Crocosphaera watsonii: CwatDRAFT_1311
Help
Entry
CwatDRAFT_1311 CDS
T05097
Name
(GenBank) Leucine-rich repeat
KO
K13730
internalin A
Organism
cwa
Crocosphaera watsonii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
COR
Roc
LRR_4
LRR_8
LRR_1
Ras
Arf
SWIRM
NB-ARC
MMR_HSR1
AAA_24
nSTAND3
AAA_16
AAA_22
PduV-EutP
Sigma54_activat
NACHT
Sigma54_activ_2
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAM48711
UniProt:
Q4BXS5
LinkDB
All DBs
Position
complement(8490..10877)
AA seq
795 aa
AA seq
DB search
MDKQELLKIIEKARGEEWEELDLAGNELTELPPEIGSLVKLKRLILGKWDSKKVELIGNN
ISFLPKEIGQLTALQQLYLSGNQLTEIPAEIGQLTSLQQLYLSGNQLTEMPAVIGQLTAL
QILNLSRNKLKEIPAEIGQLTSLQILNLGLNELREIPVVIRQLTSLQELNLIRNPLVNPP
IEVANQGIQAIRNYFRQIEKGKDTLFEAKLIIVGEGGVGKTTLARRINNPKCPLPEEKES
TQGIDIQQWNFVMEGQEKDFRVNIWDFGGQEIYHATHQFFLTKRSVYAVVADNRQESPNL
PYWLEIVELLSNKSPVLLIKNEKKDQKVQINEKELRARFENIKESLPTNFAADNRGLTDI
INNLKFQLQQLPHVGTTLPKTWINIRNELERLFKEERKNYISLNEYYKICEDMKVTDRTF
QLEISQFLHDIGVILHFQDDPISTLYNTVILNPEWGTDAVYKVLDEPTVINQLGRFNNTD
LGNIWNEAKYETMQPQLLELMLKFKLCYELPKEKNTYIAPQLLTKEPPEYEFNTTQNLQL
KYEYEFLPKAIIIQFIVEMSRLIDESKVWQKGVVLKRESNGQITYAEIVESYNRREINIR
LDGEDKREFLGIITNKLEEIHESYNQLQVKALISCNCEVCKDSQKPYLHSLPVLKNFLNK
NKTEAQCQKSGILVPIWNLIGEIIGEDIYKRITSERERITNQTNNFFNDSPSTESPNPPE
SPQPTPLHPIERRNLQVGIIVSILTLIVTFCGLVFTNIWNPFKPSNNNNQNQQTKPSLTP
SPTPSPSPSPSPSQP
NT seq
2388 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaacaagagttattaaagattattgagaaagctaggggtgaagagtgggaagaa
cttgatttagcagggaatgagttgacggaacttccgccagagattggttctttagttaag
ttgaaacgcttgattttagggaaatgggattcaaaaaaagttgaattgataggtaataat
attagttttttaccaaaggaaatcggacaattaactgctcttcaacaactctacctcagt
ggaaatcaactaacagagataccagcagaaatcggacaattaacttctcttcaacaactc
tacctcagtggaaatcaactaacagagatgccagcagtaatcggacaattaactgctctt
caaatactaaacctcagtagaaataaactaaaagagataccagcagaaatcggacaatta
acttctcttcaaatactaaacctcggtttaaatgaactaagagagataccagtagtaatc
agacagttaacttctcttcaagaactcaacctcattagaaatcctttggtaaacccaccg
attgaagttgctaaccaaggaatacaagcaattcgcaattatttccgtcaaatagaaaaa
ggaaaagatacactttttgaagcaaaactgattattgttggggaaggaggggtaggaaaa
acaacattagcgaggagaattaataatcctaagtgtcccttacctgaagaaaaagaatct
acccaaggaattgatattcaacaatggaattttgttatggaaggacaagaaaaagacttt
cgggtgaatatttgggactttggaggacaagaaatttatcatgcgacccatcaatttttc
ttaaccaaacggtcagtttatgcagtggttgccgataatcgccaagaatcgcccaattta
ccttattggttagaaatagttgaattactcagcaataaaagtcctgttttgttaataaaa
aatgagaaaaaagatcaaaaagttcaaattaacgaaaaagaattaagagcaagatttgag
aatattaaagagtctttacccacgaactttgctgctgacaatcgtggtttaacggatatt
attaataacctaaaatttcaattacaacaattaccccatgtaggaacgactttaccaaaa
acttggattaatattcggaatgaattagaaagactttttaaagaagaacgaaaaaattat
atttctttgaatgagtattataaaatttgtgaagatatgaaagtaacagacagaactttt
caactagaaatcagtcaatttttacatgacattggggtaattctacattttcaagatgac
ccaatatctactttatataatacagtgattcttaacccagagtggggaaccgatgcagtg
tataaagtattagatgaaccgacagttattaatcaactaggacgatttaataacacagat
ttaggcaatatttggaatgaagctaaatatgaaacaatgcaaccacaattattagaatta
atgctgaaatttaagttatgttatgaactacccaaggagaagaatacttatatcgcacct
caactattaaccaaagaaccccctgaatatgaatttaataccacccagaatttacaatta
aaatatgaatatgaatttttgcccaaagcaatcattatccagtttattgtggagatgtcc
cgtttaattgatgaatcgaaagtttggcaaaaaggagtcgtcttaaaaagagaatccaat
ggacagataacttatgcggaaatagtggaaagttataaccgaagagaaattaatattaga
ttggatggagaggataaaagagaattcttaggaattattacgaacaaactggaagaaatt
catgaaagctataatcaattacaagttaaagcgttaatttcctgtaattgtgaagtttgt
aaggatagtcaaaaaccgtatcttcattcgttacccgtcttaaaaaatttcttaaacaaa
aataagacagaagcgcaatgtcaaaaaagcggaattctagtacctatttggaacttaatt
ggtgagataattggggaagatatttacaaaagaattaccagtgaacgagaaagaattact
aatcaaactaataatttttttaatgattctccatcaactgagtcacctaatccacctgaa
tcacctcagccaacccctctacatcctatagagagacgtaatttacaagttggaattata
gtatcaatactgactctaatagtaacattttgtggattagtttttactaatatctggaat
ccttttaaaccatctaacaacaataatcaaaatcagcaaactaaaccatcactaacacca
tcaccgacaccatcaccatcaccatcaccatcacctagtcaaccataa
DBGET
integrated database retrieval system
