Flavobacterium ammonificans: SHINM13_18490
Help
Entry
SHINM13_18490 CDS
T08737
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fao
Flavobacterium ammonificans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_6
PKD_5
PKD_4
CHU_C
I-set
Ig_3
SprB
ig
Ig_2
V-set
PKD
ChitinaseA_N
FlgD_ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB57553
LinkDB
All DBs
Position
complement(2133861..2143562)
Genome browser
AA seq
3233 aa
AA seq
DB search
MKKPHKFQSVLISLCLLVSTLSFSSEKFELSNSDNIHRAFNHIISNSIRFTLKSEIAKVS
AVPNITAQPQSQSVCAGDNVTFSVTVTGTGSGNLVFLWKKNGVTITNAVGRISGATTASL
TLSNISISDADNYTCVITDDIDSTNTITSDPATLIVKSPPVLSSPLTATVCSGIANTYIG
QSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANGNINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTN
TQSVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSYTPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGT
GSISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVSTGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSE
IDYSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTLSINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPA
VAITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANG
NINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTNTQSVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSY
TPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGTGSISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVS
TGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSEIDYSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTL
SINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPAVAITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQS
SDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANGNINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTNTQ
SVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSYTPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGTGS
ISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVSTGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSEID
YSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTLSINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPAVA
ITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSVNGNI
NETLTNTTSAPIDVYYDYSLSLNGCINTQSIKVTVNPISKLSSTLTPPTVCSGVSFEYTP
NFTVSGTTFSWSRSAQAGISELSSSGTGSISEVLTNTTNASVGVDYIFSLTSPSGCTFTE
TVRVNVTPLPSAPITITGDKTVCIGIQRTYNITAIPNATSYRWTLPNGSTTDTNITSLIV
DYSVVTSSGNLSVAGVNSCGVGVAKTEVITVLAPPALSSSLTATVCSGSPFAYTATSSNS
SSTMSWSRAVVPGISNVSATSITGNISETLVNTTSLPIEVVYVYTLTLNGCTNTQIVTVT
VNPNDLLLNIPSAVELCSGATFNFTPTTSIDGSIFSWNRGTVVRITPTINERLDNNGTTP
INVVYNYKLTTAEGCISPNRSFTVKVNPSPKLINIPTTSFCTTSNQSVTFTYNPTANIPG
VNISWTRAAKDEIQESSSSGINSEISETLTSTSTTKTVFADYSFVLDDTVNGCDATDSFS
VRLEKIPDGIPVIEGDQMVCAGSSNNRYKASFSTNTSRYVWTLPNGNEITTSSDTINLNF
PTTTTSYFLKVEGINTCGRSTISDSYPITVIPPPTLSSPKTASICSGSLFAYTPNSSDGN
ARYTWSRPAIDGISNPQSTDITGNIEEVLVNTTNLPIDVLYRFTIFTTGGCKNIQDLIVT
VKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFSLPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSSLT
ETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSELRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQEFR
VPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVIKVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGISTTLPI
TIVPLPTLSSPQTANICSGSEFTYTPISSDSSTAFRWSRATMIGISNPSATGTGVIVETL
INTTGLPINVVYEYELENEQGCISTQQVTVTVKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFS
LPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSSLTETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSE
LRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQEFRVPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVI
KVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGISTTLPITIVPLPTLSSPQTANICSGSEFTYTPISS
DSSTAFRWSRATMIGISNPSATGTGVIVETLINTTGLPINVVYEYELENEQGCISTQQVT
VTVKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFSLPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSS
LTETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSELRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQE
FRVPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVIKVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGIAFSL
PVTIYQNAMVSLVSGNPNTTLCMGSSFVTPIKYAISPSTEELKLTGKLPAGVDFTSSTGI
ITGTPTESGSFPFTITSTSNCSNSLSGIIVVNPLQSIAKLSGTVNQIACINTEIDPIVYS
IAKGTTGVLINPVLPLGIVATVDEVNGLVSISGTPTVATSLAQNYVITTQGSCGSPASTT
ISFDIKPAVILDFISPTATLNQAVCLNGPIIPIRFSVGGGATGIITPVLPAGLTISQDPL
TLVYTIQGNPTANGTFTIPITTTGCTKTEIITISNVNTAVSIDLLSASGTDQQTLCQTNF
NSPIVPIQYTIVGATSVQVLGLPSGVNFVYDSAISKLVISGTPIQTGIFNYTITSLPCSI
IKTGVLKVSIPMFISSESVKNVSCSKVNDGEIAVTIIGGVPLSGSYSVQWTGPNNFQQNR
LNITGLQAGEYTLTGRDAIGCLIPSKKYTILPASPINISLVSTTNISCNGSLGCANLNYT
GGTGIYTNFVLQFLDPSLQMWTSVPNPSNNYFNVCNLKAGLYRIAVTDSNSCTTEPFQFT
IYDYGSLKIDSVNLDNKLCSTSGGKVRVSLSTLDPNLTFFYNNVVVPFTKIGNKLYELSI
SNPTSPTGNIKVTNNENCWDTITLNTTVINPSLSFTSLNLTTYGNVSVNESIKFTNGLTA
TTIPPEYDYLVWDFGDNSPLKVFYNPEDINPNSDGESLTTVFHSYAKDGLYTVTLIAYNQ
FGCSKSITEVITVGQGASIMAPTAFSPNNDGINDLFRPSLLGLKEVNVNIYDHWGNLIYE
ITSDTASLPTDWGWNGLENGKSEPVNGTYRYYIMAKTINDLIIEKEGQFILIK
NT seq
9702 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaccccacaagtttcagtctgttcttatatcgttatgtctattagttagtact
ctatctttttctagcgagaagttcgaattaagtaatagtgataacattcatcgtgctttt
aatcatataatttcaaattcaattcgatttactttgaagtctgaaattgcaaaagtttca
gctgtacctaatattactgctcaaccccaatcacaatctgtctgtgcaggagataatgtg
actttttccgtcacagtaactggaactggatcgggaaatttagtttttttatggaaaaaa
aatggtgtaacaataactaatgcagttggcagaataagtggtgcaactacagcttcatta
acattatccaatatttcaattagtgatgcagataattatacttgtgttatcactgatgat
attgattctacaaacacaattacatcagatcctgctacattaatagttaaatcaccacca
gttttgagtagtccattaaccgctactgtttgttcaggaatagcaaatacatatataggt
cagagttcagataatagttcagttttgaaatgggtcagaagagcggcaacaggaataagt
ccagctccattatctacattatctgccaatggcaatataaatgaggtattaactaatacc
actagtgcacctattgatgtttattatgattacacattaactttaaatggttgtactaat
actcagagtgtaaaggttacagttaatcctaaatctcaattaacgagttcattgacacca
gcggctgtttgttcaggttcaacatttagttataccccatcaactaatgtaacaggaaca
actttcagttggacacgcggtgcacaaacgggtatatcggaattatcaagtagtggaacc
ggttcgatatctgaggttctaagaaatacaacagatgcatcaatcggagttatatacaac
tatacattgacgacactttcgaattgtgtttcaacaggtacaattacggttgatgtaaaa
ccagttccatcatctgcggtttctatcaatggagctagtacagtttgtagagggagtgaa
attgattatagcactacagctataacaaatgctacaggttatagatggactttaccggat
ggaagtattacagatacaaattcaacgacacttagtattaactatgctattatgacaagt
tcagggaacttaagtgtagcaggtttgaatgagtgtggagtaggtgtttcttctccagca
gtggcaattacggtattggcaccaccagttttgagtagtccattaaccgctactgtttgt
tcaggaatagcaaatacatatataggtcagagttcagataatagttcagttttgaaatgg
gtcagaagagcggcaacaggaataagtccagctccattatccacattatctgccaatggc
aatataaatgaggtattaactaataccactagtgcacctattgatgtttattatgattac
acattaactttaaatggttgtactaatactcagagtgtaaaggttacagttaatcctaaa
tctcaattaacgagttcattgacaccagcggctgtttgttcaggttcaacatttagttat
accccatcaactaatgtaacaggaacaactttcagttggacacgcggtgcacaaacgggt
atatcggaattatcaagtagtggaaccggttcgatatctgaggttctaagaaatacaaca
gatgcatcaatcggagttatatacaactatacattgacgacactttcgaattgtgtttca
acaggtacaattacggttgatgtaaaaccagttccatcatctgcggtttctatcaatgga
gctagtacagtttgtagagggagtgaaattgattatagcactacagctataacaaatgct
acaggttatagatggactttaccggatggaagtattacagatacaaattcaacgacactt
agtattaactatgctattatgacaagttcagggaacttaagtgtagcaggtttgaatgag
tgtggagtaggtgtttcttctccagcagtggcaattacggtattggcaccaccagttttg
agtagtccattaaccgctactgtttgttcaggaatagcaaatacatatataggtcagagt
tcagataatagttcagttttgaaatgggtcagaagagcggcaacaggaataagtccagct
ccattatccacattatctgccaatggcaatataaatgaggtattaactaataccactagt
gcacctattgatgtttattatgattacacattaactttaaatggttgtactaatactcag
agtgtaaaggttacagttaatcctaaatctcaattaacgagttcattgacaccagcggct
gtttgttcaggttcaacatttagttataccccatcaactaatgtaacaggaacaactttc
agttggacacgcggtgcacaaacgggtatatcggaattatcaagtagtggaaccggttcg
atatctgaggttctaagaaatacaacagatgcatcaatcggagttatatacaactataca
ttgacgacactttcgaattgtgtttcaacaggtacaattacggttgatgtaaaaccagtt
ccatcatctgcggtttctatcaatggagctagtacagtttgtagagggagtgaaattgat
tatagcactacagctataacaaatgctacaggttatagatggactttaccggatggaagt
attacagatacaaattcaacgacacttagtattaactatgctattatgacaagttcaggg
aacttaagtgtagcaggtttgaatgagtgtggagtaggtgtttcttctccagcagtggca
attacggtattggcaccaccagttttgagtagtccattaaccgctactgtttgttcagga
atagcaaatacatatataggtcagagttcagataatagttcagttttgaaatgggtcaga
agagcggcaacaggaataagtccagccccattatcaacattatctgtcaatggtaatata
aatgagacattaactaataccactagtgctcccattgatgtttattatgattatagttta
agtttaaatggttgtatcaatactcagagtataaaggttacggttaatcctatatcaaaa
ttatcaagtacattgactccacctactgtttgttcgggagtttcttttgaatatacacca
aattttactgtatcgggtactacctttagttggagtagatctgcacaggctggtatatcg
gaattatcaagtagtggaaccggttcgatatctgaggtattaaccaatacaacaaatgca
tcagtaggagtagattatatttttagtttaacaagtccctcaggatgtacatttacagaa
acagttcgcgttaatgttacaccactaccatcagctccgattactataacaggcgacaaa
acagtttgtattggtattcaaaggacatataatataactgctattcctaatgctacttct
taccgatggacattacctaacggtagtactacagataccaatatcacctcacttatagta
gattattcagtagtaactagttcgggtaatttaagcgttgcaggtgtcaattcctgtgga
gttggagttgctaagacagaagttataaccgtacttgctccaccagctttaagcagttca
ttaactgctacggtttgttcaggaagtccatttgcatatacagctacaagttctaatagt
agttctacaatgagttggtctagagcggttgtacctggtatttccaatgtatcagctaca
tcaattacaggtaatataagtgagacattggtcaatactactagtttgccaatagaggtt
gtttatgtatatactttaacattaaatggttgtaccaatactcagatagtaacagttacg
gttaatccgaatgatttacttttaaatatcccgagtgctgtagaattatgttcaggtgct
acatttaattttacgcccactacaagtatagatggatctatattcagttggaatagaggc
acagttgtaagaataacaccaactattaatgagaggttagataataatggaactacacct
ataaacgttgtttataattataagttaacaacagcagagggttgtataagtccaaatagg
agttttacggtaaaagtaaatccttcacctaaattaattaacattccaacaacctctttt
tgtacaacatcaaaccaatccgtaacatttacatataatcctacagccaatataccagga
gttaatatttcttggaccagagctgccaaagatgaaatccaagaatcatcaagttcagga
ataaatagtgaaatttcagaaacacttacaagtacttcaactactaaaactgtttttgct
gattattcctttgttcttgatgatactgttaatggttgtgatgcaacagatagtttttcg
gtaagattagagaaaatacctgacgggatacccgtaattgaaggagatcaaatggtttgt
gcaggaagcagcaataatagatataaagcgagtttcagcacaaatacttctagatatgta
tggacattacctaatggtaacgaaattacaacctcttcggatactattaatctaaatttt
ccaaccacgaccacttcttattttttaaaagttgaaggtataaatacatgtgggagaagc
actatttcggatagttatcctattacggtaattcctccgcctacattaagtagtcccaaa
acggctagcatatgttcaggttctttatttgcttatacaccgaatagttcggatggaaat
gctagatatacttggagtaggcctgcgattgatggtatttcaaatccacaatcaacagat
attactggaaatatcgaagaagtattagtgaatacaactaatttaccgattgatgtactt
tataggtttacaatatttacaacaggaggttgtaaaaatatccaagatttgattgttaca
gttaaaccaacgcctaacttaatcgagcctactttagatcaagttgcttgttcaggaaat
gtatatagttatataccaagttttagtttgccagtaacaacatttaattggacaagagtt
gctgttgtaggaattactccttttacacctccagtagtagcttcagtgagttcattaaca
gaaaccttaactaatactacatcttcaccaattgaggttgtttatcaacttacggctaca
agtggtggttgtagtaagacatcggagttaagggttttagttcaaccttcaccatcggca
gctggaacaattacaggtccaacaataatttgttcagggtcattaaatcaagagtttaga
gttcctgtaataccaaatgcaactacatatgactggacgttgccaacaggcgcagttatc
acagatggtttaaatacaaatgttatcaaagttaattttggtagcggagttgcatcgggt
aatgttgttgtcaaaggattaaattcgtgtggagaaggtataagtactacattaccaatt
acaatagttccattacctacattgagtagtccacaaacggctaatatttgttcaggttct
gaatttacctacaccccaattagttcggatagcagtacagcttttagatggagtagagct
acaatgataggtatttccaatccaagtgctacaggtacaggagtaatagttgagacatta
atcaacacaactggtcttccgataaatgttgtttatgagtatgaattagaaaatgaacaa
ggatgtatatcgacacaacaagtcacggttacagttaaaccaacgcctaacttaatcgag
cctactttagatcaagttgcttgttcaggaaatgtatatagttatataccaagttttagt
ttgccagtaacaacatttaattggacaagagttgctgttgtaggaattactccttttaca
cctccagtagtagcttcagtgagttcattaacagaaaccttaactaatactacatcttca
ccaattgaggttgtttatcaacttacggctacaagtggtggttgtagtaagacatcggag
ttaagggttttagttcaaccttcaccatcggcagctggaacaattacaggtccaacaata
atttgttcagggtcattaaatcaagagtttagagttcctgtaataccaaatgcaactaca
tatgactggacgttgccaacaggcgcagttatcacagatggtttaaatacaaatgttatc
aaagttaattttggtagcggagttgcatcgggtaatgttgttgtcaaaggattaaattcg
tgtggagaaggtataagtactacattaccaattacaatagttccattacctacattgagt
agtccacaaacggctaatatttgttcaggttctgaatttacctacaccccaattagttcg
gatagcagtacagcttttagatggagtagagctacaatgataggtatttccaatccaagt
gctacaggtacaggagtaatagttgagacattaatcaacacaactggtcttccgataaat
gttgtttatgagtatgaattagaaaatgaacaaggatgtatatcgacacaacaagtcacg
gttacagttaaaccaacgcctaacttaatcgagcctactttagatcaagttgcttgttca
ggaaatgtatatagttatataccaagttttagtttgccagtaacaacatttaattggaca
agagttgctgttgtaggaattactccttttacacctccagtagtagcttcagtgagttca
ttaacagaaaccttaactaatactacatcttcaccaattgaggttgtttatcaacttacg
gctacaagtggtggttgtagtaagacatcggagttaagggttttagttcaaccttcacca
tcggcagctggaacaattacaggtccaacaataatttgttcagggtcattaaatcaagag
tttagagttcctgtaataccaaatgcaactacatatgactggacgttgccaacaggcgca
gttatcacagatggtttaaatacaaatgttatcaaagttaattttggtagcggagttgca
tcgggtaatgttgttgtcaaaggattaaattcgtgtggagaaggtatagcattttcatta
cctgttactatctatcaaaacgcaatggttagtttagtttcaggaaatccaaacacaaca
ttgtgcatggggtcttcatttgttacccctattaaatatgctatatcaccttcaacagaa
gagttgaaattgactggtaaattgcctgcgggtgttgattttacatcatcaacaggaata
atcacaggtactccaactgagagtggttcttttccatttacaatcacatctacttcaaac
tgtagtaatagtttgtcaggaattattgtagtgaatccattacaatcgattgctaaattg
tctggaacagttaatcaaatcgcttgtatcaacaccgagatagatccaatcgtttattca
attgctaaaggaacaacaggtgtgttaataaatccagtattgcctttaggaatagtagca
actgtagatgaagttaatggattagtttcaatttctggaacaccaactgtagcaacaagt
ttagcacaaaactatgtgataacgacacaaggtagttgtggttcacctgctagtacaact
atcagttttgatataaaaccggcagtgatattggattttataagtccaacagcaacatta
aatcaagcagtttgtttaaatggtccaattatacctattcgattcagtgtcggtggtggc
gccactggaattattacacctgttttaccagctggtttaactatttctcaagatccacta
actttggtttacaccatacaaggtaatccaaccgccaatggtacatttacaatcccaata
acaacaacaggatgtaccaaaacggagataattacaatttcaaacgttaatactgccgta
tcaattgatttattgtcagcctctggaacagatcaacaaactttatgtcagactaatttt
aattctccaatagtaccaattcagtatactattgttggtgcaacttcagtacaagttttg
ggtttgccttcaggagtcaattttgtatatgattcagctataagtaagctagttattagt
ggtactccaatacaaacaggaatatttaattatacaattacttccttgccatgtagtatt
ataaaaactggagttcttaaagtttcaattccaatgtttatttcaagcgagtctgttaaa
aatgttagttgtagtaaagttaatgatggagaaattgcagttacgattattggaggtgtg
cctttgtcgggctcatattcggttcaatggactggacctaataattttcaacaaaataga
ttgaatataactggacttcaagcaggggaatatactttaacaggaagagatgcaataggt
tgcttaatcccctcaaaaaaatacacaatattacctgcatcgccaataaatatctcactt
gtttctactacaaatattagttgtaacggttctttaggttgtgcaaacctaaattatacg
ggtggaacgggtatttatactaatttcgttttacagtttttagacccttcattacaaatg
tggacatcagtaccgaatccttcaaataattatttcaacgtttgtaatcttaaagcaggt
ttgtataggattgcagttacagatagtaattcttgtaccacagaaccttttcaattcacc
atttatgattatggatcactgaaaattgattctgtaaatttagataataaactatgctct
acctctggtggtaaggtaagagtttcactttctactttggatccaaatcttacatttttt
tataataatgtagtagttccttttacaaaaattggaaataaactttatgaattatctatt
agtaatcctacttctcctacaggtaatattaaagttacaaataatgaaaactgttgggat
acaattacattaaatacaactgtaattaatcctagcttaagttttacttcattgaattta
actacttatggaaatgtttctgttaatgaaagcattaagtttactaatggtttaacagcc
actactattcctccagagtacgattacttagtttgggattttggagacaatagtccgttg
aaggtgttttataaccctgaggatattaacccaaatagtgatggagagagtttgacgact
gtatttcattcttatgcaaaggatggactgtacactgtaacattgatagcctataatcaa
tttggttgttctaaatcaataacagaagtaattaccgtggggcaaggtgctagtataatg
gctccaactgccttctcaccaaacaatgatggaattaacgatttgtttagaccttcattg
ttaggattaaaagaagtgaatgtaaatatttatgatcattggggtaatctaatttatgag
attacttccgataccgcttcacttccaaccgattggggttggaatggtctcgagaatggc
aagtcggaacctgttaatggaacctatcgttattacatcatggctaaaactatcaatgat
ttaattattgaaaaagagggtcagtttattttaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system