Desulfosporosinus acidiphilus: Desaci_0650
Help
Entry
Desaci_0650 CDS
T02148
Name
(GenBank) 4-alpha-glucanotransferase
Organism
dai
Desulfosporosinus acidiphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_77
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFM39712
UniProt:
I4D1N8
LinkDB
All DBs
Position
660657..664145
Genome browser
AA seq
1162 aa
AA seq
DB search
MIMFNAFHDSHDLLYREPFGAVVCGQRITFRLRTFSDVSVDHCVLRLWEMDRERTIDMSP
NTKGRQCQSADCGTASANEEVADTGIFEVEYEVPDDPGLVWYYFVIQVGTQVHYYGNNQK
GLGGEGALWEREPKSYQITVYKQMTVPDWYKRGIMYQVFVDRFFNNDPNMFVRYPRKNAL
LHARWSDQPVYIKDQLGKVTDWDFFGGTLQGVIEKLPYFKELGVSILYFNPIFDAPSNHK
YDTANYHRIDPMYGDEAVFQALIETARQLGISIILDGVFSHTGSDSIYFNKYGNYPGVGA
YQSSDSPYYNWYKFNKDNHDYKAWWGVDSLPEVNEMDHTYRRFIYGSEDSVIKKWLTLGV
AGWRLDVADELPDEFIQELRQAVKTVSPHAVLIGEVWEDASNKVSYSQQRKYFLGNELDA
TMNYPFRASFLRFILGTGDSDSLDQEVMSLYENYPRENFYAAMNLIGSHDTIRVLTLLGD
APPQQSLTDTEQRTFRLSPLAKQLAVQRLKLLSLVQMTFPGVPCIYYGDEAGMEGYADPY
NRGTYPWGQEDYRIMEWYRRILRWRQEYETLMMGDFRSFYFAPDIFGFTRSVDEEEIIIL
INRHALESKIVNLYTKLEPSPFIIDLINGETLAVEALSALPINALSGRCLLRKKSRPRNL
QLDRSCGVLLHISSLPSVWGLGDLGEEAYEFIDFLADCGQSLWQVLPLNPAGEGDCPYQS
DSALAGNPLFISIDHLIREGLLNFEETKEKYDKIRSLDPRDSFLSLAFKELKQELLREAY
RQFMNLVDAVKSSYLSQESFLEFQTRNKDWLEDYSLFKALKAYFRDVPWYDWESEIAWRD
PSKLADYARLLQDDINYIKFLQYTFSYEWGKLKAYSKEKGVRIIGDLPHFVAADSCDVWV
NRGLFVLDEHGRPLKTAGVPPDYFSKTGQLWGNPVYAWDVHAVTRYGWWKRRIQLGLEMF
DYLRFDHFRGFEAYWEVDAGEKTAETGRWIKGPGKRFLESMLEEFGRCPFIVEDLGVLTP
EVNILKQIFGFPGIKVLQFTSLQEILGNSETNFVYYTGTHDNNTLLGWYELNNLVEEENQ
LSSGVDQKTSNKQSCRKLMEEVYSSQAAWVILPMQDILGLGEEARMNVPGTIYGNWQWKM
DKNLVTDEIKTWLRTQTEKTNR
NT seq
3489 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataatgtttaacgcgtttcatgattcacatgatttgctttatcgggaaccttttgga
gcggtggtatgcggtcaaaggataacattccgtttgagaacgttttcagatgtttctgtt
gaccattgcgttcttcgtctttgggaaatggatagagaaagaactattgatatgtcccca
aataccaagggccgccaatgtcaatcagcggattgcgggacagcttctgcgaatgaggaa
gttgcagataccggtatctttgaggtggaatacgaagtgcccgatgatcctgggcttgtc
tggtactattttgtgattcaggttggaacccaagttcattactatggtaataatcaaaaa
ggtcttgggggagagggagcactctgggagcgagagcccaagtcctatcaaatcactgtt
tataagcagatgacagtacctgactggtataaacgagggattatgtatcaagtttttgtc
gatcgtttttttaacaatgaccctaacatgttcgttagatatccgcgcaaaaatgctttg
ctgcatgcccgatggtctgatcagccggtttatattaaagaccagctcggtaaagttaca
gactgggacttttttggcggaacattgcaaggggtcatcgaaaaattaccctactttaaa
gaattgggagtaagcattctttattttaaccctatttttgacgctccaagtaatcataaa
tatgatacggcgaactatcatcggattgatccaatgtatggagatgaggcggtatttcaa
gccttaattgagactgcccggcaattaggaatctctataatcctggatggcgtcttcagt
catacaggaagtgatagtatctattttaacaaatatggcaattacccgggggtgggtgcc
taccaatcctctgactcaccttattacaactggtataaatttaataaagacaaccatgat
tataaagcctggtggggcgttgattccctgcctgaagtcaacgaaatggaccatacctac
agaaggtttatctatggttcggaagatagtgtcattaagaagtggttaactttaggggtt
gccggatggcggttggatgttgccgatgaactacctgatgagttcattcaggagctccgc
caggcggtgaagactgttagcccccacgctgttctgatcggcgaagtgtgggaagacgct
tccaataaagtaagctatagtcaacaacgcaaatatttcttgggaaatgaactggatgcg
acgatgaactatccttttcgggctagttttctccgttttattctcggaacaggtgattcg
gattcccttgatcaagaagttatgagtttatatgaaaattatcctcgagaaaatttttat
gctgctatgaacctgatcgggagtcatgatactattcgagttttgacccttttgggagat
gctcccccgcaacagagtttaacggataccgaacagaggacctttcggctttctcctctt
gccaagcaattagctgtacaaagactaaaattattaagtttagtgcaaatgacctttccg
ggagttccttgtatttactatggagatgaagcaggtatggaggggtatgccgacccttat
aaccgggggacatatccgtggggccaggaagactaccggatcatggagtggtatcgacgc
atcctgcgctggcgtcaagaatacgagacgctgatgatgggtgatttccgatcgttctat
ttcgctccggatatttttggttttacacgttccgtggatgaagaagaaatcatcatcctt
atcaatcgtcatgctttggagtctaaaatcgtaaatctctatacaaagctagagcctagc
ccatttataattgatcttataaatggggaaacactggcggtggaagcgctaagtgccttg
cccataaatgctttgagcggaaggtgtttgttgagaaagaaaagccggcctcgtaatttg
cagcttgaccgttcatgcggtgtattattgcatatcagttcattgccttccgtttgggga
ctgggagatttaggggaagaggcttatgaatttatagatttcttggctgactgcggtcaa
tctttgtggcaggtcttacccttgaatcctgccggagaaggggattgcccttatcaaagt
gattcagcgcttgccggaaatccgctatttatcagtattgatcatttaatcagggaagga
ttattaaattttgaggaaactaaagaaaaatacgataagattcggagccttgacccgaga
gacagcttcttatctcttgcttttaaagaattaaaacaggaattgcttcgtgaagcctac
cggcaatttatgaatcttgttgatgctgtaaaatcatcgtatctatcacaggaaagcttt
ttggaatttcaaaccagaaacaaagattggctggaagattattcactcttcaaggcctta
aaggcatattttagggatgttccctggtatgattgggaatccgaaattgcttggcgtgat
ccaagtaagttagccgattatgctcggcttttgcaagatgatattaattatataaagttc
ttacaatatactttttcctacgaatggggtaaactcaaggcctattccaaggaaaaagga
gttcgaatcattggggatttaccccattttgttgccgccgacagctgtgacgtctgggta
aatcgcggtttgtttgttctggatgagcatggccgacctcttaaaactgcaggggtaccc
cctgattatttcagcaagacaggtcagttatggggaaaccctgtttatgcttgggacgtt
catgctgttactcgctatggttggtggaaaagacggattcagctcggcttggaaatgttt
gattacctgcgatttgaccatttccggggttttgaagcctactgggaagttgatgctgga
gaaaagacggctgaaacgggtcgctggattaaaggacctgggaaaaggttcttagaaagt
atgttagaagagtttggacgatgcccttttattgttgaggacttgggggttttaactccg
gaagttaacatcttaaaacaaattttcggttttccgggtataaaggtcctgcaatttact
tcactacaagagatattagggaattctgagaccaattttgtctattatacaggaacccat
gataacaacactttattaggttggtatgaattaaataatttggtggaagaggaaaatcag
ctcagcagtggtgttgaccaaaaaacatcgaataaacaatcatgccgtaaattgatggaa
gaagtgtattccagtcaagcggcgtgggtaatcctaccgatgcaagatattttaggttta
ggcgaggaagcaagaatgaatgtacctgggactatttatgggaattggcagtggaagatg
gataaaaatttagttacggatgaaataaaaacttggctgcgaacccaaaccgagaaaaca
aataggtga
DBGET
integrated database retrieval system
