Chitinophaga sancti: SIO70_15865
Help
Entry
SIO70_15865 CDS
T09582
Name
(GenBank) alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain-containing protein
Organism
csac
Chitinophaga sancti
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Melibiase_2
Melibiase_C
Alpha-L-AF_C
3keto-disac_hyd
CBM_4_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPQ66335
LinkDB
All DBs
Position
complement(3850466..3855061)
Genome browser
AA seq
1531 aa
AA seq
DB search
MKHLLNRQAYLNCNIQRYLTPVLIILFPLISSVAFAQHPGAVVLSAAKFKTGDTAVWASS
SFDDRSWGTIVPGKVWQEQGYPDYHGYAWYRFHVRLHKSGHWKDSLRIFLAHVNDVDATY
LNGVLIGKTGTTPEDKGGYVSKWPNVRSYHLAADHPAIKWDKENVIAVRVYDGGGTGGIF
MGQPFVDMLEKVDGINVSLGKIKNNYGLRIEGTFSYSVLDEGREIKHAAIPTSLAPLEEK
TFPVDAPQKDGIVFKYTFKESGTNLTTQGQIKVPYMQTPPPGAFPRINNALVLGARPGHP
ILFRIAATGATPLTYKVTGLPSGLSQEGAIIKGSIAGVGHYPIQIQVSNSHGTTSKTILV
KVDSLLQLTPPMGWNSWNCWGLSVSEDKVKSAAQALIDKGLADHGWSYINIDDGWQAATR
NTDGSLSPNEKFGDMKGLGDWLHNQGLKFGIYSSPGPLTCGGYLGSYQHELADANAYDAW
GVDYLKYDWCSYVQTDTSQAAYIYPFKIMQQALASQNRDIVYNLCQYGMKRVWEWGPSVG
AQSWRTTEDIDDTWESLYNIGFSQGPLASYAGPGKWNDPDMMIVGQVGWGESLHPSRLTP
DEQYTHVSLWSLLSAPLLIGCDIRKLDSFTLNLLTNDEVIAIDQDTLGKQAIRVKVNIWV
KELSDGSKAIGIFNLDTVYRDITLSFKDVGLPSKVLLHNVWRQRDERFCTDSFHTRIPPH
GVKLLKAIPVIQSTIEIKSVRSKDTIPSTLHGIFFEEISHAGEGGLYAEMIQNRGFEESR
IPAGTKLVNGMLEAPPTAWKMEWPYKNDWPAWSVKRDSHDDKLVSGTDSKLISPNVSLTV
DHPLSAATPHSLKLQGPATLINEGFWGIAVKAGESYQLSFYLRGYKGTVTAGISSHDHII
ASHQFDIAANDDWQKYECVLVPDSTVDKAKFVLNFGSKGTAYVDFVSLFPINTFHNRPNG
LRNDIATLIDSLHPSFVRWPGGCFVEGITIESAPNWKNTIGKLENRPGTFSPWGYWSSDG
FGYHEYLQFCEDIHADALFVFNAGTSCEYRSGTSVPDSLLQPYIQDALDAIEYATGPVTS
KWGALRASNGHPAPFPLKYVEVGNEQHGPVYAKRYNRFYDAIHAKYPNITILASMGIGDV
NRHTLDSMQHVQRVDEHAYKDAYWSMRNFDHFDKYKRGDWDMYVGEYATNAGVGTGNMQA
AISDAIYVLSMEKNADLVKMSSYAPLLVNENDVDWPVNLIHFDAANSYARISYYAIKLLA
DNKADFNLPTSVTVAADNDAPLYSGGIGAGTWDTEAEFKDIKVNGQAFELSEWSFPRGTW
KVTDSSIAQTAEGAQQLAVLKNHAFDSYTLTLKARKTGGVNAFMIPFAVLDSNTYLRAHI
GSWWNSHCVFESVTNGYDVAGISDQKKMTPLETGRWYDVKLDVGKDTVKCFLNDTLIMQY
IPPQKFYSIAGKAKNGDVIVKAVNGYASSVMADIKLETAGKHVLLISSLSAPANAENSME
APLEYVPETVVGDSLRVVLKPNSVNVIRILH
NT seq
4596 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagcatcttcttaacaggcaggcttacttaaattgcaatatccaacgatatctgaca
cctgttctgatcatccttttcccacttatttcttctgttgcttttgcacagcatcccgga
gcagtggtattgtctgctgcaaaatttaaaaccggtgatactgctgtatgggcttcttcg
tcgtttgatgatcgttcatgggggactattgtcccaggtaaggtttggcaggaacaaggc
tatcctgattaccatggatatgcgtggtaccggtttcatgttcggttacacaagagcggg
cattggaaagacagcttacggatatttcttgcgcatgtgaatgatgtggatgctacgtat
ttgaatggtgtattaattggtaaaacaggcactacgccggaggataaaggtgggtatgta
agtaaatggccgaatgtgcggtcgtatcacttagcggctgatcatccggctatcaaatgg
gataaggagaatgtgatagcggtgcgggtgtatgatggcggtggcacaggaggaatattt
atgggacagccgtttgtagatatgttggagaaggtggatgggatcaatgtaagtttgggt
aagataaagaataactatggcctgcgaatagaagggacatttagttattcagttttagat
gagggccgggagatcaaacatgctgctattccaacaagtcttgctcccctcgaagaaaaa
accttcccagttgatgcacctcagaaagatggcattgtatttaaatacacattcaaagaa
tcgggcacaaatctaaccacgcaaggacagataaaagtcccttacatgcaaacaccgccg
ccaggtgcattcccgagaattaataatgcgttagtattaggtgcacgtccgggtcatcct
atattattccgtatcgcagctacaggcgccacacctttaacttataaagtaacaggatta
ccctccggtctttcgcaggaaggcgccatcataaaaggatccattgctggtgttggccac
taccctattcaaatacaggtatccaattcccatggcactacttcaaaaaccatcctggta
aaagtcgattctcttttacaactcacacctcccatgggctggaatagctggaactgctgg
ggcctgagcgtaagcgaagacaaagtaaaaagcgctgcacaggcattgattgacaaaggc
ctcgcagatcatggctggtcttatatcaacattgacgatggctggcaggcagcaacacgt
aatacagatgggagtctatcacccaatgaaaagtttggagatatgaaaggactcggtgac
tggctacacaatcaaggcttgaaattcggtatctactcctcccccggcccactgacctgt
ggtggttatctgggttcatatcaacatgaattagccgatgcaaatgcctatgatgcatgg
ggagtcgattatttaaaatatgactggtgtagttatgtacaaacagatacgtcgcaggca
gcttatatctatccgttcaaaatcatgcaacaggcattggcgtcgcaaaacagggatatt
gtgtacaatctctgccaatacggaatgaaacgtgtatgggaatggggaccttcagtaggt
gcacaaagctggcgtacgacagaagatatcgatgatacatgggagagcttatataatatc
gggtttagccagggaccactggcatcgtatgcaggaccaggtaaatggaatgatccggat
atgatgatcgtaggtcaggtaggttggggagaaagcctacatccatccagactaacacct
gatgagcaatatacccatgtaagtttgtggagtttgttatccgcaccgttgttgattggt
tgtgatattcgcaaactggatagctttacgttgaatttattgacgaatgatgaagtgatt
gccatagatcaggatacattagggaagcaggcgatacgggtgaaagttaatatatgggtg
aaggaattatctgatggtagcaaagcaattggaatatttaatttggataccgtatatcgt
gatatcaccttatcatttaaagatgtaggactgccatcaaaagtattattacataatgta
tggagacagcgtgatgaaagattttgcacagatagctttcatactagaataccaccgcat
ggggtaaaattgctaaaagccattcctgttatacaaagtacaattgagattaaaagtgta
cgctctaaagatacgatcccgtctaccttacatggcatcttttttgaggaaatcagtcat
gcaggagaagggggattatatgcagaaatgattcagaacaggggatttgaagagagtcgg
ataccagcggggactaaactggtaaatggcatgttggaagcgccgcctacagcatggaaa
atggaatggccgtataagaatgactggccggcgtggtctgtgaaaagggatagtcatgac
gacaagttagtatccgggactgattcaaaattaatttcacccaatgtttccctgactgta
gatcaccctttatcagctgctacaccacactcattaaaactacaaggccctgccacctta
atcaatgaaggcttttggggtatcgctgtaaaagctggtgaaagctatcaactatcattc
tatttaagagggtataaaggtactgtcacagcgggtatatcatcccacgatcatattatc
gcttcacatcaatttgatattgctgctaatgatgactggcaaaaatacgaatgtgtactt
gtgcctgacagcactgttgacaaagcaaaatttgttttaaactttggctcgaaaggcacc
gcatatgtagatttcgtgtcgctattccctatcaacacctttcacaacagacctaatggt
ttacgcaatgatattgctaccctcatcgacagtctgcatccatcctttgtaagatggccg
gggggctgcttcgtagaaggcatcaccatcgaaagtgcgcctaactggaaaaacaccatc
ggtaaattagaaaatcgccctggtacatttagtccctggggatattggagcagtgatgga
tttggttaccatgaatacctgcaattctgtgaagatatccatgcagatgcattgtttgtg
ttcaacgcaggtacatcctgcgaataccgtagcggcacatcagtaccagattcattatta
caaccctacatccaggatgcactggatgcaatagaatatgccaccggcccggttacttcc
aaatggggagcattaagggcttccaacgggcaccccgctccttttccattgaaatatgta
gaagtgggcaatgaacaacatggccctgtttatgcaaagcgatataatcgtttttatgat
gccatacatgcaaagtatccaaacattaccattttagccagcatgggcattggtgatgta
aacaggcataccttagacagtatgcaacatgtacaacgggtagatgaacatgcttacaaa
gatgcttattggagtatgcggaatttcgatcactttgataaatacaaacgtggtgactgg
gatatgtacgtaggcgaatacgctactaatgcaggcgtaggcacaggtaatatgcaggca
gcgataagtgatgcgatttatgtactcagcatggagaagaatgcagacctggtaaaaatg
tcatcctacgctccgttattagtaaatgaaaacgatgtagactggccggtaaacctgatc
cattttgatgcagcgaatagttatgcgcgtatttcttattatgctattaaattactcgca
gataataaagcggatttcaatttacctacctcagttactgttgctgctgataatgacgcc
ccactttattcaggaggtattggtgcaggcacctgggatacagaagctgaattcaaagat
atcaaagtaaatggtcaggcatttgagctttcagaatggtcattcccaagaggcacctgg
aaagttactgattcttctattgcgcaaactgcggaaggtgctcagcaactggcagtatta
aaaaaccacgctttcgatagttacacattaacactgaaggcacgcaaaacaggtggggtc
aatgcgttcatgatcccgtttgcagtattggatagtaatacttatttacgggcacatatt
ggttcctggtggaatagtcattgtgtatttgaaagtgttacgaatgggtatgatgtggct
ggtatttcagatcaaaagaaaatgactcctttggaaaccgggcgttggtatgatgtaaaa
ttggacgtgggcaaggatacggtgaagtgctttttaaatgatacattgattatgcaatat
atcccgccgcagaaattctatagtatagcggggaaggcgaagaatggggatgttattgta
aaagcggtaaatgggtatgcttcatcagtaatggcggatattaaactggaaacagcgggg
aagcatgttttattaattagttccttatcggctcctgcgaatgcggagaatagtatggaa
gcgccgttggaatatgtaccggagacggtggtgggagattctttgcgagtggtattaaag
ccgaattcggtgaatgtaatcaggatattacattag
DBGET
integrated database retrieval system
