Daucus carota (carrot): 108195992
Help
Entry
108195992 CDS
T05350
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC108195992
KO
K11886
proteasome component ECM29
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dcr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03051 Proteasome [BR:
dcr03051
]
108195992
Proteasome [BR:
dcr03051
]
Eukaryotic proteasome
Proteasome interacting proteins (PIPs)
Other PIPs
108195992
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ecm29
HEAT_EZ
Vac14_Fab1_bd
HEAT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108195992
NCBI-ProteinID:
XP_017218526
LinkDB
All DBs
Position
7:5789502..5819326
Genome browser
AA seq
1812 aa
AA seq
DB search
MAGSSSASEKSEMEKEEMLDRMLTRLALCEDSNLQNLLSKLLPLSISSLSSNSTPVRNKV
IEILSHVNKRVKHQLDIGLPLSELWNLYIEPNATPMVKNFCIVYIEMAFERVQIEVKEDM
VPLLVANISKLPTQHQEIILRISAKVIGDCHCTNLRDEVAAKYRSIMGSQDSEIFLEFCL
HTILYQPPSQGGGCPAGLSVSQSNRVSGKQLLTSDILSKRKLGILNVVEAMDLAPEIVYP
LFLVACVDRHEPVIKRGEELLKKKAAGVNLEDQSLINRLYLLFNGTAGAQQISLDNKVTP
GSLALRAKLMSSVFCRSITAANSFPATLQCIFGCIYGNDTSSRLKQLGMEFTVWVFKHAR
EAQLKLMGPVILNGIIKSLDGYSASESDTIARETKTFAFQAIGLLAQRMPNLFRDKIDMA
LRLFDALKSETQFLRLTIQEATSSLAVAYKGADRKVLENLELLLLKSSQVEQSEVRFCAV
RWATSLFDLEHCPSRYICMLGAADMKMDIREMALEGLILGKDQQRTISENPNLKYPKVGN
MLDYIVKQQPALLESTEMRGSTLLFPSKSYVAMIQFLLKCFKAGLDESNASGKMPNDSIP
LENMFLLLEHAMAYEGSAELHAIASKALIDVGAHVPEMVASRYARRIVWLKQLLGHVDFD
TRESVARLLGISSCALPISALSDLITELISSLGGSKLRFEFQHGVLCALGYVTANCMSRS
PTISESLLQRTLKCLVDIVNSETSTLASIAMQAIGHIGLGVQLPQLHSDSSSAPILTVLK
DKLSKLISGDDAKATQKAVLALGHMCVKESSLPHLTAALDLIFSLCRSKVEDILFAAGEA
LSFLWGGVPVTVDIILKTNYNSLSMSSNFLMGDVSSSLSRSSCIEFDPHGDCDVSVRDLI
TRKLFDNLLYSNKKEERCAGTVWLLSLTIYCGRHPAIQKLLPDIQEAFSHLIGEQNELTQ
ELASQGLSIVYELGDASMQKNLVNALVGTLTGSGKRKRAVKLVEDSEVFQEGAIGGSPSG
GKLSTYKELCSLANEMGQPDLIYKFMDLANYQASLNSKRGAAFGFSKIAKLAGDALQPHL
RLLIPRLLRYQYDPDKNVQDAMTHIWKSLVADSKKTIDEHLDFIIEDLLSQCGSRLWRSR
EASCLALADIVQGRKYDQVGKYLKRIWTAAFRAMDDIKETVRNSGDRLCRTLTSLTIRLC
DVSLTDVSDARQTMNIVLPLLLTDGIMSKVDSIRKSSISIVTKLAKGAGTAILPHLSDLV
CCMLEGLSSLEDQGLNYVEMHAANVGIQTEKLENLRISIAKGSPMWETLDLCIDVANSQA
LEQLVPRLIQLVRSGVGLNTRVGVANFISLLVQKVGSDIKPYTSMLLKLLFTAVKEEKSA
TSKRAYANACATILKYSTPSQAHKLVEDTVALHTGDKNSQSSCALLLKSYSSTASDVLSG
YQTIIVPVIFISRFEDDKNVSTLYEELWEENMSSERVTLQLYLNEIVTLVDEGVTSSSWA
SKKKASLAISKLCEVLGDTVSPHHHVLLASLMKEIPGRLWEGKEALLCALSALCESCHIA
IVNSDPATSNEILSLVSSACKKKDKKYRETAFCCLKQIIKAFSNPDFFNIVFPMLFEMCD
STIVYSSQVPSSNNIVKEEIDEKKDVVPHDKVMDCINSCICVARVTDIIEQCQNLLHVLS
ISLAPSVVWTVKMSVFSTIKELCSRLRSDTVEISQHVRIAALVHELFLSISPKVVDCIST
VKIGQVHVTASECLLEITLLLESLPTFQRIEIGFKGELHHQYEIEKNQEAKSILKKCMDI
IQSLEEKSLQNC
NT seq
5439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgggatcatcgtcggcgtcggagaaatcggaaatggagaaagaagagatgctggat
cgaatgcttactcgtttagctctctgtgaagactccaatcttcagaacttactctctaag
cttcttcccctttctatctcttctctctcttccaattctactcctgtcagaaacaaggtt
attgagattctgagtcatgtcaacaagagagtgaaacaccagctggatattggtttgcca
ttgtcagaattatggaatctgtacatagaaccaaatgctacccccatggttaaaaatttt
tgcattgtgtatattgagatggcttttgaacgtgtacaaatagaggtaaaggaagatatg
gtacctcttcttgttgctaacatatcaaaactccctactcaacaccaagagataatattg
agaatatctgccaaggtaattggtgactgtcactgcactaatcttagggatgaagttgct
gccaagtacagatcgataatgggttctcaggatagtgaaatatttcttgaattttgcctc
catacaatactttatcaaccaccatctcaaggaggaggttgcccagctgggctttccgtg
tcccaaagcaaccgtgtttctggaaaacaattgttgactagtgatatactttcaaaaaga
aagttaggtatcttgaatgttgttgaggctatggatttggctccagagattgtttatcct
ctttttcttgttgcatgtgttgaccggcatgaacctgttattaagagaggagaggagctg
ttaaagaagaaggcagctggggtgaatttagaggatcaaagtctgataaacaggctatat
ttattatttaatgggactgctggggctcaacaaatttccctggataataaagtaactccc
ggaagtcttgctttgagagcaaagttgatgtcctctgtcttctgcagatcaatcaccgct
gcaaacagtttcccagcaactctacagtgcatttttggctgtatatacggaaatgataca
tcctcaaggttaaagcaattggggatggaattcacagtgtgggtttttaaacatgcaaga
gaagctcagctgaagctcatgggtcctgttattttgaatggaattataaaatcccttgat
ggctattcggcatcagaatcagatactattgctagggagacaaagacttttgcatttcaa
gctattggattacttgcccagcgcatgcctaaccttttcagagataagattgatatggcc
ttgcgtctttttgatgctctgaaatctgagacacaatttctccgccttaccatccaagaa
gctaccagttctcttgctgttgcatacaagggtgcagacagaaaagtgctggagaacttg
gagttgcttctgctaaaaagttctcaagtggaacaaagcgaggtacgtttttgtgctgtg
agatgggcgacctcactgtttgacttggaacactgccccagccgatatatatgtatgctt
ggagctgccgatatgaaaatggatataagggaaatggccctagagggtttaattcttggt
aaagatcaacagaggactattagtgagaatcctaatctaaagtacccaaaggtgggtaat
atgctagattatatagttaagcagcagccagctctgttagaatccactgaaatgagaggc
tcgacacttcttttcccatcaaaatcatatgtagctatgatccaattcttgctaaagtgc
tttaaggctggattggatgagagtaatgcatcaggtaaaatgcctaatgatagtattccg
ctggagaatatgtttttgctgttagaacatgctatggcatatgaaggttctgctgagttg
catgctattgcatccaaagcactgattgatgttggagctcatgttccagagatggtagct
tctcgatatgctcgaagaatagtttggctaaagcaattgctagggcatgtggactttgac
acgcgcgaatctgtagcacgcttgcttggaataagttcatgtgctcttcctatatctgcg
ttgtctgatcttattaccgaattaatttcatcccttggtggatccaagttgaggtttgaa
ttccagcatggagtgttatgtgccttaggatatgttactgcaaactgtatgtccaggtca
cctactatctcagagtcccttcttcaaaggacactgaaatgcttagttgatattgttaat
agtgagacatctacactggcttctattgcgatgcaagcaataggtcacattggacttggt
gtgcaattgcctcagttacatagtgactcaagctcagctcccattttgaccgttttgaaa
gataaattgagcaagctaatttctggtgatgatgccaaagcgactcaaaaagctgttcta
gctttagggcatatgtgtgtcaaggaatcttctttgccacatttaactgcagctcttgat
ttaattttcagtctctgccggtcgaaggttgaggatattttgtttgctgctggagaagct
ctatcatttttgtggggcggagttccggtgactgttgatataattcttaagacaaactac
aattcactttccatgagctcaaacttcctaatgggagatgtgtcatctagcctatctaga
tctagctgcatagagtttgatccccatggagactgtgatgttagtgtcagagacttgatt
actagaaagctgtttgataatttactatatagtaacaaaaaagaggagaggtgtgccgga
actgtttggttactatcattaacaatatattgtgggcggcatccagcaattcagaaattg
cttccagatattcaggaagctttctcacacctaataggagaacagaacgaacttacacag
gagctcgcttcccagggtctaagtattgtctatgaacttggtgatgcttcaatgcagaag
aatttagtaaatgcactggtaggcaccttgactggatcgggaaagagaaaaagagctgta
aagcttgttgaggactcagaagtgtttcaagagggtgccatcggcggtagtcctagtgga
ggaaaacttagcacttataaagagctttgcagtcttgctaatgagatggggcaaccagat
ttaatttataagttcatggatttggctaactatcaagcttccttaaattccaagagaggt
gctgcttttgggttttcaaaaatcgcgaagcttgcaggagatgctctacaaccccattta
cgattattgataccaagacttctgcgataccaatacgatcctgataaaaatgtgcaggat
gcaatgacacacatttggaaatcacttgttgcggactcaaagaaaactatcgacgaacac
ttggacttcataattgaagatctcttaagtcaatgtggttccaggctttggcgctcgcgc
gaggcttcttgtcttgctcttgcagatatagttcaagggcgtaaatacgatcaggtagga
aagtatctgaagagaatatggactgctgctttccgtgccatggatgacataaaggagact
gttcggaattctggtgacagactatgtcgtacattaacttcattgacaattagactctgt
gatgtctctctcactgatgtttctgatgcaagacaaactatgaatattgttctgcctttg
ttgctaaccgacggcataatgagcaaagtggacagcattcgcaaatcgtctatttccatt
gttacaaaacttgcaaagggtgcaggtactgcgatacttccacatctatcagatttagtt
tgttgcatgctggaaggtttgtccagccttgaagaccaggggctcaattatgttgagatg
cacgcagcgaatgttggaatacaaaccgaaaaacttgagaatttacgtatttcgattgcc
aaaggttctccaatgtgggaaactctagatctgtgcatagatgttgcaaattcccaagca
ctagaacagctagtacctcgtctcattcagttggtgcgctctggagttgggctaaataca
agggttggcgtggcaaactttataagcttattagtgcaaaaagttggtagcgatattaag
ccatacacaagcatgctgttgaagctcttatttacagctgtcaaggaggagaaaagtgct
acatccaaacgtgcctatgcaaatgcttgtgcaaccattttaaaatattcaactccctcc
caggcccataagttggttgaagatacggtagctttgcatactggtgacaagaattctcaa
agttcatgtgcgcttctattgaaaagctactcatcaacagccagtgatgtattgagcgga
tatcagactataattgttccagttatatttatatcaagattcgaggatgacaagaatgtt
tctactctatatgaggaattgtgggaggaaaatatgagtagtgaacgagttactcttcag
ttgtatctaaacgaaatcgttactcttgtggacgaaggagttacatcatcatcatgggca
agtaagaaaaaggccagcctggcaattagtaagctttgtgaagtcttaggtgatacagta
tcaccacaccaccatgttttgcttgcatctcttatgaaggaaattcctggtcgtttatgg
gagggaaaggaagctttattatgtgctttgtcagctctttgtgaatcctgccatatagca
atcgtcaattcggatcctgcaacatcaaatgaaattttaagcttggtatcttctgcatgt
aaaaagaaagacaagaaatatagggagacagctttttgctgtctaaagcagattatcaag
gcattcagtaatccagacttcttcaatattgtctttccaatgttatttgagatgtgcgat
tcaacaattgtctactcaagccaagtaccttctagcaataacattgtcaaagaagaaata
gatgaaaagaaagatgttgtcccacatgataaagttatggactgcattaattcttgcatc
tgtgtggctcgtgtaactgacattattgaacagtgtcagaacttgcttcatgtgctttca
atctcactggctccaagtgttgtttggacagttaaaatgtcggtcttttcaactataaaa
gaattatgctccagactccgtagcgatacagttgaaatttcgcaacatgttaggattgca
gctctagttcacgagctatttctatcaatttctcccaaggtggttgactgcatctcgact
gttaagattggacaggtacatgtcacagcctcagagtgtctcctagaaattaccttgttg
cttgaatcacttccaacatttcagaggatagaaattgggtttaagggtgagcttcaccat
cagtatgaaatagaaaaaaatcaagaggccaagtcgatattgaagaaatgcatggacatc
attcaaagcttggaagagaaaagtctacagaactgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
