Clostridium taeniosporum: BGI42_03610
Help
Entry
BGI42_03610 CDS
T04957
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
ctae
Clostridium taeniosporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
TPR_12
TPR_2
GAF_2
TPR_1
TPR_19
MIT
TPR_5
AAA_22
TPR_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR24899
UniProt:
A0A1D7XP23
LinkDB
All DBs
Position
747979..753165
Genome browser
AA seq
1728 aa
AA seq
DB search
MFNNKTYSLYIFQDNVEYENCREYLLSKFKTLRNLNFKNLVNILDIEIIRNIDGVNLDKL
NYGYVTEYIESLIDTQNYFNESSFNKKLDIFMQLCAAVNTLNIKGYIFNELNIKDINIIL
DNKGKPLLKIKNLLQYEISKLRANNLLDVQSLPYPYNIEKLDCEISQKDNIKDILSLFKY
MFNEKELNIYFKENNCIDNILSFNRVHKITDFIKWINKRLRTNYNIFVFEALDKVTTDLD
IIGMEEEIKKVELRLKYIYENKLKYKIICFKGEQGNGKTKTLIEIKNKILRKYVGNNGEN
GFLIIDNLDENNSFMFIIEKILSRLDKYLKDKYELYLKKFILMILDKNVVINEEVFKIIN
RVCALLHEYTLNNVLIILIDDIEKTSEIFKVFFKYMCFLRKKLENVMVIISTNEENFDSN
MINYMKSIKELINYEEVSINYFNNYNTSKMVKNMLNYHKSIDELSMKIYSETLGKPGFIS
KTIEGLYKEGIIYLCKDDGKWKSKININDIVIPKVVKKILENKMLNLNSEELEVLERLSI
FQTPLSETLIFSYVILDKKRKDRYYKLKKDRFLIEKISDDGVRVDFYNDLIKKIIYSKIP
KEKSLTMHNDACYFLECILKNTQEYLDEFLNQLEKSNQRDKLVEYSLKCGKNFDQIGDTF
KAIDYYKKALNYSKDSKKTRIAISIAKLNEKVGKDKEAYNYFNKANIYSVNNNQKELQIY
ALLRMIIITSKEYRAIDLTFPLEVVRKLLRNITYPKGEAYYYYALASVVKVKEKKELSVK
YIEEVFKICEVNNIKVGVYACAKLLLSNIYISRGKYDKARKLLTESMSVFEIENNYSGIL
TTKINFEIINKEVGENISNILCNITHIKRLCNKYKVYKKEVTSLIYIAKCNIEIFEYKKA
AKNLLLALEVARENGLDRYILKICTLLCLVYCREGKIKLASDYYQLILQLKDGIQVSGLD
MLTLKSAQALYNSIIYNFKTAFKELSVVNDIGNDYKGSEFSKIKSQYYQLCIINCKNEGD
VKYNFKLLKEELVNLKNSIIKESMIIGSITSILLLGYKELSRELFSDIKECPKYYDNQLA
YIFLQIYFSKDDECENLINSALNIIRFAKNKQIKGIVYCSIAEKYEFKGDFELAINYYYE
SINIFINILNSLPEKEKLQYANNSMFLFAYDKFRKILVENIGIKLNLDKVEYINSNIKIS
DLLGKLKINKLILNEEFFNIMQNNYSNNYFNFKKNIHEILNGFSSDILKNLDELLKYTAR
LTLADKALLTVENNFGENRVICKYRIRNDDEIKKYIALKINSNKDIITICNDYDNNSRIN
YEIIKDGIKAVMYIKFGNKRKFINNNECINGKLILISNNSINNINSNSEITVKKLVPFII
FLLDQYNLMITSTLDKLTGAYNRKYLEKVFDNLINDSYSKEKEFSLIIFDIDDFKGVNDR
YGHQTGDEVLIKLTEEVKNSLCKDEIFVRYGGEEFIILLPEKNQKEAYMLAERIRNRIEK
AKILGNKRTVTISLGISVYMKHSSNSEELIKMADQALYTSKAQGKNRTTIWNENIDVLNN
NLNTSKRMLLSRYNKDNNLILLIKDIIELLSNKNSKEDKLYKFLSKIIQITDSEFATAFI
IENNKITNIYSKKIQEDNAYNKERFNINLIEQVIKNAKGCYLVDWDNSYINKHFGIYDWK
SLCINPIIYNNEVIGIIYVSISVNKKEYTLEDLHLINYLGQLMIPLFF
NT seq
5187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attttcaataataaaacatatagcttatatatttttcaagacaatgttgaatatgaaaat
tgtagagaatatttattaagtaagtttaagacattaagaaatttgaattttaaaaattta
gttaatatattggatatagaaataataaggaatatagatggagtaaatttagataaatta
aattatggatatgtaacagagtatatagaaagtttaatagatacccaaaattattttaat
gaatcctcatttaataaaaagttagatatttttatgcagttatgtgcagcagttaatact
ttaaatattaagggatatatatttaatgaattaaatattaaagatattaatataatttta
gataacaagggtaaaccattattaaaaataaaaaatcttctacaatatgagataagtaaa
cttagagcgaataatttattagatgtgcaatcattaccgtatccttataatattgaaaaa
ttagattgtgaaattagtcaaaaggataatataaaagatatattatctctatttaagtat
atgtttaatgaaaaagaattaaacatatactttaaagaaaataactgcatagataatata
ctatcatttaatagagtacataagataacagattttattaaatggataaataagagacta
agaacaaattataatatatttgtttttgaagcgttagataaagtaacaactgatttagat
attattgggatggaagaggaaataaaaaaagtagaattaagattaaaatatatatatgaa
aataaattaaaatataagataatatgctttaagggagaacaaggtaatggaaaaactaaa
actttaattgaaattaagaataaaatactaagaaaatatgtagggaataatggtgaaaat
ggatttttaataatagataatctagatgaaaataattcatttatgtttattatagaaaag
atattaagcagattggataaatatctgaaagacaaatatgaattatatttaaaaaaattc
atattgatgattttggataaaaatgtggttataaatgaggaagtttttaaaattattaat
agagtttgtgctttattacatgaatatactttaaataatgtattaattattttgatagat
gacattgaaaaaacaagtgaaatattcaaagtattttttaaatatatgtgctttttgcga
aaaaaattagaaaatgtaatggttataatatcaaccaatgaggaaaattttgattctaat
atgataaattatatgaaatcaattaaagaattaataaattatgaggaagtttcaataaat
tattttaataattataatactagcaaaatggtaaaaaacatgttgaattaccataaaagt
atagatgaactttcaatgaagatatattctgaaactttaggaaagccaggttttataagc
aaaactatagaggggttatataaagaaggaattatatatttatgtaaagatgatggtaaa
tggaaaagtaagatcaatataaatgatatagtaattcctaaagtggtaaaaaaaatttta
gaaaataaaatgttaaatttgaatagtgaagagcttgaggttttagaaagattatcaata
tttcaaactccattatcagaaactttaatattttcatatgtaattttagataaaaagaga
aaagatagatattataaattaaaaaaagatagatttttaattgaaaagataagtgatgat
ggagttagggtagatttttataatgatttaataaaaaaaataatttattctaaaatccca
aaagaaaaaagtttaactatgcataatgatgcatgttattttttggaatgcatattaaaa
aatactcaggaatatttagatgaatttttaaatcaattagaaaaatcaaatcaaagagat
aagttagtagaatacagtttaaaatgtggaaaaaattttgatcaaataggggatacgttt
aaagcaatagattattataaaaaggcattaaattattctaaagatagcaaaaaaacacga
attgcaataagtattgcaaaattgaatgaaaaagtaggaaaggataaggaggcatataat
tattttaataaagctaacatatattcagtaaataataatcaaaaggagttacaaatatat
gcattacttagaatgataattataacatctaaggagtatagagcaatagatttaactttt
ccattagaagtagttagaaagcttttaagaaatatcacatatcctaaaggtgaagcgtac
tattactatgcacttgcatcagtagtcaaagtaaaagaaaagaaagaattatcagtaaaa
tatatagaagaagtatttaaaatttgtgaagttaataacataaaagttggagtatatgct
tgtgcaaaattattattgagtaatatatatatatctagaggtaaatatgataaagctaga
aagttattaactgaatcaatgagtgtatttgaaattgaaaataattattcaggtatatta
actaccaaaataaatttcgaaattataaataaagaagttggagaaaatataagcaacata
ttatgtaatattacacatattaaaagattatgtaataaatataaagtgtataaaaaagag
gttacaagcttaatatacattgctaaatgtaatatagaaatatttgaatataaaaaagct
gcaaaaaacttattattagccttagaagttgctagagaaaatggtttggatagatatata
ctaaaaatttgtacattattatgcttagtatattgtagagaaggaaaaataaaattagct
tcagattattatcaattaattttacaactaaaagatggtatacaggtatcaggattagat
atgttaactttaaaatctgcacaagcattatataattcaataatttataattttaaaaca
gcatttaaagagttaagtgtagttaatgatataggaaatgactataagggatctgaattt
agtaagataaaaagtcagtattatcaattatgtattattaattgcaaaaatgaaggtgat
gtaaaatataattttaaattattaaaagaagaattggttaatttaaagaattctataata
aaagaaagtatgataataggaagcataacaagtatactacttttaggatataaggaatta
tctagagaattattttctgatataaaagagtgtcctaagtattatgataaccaattagca
tatatctttttacaaatatatttctcaaaagatgatgagtgtgaaaatttaattaatagt
gctttaaacataattagatttgctaaaaataaacaaataaaaggtatagtatactgttca
atagcagaaaaatatgaatttaaaggagattttgaacttgctataaattactattatgaa
tctattaatatatttattaatatattaaactcattacctgaaaaagaaaaattacaatat
gctaataatagtatgtttttatttgcttatgataaatttagaaaaatattagttgaaaat
attggtataaaattaaatttggataaagtagaatatataaattcaaatattaaaataagc
gatttattaggtaaacttaaaataaataaattaatattaaatgaagaattttttaatata
atgcaaaataattatagtaataattattttaattttaaaaaaaacatacatgagatatta
aatggattttctagtgatatattgaaaaatttagatgaattattaaaatatactgcaaga
ttaactttagcagataaagctttacttactgttgaaaataattttggagaaaatcgagtt
atatgtaaatatagaataagaaatgatgatgaaataaagaaatatattgcattaaaaata
aactcaaataaagacataattactatatgcaatgattatgataataacagcaggataaat
tatgaaattattaaagatggaattaaggcagttatgtatattaaatttggaaataaaaga
aagtttataaataataatgaatgtattaatggaaaactaatattaatatcaaataattct
attaataatataaattctaattcagaaatcacagttaaaaaattagtgccttttattata
tttttattagatcaatataatttaatgataacatctactttagataaacttacgggtgca
tataatagaaaatatcttgaaaaagtttttgataatcttattaatgattcatactctaaa
gaaaaggaattttcattaattatttttgatatagatgattttaagggagtaaatgataga
tatggtcatcaaactggagatgaagtgttaataaaattaactgaagaagtaaaaaattct
ttatgtaaagatgaaatctttgttaggtatggaggagaggaatttataatacttttacca
gaaaaaaatcaaaaagaagcttatatgttagcagaaagaataagaaatagaatagaaaag
gccaaaattttaggtaacaaaaggacagtaactattagtttagggatatcagtttatatg
aaacattcctctaattcagaagaactaattaaaatggcagatcaagctttatatacatct
aaagcacagggaaaaaacagaacaactatatggaatgaaaatatagatgtcttaaataat
aatttaaacacttctaaaaggatgttattatcaaggtataataaggataataatttgatt
ttgttaataaaagatattattgaattattgtcaaataaaaatagtaaagaagataaatta
tataaatttctttctaaaataattcaaataactgattcagaatttgctacagcttttatt
atagaaaataataaaataacaaacatttatagtaaaaaaattcaagaggataatgcttat
aataaggaaagatttaatattaatttaatagaacaggttataaaaaatgccaaaggatgc
tatttagtggattgggataattcatatattaataaacattttggtatatatgattggaaa
tcattatgtataaatcctattatatataacaatgaagttattggaattatatatgtgtct
atttcggttaataaaaaagaatatacattagaagatttacatttaataaattatttaggt
cagcttatgataccattatttttctaa
DBGET
integrated database retrieval system