Ehrlichia chaffeensis Saint Vincent: ECHSTV_0612
Help
Entry
ECHSTV_0612 CDS
T03348
Name
(GenBank) trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein
Organism
echv
Ehrlichia chaffeensis Saint Vincent
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TrbL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHX08967
LinkDB
All DBs
Position
complement(700088..708910)
Genome browser
AA seq
2940 aa
AA seq
DB search
MCNFIKKGFIKLLLLLVITACESNQHPVPRCVPADVFTETRTASVSAYFDSRSEDFIADN
KSLGNIVKNDQVVRWKYTGYVTDGRPIVLKAEGMWTAWVNDVSAEKSVSFGDEDSEHYNQ
ILSVERICGPYNKIEKTFVPDGHSECKVSCELITGVKDDLERGAYGPPCWFKNGYGAYLL
FKRPDDPEPNETLDHMRYPVSPVMHIGYKPLELAGSDVFSTKNKPIMNSLCQKVQLEPGW
KIYVKILDKYYYDNVGGYAITFLEGVKTEKQFSVFEWVRKQVRGELDKAGEQVFRHLVGN
PIFKNFIFSVLTLFLVFGALAYIFGMVQSPFGDIIIRILKISLVILLISPSSWEFFYNHL
LALFIHGIDQIIALINSHTGSYNPKEPFSFLDDMIVNKIFSPVIWKIKIRALIIADFSSI
FAVCVIIIAVFIYIALCMYGCVIYLTAFVGITFLIGLFPLFLLGILFSQFKSLFDGWLTQ
CVSFAMQAILMFTLISLFGALIMNYYYRIFGFTTCYNEWLKVKICVLGKIGCIVDQSIFG
WTPGQTYDPKVIGLTTDFNLNDRKSSGSARYKFTGGGAYIDVPPDRKHKDFRYVDYPFLD
PDAKTDGNPFGVTVSQDSPFRQLSYYINALLSSNKKYVAARLVKDIEDELDVLEKNGTIS
LNSKNKVLQIIQQRRTKDNSEKKSELEKYKDEDFKSQIIDSIIADVIGSAAQERTPQEEL
NKQYDYWLILRVRAGYLIFWTEVGSLLLAALLIWQMRAFVQSVAVSLAGGNMMSQTIASM
YEGGFMKIFSGIPVVGVVFQKIDQGIDGLKFAVGNYITAVARMPLNALKSIPYLGAAVKF
TAGVTGALTSSYNEYDRSFSNNFKRLNYARAFIGAHLGFSPLDALKYLGGHVAGKMLGNR
DGGLIHNAIEDRKAALDSLKAHILGPEKHRPSPYIPNKKKETEDDDARNPFSKETVGNKS
GTVSPDEYKGGDKNHIIREGLRSEAGSALSDDYKDGDKSHIIREGLRSEAGSALLDGYKG
GNGSDIIKGGLPTEGSTLLDRYGNVCVSEGNIEHALEVREQLKTMLDNAENDTALQTIQY
DCDRLDNALHEYLGDKFDDVTQGYASSRDPMGHPQDLITEDLSKISASSDFRDLNAIDLG
TQVQVGSDIGSDVLQQGSADGNRSEVEVSMDISKRDALLEQMELKGMEAASGTEAQLYDS
AELSTPLDVTSSINNVSSEVSQQDLASNGEIEVSLDKDLELKNLDVVSGDIPDVEVTSSS
DDVTQIYDSAQDRDSCLDIISSADDASSEVSQQDLASNGEIEVSLDKDLELKNLDVVSGD
IPDVEVTSSSDDVTQVYDSTEDRDSCLDIVSSADDTSSEISQQDLEGNDGYEIDKDMGSS
NESMLDEIPGGFADVIQDCSDASLSTPLGMSARDDTDATDTVEDPKENVLPQDVDLEDLD
TTHSTNDIADFSGESSLFDATSESDSAAFVGEQSIDFSTEEGSDLPSEVVAQHDVDSQDS
SVSVSDMAVADMEQGTEDSKYTDVDGLSDSVLDLGYLEGNVDNPDIEPEHDMSQQYSTET
EELSDMLSDDVIEPEGVSETDTQVDSEESQDDSGTAGQVEDERVHDEVPYDTQDSTSGDK
GDIAEHDDKDGVVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEPEGVSETDTQVDSEES
QGDSSASDQVEDERVHDEVPYDTQDSTSGDKGDIVEHEDKDSVVEHEGTVDQSIDDTHEE
EGKFTEGIVSESVTEPEGVSETDTQVDSEESQGDSSASGQVEDERVHDEVPYDTQDSTSG
DKDDIVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVAEPEGVSETDTQVDSEESQGDSSAS
GQVEDERVHDEVPYDTQDSTSGDKDDIVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVAEP
EGVSETDTQVDSEESQGDSSASGQVEDERVHDEVPYDSQDDTQDSTSEDEGDVVEHGDKG
DIVAHEDKDSVVEHEGTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVDSEESQ
GDSSASDQVEDERVHDEVPYDIQDSTSGDKGDIAEHGDKDDIVEHEDTVDQSIDDTHEEE
GKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVDSEESQGDSSASDQVEDERVHDEVPYDIQDSTSGD
KGDIAEHGDKDDIVEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVDSEE
SQGDSSASDQVEDDKVHDEVPYDSQDDVEHGDKGDIVAHEDKDSVVEHEGTVDQSIDDTH
EEEGKFTEGIVSESVAEPEGVSDVDTQVDSEESQGDSSASDQVEDDKVHDEVPYDSQDDT
QDSTSEDEGDVVEHGDKGDIVEHEGTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVAEPEEVSEAD
TQVDSEESQGDSSASDQVEDERVHDEVPYDAQDSTSGDKGDIAEHGDKDDIVEHDDKGGV
VEHEDTVDQSIDDTHEEEGKFTEGIVSESVTEPEGVSETDTQVDSEESQGDSSASDQVED
ERVHDEVPYDSQDDTQDSASEDEGDVVEHGDKGDIVEHEDKDSVVEHEGTVDQSIDDTYE
EEGKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVNNEESQGDSSASDQVEDERVHDEVPYDAQDSTS
GDKGDIAEHGDKDDIVEHDDKDDIVEHDDKDDIVEHDDKDGVVEHEDTVDQSIDDTHEEE
GKFTEGIVSESVTEPEEVSEADTQVDETLQDLEHEDLKEGADDISDSETDENSSGNSDSV
SDVEGLASLASIGEESTITQNVKTQSVQSSAILSMKDRDGVLDNKGIPSDQLDVKDTEKK
KKESSKSKVENSDKKAKSTKATVTPKSLKKTFKVILSQCTQELSNKLSEAFDKLFIDPQS
GKQKRRLSKQDIALMIEQLKAMIESLKDRKAQVTDPDEMKAIEESIKQAESTIQNLLNQE
NT seq
8823 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgtaattttattaaaaagggttttataaaattattattacttttggtaataactgca
tgtgaatctaatcaacatccagttcctagatgtgtaccagctgatgtctttactgaaact
agaacagcttctgtttcagcatattttgattcacgatcagaagattttattgctgataat
aagtcattgggaaatattgtaaaaaatgatcaagtagtacggtggaaatatactggatat
gtgacagatggtcgtccaattgtattaaaagctgaggggatgtggactgcatgggtcaat
gatgttagtgctgaaaaaagtgtaagttttggtgatgaagattcggaacattataatcaa
atattgtctgttgagagaatttgtgggccttataataaaatagaaaagacttttgttcct
gatggtcatagtgaatgtaaggtatcatgtgaactaatcactggagttaaagatgacttg
gaaagaggggcatatggacctccttgttggttcaaaaatggatatggtgcatatttatta
tttaagagaccagatgaccctgaaccaaatgaaacgttggatcatatgagatatccggtg
tctcctgtaatgcatataggatacaagccattagaattggctggtagtgatgttttttct
actaaaaataaaccaattatgaattccctttgtcaaaaggtgcaattggagccagggtgg
aagatatatgtaaaaatattagataagtattattatgataatgttgggggatatgcaatc
acattccttgaaggtgtaaaaacagaaaaacaattttctgtttttgaatgggttcgtaaa
caggtaagaggtgaactagataaagcaggtgaacaagtttttagacatctagttggaaac
ccgatatttaaaaattttatttttagtgtgttaactttgtttttagtatttggggcttta
gcttatatttttggtatggtacagagcccatttggtgatattattattagaatattaaaa
atatcgttagtaatattattgatttctccaagtagttgggagttcttttataaccattta
cttgctttatttattcatggtatagatcagattattgcgctaattaatagtcatacaggt
tcttataatcctaaagaacctttttcttttctggatgacatgatagtaaataaaatattt
tctccagttatttggaagataaagatcagagcattaatcatcgctgatttttcttcaata
tttgctgtatgtgtaattattattgccgtattcatctacattgctttatgtatgtatgga
tgtgttatatatctaacagcatttgttggtattacatttttgattgggttattcccatta
tttttgttaggtattcttttttctcaatttaagagcttatttgatggttggttaacacaa
tgtgtaagttttgctatgcaggcaatattaatgttcactctgatttccctgtttggtgca
cttattatgaattattattaccgtatttttgggtttacgacatgttataatgagtggctg
aaggtaaagatatgtgtattaggtaaaattggatgtatagttgatcaaagtatttttgga
tggactccagggcaaacttatgatccaaaagttattggattgacaacagattttaatctt
aatgatcgtaagtcttctggtagtgcaagatataaatttactggtggaggtgcatatatt
gatgttcctcctgatcgtaagcataaggattttagatacgtagattatccttttcttgat
ccagatgctaaaactgatgggaatccgtttggtgtgactgtatctcaagatagtccgttt
agacagttatcttattatattaatgcattactttcttctaataaaaaatatgtagctgca
aggttggtaaaggatatagaagatgagttagatgttttagaaaaaaacggtactataagc
ttgaacagtaaaaataaagttttacaaattatacagcagagaagaactaaagataattct
gagaaaaaaagtgaattagagaaatataaagatgaggattttaaatctcaaataattgat
agtattattgctgatgttatagggagtgctgctcaagaacgtactcctcaggaagaattg
aataagcaatacgattattggttaatcttaagggttagggctggatatttaatattctgg
acagaagttggttctttattattagctgcgttattaatatggcagatgcgtgcgtttgtt
caaagtgtagcagtatctctagctggcggtaatatgatgtctcaaactattgctagtatg
tatgaaggtggattcatgaagattttttcaggaattccagttgtaggtgttgtgttccaa
aagattgatcaaggtatagatggcttaaaatttgcggtaggtaattacattactgcagtt
gctcgtatgcctttaaatgcgttaaagagtattccttatctaggtgcagctgttaaattt
actgctggtgttactggtgcattgacttcttcatataatgaatatgataggagttttagt
aataactttaagcggttaaattatgctcgagcttttataggtgctcatttaggattttct
ccgttggatgcattgaaatatttaggtggtcatgttgctggcaaaatgcttggtaatagg
gatggtggattaattcacaatgcaattgaagatcgtaaagctgctttggatagtttgaaa
gcacatatattaggacctgagaaacatagaccaagcccttatattcctaataaaaagaaa
gaaacagaggatgatgatgcaaggaatcctttttctaaagaaacagtaggtaacaaaagt
ggtactgtatcaccagatgaatataaaggtggtgataagaatcatattattagggaagga
ttacgtagtgaagctggtagtgcattatcagatgattataaagatggtgataagagtcat
attattagggaaggattacgtagtgaagctggtagtgcattattagatggatataaaggt
ggtaatgggagtgatattattaaaggaggattacctactgaaggtagtacattattggat
agatatgggaatgtatgtgtaagtgaagggaatatagagcatgcacttgaagtaagagag
cagcttaaaacaatgcttgataatgctgaaaatgacactgcgttgcaaactattcagtat
gattgtgatagacttgataatgctttacatgaatatttaggtgataagtttgatgatgtt
acacagggttacgctagttctcgtgatccaatgggtcatcctcaagatttaattactgaa
gatttatctaaaattagtgcttcctcagattttcgagatctgaatgctatagatttaggt
acacaggtgcaggtaggtagtgatataggttcagatgtattacaacagggttcggcagat
ggtaatcgaagtgaagttgaagtatcaatggatatatcgaaacgtgatgcgttgttggag
caaatggaattaaaaggtatggaagcagcatcaggtactgaggcacagctatatgatagt
gctgagttaagtactcctttagatgttacatcttctattaataatgtgtcttcagaagta
tcacaacaagatttagcgagtaatggtgaaattgaagtatctctagataaagatctggaa
ttgaagaatttagatgtggtatcaggtgatattccagatgttgaagttacctcaagttca
gatgatgtgacacaaatatatgatagtgctcaagatagagattcttgtttagatattata
tcttctgcggatgatgcaagttcagaagtatcacaacaagatttagcgagtaatggtgaa
attgaagtatctctagataaagatctggaattgaagaatttagatgtggtatcaggtgat
attccagatgttgaagttacctcaagttcagatgatgtgacacaagtatatgatagtacc
gaagatagagattcttgtttggatattgtatcttctgcagatgatacaagttcagaaata
tcacaacaagatttagaaggtaatgatggatatgaaattgataaggatatgggatcctca
aacgaatcaatgctagatgaaattccaggaggatttgctgatgttatacaagattgtagt
gatgctagtttaagtactcctttaggtatgtctgcaagagatgatactgatgctacagat
actgtagaggatccaaaagaaaatgtgttaccgcaagatgtagatttagaagatttggac
acaactcattctacgaatgatattgcagattttagtggtgaaagttcattatttgatgct
acttcggagtcagatagtgctgcatttgtaggtgagcaaagcattgatttcagtaccgag
gaagggagtgatttaccttcggaagttgtagcgcagcatgatgtagattcacaagattca
tcagtatcagtaagtgatatggctgttgcggatatggaacaaggaacagaggattctaaa
tacaccgatgttgatggtttgagtgatagtgttttagatttaggttatttagaaggtaat
gtagataatcctgatattgagcctgaacatgatatgtcacagcaatatagtacagagact
gaagaactcagtgatatgctatctgatgatgtgatagaaccagaaggagtaagtgaaact
gatactcaggttgatagtgaagaatctcaagatgacagtggtactgcaggtcaagttgag
gatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatactcaagatagtacatcaggagataaa
ggtgatattgcagaacatgatgataaagatggtgttgtagaacatgaggatactgtagat
caaagtattgacgatactcatgaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaa
agtgtgacagaaccagaaggagtaagtgaaactgatactcaggttgatagtgaagaatct
caaggtgatagtagtgcttcggatcaagttgaagatgaaagagtacatgatgaagtacct
tatgatactcaagatagtacatcaggagataaaggtgatattgtagagcatgaagataaa
gatagtgttgtagaacatgagggtactgtagatcaaagtattgatgatactcatgaagaa
gaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtgacagaaccagaaggagtaagt
gaaactgatactcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcaggtcaa
gttgaagatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatactcaagatagtacatcagga
gataaagatgatattgtagagcatgaggatactgtagatcaaagtattgacgatactcat
gaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtggcagaaccagaagga
gtaagtgaaactgatactcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttca
ggtcaagttgaagatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatactcaagatagtaca
tcaggagataaagatgatattgtagagcatgaggatactgtagatcaaagtattgacgat
actcatgaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtggcagaacca
gaaggagtaagtgaaactgatactcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagt
gcttcaggtcaagttgaagatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatagtcaagat
gatactcaagatagtacatcagaagatgaaggtgatgtcgtagaacatggtgataaaggt
gatattgtagcgcatgaagataaagatagtgttgtagaacatgagggtactgtagatcaa
agtattgacgatactcatgaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagt
gtgacagaaccagaagaagtaagtgaagctgatactcaggttgatagtgaagaatctcaa
ggtgatagtagtgcttcggatcaagttgaggatgaaagagtacatgatgaagtaccttat
gatattcaagatagtacatcaggagataaaggtgatattgcagaacatggtgataaagat
gatattgtagagcatgaggatactgtagatcaaagtattgacgatactcatgaagaagaa
ggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtgacagaaccagaagaagtaagtgaa
gctgatactcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcggatcaagtt
gaggatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatattcaagatagtacatcaggagat
aaaggtgatattgcagaacatggtgataaagatgatattgtagagcatgaggatactgta
gatcaaagtattgacgatactcatgaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatct
gaaagtgtgacagaaccagaagaagtaagtgaagctgatactcaggttgatagtgaagaa
tctcaaggtgatagtagtgcttcggatcaagttgaagatgacaaggtacatgatgaagta
ccttatgatagtcaagatgacgtagaacatggtgataaaggtgatattgtagcgcatgaa
gataaagatagtgttgtagaacatgagggtactgtagatcaaagtattgacgatactcat
gaagaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtggcagaaccagaagga
gtaagtgacgttgatactcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcg
gatcaagttgaagatgacaaggtacatgatgaagtaccttatgatagtcaagatgatact
caagatagtacatcagaagatgaaggtgatgtcgtagaacatggtgataaaggtgatatt
gtagaacatgagggtactgtagatcaaagtattgacgatactcatgaagaagaaggtaag
tttactgaaggaattgtatctgaaagtgtggcagaaccagaagaagtaagtgaagctgat
actcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcggatcaagttgaggat
gaaagagtacatgatgaagtaccttatgatgctcaagatagtacatcaggagataaaggt
gatattgcagaacatggtgataaagatgatattgtagagcatgatgataaaggtggtgtt
gtagaacatgaggatactgtagatcaaagtattgacgatactcatgaagaagaaggtaag
tttactgaaggaattgtatctgaaagtgtgacagaaccagaaggagtaagtgaaactgat
actcaggttgatagtgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcggatcaagttgaagat
gaaagagtacatgatgaagtaccttatgatagtcaagatgatactcaagatagtgcatca
gaagatgaaggtgatgtcgtagaacatggtgataaaggtgatattgtagagcatgaagat
aaagatagtgttgtagaacatgagggtactgtagatcaaagtattgacgatacttatgaa
gaagaaggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtgacagaaccagaagaagta
agtgaagctgacactcaggttaataatgaagaatctcaaggtgatagtagtgcttcggat
caagttgaggatgaaagagtacatgatgaagtaccttatgatgctcaagatagtacatca
ggagataaaggtgatattgcagaacatggtgataaagatgatattgtagagcatgatgat
aaagatgatattgtagagcatgatgataaagatgatattgtagagcatgatgataaagat
ggtgttgtggaacatgaggatactgtagatcaaagtattgacgatactcatgaagaagaa
ggtaagtttactgaaggaattgtatctgaaagtgtgacagaaccggaggaagtaagtgaa
gctgatactcaggttgatgaaacacttcaggatttagaacatgaagatcttaaagagggt
gctgatgatatatctgatagtgaaacagatgaaaatagttcaggaaatagtgatagtgta
tccgatgttgaagggttagctagtttagcatctattggtgaagaaagtacgataactcaa
aatgtaaaaacacaatctgtacagtctagtgctatattatcgatgaaagatagggacgga
gttctagataataagggtattccaagtgatcaattggatgttaaagatacagaaaagaag
aagaaagaatctagcaaaagcaaagttgagaattctgataaaaaagcaaagtcaactaaa
gcaactgtgactccaaagtctttaaagaaaacttttaaagtaatattgagtcaatgtacg
caagaattatcaaataaattatctgaagcttttgataagttatttatagatcctcaaagt
ggtaaacaaaaacgtagattatcaaaacaagatattgcattaatgatagagcagcttaag
gcaatgatagaatcattaaaggatagaaaagcacaggtgacagatcctgatgaaatgaaa
gcgatagaagaaagtattaaacaagcagaatctacaattcagaatttattgaatcaggaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
