcaggttaacaatggtaactttacgggtctattctctggtttgtatcagttgattgtt
acggatcaaaatggatgtcaagattcaacattccaggcattgtcagataacgttatgaca
acacaaacagactttatccaaccggctacttgtttcaatagctgtgatggtggagcaatt
gtgtctcaaatcaatggacaatcaccatatacttatgaaattaacacaagtactgcacct
ccacaagcgtttggtgtatttactaatctttgtgcaggacagcactttattacaatccat
gataatggttcgtgtattggtatagaagaaataaatattccacaacctgattcaatttta
tttgatttggcagcagacagtgtttcttgtcctgatggtgcggatggtcagattaccatc
tcaaacgtgacaggaggtgatactgttaatggatatacttatagtattgatggggttaac
ttccaggcaagtccaattttccctggattgacaagtggaaactatgtactttgggtacaa
gatgctaatggatgtttaggttctgatgatattgacattttcgaaccagctccttgggat
attggtatccttgaagtggatgttacttgtaatggtggtaacaccggatttgcccaagtt
gtggctgatccaaatggtgcgacagatccgttctcttatgacttaaatggtactgtaaac
gtatctggtcagtttcctttattaactgcgggtgtttatcctgtaacgattacggatgcc
aataactgtacttttgatacaattgctactattaatgaacctactcctgtagacgcaaac
ttggtggctacaaatcctttatgtttcggttctgctgatggaaccatcactgtaacagct
tcaggtggtactcctggtactccagcttatatgtacagtgctgatggtggtacaacatgg
tcttcaaacaacgttttaagtggtttaactgatggttgctatgacgtagttgttgaagat
gataacagttgtacttatactgaaaatatatgtatcactgaacctgcagaagtaacattg
tcattcacttttgtggaagaaacatgtggagcaggtaatggtgaaattaatatgactgga
gcaggtggagatggtaacttcctttacagtataaacggtggagcactgtctccaagtgga
agtttcttaagcttgtcagctggtaactttattctttatgtagaagatggaaatggatgt
tttgcagattcagcatttactttaactgcatttgatcaaccattgattgataacgtaaca
tttactgatccttcgtgtgcaactttcactgatggagacattgaagtatttgcttctgga
ggtttagctccttatggatatagtatcacaggtgctgctcctttccaattgccttcaaca
tttgctggtattggggctggagtttatacagttgcagttcaagatgctaacggatgtatc
gttacttcacaaattactttaactgatcctgccgtattaactttaaatacaaatgtgact
gatttgttttgtaatggagataacaccggtcaacttgaattagttggtggtggtggtact
ttaccatacatgtacagtatcaatggtggtgcactacaaggtggaggtactttcagtggt
ttagctgctggtaactatactactcatgtagaagatgctcaaggatgtgttgttgatgcc
aatgaggtaatcaatgaacctgcaccaatggtatttgattcatttgtaattactgatcct
acatgtttcaatgattgtgatggacaggttgccattcaagtttctggtggacaaggtgca
gcaacatatacgtacaactggtcaggaaacatagctggtccaaatgatgcaacagcaaca
ggtgtttgtgctggaacttactcagtatatattactgatggtaacaactgtactttagac
tctgttgactttgttgtaaacaatccagctcaatttgtagccaatggtttaactacaact
gatgttctttgctacggtggtaatacaggtacaataactgtaactcttccagtaactgga
acaccaacttatcaatatagtattaatggtggtgcacctcaagcatccaatgtatttggt
gatgtaaatggaggtactatcactgcaggtaactatgatattacaattattgatgctgac
ggttgtgaagctttaacaaacacaactatttatcagccatctgagttgtatgcattagct
ccttctgattggacttcatgttacaatgaaattgcagttgttcaaggatttgtaaatgga
ggtgaacaaccttatacttacgaatggacaaatgatgttaatgctacaattgaaaataca
ttattgttcaatcatgtggtaacacaaccaattacatttacacttgttgtaactgatgat
aatggatgtgtggcaccggcagtatcttatacaattactccgacaccacctcttcagtta
gatttgttaactactaatgatacaacaatttgtgaaggagattcaactactctaggaatt
tcggtttcaggtggtcaaatgattgactttggtaactatatgggatactcttattcatgg
gatacaggtataccaggagatacattatctgatgtaactgttggaccaatgacaactacc
acttatactgtaactgttacagatttatgtggagaagttgctgatacatcaattacggtt
actgtttatcctaatccagtagttccatatttaggagacttctatggatgtgaacctgca
acatttgattttgatatttctgcagacattccagctggttacacatttaactggaattta
ggaaatggaagtagtgcaacgaatcctgtagtttctaatgcgtcttatccaaatgctgga
tactatgaaatgtcattagaaattacctcagatcaaggttgtgtatcaacttcggcttct
gctggtggagtttatgtaaatgagccaccggtaccaggattctattttgatccttatagt
ccttctgtattagagcctactgttcaaatcaatgattactcagaaggtggaaccagctgg
tactatacatttgaagattacggatcttcatctcaacaagagcctgaagtaactttcaat
gttgaagaagaaacgacaatttatgtttgtcaatacgttacttctgatgatggatgtgag
gcaagtgtatgtgcaccattggttattcacgaagaaattattttctatgtgccaaatgtt
gttacaccggatggagatttatttaacgaagtattctatccagtatttacatcaggagtt
gatccatacgattatcacttaacaatcttcaatagatggggtgaagttgtatttgaatct
tatgactttaccaaaggatggaattgtcactatggtgatggcggattagttcaggatgga
gtttatgtgtggcaaattgaatttggagaaaagcttaccgataaaaaacagacccaccga
ggtcacgtaacggtacttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
