Elizabethkingia sp. JS20170427COW: FGE20_08125
Help
Entry
FGE20_08125 CDS
T06442
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
elt
Elizabethkingia sp. JS20170427COW
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
Por_Secre_tail
Cleaved_Adhesin
PKD
PKD_4
CARDB
NPCBM_assoc
DUF3244
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCX53696
UniProt:
A0A5B7UH04
LinkDB
All DBs
Position
1802486..1806868
Genome browser
AA seq
1460 aa
AA seq
DB search
MKNNYPRKAPRLLIAVGFLALLSTSVDAQTLSDSKKLKTDTKFSILNKAQSSIKRTVVTN
QRLQAFAKQKGIDYQIKTKDGKIMQLVAIEGNGNPIYLTTFNDKAAITSGVNLIRKGGSS
QYNLTGKDVNIIEWDGGQVRATHQELKGRITKGEDTGNVMGTISDHATHVAGTVLGKGVN
PKAKGMAPESTIVSYDFNDTYNELFASLGKQEGILSTHSYGYGVGWSYNGFGYSWGGDKN
VSTTQDYKFGYYSEYDAVVDELLLAAPWHTYVRAAGNDRGEGPANAGISGRAEKDGGETG
YDTVGFGSLPKNVIVVGAVEPIENYTGPESVKMTDFSSWGPADDGRILPTVVADGFQVFS
SVSTSDTAYGQMSGTSMATPATTGAISLLQEYAKKKTGSFFTSPLVKSIIVNTAKEAGRP
GPDYSYGFGLIDAKAAVETVDYKGKSTDYKEGTLKNGETVTLTFETKEGVPFKATLAWLD
QPGEPKAWVSDDAQKDSSFLNDRTSKLVDDLDMRVTQDGVEYKPYVLNPETPEALATTGD
NVVDNIEQIYIANPKTGTLTLTFTHKGTLNAEVHYGLSVSGLSVSKDLILENLATNVPVE
QYGKATPVKVNVANKGTQNMGAFQVKFTVKDPAGSIKSESVKDFSGLAVGETLEANATVD
LLEVFTPYTVTAEIISAEDEIPGNGFASMVLTPVVADLREGGSTYQEDFNEVFDVHNWKI
IDENADGITWRQLAQEEFALDGTSFAINYAQGQKSAKDWLVSNPIQLKAGNTYKVSYYTM
KLSNNASHNENIEVFLGDQASVAGMSQSLNKFTWNQTEENVKWKKVEFTFTAAKDGIQYF
GIKHYSNDGIKSYLGAVENFKILNTNEGLPTPEFTYSTVDQTSVITPFTDVVLQNATESN
PTVTAWQWEFVPNTVSFREGTTANSENPIVRFNENTTYSIKLKATNANGTVEKNKYNTIS
VQEPTLASSFSQDRTKVYSKENVQFTNTSVGSPAPQSWKWEITPNTPGAFEFLEGTSATS
EHINVKFIKAGDYAVKLTSTSEATTNQVVKESLIKVVANKSAPGNVSGVQKNSTVALEWT
KPEIDLPESYIDEGFEDSVFPPKQWQVIDGNSDGNTWNRVMFQEGPITAAVFSFINATGR
AVQTDDYLVTPKLTLPKDYTELTFEGGGDPNFPDNIKIYVVKVTDDEPLTAAKIKNQGIK
VYDGDVIHPSIESTFNKIDLSSALDGSPVKLAFYSYNKDQFVLSIDDIKISKPGTVTEVK
SANKGTTTTTKKGEVKLQQLGAEGKFIMTPKPYASVKPTWESLEVGPTNNVTSYEVLRDN
TVIANVDEQNTIYVDNTVAANTTYSYSLVAVYDGVNKSEASQPITVEVGTLGTLDLEKAS
QIAAYPNPVVDVVKVKFASALSGKAEVELYGMDGKKVFSKSLTEAELSQQGINLSQLNSG
AYVLVVKNNNQAFTTKIMKK
NT seq
4383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaacaattaccctagaaaagcccctcgcttattgatagcagtgggctttctagcg
ttgttatctacaagtgtagatgcccaaacgctttctgattctaaaaaattaaagacagac
acaaaatttagtattctaaacaaagcacaatcgtcgattaagcgtactgtagttaccaat
cagaggttacaagcttttgccaaacaaaaaggtatcgattaccaaatcaagaccaaagat
ggtaaaattatgcagttggtagcgattgaaggtaacggaaaccctatctaccttactact
tttaatgataaagctgcgattacctcaggggtaaaccttatcagaaaaggaggaagctca
cagtataatcttaccggtaaggatgttaatattatcgaatgggatggtggtcaagtaagg
gctactcaccaggagttaaaaggtagaataacaaaaggagaggatacagggaatgttatg
ggaacaattagcgatcacgctactcacgttgcaggtactgttcttggcaaaggagtaaat
cctaaggctaaaggtatggcccccgaatctactattgtaagctatgattttaatgatact
tataatgaattatttgcttctttaggaaagcaagaaggaatattgtccacccactcctat
ggttatggcgtaggttggagttataatggttttggatacagctggggaggagataaaaac
gtaagtaccactcaagattataaatttggatattattcggaatatgacgctgttgtagat
gagttattgttggctgcaccttggcatacttatgtaagagcagcaggtaacgatagaggt
gaaggacctgctaatgctggtatatctggaagagcggaaaaagatggaggagaaacagga
tatgatacagtaggttttggtagcttgcctaaaaacgttattgtagttggagcggtagag
cctatagaaaactacacaggacctgaaagtgttaaaatgacagattttagctcttggggc
cctgctgatgatgggcgtattttaccgacagtagttgcagatggatttcaagttttttca
tccgtttctacctccgatacagcttatggacagatgagtggtacttctatggcgactcct
gctacaacgggagcaatttctcttttacaagaatatgcaaaaaagaaaacaggaagcttc
tttacttctccattagtaaagagtattattgttaatacagcaaaggaagcaggaagacca
ggaccagattatagctatggatttggattaatcgatgctaaagcagctgtagagaccgtg
gattacaaaggtaaatctacagattataaagaaggaactcttaaaaatggagaaactgtt
actttgacatttgagaccaaagaaggagtaccttttaaagcgactttagcttggttagat
caaccaggagaaccaaaagcttgggttagtgatgatgctcaaaaagattcgtctttcctt
aatgatagaacctcaaaattggtagatgatttagatatgagagttacccaagatggtgta
gaatataaaccttatgtgttgaacccagagactcctgaagcattagcaactacaggggat
aacgtggtggacaatatcgagcaaatttatattgcaaatcctaaaacgggaactttaacc
cttacctttacccataaagggacattaaatgctgaggtacattacggactttcagtatct
ggactttccgtatcaaaagatttaattttagagaacttagcaacaaatgttcctgtagag
caatatggtaaagcaactcctgtaaaagtaaatgtggcgaataaaggaactcaaaatatg
ggggctttccaagttaaatttaccgtaaaagatcctgcaggatctattaaatcggaaagc
gttaaagacttctcaggattagctgtaggtgaaactttagaggcaaatgctaccgtagat
ttattagaagtatttacaccttatactgtgactgctgaaattatttctgctgaagatgaa
atcccaggaaatggctttgctagcatggtattaacacctgtagtggctgacttaagagag
ggaggatctacctatcaagaggattttaacgaagtatttgatgttcataattggaaaatt
attgacgaaaatgccgatggaattacatggagacaattagctcaagaagagtttgcttta
gatgggacatcttttgcaattaattacgcacaagggcaaaaaagtgcaaaagattggttg
gtttccaatcctattcagttaaaagcaggaaatacttataaagtttcttattatacgatg
aagctttctaacaatgcttctcataatgagaatatagaagtatttttaggagatcaggct
tcagtggcagggatgtctcaatcgctgaataaatttacttggaatcaaacagaagaaaat
gtaaaatggaaaaaagtagaatttacctttactgctgctaaagatggtatccaatatttt
ggtattaagcactatagtaatgatggtattaagagttatctaggtgctgtagagaacttc
aaaatattaaatacaaatgaaggtctccctactccagaattcacctattcaaccgttgat
caaacttccgttattacaccatttacagatgtagtattacaaaatgctacagaatctaac
cctacggtaacggcttggcagtgggaatttgtgccaaatactgtaagctttagagaaggt
actactgctaatagcgaaaatcctattgtaagatttaatgagaatacaacatattctatt
aaattgaaagctactaacgcaaatggtaccgttgaaaagaataaatacaataccatctct
gtacaagaacctactttggcatcttccttctctcaagatagaacaaaagtatattctaaa
gaaaatgtacagtttaccaatacttcggtaggtagcccagcaccacaatcatggaagtgg
gagataacccctaatacaccaggagcttttgagtttttagaaggaacctctgctacttct
gagcatattaacgtgaagtttattaaagctggagattatgctgtgaagcttacctcaact
tctgaggcaacaaccaatcaagtggttaaggaaagcttgattaaggttgtggcaaataaa
tcagcaccaggaaatgtatcaggagttcagaaaaactctactgttgccttagaatggacg
aaaccagaaatagatcttccagaatcttatattgacgaaggatttgaagacagcgttttc
cctccaaaacaatggcaagtgattgatggtaatagtgatggcaacacatggaatagagta
atgttccaagaaggaccaattacggcagctgttttctcttttataaatgcaacaggaaga
gcggtacaaacagatgattacctagttacccctaaattaactttaccaaaagattatacc
gagcttacttttgaaggaggaggagatccaaactttccagataatataaagatatatgta
gtaaaagttacagatgatgagcctttaactgctgctaaaatcaaaaatcagggtattaaa
gtatatgatggagatgtgatacacccatctatagaatctacatttaataagatagatttg
tcatctgctttagacggtagcccagtgaagctagcgttctacagctacaataaagatcag
tttgtattgtctatagatgatattaaaatttctaaaccaggaacggtaacagaagtgaag
tctgcaaataaaggtaccacaacaactactaaaaaaggtgaagttaaacttcaacaatta
ggagcagaaggtaaatttatcatgacgcctaaaccatatgcttctgtaaaaccaacttgg
gaatctcttgaagtaggtcctaccaacaatgttacttcttatgaagtgttaagagataat
actgttattgctaatgtagatgagcaaaataccatttacgtagataatacagtagcggct
aacactacttacagctattcattagttgctgtctatgatggagtaaataaatcagaagct
tctcagccaataacagtagaagtgggtaccttaggtactttagatttggaaaaagcttct
cagattgcagcttaccctaacccagtggtagatgtagtgaaagtgaaatttgcttctgca
ctatccggaaaagctgaagtagaactttatggtatggatggtaagaaggtattctcgaaa
tcattaaccgaggcagaactttctcaacaaggtatcaacctatcacaactaaactctgga
gcttatgtcctagtagttaaaaataacaatcaagcatttactactaaaattatgaaaaag
tag
DBGET
integrated database retrieval system
