Clostridium scatologenes: CSCA_2249
Help
Entry
CSCA_2249 CDS
T03803
Name
(GenBank) leucine-rich repeat protein
KO
K13730
internalin A
Organism
csq
Clostridium scatologenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_6
LRR_9
LRR_1
Big_5
Tsi6
Peptidase_A4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA69374
UniProt:
A0A0E3JYY3
LinkDB
All DBs
Position
complement(2442601..2444631)
Genome browser
AA seq
676 aa
AA seq
DB search
MKNKFIIGILFSILLLCSSNVKAVNFIDNQTVDANKTWTIKFNYEIQLDDLTRQDIFVID
ERGDTVDVSLKLGQDGKSIMVAAPEYGYGGGKSYTLHVANKVHSINGKTLNDGCCLNFNV
KRKPNSGGIVSFKDKNLEQEIRDEIEKPNGDIYQSDVDYITELYMWNGQIKDLSGIENLT
NLKQLNLRESEINDINQLKNLVNLQSIDLSHNEISDISSLKNLTNLKKLNLGNNKVRDIS
VLSKLTNLQELNLGYVSYHDFETPDPEANYNEISDIGALKNLTNLQTLNLGYTKINDLND
LKGLSNLQTLDLSGNQISDISSIVNVLKEVTSLNDLNLSTNEISNIDELNKLTSLKMLKL
NSNKISNINGLKGLSNLQTLDLSSNQISDTANTLKELNNLKDLNLSNNQISNIGEFNKLT
NLKTLNLYYNKISDISTLKGLTNLRAIDLSYNEISDVSVFKNLANLQELILLSNPISDAD
IQALKNALPQCHINEIPVKKPNIYLYPEKTEELSVQVTPKGRITKSIPEYNGGWKVTVDP
SGKIDNTYNFLFYEALINYKFTLDKGWIVNKSSFNEEMNSILTSIGLNSREKSDFIEYWS
KELNWKSSRYAVYYLDPKEINEAIKLNLSKEPDSILRAYFYFVPIKDNENLQIKKPEIKQ
FKRNGFTVVEWGGIGK
NT seq
2031 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaatttataattggaatactttttagtattttattactatgttcatctaat
gttaaagcagtaaactttatagataatcaaacggtagatgctaataagacatggacaatt
aagtttaattatgaaattcaattggatgatttaactagacaagatatattcgtaattgat
gaaagaggtgatacagtagatgttagtctaaaattaggacaagatggcaaatctattatg
gtagcagctccagagtatggatatggaggaggaaaaagttacacattacatgttgcaaac
aaagtacattctattaatggcaagacattaaatgatggttgctgtttaaattttaatgtt
aaaagaaagcctaatagtggcggtatagtatctttcaaggataaaaatttagagcaggaa
ataagagatgaaatagaaaagccaaatggggatatttatcaaagtgatgttgattatata
actgaactatatatgtggaacggacaaataaaagatcttagcggaatagaaaatttaact
aatttgaaacagcttaatttacgtgaaagtgaaattaatgatataaatcaattaaaaaac
ttggttaatttgcaatctattgatttaagtcacaatgaaataagtgatataagttcatta
aagaatttgactaatttgaaaaagcttaatttaggtaataataaagtaagagatataagt
gtactaagtaaattaactaatttacaggaacttaatttaggttatgtgtcatatcatgat
tttgaaacacctgatccagaagcaaattataatgaaataagtgatataggtgcattgaaa
aatttaacaaacttgcaaacacttaatttaggctatactaaaataaatgatttaaatgat
ttaaaaggattgagcaatttgcaaacgcttgatttaagcggtaaccaaataagtgatata
agcagcatagtaaatgtattaaaggaagtaactagtttaaatgaccttaatttatctact
aatgaaattagtaatatagatgaattgaataaattaactagtttaaaaatgcttaagcta
aatagcaataaaatcagtaatataaatggattaaaaggattaagtaatttacaaacactt
gatttaagcagtaatcaaataagtgatacagcaaatacattaaaagaattgaataattta
aaggatcttaatttatctaataatcaaattagcaatataggtgaatttaataaattgacg
aatttaaaaacacttaatttatattataataaaataagcgatataagtacattaaaggga
ttgactaatttaagagcgattgatttaagttacaatgaaataagtgatgtaagtgtattt
aaaaatttagctaacttacaagagcttattttgcttagtaatccaataagtgatgcggat
atacaagctttaaaaaatgctctacctcagtgtcatattaatgagattccagtgaaaaaa
cctaatatatatttgtatccagaaaaaacagaagaattatcagtacaagttactcctaag
gggaggataactaaatcaattccagaatataatggaggatggaaggtaacagttgaccca
agtggaaagattgataatacttataatttcttattctatgaagctttaattaattataaa
tttactttggataagggatggattgtaaataagagtagttttaatgaagaaatgaatagt
atattgacttcaataggtttaaattcaagggagaaatcagactttattgaatactggtca
aaagaattaaactggaaaagcagtaggtatgcggtttattaccttgatcctaaagaaata
aatgaagcaataaagttaaatttatctaaagaaccagattcaattttaagagcttatttt
tactttgtacctattaaggataatgagaatttacaaattaaaaagcctgaaataaaacaa
tttaagcgtaatggatttactgttgtagagtggggcggaattggtaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
