Diuraphis noxia (Russian wheat aphid): 107161804
Help
Entry
107161804 CDS
T04900
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein Nup98-Nup96
KO
K14297
nuclear pore complex protein Nup98-Nup96
Organism
dnx
Diuraphis noxia (Russian wheat aphid)
Pathway
dnx03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dnx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
107161804
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dnx03019
]
107161804
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
dnx03036
]
107161804
Messenger RNA biogenesis [BR:
dnx03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
107161804
Chromosome and associated proteins [BR:
dnx03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
107161804
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nup96
Nucleoporin2
Nup98_GLEBS
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107161804
NCBI-ProteinID:
XP_015363869
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1787 aa
AA seq
DB search
MFGSGAGAFSGGAGNTSGFGQSAFGKPTAPAVFGQTNTSLFNQTTQPNTGLFGSTAAAPA
FGQTPTAQPTFGGFNTGGTSLFGTPTATSASTGGLFGQQNASMGGNTGGGLFGSSNPNTS
FGQSKPVGTGFSFGTPVAQPTGNIFGTPQSNTTGTGMFGASTTGTFGATSGFGATSAGGT
TIKFNPVTGTDTMVRNGVNQTINTRHQSITVMKEYESKIFEELRFEDYSANRKVGQQGAV
GGGIFGSPKTLFSSTATTSTGLFGANDNKPLFGATSTTPALGGFGNTSTSNVFGAQNSIF
GKSQQTTPAFGTQPSTQPFGMNTTQPNIFGSNTAQTAKPFGVAAPQTNIFGSTAPSTFGT
QTTGFGQTGFGQPAQNNLFGQNKPAFGLGSTQTTTGFGFGTNTSTSTNGIFGSKPANTGF
QMTTPAFGTNNAFGATSTSQPATGGLFGSNSFNKAPTTSLFNQPSNQQTGVFNNAAKPGG
LFGQGTQGTGLFGSSNTNSFGTSGTSFFGNNQQTSGIGLFGNTNNVQLSTNQASQSNQMQ
LQLDTLKAMPYGDSPLFKRFYKDVSKVDDSSLVRSQSVSLEKFGSYKVSPIPTPKRIPQI
RRNFPQFNRKSLFDGLEESPPTMKCLDKVSDNSLLLNISSPRSGCKKLNLKKDINDCSKN
NGNSMIMHTKPLAKLELYFSNKQSSPEDKSHSVNLSLTEENNTISQLQSNKQINLNTSKE
TEANESSRNNVIDTVIENQEPSIDPNSPEAEDHPTGIKLRRVGYYTIPPMNELAELVDDD
GSCFVDNFTIGRYDFGNVFFPDRFNVAGLDLDTIVHIRHREIIIYQDDELKPPLGEGLNR
KAVVTLDRVWPNDKTTKQPITNPDRIAATNFVVKLQRACAKLNTQFVDYRPDTGSWVFNV
EHFSKYALVDSDDDDDENNVERNIEPKTLPKPTLQKPKTIKSTENVSPKQNVMKPLLDLS
VGLDRAQLPHQYLLKPNFQLSVVNEPTNDSHMHYYDINKENSINVTAQLSQHMNLQTSKI
QCMKASFNDIFYNELDLMEQDDDTYGQKDKFEDKLEKILETIPECLISPKIQDSISKSKS
IIAPVDNQASPKFFIPKQKTKVIQAAELLKPISTAPLQAQRFNLLYNSSVRLPFEVELNN
TCESSKLALLNNLSMKVPWSGNLTFITLNTKSKGSCLPKKGLDISYLSTELSGRGNNDYT
STIVQKLQIITPNQTETFTELLTEHLEICMMNSNCDAKNGNIPYFYPKFGVDALHSHCYL
LSHFSELPEEEHYAHVWELMKALWGDPENLYTKDCPQEHVYNMARXQAVSDWLENILEKT
VNSKNVEENVSRKILNLVSVHKIMEASDLAISNNEFILAILLSQLGSENSVRCCIQRQLW
QWFNSKADLFIDIDHLKLYTMISGQPLFDSNQGIINVCENLNWIRAFAIHMWYILPSTST
IGDVLDAYQNSFESDDSYAFKPYKTYDGIIDIDDKFATYDVCYHLLKLYTDSAYQMDKII
NPFTHTRDPLDYNFSWLLFNTLQSLGYTQMSEIYANQLHINFASQLVSHGQWQWAVFVLM
HIKEEQLRESLVEEFIGRNVELPVGDINEIKLSEKEAFVVEKLKVKEVILFNAKAILAMT
QKKYLEATFCYLKAEQWQEAHNILANHLFANYLLQKNGQKTLKHLLGWLIDGSKINGSIP
TTLQDSLTILEYLNLNDNLSKMSDEKSITHIALLCEKVSCLPDTTNEERMIKTELSSVIT
WQIGQLISKIDPKNLEILDSLVLPLYKLSMTDDYTTEELLKTLCKYI
NT seq
5364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggttctggagcaggtgcattttccggtggggccggaaacacgtcaggatttggt
cagtcggcatttggtaagcctacagcacctgcagtatttggtcaaacaaatacatcacta
tttaatcaaactacacagcctaatacgggattatttggatctactgctgctgcgcctgca
tttggtcagacaccaaccgctcaaccaacatttggaggttttaatactggtggaacttca
ctatttggaactcctacagcaacatcggcatcaactggaggtttatttggccagcaaaat
gcttcaatgggtggaaatactggaggtggattatttggttctagtaatcctaatacatca
ttcggacaatcaaaaccagttggaacaggtttttcttttggaacaccagttgctcagcca
acgggtaatatatttggtacacctcaatcaaacactacaggcactggaatgtttggcgct
tctactactggaacctttggtgctacatcaggatttggagcaacatctgcaggcggtaca
accataaaattcaatcctgtgactggtactgatacaatggtcagaaatggtgtaaatcaa
acaattaatactagacatcaatcaataactgttatgaaagaatatgaatcaaaaatattt
gaggaacttagatttgaagattattctgcaaaccgtaaagttggacaacagggtgctgtt
ggtggtggcatctttggatctcctaaaactttatttagttctacagcaacaacaagtaca
ggtttattcggagcaaatgataataaaccactttttggcgcaacctcgactacacctgca
cttggaggatttggaaatactagtacttccaatgtttttggtgcacaaaatagcattttt
gggaaatctcaacaaacaacaccagcatttggtactcaaccgtcaactcaaccttttggt
atgaatacaactcaaccaaatatctttggatcaaatacagctcaaacagctaaaccattt
ggagttgctgctcctcagacaaatatatttggaagtactgcaccttcaacttttggtact
caaactactggatttggtcaaactggattcggacaacctgctcagaacaatctatttggt
cagaataaaccagcatttggtcttggatcaacacaaacaacaacaggttttggttttgga
actaatacatctactagtacaaacggtatttttggtagtaaacctgctaatactggtttt
caaatgactactccagcttttggtacaaacaatgcttttggtgctacttctacatctcaa
ccagctactggtggcttatttggttctaattcttttaataaggcaccaactacttcatta
tttaaccaaccttcaaatcaacaaacaggtgtatttaataatgctgctaaaccaggaggg
ttatttggccaaggaacacaaggaactggactttttggatcatctaatactaatagtttt
ggtacaagtggaacatcgttttttgggaataaccaacaaactagtggaattgggcttttt
ggaaataccaacaatgttcagttatctacaaatcaggcatcacaaagtaatcaaatgcaa
ttacaactagatacattaaaagcaatgccatatggagattcaccactgttcaaaagattt
tataaggacgtatcaaaagtagatgattcatctcttgtgcgrtcccagagtgtatcactt
gagaagtttggtagctataaagtttctccaataccaacaccaaagagaatacctcaaatt
cgtagaaatttccctcaattcaatcgtaaatccttatttgatggacttgaagaatctcca
ccaacaatgaaatgtctagataaagttagtgataattcactgctacttaatatttcttct
ccgagatcaggctgtaagaaattgaatttaaaaaaagacattaatgactgtagtaaaaac
aatggaaatagtatgattatgcatacaaaaccacttgcaaaattagaactatatttttct
aataaacaaagctctccagaggataaatcacattctgttaatttatctttaactgaagaa
aataacacaatttctcaattacaaagcaataaacaaatcaatttgaatacttcaaaagaa
acagaagccaatgaatcttctcgaaataatgttattgatactgtcattgagaaccaagaa
ccttcaattgatcccaattctcctgaagcagaggaccatcctaccgggataaagttaaga
cgtgttggatattatactattccacctatgaatgaattggcagaattagtagatgatgat
ggatcatgttttgtggataatttcacaataggacgctatgactttggaaatgtttttttc
cccgatcgttttaatgttgcaggtctagacttagatactattgtgcacatacgacataga
gaaattataatttatcaagatgatgaactcaaaccccctttaggggaagggttaaataga
aaggctgttgttactttggatagagtctggcctaatgataagacgacaaagcaaccaata
actaaccctgatcgtattgcagctacaaattttgttgttaaacttcaaagggcatgtgcc
aaactaaacactcaattcgttgattatcgtccggacacgggatcttgggtttttaatgtt
gaacatttctccaagtatgctcttgtagattctgatgatgacgatgatgaaaataatgtg
gaacgtaatattgaacctaaaactcttcctaaaccaacattacaaaaaccaaaaactata
aaatcaactgaaaacgttagtccaaaacaaaatgttatgaaaccattgttagatctttct
gttggtcttgatagagctcaattaccacatcagtatttattaaaaccaaactttcaacta
tctgttgttaatgaaccaactaatgattcacacatgcattattacgacatcaataaagaa
aatagcattaatgtgactgctcagctatcacaacatatgaatttacagacatcaaagata
caatgcatgaaagcttcatttaatgatattttttataatgaattagatttgatggaacaa
gatgatgatacatatggacaaaaagataaatttgaagataagttggaaaaaattttggaa
actattcctgaatgtttaatcagccctaaaattcaagatagtatttccaagtcaaaatca
ataattgcaccagtagataatcaagcgtctccaaagtttttcatcccaaaacaaaaaact
aaagttattcaagctgcagaactattgaaacctatttcaactgctccacttcaagctcaa
cggttcaatttgctatacaattctagtgttcggttaccatttgaagtagaacttaataat
acatgcgaatctagtaaattagcattgttgaataatttatcaatgaaagttccttggtct
ggcaatttaacatttattacactcaatacaaaatctaaaggaagttgtttaccaaaaaag
ggattggacattagttatttatcaacagagttgtctgggcgtggaaataatgattatact
tctactattgtacagaagttacaaattattacccctaaccaaacagagacattcactgaa
ttattgactgaacatttggaaatttgtatgatgaatagtaattgtgatgctaaaaatggt
aacattccatatttttatccaaaatttggagttgatgcattacattctcattgttacytg
ctgtcccacttttctgaacttcccgaagaagaacattatgctcatgtatgggagctgatg
aaagcattatggggcgatccagaaaatctttatactaaagactgtcctcaagaacatgta
tacaacatggctagacktcaggcggtgtctgattggttagaaaatatattagaaaagaca
gtgaattctaaaaatgttgaagagaatgtctctcgaaaaatattaaacctagtgtcagtt
cataaaattatggaagcttctgatttagcaatttccaataacgaatttattttagcaata
ctattatcacagttaggaagtgaaaattctgtcagatgttgtattcaacgacaactttgg
caatggttcaacagcaaagctgatctgtttatagatattgatcacctaaaattgtacact
atgatttcgggtcaacctttatttgattccaatcaaggtataataaacgtctgtgaaaat
ttaaattggatcagagcttttgctatacacatgtggtacatactaccttcaaccagtacc
attggagatgtattagatgcttatcaaaattcatttgaaagtgacgactcatatgctttc
aaaccatataagacatatgatggcattattgatattgatgataaatttgctacttatgat
gtctgttaccatttattgaaactttacaccgattcagcataccaaatggacaaaattata
aatccttttactcatacacgagatccattggattataattttagttggcttttgttcaac
acgttacaatcccttggctacactcaaatgtctgaaatatatgccaatcaattacatata
aattttgcttcacagttggtatcacatggacagtggcaatgggcagtatttgttcttatg
catataaaagaagaacaattgagagaaagtttagttgaagaatttattggaagaaatgtt
gaactacctgttggcgatatcaatgaaataaagctttctgagaaagaagcttttgtagta
gaaaagttaaaagttaaagaagtgatactatttaatgcaaaggctattttagctatgaca
caaaaaaaatatttggaggccacattttgttacttaaaagccgaacagtggcaagaagca
cataacatacttgcaaatcacttatttgccaattatttacttcaaaaaaatggccaaaaa
acattaaaacatttgctaggttggttaatagatggttccaagataaatgggtcaatacct
acaaccttgcaagatagtttaactattttagaatatttaaatttaaatgataatttaagc
aaaatgtctgatgaaaaatcaataacacatattgcattattatgtgaaaaagtatcatgt
ttgcctgatactacaaatgaagaaaggatgataaaaactgaattgtctagtgttataact
tggcaaattggacaactgatatcaaaaattgatccaaaaaatcttgagattttggattcy
ttagttctacctttatataagttatctatgactgatgattatacaacagaagaattactc
aaaaccttatgcaaatatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system