Elizabethkingia anophelis JM-87: BBD30_09865
Help
Entry
BBD30_09865 CDS
T04743
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
een
Elizabethkingia anophelis JM-87
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
een00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
een02000
]
BBD30_09865
Transporters [BR:
een02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BBD30_09865
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQW94473
UniProt:
A0A1T3EQU8
LinkDB
All DBs
Position
2160993..2163827
Genome browser
AA seq
944 aa
AA seq
DB search
MNKKVLQVSCLIAAFYFGADLHAQTKKNDTVTKEKAIEEVVMIGYGSRKKVDNTTSISSI
NSEEVNRTKVLNPTQAIQGKAAGVQVTASDMPGSTPTILIRGLGTVLGGRTPLYVVDGMF
ADNINNINANDILTYDILKDAAALAIYGNRAANGVIIITTKTGKGKLSISYDGFVGVRTP
LKEVKMANASEFARYNNIALGKNTFSENQPTNTNWFDKITRTGMYNQHNLSISGSSENIK
YFFSLNNYDEKSILRGTDYNRSTIRTNNEFKLAKGITLSQNLSVAFTNMTPKPLGAFTTA
YKQSPMVPVYFPTGQFGSPFIGANGIVSEKGTSKFNDVGNPVSQLFYNDERNQNMLLQGG
LKLDIDIVKGLKFTSQFNGEYSNYKGYNFENSLATWLAADPSRVASGFDKGAPLNRLTNT
KRDYYNWALTNYLTFNKKFGVHDIEATVGTETAVKNGIDELIIVRKDMPLNNNYWNLSGT
DYVNNILNLNSVKYNKNTTNSYFARAQYKLLNRYLLSATVRRDGSSQFADGHKWGTFPSF
GAGWIISEESFMKNSGFNMLKLRGGWGRLGNQNVPLNSLPLTTGSGYNYGFNGVSVSNGI
TVNQGFDPNLTWEITEESSAGIDFGVLNNRLTGSIDVYNRLTKNIILNVVDPIASGKEKT
YPAHVGEVQNRGVELGLNWNDKIGQDFSYSIGANYSYNNNELTKITRTDISQISGGSLGN
GQWTKLFNSTTVGQALGSFYLWEFDGFDASGAMKYKDLNGNGVTGSADAGDRKYFNSYIP
KSTLGINLSMAYKNWDFAVNGYGAFGFKVYNGKKAQRITGSNIESSVVNDYWTSSNTGAA
NPAPVNNIPIASTYFLESGNFFRINNITLGYTIKGVTEHLKSIRLYVSAINPFVFQKYTG
YSSEISGYNPSDNKLEGDPYKLAGVELDSYPTLRSFVFGLNINF
NT seq
2835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaaagtgttacaggtttcgtgtctgatagcagccttttattttggcgcagat
ttacacgcacaaaccaaaaaaaatgacactgtaaccaaagaaaaagctattgaagaggta
gtaatgattggttatggtagtagaaagaaggtagataataccacgtcaattagttctatc
aacagtgaagaagttaacagaactaaagttttaaatccaacacaggcaatacaaggaaag
gctgcaggggttcaggtaactgcttctgatatgcccggatctacgcctacaatcttaatc
cgaggattaggaactgtgttaggggggcgtactccattgtatgttgtagatggaatgttc
gcagataatattaataatattaacgctaacgatatcttaacttatgatatccttaaagat
gctgctgcattagctatctatggtaacagagcagcaaacggagttattattattacgacc
aaaaccggaaaaggaaaattaagtattagctatgatggttttgtaggagtaaggactcct
ttgaaagaagttaagatggctaatgcatcagaatttgcaagatataataatattgcgttg
gggaagaataccttttctgagaatcagccaacaaatactaattggtttgataaaattaca
agaactggtatgtataatcagcataatttatcaatttctggttcatctgaaaatattaag
tattttttcagcttaaataattatgacgagaagtctattctaagaggcacagattataac
aggtctacgattcgtactaataatgaatttaagcttgcaaagggcattacattaagtcag
aatcttagtgttgcatttactaatatgacccctaaaccgttaggagctttcactacggca
tataagcaatctccaatggttccagtctattttcctactggtcaatttggatcacctttt
ataggcgctaatgggattgtatctgaaaaaggaacttccaagttcaatgatgttggtaac
ccggtaagccaacttttttataatgatgaacgcaatcagaatatgcttttgcagggaggg
cttaaattggatattgatattgtaaagggtttaaaatttacttcccagtttaatggagaa
tattccaattataaaggttataattttgaaaactctttagctacatggctggctgcagat
ccctcaagagtagcttcggggtttgataaaggggcaccgttaaataggcttacaaatacc
aaaagagattattataactgggctttgactaattatttaacatttaataaaaagtttgga
gtacatgatatagaagcaaccgtaggtacagaaactgctgtgaaaaacggtattgatgag
cttattatcgtaagaaaagatatgcctttgaataataattattggaatctatcgggtact
gattatgtaaataatatactcaatctaaactctgtaaagtataataaaaatactaccaac
tcttattttgcgcgggcacagtacaaattattaaatcgctatttactaagtgctacggta
agaagagatggttcatctcagtttgcagatggtcacaaatggggcacgttcccttcattt
ggtgcaggttggattatttcggaagaaagctttatgaaaaattcaggattcaatatgctt
aaacttagaggaggctggggtagattaggaaaccaaaatgtaccactaaattctttacca
ctaactacaggatcaggatataactatggtttcaatggggtttctgtgagtaatggtatt
actgttaatcagggatttgatcctaacttaacatgggaaattactgaagaatcatcggca
ggtatagatttcggagttttaaacaacagattaaccggatcaatagatgtttataaccgt
cttacaaaaaacattattcttaacgttgtagacccaatagcatcgggtaaagaaaaaact
tatccggcacatgttggtgaagtacaaaaccgaggggtagaattaggacttaactggaat
gataaaattggtcaggactttagttattcaataggagcaaattattcttataataataat
gaactcactaaaattacccgtacagatatttcacaaattagtggaggatcattaggaaat
gggcaatggacaaagcttttcaacagtactactgtaggacaggctcttggtagcttctac
ctttgggaatttgatggattcgatgctagtggtgcgatgaaatataaagatcttaatggt
aatggagtaacgggttctgctgatgctggagacaggaaatattttaattcttatatccca
aaatctactttaggaattaatctgtctatggcatataagaattgggattttgcagttaat
ggttacggggcttttggatttaaggtatataatggaaaaaaagcacagagaattactggg
tctaatatagaatcatcagtcgtaaatgactattggacttcttcgaatactggagctgcg
aaccctgcacctgttaataatattccaattgcttcaacatattttttagaatctgggaat
tttttcagaattaataatattacattgggatatactataaaaggagttacagaacatctg
aaatcaataagattatatgtgagtgcaataaatccttttgttttccaaaagtatacggga
tatagctctgaaatatcagggtataatcctagtgataacaaactagagggtgatccgtat
aaattggctggtgtagagttagattcttatccaacattaagatcttttgtatttggtcta
aatattaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
