Candidatus Ecksteinia adelgidicola: F7X37_00045
Help
Entry
F7X37_00045 CDS
T08924
Symbol
rnr
Name
(GenBank) Ribonuclease R
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
eag
Candidatus Ecksteinia adelgidicola
Pathway
eag03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
F7X37_00045 (rnr)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
eag03019
]
F7X37_00045 (rnr)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
eag03016
]
F7X37_00045 (rnr)
Enzymes [BR:
eag01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
F7X37_00045 (rnr)
Messenger RNA biogenesis [BR:
eag03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
F7X37_00045 (rnr)
Transfer RNA biogenesis [BR:
eag03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
F7X37_00045 (rnr)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
CSD2
OB_RNB
S1
HTH_12
Rho_RNA_bind
OB_Dis3
TFIIE_beta
SOGA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG79106
LinkDB
All DBs
Position
complement(94043..96256)
Genome browser
AA seq
737 aa
AA seq
DB search
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INFTLVSNSLNSLIKKR
NT seq
2214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
