Ceratosolen solmsi marchali (fig wasp): 105364612
Help
Entry
105364612 CDS
T06056
Name
(RefSeq) protein NRDE2 homolog
KO
K26109
nuclear exosome regulator NRDE2
Organism
csol
Ceratosolen solmsi marchali (fig wasp)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
csol03019
]
105364612
Messenger RNA biogenesis [BR:
csol03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Other 3'-5' decay factors
105364612
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NRDE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105364612
NCBI-ProteinID:
XP_011500893
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
784 aa
AA seq
DB search
MDELKDEQKVLIQKFNKRITECPKDINAWLEYVQFQDQVIESCSFYKQKNIKEIITQKKL
TIIEKALAINYDSVELLNLKLQLLSMSIPADQFLNKIEEMIKHDKKNIILWEALIKLTQT
SCVLCKVSKVLDSYVKYFSVLKQKCKTSPKFYDEQIFNLLYQCLIFLRHVGLWEQMWEIL
KINLHLNLEIDREKLKNINTIDEKLIMDMEELILNSKLPLNQLWLRIELLRERCFWTSVD
INQVNVNLIGDEKRLVSADEITNFIYPTITIESNFRLVIFTLLCLKVPLLPSRHCTFKDF
KLEKDCWTIDSLECILPMIYSTVWIGAVDKYLSNKFMLTSLFEGELTSGPQFIKYHPAQE
LYLDFIRLIFSTISQKLPIIQRTSILIWWLRFERLLIFITKDEPLKEESKNKKAKSIIKN
FLKKPENRNNLHFYREFALFEYELGSFDNCIYMLRKIIQSQDIKFLDNEEKAALLSLYRT
SFEILLDLSTYKNSNLEIFNEMTESLKNFICVCFNYNQNMTVEEILYEEIIKFLTNSVAD
ESEDTFLLPNLHCDLLICYSYILYSKNRIDTNSIFELFNRCLTHCNKCFRLQERFYETKV
AFLQFLQHTVQKVENVLINTLNEALEKYPSNLFLLSLNASIESKLPYWKLKTSNKRYNIW
SILANCLAGRARIIHLNNIGLEQSSNAMINKMLSFHKTLSITEEVQNCPLVWRFYMLLLR
EHDLSKNKGEEIYFQAVTQCPWSRSVYISAAEIAPQILSQIQDLIQEKELRIHVTPDELD
ILRG
NT seq
2355 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaactcaaagatgagcaaaaagtattaattcaaaaatttaataaaagaattact
gaatgtcctaaagatattaatgcatggcttgaatatgtacaatttcaagatcaggttata
gaatcgtgttcattttataagcaaaagaatattaaagaaatcataactcaaaagaaatta
accattattgaaaaagctttagcaattaattatgattctgtagaacttttaaatttgaaa
ttacaattgctatcaatgtcaataccggctgatcaatttttaaataaaattgaggaaatg
attaagcatgataaaaaaaatattattttatgggaagctttgataaaattaactcaaact
tcttgtgtgctgtgtaaagtatcaaaagtattagattcgtatgtaaaatacttttcagtt
ttaaaacaaaagtgtaaaacaagtcctaagttttatgatgaacaaatttttaatttatta
tatcaatgtctaatatttttgcgtcatgttggactttgggaacaaatgtgggaaatttta
aaaattaatctacatttgaatcttgaaatagatcgtgaaaaacttaaaaatataaataca
atcgatgaaaaactaattatggatatggaagaattaattttaaattctaaacttccattg
aatcaattatggttacgtatagagttattacgtgaaaggtgtttttggacaagtgttgat
attaatcaagttaatgttaatcttattggagatgaaaaacgattagtatcggctgatgaa
ataactaattttatttatccaacaattacaattgaatcaaattttcgtttggtaattttc
actcttctttgtcttaaagttccattacttccaagtcgtcactgtactttcaaagatttt
aaactggaaaaagattgctggacaatagattccttagaatgtatattacccatgatatat
tcaacagtatggataggtgcggtagataaatatttaagtaacaaatttatgttaacatca
ttatttgaaggggaactaacatctggaccacaatttataaaataccatcctgctcaagaa
ttatatttagattttataagattaatatttagtaccatttctcaaaaattaccaataatt
caaagaactagtattcttatttggtggttaagattcgaaagattattaatttttattacc
aaagatgagcctttgaaagaagaaagcaagaataaaaaagccaagtccattataaaaaat
tttttaaaaaaaccagagaacagaaacaatttgcatttttacagggaatttgctttattt
gagtatgaacttggttcttttgataattgcatttacatgttaagaaaaattattcaatcc
caagatattaaatttttagataatgaagaaaaagcagcgcttcttagtctgtatagaacg
tcttttgaaattttattagatttaagcacttataaaaattcaaatctagaaatctttaac
gaaatgactgaaagtttaaaaaattttatttgtgtatgtttcaactataatcagaatatg
acagtagaagaaatattatatgaagaaattattaaatttttaactaattcagttgcagat
gaatctgaagatacatttttgttaccaaatttacattgtgatttattaatttgttatagt
tacatattatatagtaaaaatagaattgatacaaattctatttttgaattatttaataga
tgtttaacacattgtaataaatgttttcgattgcaagaaagattttatgagactaaagtg
gcatttttacaatttttacaacatacagttcaaaaagttgaaaatgtattaattaacact
cttaatgaagctcttgaaaaatatcccagtaatttattccttctatcattaaatgcttct
atagaaagtaaactaccatattggaaattgaaaacaagtaataaaagatataatatatgg
tcaattttagcaaattgtttggctggaagagctcgtattattcatctaaataatattgga
cttgaacaatcttctaatgcaatgattaataaaatgctttcatttcataaaacattatca
ataacagaagaagtacaaaattgccctttggtctggagattttatatgttattacttcga
gagcatgatttatcaaaaaacaaaggagaagagatttattttcaggctgttactcagtgt
ccatggtcgagaagtgtatatataagtgcagctgaaattgcacctcaaattttatcacaa
attcaagatttaattcaggaaaaagaattaagaatacatgttacaccagatgagttagat
atattaagaggataa
DBGET
integrated database retrieval system