Eucalyptus grandis (rose gum): 104425872
Help
Entry
104425872 CDS
T03547
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g15130
Organism
egr
Eucalyptus grandis (rose gum)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
PPR_long
E_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104425872
NCBI-ProteinID:
XP_010037018
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(43278429..43281313)
Genome browser
AA seq
600 aa
AA seq
DB search
MLGPSLRRARTSLSNHPIVAAVFPPTGFHRPAAAAAEEEEQLLSCELRKCARASDLRNGS
AIHARLLKGSAPFSLFLRNHVLNAYLKCGSLESGLQLFDEMPERNVVSWSALIAGFVQRG
RPEGAVALFRGMNREGTARPNEFTLVSALHACSCSGNRVXARQVYAHVVKLGFEGNVYLI
NAFSTALIRNGRLSEAMEVFEKCPIRDIVSWNAIMAGYLEFSYAEVPWFWGRMIREGEVK
PDHYTFSSVLTALAALSDIDMGLQVHAQLVKCGHGSEICVGNSLVGMYLKNLRLDEGFRA
FEEMCSKDVLSWTQMAAGCLLCGEPGKALEVFAEMRKAGVMANEFTLSTALNACANIASL
EEGVKIHGLRIKLGSNDDICALNALIDMYMKCGCVDAARGVFQSMKEHSVVSWTTMIIGC
AQNGQAREALKFFDEMIEEGAQPNQITFVCVLYACSQGGFVDEGWKYFSSMSQRHGISRG
EDHYACMVNLLGRNGQIKQAEGLILSMPFQPGVLIWQTLLGAALIHGDMETAKHASDHAL
KLDRKDPSTYVLLSNMFAGLRNWDGVGMMRELMGTSDVRKLPGSSWIGQEKSGPLALADG
NT seq
1803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcggcccatccttgcgtcgcgctcggacatccctttcgaaccatccgatcgttgct
gcggttttcccaccaaccggttttcatagaccagcggcggcggcggcggaggaggaagaa
cagcttctctcttgcgagctccgaaagtgcgctcgagcctccgatctgcgcaatgggagt
gcaattcacgcgcgcctcctcaaagggtcggcacccttttccctcttcctcaggaatcac
gtgctcaacgcctacctcaagtgcggcagcctcgagagcggcctccagctgttcgacgaa
atgcccgagcggaacgtggtgtcctggtcggccctcatcgcgggcttcgtgcagcggggc
cgccccgagggcgccgtcgccttgttccgcggcatgaaccgtgaggggaccgcgaggcct
aacgagttcacgctcgtgagcgcgctccatgcttgttcttgctcggggaatcgggttntg
gctcgccaagtttatgcgcatgttgtgaagttgggattcgagggcaatgtgtatttgatc
aatgcgttttcgacggccttgataaggaacggtcgattgtcggaggccatggaagttttc
gagaagtgcccgattagggatattgtgtcttggaatgctatcatggcaggatacttggag
ttttcttatgctgaagttccttggttttggggtcgtatgatccgtgaaggagaggtgaaa
cctgatcactataccttttcgagtgttctcacagcattggctgctctttcagatattgat
atgggattgcaggttcatgcgcagcttgttaagtgtggccatggaagtgaaatttgtgtg
gggaattctttggtaggtatgtacttgaaaaatcttagattagatgaaggatttagagct
tttgaagaaatgtgctcaaaggatgttttgtcgtggacccagatggctgctggttgtcta
ttgtgtggtgagccgggcaaagcgcttgaggtctttgcagaaatgcgaaaagcgggggtt
atggcaaatgaatttactctttcgacggcactaaatgcctgtgccaacattgcttctttg
gaagaaggggtgaaaattcatggtttaaggattaaactggggagcaatgatgacatctgt
gcattaaatgcactgattgatatgtacatgaaatgtggatgtgtggatgctgcacgaggt
gttttccaatccatgaaggagcattcagttgtgtcatggacaacgatgatcattggatgc
gcacaaaatggtcaagctagagaggctctcaagttctttgatgagatgattgaagaagga
gcgcagccaaatcaaatcacctttgtttgtgtgctctatgcttgctcccagggagggttt
gttgatgaagggtggaaatatttttcctctatgagtcagcgtcatggcatttcccgcgga
gaagatcactatgcatgtatggttaatctacttggacgaaatggacaaattaaacaagct
gagggattgattttgagcatgccatttcaaccaggggtgcttatctggcagacgctgctt
ggtgctgccctcattcatggggatatggaaactgcaaagcacgcttctgatcatgcattg
aaattggaccgaaaagacccttcgacttatgtgctgctatcaaatatgttcgctggtttg
aggaactgggatggggttgggatgatgagagagctaatggggacttctgatgtaaggaaa
ttgcctgggtccagttggatcggtcaggagaaaagtgggccgctagctttagctgatggc
tag
DBGET
integrated database retrieval system
