Elizabethkingia sp. M8: JCR23_14315
Help
Entry
JCR23_14315 CDS
T09429
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
eliz
Elizabethkingia sp. M8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eliz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
eliz02000
]
JCR23_14315
Transporters [BR:
eliz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JCR23_14315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQM26027
UniProt:
A0A7T7KGY3
LinkDB
All DBs
Position
3104757..3107591
Genome browser
AA seq
944 aa
AA seq
DB search
MNKKVLQVSCLIAAFYFGADLHAQTKKNDTVTKEKAIEEVVMIGYGSRKKVDNTTSISSI
NSEEVNRTKVLNPTQAIQGKAAGVQVTASDMPGSTPTILIRGLGTVLGGRTPLYVVDGMF
ADNINNINANDILTYDILKDAAALAIYGNRAANGVIIITTKTGKGKLSISYDGFVGVRTP
LKEVKMANASEFARYNNIALGKNTFSENQPTNTNWFDKITRTGMYNQHNLSISGSSENIK
YFFSLNNYDEKSILRGTDYNRSTIRTNNEFKLAKGITLSQNLSVAFTNMTPKPLGAFTTA
YKQSPMVPVYFPTGQFGSPFIGANGIVSEKGTSKFNDVGNPVSQLFYNDERNQNMLLQGG
LKLDIDIVKGLKFTSQFNGEYSNYKGYNFENSLATWLAADPSRVASGFDKGSPLNRLTNT
KRDYYNWALTNYLTFNKKFGIHDIEATVGTETAVKNGIDELIIVRKDMPLNNNYWNLSGT
DYVNNILNLNSVKYNKNTTNSYFARAQYKLLNRYLLSATVRRDGSSQFADGHKWGTFPSF
GAGWIISEESFMKNSGFNMLKLRGGWGRLGNQNVPLNSLPLTTGAGYNYGFNGISVSNGI
TVNQGFDPNLTWEITEESSAGIDFGVLNNRLTGSIDVYNRLTKNIILNVVDPIASGKEKT
YPAHVGEVQNRGVELGLNWNDKIGQDFSYSIGANYSYNNNELTKITRTDISQISGGSLGN
GQWTKLFNSTTVGQALGSFYLWEFDGFDANGAMKYKDLNGNGVTGSADAGDRKYFNSYIP
KSTLGINLSMAYKNWDFAVNGYGAFGFKVYNGKKAQRITGANIESSVVNDYWTSSNTGAA
NPAPVNNIPIASTYFLESGNFFRINNITLGYTIKGVTEHLKSIRLYVSAINPFVFQKYTG
YSSEISGYNPSDNKLEGDPYKLAGVELDSYPTLRSFVFGLNINF
NT seq
2835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaaagtgttacaggtttcgtgtctgatagcagccttttattttggcgcagat
ttacacgcacaaaccaaaaaaaatgacactgtaaccaaagaaaaagctattgaagaagta
gtaatgattggttacggtagtagaaagaaggtagataataccacgtcaattagttctatc
aacagtgaagaagttaacagaactaaagttttaaatccaacacaggcaatacaaggaaag
gctgcaggggttcaggtaactgcttctgatatgcccggatctacaccaacaatcttaatc
cgaggattaggaactgtgttaggggggcgtactccattgtatgttgtagatggaatgttc
gcagataatattaataatattaacgctaacgatatcttaacttatgatatccttaaagat
gctgctgcattagctatttatggtaacagagcagcaaacggagttattattattacgacc
aaaaccggaaaaggaaaattaagtattagctatgatggctttgtaggagtaaggactcct
ttgaaagaagttaagatggctaatgcatcagaatttgcaagatataataatattgcgttg
gggaagaataccttttctgagaatcagccaacaaatactaattggtttgataaaattaca
agaactggtatgtataatcagcataatttatcaatttctggttcatctgaaaatattaag
tattttttcagcttaaataattatgacgagaagtctattctaagaggtacagattataac
aggtctacgattcgtactaataatgaatttaagcttgcgaagggcattacattaagtcag
aatcttagtgttgcctttactaatatgactcctaaaccgttaggagctttcactacagca
tacaagcaatctccaatggttccagtctattttcctactggtcaatttggatcacctttt
ataggtgctaatgggattgtatctgaaaaaggaacttccaagttcaatgatgttggtaac
ccggtaagccaacttttttataatgacgaacgcaatcagaatatgcttttgcagggaggg
cttaaattggatattgatattgtaaaggggttaaaatttacttcccagtttaatggagaa
tattccaattataaaggttataattttgaaaactctttagctacatggctggctgcagat
ccctcaagagtagcttcggggtttgataaagggtcaccgttaaataggcttacaaatacc
aaaagagattattataactgggctttgactaattatttaacatttaataaaaagtttgga
atacatgatatagaagcaactgtaggtacagaaactgctgtgaaaaatggtattgatgag
cttattatcgtaagaaaagatatgcctttgaataataattattggaatctatcaggtact
gattatgtaaataatatactcaatctaaactctgtaaagtataataaaaatactaccaac
tcttattttgcgcgagcacagtacaaattattaaatcgctacttactaagtgctacggta
agaagagatggttcatctcagtttgcagatggtcataaatggggcacgttcccttcattt
ggtgcaggctggattatttcggaagaaagctttatgaaaaattcaggattcaatatgctt
aaacttagaggaggctggggtagattaggaaaccaaaatgtaccactaaactctttacca
ttaactaccggggctggttataactatggcttcaatggtatttctgtgagtaatggtatt
actgttaatcagggatttgatcctaatttaacatgggaaattactgaagaatcatcggca
ggtatagatttcggagttttaaacaacagattaaccggatcaatagatgtttataaccgt
cttacaaaaaacattattcttaacgttgtagacccaatagcatcgggtaaagaaaaaact
tatccggcacatgttggtgaagtacaaaaccgaggagtggaattaggacttaactggaat
gataaaattggtcaggactttagttattcaataggagcaaattattcttataataataat
gaactcactaaaattacccgtacagatatttcacaaattagtggaggatcattaggaaat
ggacaatggacaaagcttttcaacagtactactgtaggacaggctcttggtagcttctac
ctttgggaatttgatggattcgatgctaatggtgcgatgaaatataaagatcttaatggt
aatggagtaacgggttctgctgatgctggagacaggaaatattttaattcttatatccca
aaatctactttaggaattaatctgtctatggcatataagaattgggattttgcagttaat
ggttacggggcttttggatttaaggtatataatggaaaaaaagcacagagaattactggg
gctaatatagaatcatcagtcgtaaatgactattggacttcttcgaatactggagctgcg
aaccctgcacctgttaataatattccaattgcttcaacatattttttagaatctgggaat
tttttcagaattaataatattacattgggatatactataaaaggagttacagaacatctg
aaatcaataagattatatgtgagtgcaataaatccttttgttttccaaaagtacacaggg
tatagctctgaaatatcagggtataatcctagtgataacaaactagagggtgatccgtat
aaattggctggtgtagagttagattcttatccaacattaagatcttttgtatttggtcta
aatattaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system