Acetivibrio thermocellus DSM 1313: Clo1313_2795
Help
Entry
Clo1313_2795 CDS
T01933
Name
(GenBank) alpha-L-arabinofuranosidase B
Organism
ctx
Acetivibrio thermocellus DSM 1313
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AbfB
Glyco_hydr_30_2
Dockerin_1
Glyco_hydro_32N
EF-hand_1
EF-hand_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU75777
LinkDB
All DBs
Position
3282325..3285273
Genome browser
AA seq
982 aa
AA seq
DB search
MNNLKKYTLVAVFVFLTAVCFQHPGITSAVTTITIDPDATYQTIEGWGASICWWGNQIGR
WSPDNRNRLIEKIVSPTDGLGYNIFRYNIGGGDNPGHNHMRDYADIQGYQNADRSWNWNA
DAAQRAVLTRLIERGRYYGSEIILEAFSNSPPYWMTKSGCASGTSDGSNNLRDDCYDDFA
DYLTEVVKHFRDAWGITFRTLEPMNEPNSDWWKAGGRQEGCSFSYANQQRIIKEVGEKLK
AKGLTGTTVSAADEASIDTALEGLQSYDATTLSYMSQLNVHSYFGSKRAQLRDLAKSKGL
RIWQSESGPLSFNGDMADSCIMLSKRIVTDLKELQCVAWLDWQIIDGGNWGSIYVDDASQ
TFTLTEKFYMHANYSRFIRPGYTIIGANNEKTIAAISPDKKKLVIVATNDNKSSSANYTF
NLTRFSGVNSTVEVYRTSPSLSLAKSIITASNKIVSDTLPPYSINTYVITLDGGVESVPA
VGLQSYNYPNRYVRHADFDARIDENVTPLEDSQWRLVPGLANSSEGYVSIQSVNYPGYYL
RHWDYDFRLDKNDGTTIFAEDATFKLVPGLADPSCVSFQSYNYPDRYIRHYGYLLKLERI
STDLDRQDATFLIISDDSPGPITDSGYIMAYFKQAPGEYGLNLCYSTDGLHWRNINDGKP
VLYAQMGTKGIRDPYIFRKQDGKFGIVATDMLGTNWGDTSQYIHYWESEDLINFTERLIK
VHNKSNMHAWAPEVFYDENRKQYGIYWAGNTDYNRIYVNYTTDFDTVSDCQVFFDPGYDV
IDAHIVSDKGMYYLFFKDERASGKAIKVARSSSLTPNSFTVFTPNFITSPNTEGPFVFKD
NNSDSWYMYVDIYSNNGIFECWKTNDLNALSWTKVTGISVPPGVRHGSVVKVNRWELETA
ISRKVVTPPAPTPPPVLKGDVNADGVINSSDIMVLKRYLLRTITLTEEMLLNADTNGDGA
VNSSDFTLLKRYILRSIDSFPV
NT seq
2949 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatttaaaaaagtatacattggtcgctgtatttgttttcctgacggcagtatgc
tttcagcatcctggaataaccagtgctgtaacaacaattaccatagaccctgatgcaacc
tatcaaaccatcgaaggctggggtgcaagcatatgctggtggggaaatcagattggccgg
tggtctcccgataacaggaacagactgattgagaaaattgtcagcccgaccgatggactg
ggatataatatattcaggtacaatatcggcggcggagataatcccggtcataatcatatg
agggactatgctgatattcaaggatatcagaatgcggaccgttcgtggaactggaatgct
gatgccgcccaaagggccgttcttacccggctgatagaaagagggagatattacggatcg
gaaattatacttgaagcgttttccaactctccaccctactggatgacgaaaagcggctgc
gcttccggaacttccgacggttccaacaacttaagagatgactgttatgacgattttgcc
gattatcttaccgaggttgtaaaacatttcagggatgcatgggggattaccttcaggact
ctggaacccatgaatgaacccaattcagactggtggaaggccggtggcaggcaggaaggc
tgctccttttcctacgccaatcaacagagaattattaaagaggttggagaaaaattaaaa
gcaaaagggttgaccgggacaactgtcagtgctgccgatgaagccagtattgacacggcc
ctggaagggcttcagtcctacgacgcaaccactttgtcctatatgtcccagcttaatgtg
cattcttatttcggctcgaaaagagcccagctcagagaccttgcaaaatccaaagggctc
agaatctggcagtcggaatccggtccgttgagttttaacggcgatatggcagattcatgt
ataatgctgtcaaaacgtattgttaccgacttgaaagaattacagtgtgtggcgtggctg
gactggcaaataatagacgggggcaattggggcagtatatatgtggatgatgcgtcccag
acctttacccttaccgaaaaattctatatgcatgcaaattacagcaggtttataaggccc
ggttatacaatcataggtgccaataatgaaaaaacaattgcggcaataagccccgataaa
aagaagcttgttatcgtcgcaaccaacgacaataaatcctccagcgcaaattatacattt
aacctgacaaggttttcaggcgtaaacagcactgtggaggtttacagaacatctcccagc
ctaagccttgcaaaaagcattataacagcgtcgaataaaattgtttccgacactttgcct
ccgtactcgataaatacatatgtcataacccttgacggtggtgttgaatcagtaccggcg
gtcgggcttcaatcctataattatcccaacagatatgtaagacacgcagactttgatgca
aggatagatgaaaacgtaactcctctggaagattcacaatggaggctggttccgggcctt
gccaacagcagcgaagggtatgtttccatccagtcggtaaactatcctggatattactta
agacactgggattatgatttcaggcttgataagaacgacggaaccacaatttttgctgag
gatgcaacctttaaactggttccgggccttgcagacccttcctgtgtttcttttcagtca
tataattatcccgacagatatataaggcactatggatacttgttgaaactcgagagaatt
tcaaccgatctggacaggcaggatgcaacctttttaataatcagcgatgattctcccgga
cctataacagattcagggtatataatggcttatttcaaacaggcgccgggcgagtatggg
ctcaatctttgctacagtacggatgggctccactggagaaatataaacgacggaaagccg
gttttgtatgcgcaaatgggaacaaagggaattagggatccgtatattttcagaaagcag
gacggaaagttcggaatagttgcaaccgacatgctggggactaattggggagatacgagc
cagtatattcattattgggaatccgaggatttgataaactttaccgaacgtttaataaaa
gtgcataataaaagcaacatgcatgcctgggctccggaggtattctatgacgagaacagg
aagcagtacgggatatactgggcaggcaatacggattataaccgaatatatgtaaactat
acaacggattttgatacagtaagtgactgtcaagtgttttttgaccccggctatgatgta
attgatgctcacattgtcagtgacaaaggaatgtattatttgtttttcaaagacgagaga
gcctcgggaaaagccattaaggtagccagatcaagctccttgactcccaacagcttcact
gtatttacgccgaattttataacctcgcccaatacggagggaccctttgttttcaaagac
aataattccgactcatggtatatgtatgttgacatttattccaacaacggtatttttgaa
tgctggaagacaaacgatttaaatgccttaagctggacgaaggtcaccggaatcagtgta
ccgccgggagtaagacatggaagcgttgtaaaggttaatcgatgggaactggaaactgcc
atttcccgaaaagtagttactccacctgctccaacaccgccaccggtgcttaaaggtgat
gtaaatgccgacggagtgattaactcatcggacataatggtattaaaaaggtatctgtta
agaacaataacgcttacggaagaaatgcttttaaatgcggacaccaatggagacggtgcg
gtaaactcttcagacttcacattgctaaaacggtatatattgcgcagcatagattctttc
ccggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system