Clostridium taeniosporum: BGI42_07765
Help
Entry
BGI42_07765 CDS
T04957
Name
(GenBank) helicase
Organism
ctae
Clostridium taeniosporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DEAD
SWIM
ERCC3_RAD25_C
FtsH_ext
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR23635
UniProt:
A0A1D7XJY5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1679640..1682900)
Genome browser
AA seq
1086 aa
AA seq
DB search
MIKQVLMEGFNNSISGRNRVKAEAILKNDLVKDIKINVDDHMISILSSVISESLFNEYSC
KIEMDSKTKEVIGTYCSCEDFEKKEFSKDNYCCKHLVASFYYFLNRLDNNENLKEELLML
QKNKDDNSKVFSKNSQSQDILSSLLDDNKNRIKFEITLNRNTWSSKLQAEFKIGLKDVNN
KMYVLKDINQFLVCMYNKMPIKYGKDFIFDIRKQSLSFNDRRLIKFIYRLSERENLKSSF
RRSQDKIINGKTLTIPDILVKSFLDIIKDHRVYLGDGFFCRIIDSEILYEDIPVPFSLIE
KGNNIILEVPSGIPEALTQDEDVFLYGTSIYVPSIEQSERLSPYLKVFNNTQSISFNKND
EKRILKELIPSIQNVSSILNLSNKIQNKVVIAPVVFKFYFDKDRENIYMTLKVSYGGYEF
NYFEEFKDKIIYRDSEKEKEVYKLIKRYGFEDVNNKFLFLKDDDYIFKFFRYDIDKFQNY
GEIFYSENFKGIKKISKSDFRGDIRKGKFDYFEFEFLIGDISKEETSNILRSFRNNLKYY
KLKNGEFLDLEDENLKDILTLLDNLLLEDKLNNNKIDLYKNKTIYLDEYLEDKDFRFIDG
RDTISEIRNKVHNIKDKSFQPPYGIQATLREYQRDGYNWFRSLEYLGFGGVLADEMGLGK
TLQTIVFLSSRKNSHTLIVAPTSLIYNWFNEFKKFAPHISVCIVNGNKETRKDQIETYNN
YDVIITTYNLLRRDLELYTMVFDYCILDEAQNIKNPSSQNAKAVKNIKSNSNFALTGTPI
ENSLMELWSIFDFIMPGYLFDEKRFMSRYYRRLEEEKEILVELNRLVKPFILRRYKKNVI
KELPDKIEKRLIIPLSDEQKTVYKTYSEYAKDLIKKKVEDDEFKNSKIEILSYITKLRQI
CLDPSVIMENYLGTSGKIDALLEILDHSISAGHKILVFSQFTSILKNISNLLKENNILFS
YLDGSVSSMNRIKMVNEFNTGENNVFLVSLKAGGTGLNLTSADIVIHFDPWWNPAVEDQA
TDRAHRFGQKNTVEVIKLIAQGTIEEKIIELQDTKRKLIDKILGDDLNMGSFINTLSDEE
IVNLFN
NT seq
3261 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaacaagttttaatggaaggattcaataatagtataagtggaagaaacagagta
aaagctgaagctatactaaaaaatgatttagtaaaagacataaaaataaatgtagatgat
catatgataagtatattatcttctgtaatatcagaaagtctttttaatgaatattcatgc
aagatagagatggatagtaaaactaaagaggttataggaacatattgtagttgtgaagat
tttgaaaagaaggagttttcaaaagataattattgttgcaaacatttagttgcatcattt
tattattttttaaataggttagataataatgaaaatctaaaagaagaattgttgatgtta
caaaaaaacaaagatgataattctaaggtattttcaaaaaattcacaatctcaagatata
ttaagttccttattagatgataataaaaataggattaaatttgaaataactttaaataga
aatacatggtcttcaaaacttcaagcagaatttaaaataggtcttaaagatgttaataat
aaaatgtatgtactaaaagatataaaccagtttttagtatgtatgtacaataaaatgcct
attaagtatggaaaggactttatttttgatataagaaaacaaagtctttcatttaatgat
agaagacttattaaatttatctatagattaagtgaaagagaaaatctaaaaagttcattt
agaagaagccaagataaaattataaatggaaaaactttaactattccagatattttggtt
aaaagctttttagatataataaaagatcatagagtatacttaggtgatggcttcttctgt
agaataattgattctgaaatcctctatgaagatatacctgttccattttctttaattgaa
aaaggaaacaatattatattagaagttccaagtggaataccagaagctcttacacaagat
gaagatgtctttctttatggaacttcaatatatgttccatctatagaacaaagtgaaagg
ttatctccatatttaaaagtatttaataatactcaaagtatttcttttaataagaatgat
gaaaagagaatattaaaagaattgataccttctatacaaaatgttagtagtattttaaac
ttatctaataaaatacaaaataaggtggtaatagctccagttgtatttaaattttatttt
gataaagatagggaaaatatttatatgactttaaaagtttcatatggtgggtatgaattt
aattattttgaagagtttaaggataaaattatatatagagattcagaaaaagaaaaagaa
gtatataaactaataaaaagatatggatttgaagatgttaataataagtttttattttta
aaagatgatgattatatatttaaatttttcagatatgatatagataaatttcaaaattat
ggagaaattttttattctgaaaattttaagggaataaagaaaatatcaaaatcagatttt
agaggtgacattagaaaaggaaaatttgattatttcgaatttgaatttttaataggagat
atatctaaagaagagacaagtaatattttaagaagttttagaaataatttgaaatattat
aaattaaaaaatggagaatttttggatttagaagatgaaaatttaaaagatattttaaca
cttctagacaatttacttttagaggataagttaaataataataagattgatttatataaa
aataaaactatttatttagatgaatatttagaagataaagatttcagatttatagatggc
agagatacaattagtgaaataagaaataaagtccataatataaaagataaatcttttcaa
cctccatatggaattcaagcaacattaagagaatatcaaagagatggttataattggttt
aggtctttagaatatttaggttttggtggagttttagcagatgagatgggacttggtaaa
acacttcaaacaatagttttcttatcatcaagaaaaaattcacatacacttatagttgca
ccaacatctcttatatataattggtttaatgaatttaaaaaatttgctccacatataagt
gtatgtattgtaaatggaaataaagagacacgtaaagatcaaattgaaacatataataac
tatgatgttattataacaacatataatcttttaagaagagatttagaattatatactatg
gtatttgactattgtattttagatgaagctcaaaatatcaagaatccttcatcgcaaaat
gcaaaagctgttaaaaatataaaatcaaattctaactttgctcttacaggtacacctata
gaaaattctttaatggaactttggtcaatttttgattttataatgcctggttatcttttt
gatgaaaaaagatttatgagtagatactatagaagattagaagaagaaaaggaaattctt
gtggaattaaatagacttgttaaaccatttatattaagaagatacaaaaagaatgttatt
aaagaattacctgataaaatagaaaaaagattgattatacctttaagtgatgaacaaaag
acagtatataaaacatattctgaatatgcaaaagatttaataaaaaagaaagttgaagat
gatgaattcaaaaatagtaaaatagagatattatcttatataactaaattaagacagatt
tgtttagacccgtctgtaattatggaaaattatttaggaacaagtggcaaaatagatgca
cttttagagatattagatcatagtataagtgcaggacataaaattttagtattttctcaa
tttacatctatacttaaaaatataagtaatttacttaaagaaaacaatattctattttct
tatttagatggatctgtatcttctatgaatagaataaaaatggttaatgaatttaatact
ggagaaaataatgtatttttagtatctttaaaagctggaggaacaggtcttaatttaact
agtgcagatatagtaatacattttgatccttggtggaatccagcagtagaagatcaagca
actgacagagcacatagatttgggcaaaaaaatactgtggaagtgattaaacttatagca
caaggaacaattgaagaaaaaataatagaattacaagatactaagagaaaacttatagat
aaaatcttaggtgatgatttaaatatgggatcatttataaatacgttgagtgatgaagaa
attgttaacttatttaactaa
DBGET
integrated database retrieval system