Thomasclavelia ramosa: EYR00_12375
Help
Entry
EYR00_12375 CDS
T06753
Name
(GenBank) carbohydrate-binding protein
KO
K05349
beta-glucosidase [EC:
3.2.1.21
]
Organism
erm
Thomasclavelia ramosa
Pathway
erm00460
Cyanoamino acid metabolism
erm00500
Starch and sucrose metabolism
erm00946
Degradation of flavonoids
erm00999
Biosynthesis of various plant secondary metabolites
erm01100
Metabolic pathways
erm01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
erm00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EYR00_12375
09106 Metabolism of other amino acids
00460 Cyanoamino acid metabolism
EYR00_12375
09110 Biosynthesis of other secondary metabolites
00946 Degradation of flavonoids
EYR00_12375
00999 Biosynthesis of various plant secondary metabolites
EYR00_12375
Enzymes [BR:
erm01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.21 beta-glucosidase
EYR00_12375
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3
CBM_6
Glyco_hydro_3_C
Glyco_hydro_30
Bact_surface_Ig-like
CBM_35
Glyco_hydro_30C
SusF_SusE
CBM_35_2
Big_3
He_PIG
Glyco_hydr_30_2
PKD_4
PKD
Big_13
DUF4399
HYR
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMW75461
LinkDB
All DBs
Position
complement(2557289..2563981)
Genome browser
AA seq
2230 aa
AA seq
DB search
MKRILKGALVALMVVSSTIGVKAESKISAEVQRIIDSMTPVEKVAQMIQADTRWITPAEV
AEYKIGSILSGGGAAPTSGNELSNWVTSANSYQKAVIDSGGIPLLYGIDAVHGNNNLYGA
TIYPHNIGLAAANNTQLVEQIGEATASEVRAMGANWTFTPTLGVPHNERWGRTYETFGDD
VERVTNLGTAYIKGIESDGDTLSSAKHYLGEGLTTNGANQGNVELSDADYQDLINANMNN
PMVKELLTPYKEAIKQGTKSIMVTYNSINGKRCHGNKDVVTTLLKENLGFDGIVISDYNG
LDQIENQATYKDKAIACINAGVDVLMVAEKDGSTPRWKNLYNALVEAVNEGKISEERLND
AVARILTAKEELGFLDNPSKAYADEADQAKFGGSEHRALAKQAVSESLVLLKNDEVNAGK
TVMQALADMDNIVVAGSAGDDIGKQCGGWTITWQGATGNTTPGTTIFSGLKAAMDKKGGT
ISYNANGVFTNSDNKVDAAIVVVGEDPYAESNGDRSAGQLKLPANDISTIKRIENSHPDL
PIILVLTTGRPIAMADYVNDDHIKGIVNAWLPGSEGDGVADVLLGDKDFVGTNPITWTWY
PQDITSKYDDSSKVLYRVGYGLKKAQKTGDFTAPADPNVIDLAKTNGKLEAEAFVDAHSE
IKLENNGTTVGYLQDGRHMTYKINVPEQAAYKLTVQAAREYAATIDGAFELYLDDELVLE
KKNTPIVSTGSWTKFTAQEMTALVSLKAGIHELKLVARDKDFNIDYYIFEKAGDYVGPII
PDEVTNEGTGAMLQEGAVEVSMSSSENSQDMAWYKGEFEISNKNATKDPLDLRVADDSSQ
TTIVVNDQKTYQSVLGMGTSIEESTIYNLLKMTDENRQAFLRRLLDPVNGMGMSLMRVTV
GTSDFTAQDFYTYYDGTGKELDGKPDWNNVTGKGFSIQKDKDLGIIKVINEMQAIAKELG
VEDNLKFFASSWTPPGWMKLPTSSSNSYEDNELLLKGGKLNDDYIDDLAKYMVRYVEEYQ
KCGIPIYAMTIQNEPLLEINYPSCAMTGTQEAKIAKAIKAELAKSTVLKDNEKEVKLWAF
DHNFDGADKFMADFFKEAGDQLNIDGIAFHPYGGNASTMGSFYDRYKDQLSMNLTERSVW
GTSGANDIITWLRNGSESYNSWVTMLDSNVGTHHWVGTPDPTLFVQDANNPQRYWATPEV
YIMSQFTKYVKPGYVRVDTNNGSSSTVTNVAFKDPETGKIVMIVANRSGTDQKFKVMMKG
AQFNAVLPAGNVATYIWDGSDIEINALDVPGTFTADKCSSATNANINTTDHIIDYVNKNA
SIDYLVDVKEAGTYNVMIKVASGEDWENKTVNVKSGDTVVGTTVAQRFNFWGGEWQDYRY
IQVQANLEKGIQTLTIELPDGGMNLSEIKINKTKYSHDVPGYISATDYCYGERIIVEDGN
IGFFGEYDRVNYRVNVQKAGTYQMKMNYASDGEAKFWMDLIQNGISASIGEATLSSTGND
STYSTGVVEINLPEGESQISFVPQSGVSFNLKALSFGSYIQISSDELEEGKLAGKEITVN
LKDGKFETDLNQANWVVEGLPAGITYSLKRINDTKAVIILKGNEVVDYDSNLTVTVKVDA
GEIGDTGYSLSDSVMIAAVDDDETLLDIGDLAFGTTEFDLMIEGGKFNQDLKVNDLVLSE
EAANYMTVKAIKVSADGNKVTVTLERKNTNYEDVAGTISIKSNGYSDGNVDLTANLKLLK
TNNLPDSIDVGDVAVGLKESDAYRKKGTLVNGAKGDYIDFYLNIKEEGNYVLTYKIKDSE
AITNGLKLSGGLGLATDNLGSVSFGKYWGNAQGYAQMLNLKAGEQTLRFEVNSAGFELTN
LKIEKLTQAIEVSDTLDQTTTITADKVVDGSKEIGWGIEGSTTKNIGFGSAGAYQDYYLD
VKTAGLYDVKVNYSHDCGGDTKAVIMTVDGKITATLGEVTLKNSGGWSNWKDSDTIQIKL
EAGKQFIRIYDDLDGFNYRNFQLTFKGEQDVTAPEITGNDAVIYVNDATDIKDLLGLIVT
DDVDGDLLDKVTISGEYNYNVAGTYTITVTVSDEAGNETSKEFTVKVVEPAKLIVEDKVL
TVGDKFDPLAGIQVLDVDGTDITKNIIVISDGVDTSKAGSYEVIYRITDALGNEVEFRRM
VEVKDIEPDVKPVDPDEQTPSDNSGQQTIPGQVVEAAKTSDDVNITGMFGILVLAGLGWI
GSRKRKFCDC
NT seq
6693 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagaatattgaagggagcattagtagctctaatggttgtttcatcaactattggg
gttaaagcagagtcgaagatttcagccgaagtacaaagaattattgatagtatgacaccg
gttgaaaaagtcgcacaaatgattcaggcggatactcgctggatcactccagctgaagtg
gcggagtataagattggttcaattcttagtggtgggggagcagcaccaactagtggaaat
gaattaagtaattgggtaacttcagcaaatagttatcaaaaagcagtaattgatagtggt
ggtattccattgttatatggaatagatgcggttcatggaaataacaatttgtatggagcg
actatctatcctcataacattggattggcagcagctaataatactcaattagttgaacaa
attggggaggctactgcaagtgaagttagagcaatgggagccaactggacatttacacca
acattaggtgtacctcataacgaacgttgggggcgtacatatgaaacttttggtgatgat
gttgaacgggtaactaatttaggtactgcatatattaaaggaattgaaagtgatggtgat
actctatcgtcagcaaaacattatttaggagaaggattaactactaatggagctaaccaa
ggtaatgtagagcttagtgatgctgattatcaagatctaatcaatgcaaatatgaataat
ccaatggttaaggaacttttaacaccttataaagaagctattaaacaaggaactaaatca
attatggttacctataatagtatcaatggtaaaagatgtcatggaaataaggacgttgtt
acaacgttattaaaagaaaatcttggttttgatggcattgttattagcgattataacggt
cttgatcaaattgagaatcaagcaacttataaagataaggcaattgcttgtatcaatgct
ggtgttgacgtcttgatggtagcagaaaaagatggttcaacaccacgctggaaaaattta
tataatgctttagttgaagctgttaatgaaggaaaaattagtgaagaacgcttaaatgat
gcagttgcaagaattctaactgctaaagaagaattaggatttttagataatccttcaaaa
gcatatgctgatgaggcagatcaagctaaatttggtggtagtgaacatcgggcattagct
aaacaagcagttagtgaatctttagttttattaaaaaatgatgaagttaatgctggtaaa
acagtgatgcaggctttagcagatatggataatatcgtggttgctggtagtgctggtgat
gacattggtaaacaatgtggtggttggacaattacttggcaaggggcaactggaaataca
acacctggtacaactattttcagtggtttaaaagcagcgatggataaaaagggtggaaca
atcagctataatgctaatggtgtatttacaaattcggacaataaagttgatgcagcaata
gttgtagttggtgaagacccatatgctgaaagtaatggtgatcgcagtgctggacaatta
aaattaccagctaatgatattagtacaattaaacggattgaaaatagtcatcctgattta
ccgattattttagttttaacaacagggcgaccaattgcaatggctgattatgttaatgat
gatcatatcaaagggattgttaatgcatggttaccaggtagtgaaggtgatggggttgct
gatgtactattaggtgataaagattttgtaggaacaaatccaattacttggacatggtat
cctcaagatattactagtaagtatgatgattcaagcaaagtattatatcgggttggatat
ggattgaaaaaagctcaaaaaaccggtgattttacagcaccagctgatcctaatgtgata
gatttagcgaaaactaatggaaaattagaagccgaggcgtttgtggatgcacacagtgaa
attaagttagaaaataatggtacaactgtagggtatttacaagatggacggcatatgact
tataaaattaatgtgccagaacaagcagcatataaattaactgttcaagcagcacgtgaa
tatgcagcgacaattgatggagcatttgaattatatttagatgatgaattggtactagaa
aagaaaaatacaccaattgtttcaacgggcagctggactaagttcacagctcaagagatg
acagctttggttagtttaaaagcggggatacacgaacttaaacttgtagcacgcgataaa
gattttaatattgattattatatttttgaaaaagctggtgattatgttggtccaatcatt
cctgatgaagtaacaaatgagggaactggagcaatgttacaagaaggagcagttgaagta
agcatgtcttcttctgaaaattcacaagatatggcttggtataaaggtgaatttgagatt
tctaataaaaatgcaacaaaagatcctcttgatttacgtgttgcagatgattctagtcaa
acaacaattgttgtaaatgaccaaaaaacatatcaaagtgttttaggaatgggaacttca
attgaagaatcaacaatttacaatttattaaagatgactgatgaaaatcgtcaagctttc
ttaagaagattattagatcctgttaatggtatgggaatgtcgttaatgcgggtaacagtg
ggaacatcagattttacggcacaagacttctacacttattatgatggtacaggaaaagaa
ttagatggtaaaccagattggaataatgttactggtaaaggatttagtattcaaaaagat
aaagatttaggaattattaaagttattaatgagatgcaggctatcgcaaaagaattagga
gtagaagataatctgaaattctttgcttcatcttggacaccaccagggtggatgaagtta
cctacttcaagtagtaattcatatgaggataatgaattattattgaagggtggtaaatta
aatgatgattatattgatgatttagctaaatatatggttcgttatgttgaagaatatcaa
aaatgtggtattcctatctatgcaatgacgattcagaatgagccattattagaaattaat
tatcctagttgtgcaatgacaggaacccaagaagcaaaaattgctaaagcaatcaaagct
gaattagcgaaaagcactgtgttaaaggataatgaaaaagaagttaaactatgggcgttt
gatcataattttgatggtgctgataaatttatggctgatttctttaaagaagctggtgat
caattaaatattgatggtattgcattccatccttatggtggtaatgcttcaacaatgggt
tctttctatgatagatataaagatcaattaagtatgaacttaacggaaagatcagtatgg
ggtactagtggtgctaatgatattattacttggttaagaaacggttctgaaagttataat
agctgggttacgatgttagatagtaatgttggaactcatcattgggttggaactccagat
ccaacgttatttgtgcaggatgctaataatcctcaaagatattgggctactccagaagta
tatatcatgtcgcaatttactaaatatgtaaaaccgggatatgtccgtgttgatacaaat
aatggttctagttcaactgtaacaaacgttgcgtttaaagatcctgaaacaggaaaaatt
gttatgattgttgcaaaccgaagtggtactgatcaaaaattcaaagtaatgatgaagggt
gctcaatttaatgcggtattaccggctggtaatgttgcaacatatatttgggatggtagt
gatattgaaataaatgcattagatgttccaggaacatttacagctgataaatgtagttca
gctactaatgctaatattaatacaacagaccatattattgattatgtaaataaaaatgcg
agtatagattatttggttgatgtaaaagaagccggaacatataatgttatgattaaagtt
gcttctggtgaagattgggaaaataaaacagtaaacgttaaatcaggtgatacagttgtt
ggtactactgtggcacaaagatttaatttctggggtggtgaatggcaagattaccgttat
atccaagttcaagcaaatctggaaaaaggaattcaaactctaacgatcgaattgccagat
ggcggtatgaatctaagtgaaattaagatcaataagacaaaatacagccatgatgtgcct
gggtacattagtgctacagattactgttacggtgaaagaattattgtagaagatggaaat
attggtttctttggtgagtacgaccgagttaattatcgggttaatgtacaaaaagctggc
acttatcaaatgaagatgaactatgctagtgatggagaagcaaaattttggatggattta
attcaaaatggtatctctgcttcaattggtgaagcaacactctctagtactggtaacgat
agcacttacagtactggggtagtagagattaatctgcctgaaggtgaaagccaaattagt
tttgtcccacaaagtggtgtaagttttaacttgaaagcattatcgtttggctcatatatt
caaatttctagtgatgaattagaagaaggtaaattagctggtaaagaaattactgttaat
ttaaaagatggaaaatttgaaactgatttaaatcaagctaattgggtggttgaaggattg
cctgcaggtattacttattctttaaagagaataaatgatacaaaagcagtaattatatta
aaaggtaatgaagttgtagattatgatagtaatcttacagtgactgttaaagttgatgct
ggtgagattggtgatactggttatagtttgagtgatagtgtaatgattgctgcagttgat
gatgacgaaacattattagatattggtgatcttgcttttggaacaactgaatttgattta
atgattgaaggcggaaaattcaatcaagatttaaaagtaaatgatcttgttttaagtgaa
gaagcagctaattatatgactgttaaagcgataaaagtaagtgctgatggaaacaaagta
acagtaacattagaacgtaaaaatactaattatgaagatgttgcagggacaattagtata
aaatcaaacggttatagcgatggcaacgtcgatttaacagcaaatcttaaattattaaaa
acaaataatctaccagatagtattgatgttggtgatgttgcggtaggattaaaagaaagt
gatgcatatcgtaaaaaaggtactttggttaatggtgctaagggagattatattgacttc
tatttgaatattaaagaagaaggaaattatgtattgacatataagattaaagatagtgaa
gcaattactaatggtttaaaactaagtggtggtttaggattggctactgataatcttggc
agtgtttcttttggtaaatattggggaaatgcacaaggttatgcacagatgttgaattta
aaagctggtgaacagactttaagatttgaagttaatagtgctggttttgaattaactaat
ttaaaaatcgaaaaattaactcaagcaattgaagttagtgatacgcttgatcaaacaacg
acgataacggctgacaaggtagttgatggttctaaagaaattggttggggaattgaaggt
tcaacaactaaaaatattggttttggatctgcaggagcttatcaagattattatcttgat
gtaaagacggcaggattatacgatgtaaaggttaattatagtcatgattgcggtggcgat
actaaagctgttatcatgacagtagatggaaaaataactgctactttgggtgaagttact
ttaaagaattctggtggctggtcaaattggaaagatagtgacacgattcaaattaaatta
gaagctggtaaacaatttattcgtatttatgatgatctagacggctttaattatcgtaat
ttccaattaacatttaaaggagaacaggatgtcactgctccagaaattacgggtaatgat
gcagttatctatgtaaatgatgcaacagatattaaagatttactagggttaatagttact
gatgatgttgatggtgatttattagataaagtaacaattagtggcgaatataattacaat
gttgcaggaacttatacgattacagtgactgtaagtgatgaagctggtaatgaaacaagt
aaagaatttacagttaaagtagttgaacctgcaaaattaattgttgaagataaagtatta
acagttggcgataaatttgatccattagctggtatacaagttttagatgttgatggtacg
gatattactaaaaatattattgtaattagtgatggtgttgatacaagtaaagcgggaagt
tatgaagttatttacagaataactgatgctttaggtaatgaagtagaatttagaagaatg
gttgaagttaaggacatcgaaccagatgttaaaccagttgatcctgatgagcaaacacca
tcagataatagtggtcaacagactattccaggacaagtagttgaagcagctaagactagt
gatgatgtaaatatcacgggtatgtttggtatacttgtattagctggattaggatggatt
ggatcaagaaaaagaaaattttgtgattgttag
DBGET
integrated database retrieval system