KEGG   Flavobacterium ammonificans: SHINM13_18490
Entry
SHINM13_18490     CDS       T08737                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fao  Flavobacterium ammonificans
SSDB
Motif
Pfam: PKD_6 PKD_5 PKD_4 CHU_C I-set Ig_3 SprB ig Ig_2 V-set PKD ChitinaseA_N FlgD_ig
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDB57553
LinkDB
Position
complement(2133861..2143562)
AA seq 3233 aa
MKKPHKFQSVLISLCLLVSTLSFSSEKFELSNSDNIHRAFNHIISNSIRFTLKSEIAKVS
AVPNITAQPQSQSVCAGDNVTFSVTVTGTGSGNLVFLWKKNGVTITNAVGRISGATTASL
TLSNISISDADNYTCVITDDIDSTNTITSDPATLIVKSPPVLSSPLTATVCSGIANTYIG
QSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANGNINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTN
TQSVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSYTPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGT
GSISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVSTGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSE
IDYSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTLSINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPA
VAITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANG
NINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTNTQSVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSY
TPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGTGSISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVS
TGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSEIDYSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTL
SINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPAVAITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQS
SDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSANGNINEVLTNTTSAPIDVYYDYTLTLNGCTNTQ
SVKVTVNPKSQLTSSLTPAAVCSGSTFSYTPSTNVTGTTFSWTRGAQTGISELSSSGTGS
ISEVLRNTTDASIGVIYNYTLTTLSNCVSTGTITVDVKPVPSSAVSINGASTVCRGSEID
YSTTAITNATGYRWTLPDGSITDTNSTTLSINYAIMTSSGNLSVAGLNECGVGVSSPAVA
ITVLAPPVLSSPLTATVCSGIANTYIGQSSDNSSVLKWVRRAATGISPAPLSTLSVNGNI
NETLTNTTSAPIDVYYDYSLSLNGCINTQSIKVTVNPISKLSSTLTPPTVCSGVSFEYTP
NFTVSGTTFSWSRSAQAGISELSSSGTGSISEVLTNTTNASVGVDYIFSLTSPSGCTFTE
TVRVNVTPLPSAPITITGDKTVCIGIQRTYNITAIPNATSYRWTLPNGSTTDTNITSLIV
DYSVVTSSGNLSVAGVNSCGVGVAKTEVITVLAPPALSSSLTATVCSGSPFAYTATSSNS
SSTMSWSRAVVPGISNVSATSITGNISETLVNTTSLPIEVVYVYTLTLNGCTNTQIVTVT
VNPNDLLLNIPSAVELCSGATFNFTPTTSIDGSIFSWNRGTVVRITPTINERLDNNGTTP
INVVYNYKLTTAEGCISPNRSFTVKVNPSPKLINIPTTSFCTTSNQSVTFTYNPTANIPG
VNISWTRAAKDEIQESSSSGINSEISETLTSTSTTKTVFADYSFVLDDTVNGCDATDSFS
VRLEKIPDGIPVIEGDQMVCAGSSNNRYKASFSTNTSRYVWTLPNGNEITTSSDTINLNF
PTTTTSYFLKVEGINTCGRSTISDSYPITVIPPPTLSSPKTASICSGSLFAYTPNSSDGN
ARYTWSRPAIDGISNPQSTDITGNIEEVLVNTTNLPIDVLYRFTIFTTGGCKNIQDLIVT
VKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFSLPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSSLT
ETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSELRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQEFR
VPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVIKVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGISTTLPI
TIVPLPTLSSPQTANICSGSEFTYTPISSDSSTAFRWSRATMIGISNPSATGTGVIVETL
INTTGLPINVVYEYELENEQGCISTQQVTVTVKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFS
LPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSSLTETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSE
LRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQEFRVPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVI
KVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGISTTLPITIVPLPTLSSPQTANICSGSEFTYTPISS
DSSTAFRWSRATMIGISNPSATGTGVIVETLINTTGLPINVVYEYELENEQGCISTQQVT
VTVKPTPNLIEPTLDQVACSGNVYSYIPSFSLPVTTFNWTRVAVVGITPFTPPVVASVSS
LTETLTNTTSSPIEVVYQLTATSGGCSKTSELRVLVQPSPSAAGTITGPTIICSGSLNQE
FRVPVIPNATTYDWTLPTGAVITDGLNTNVIKVNFGSGVASGNVVVKGLNSCGEGIAFSL
PVTIYQNAMVSLVSGNPNTTLCMGSSFVTPIKYAISPSTEELKLTGKLPAGVDFTSSTGI
ITGTPTESGSFPFTITSTSNCSNSLSGIIVVNPLQSIAKLSGTVNQIACINTEIDPIVYS
IAKGTTGVLINPVLPLGIVATVDEVNGLVSISGTPTVATSLAQNYVITTQGSCGSPASTT
ISFDIKPAVILDFISPTATLNQAVCLNGPIIPIRFSVGGGATGIITPVLPAGLTISQDPL
TLVYTIQGNPTANGTFTIPITTTGCTKTEIITISNVNTAVSIDLLSASGTDQQTLCQTNF
NSPIVPIQYTIVGATSVQVLGLPSGVNFVYDSAISKLVISGTPIQTGIFNYTITSLPCSI
IKTGVLKVSIPMFISSESVKNVSCSKVNDGEIAVTIIGGVPLSGSYSVQWTGPNNFQQNR
LNITGLQAGEYTLTGRDAIGCLIPSKKYTILPASPINISLVSTTNISCNGSLGCANLNYT
GGTGIYTNFVLQFLDPSLQMWTSVPNPSNNYFNVCNLKAGLYRIAVTDSNSCTTEPFQFT
IYDYGSLKIDSVNLDNKLCSTSGGKVRVSLSTLDPNLTFFYNNVVVPFTKIGNKLYELSI
SNPTSPTGNIKVTNNENCWDTITLNTTVINPSLSFTSLNLTTYGNVSVNESIKFTNGLTA
TTIPPEYDYLVWDFGDNSPLKVFYNPEDINPNSDGESLTTVFHSYAKDGLYTVTLIAYNQ
FGCSKSITEVITVGQGASIMAPTAFSPNNDGINDLFRPSLLGLKEVNVNIYDHWGNLIYE
ITSDTASLPTDWGWNGLENGKSEPVNGTYRYYIMAKTINDLIIEKEGQFILIK
NT seq 9702 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaccccacaagtttcagtctgttcttatatcgttatgtctattagttagtact
ctatctttttctagcgagaagttcgaattaagtaatagtgataacattcatcgtgctttt
aatcatataatttcaaattcaattcgatttactttgaagtctgaaattgcaaaagtttca
gctgtacctaatattactgctcaaccccaatcacaatctgtctgtgcaggagataatgtg
actttttccgtcacagtaactggaactggatcgggaaatttagtttttttatggaaaaaa
aatggtgtaacaataactaatgcagttggcagaataagtggtgcaactacagcttcatta
acattatccaatatttcaattagtgatgcagataattatacttgtgttatcactgatgat
attgattctacaaacacaattacatcagatcctgctacattaatagttaaatcaccacca
gttttgagtagtccattaaccgctactgtttgttcaggaatagcaaatacatatataggt
cagagttcagataatagttcagttttgaaatgggtcagaagagcggcaacaggaataagt
ccagctccattatctacattatctgccaatggcaatataaatgaggtattaactaatacc
actagtgcacctattgatgtttattatgattacacattaactttaaatggttgtactaat
actcagagtgtaaaggttacagttaatcctaaatctcaattaacgagttcattgacacca
gcggctgtttgttcaggttcaacatttagttataccccatcaactaatgtaacaggaaca
actttcagttggacacgcggtgcacaaacgggtatatcggaattatcaagtagtggaacc
ggttcgatatctgaggttctaagaaatacaacagatgcatcaatcggagttatatacaac
tatacattgacgacactttcgaattgtgtttcaacaggtacaattacggttgatgtaaaa
ccagttccatcatctgcggtttctatcaatggagctagtacagtttgtagagggagtgaa
attgattatagcactacagctataacaaatgctacaggttatagatggactttaccggat
ggaagtattacagatacaaattcaacgacacttagtattaactatgctattatgacaagt
tcagggaacttaagtgtagcaggtttgaatgagtgtggagtaggtgtttcttctccagca
gtggcaattacggtattggcaccaccagttttgagtagtccattaaccgctactgtttgt
tcaggaatagcaaatacatatataggtcagagttcagataatagttcagttttgaaatgg
gtcagaagagcggcaacaggaataagtccagctccattatccacattatctgccaatggc
aatataaatgaggtattaactaataccactagtgcacctattgatgtttattatgattac
acattaactttaaatggttgtactaatactcagagtgtaaaggttacagttaatcctaaa
tctcaattaacgagttcattgacaccagcggctgtttgttcaggttcaacatttagttat
accccatcaactaatgtaacaggaacaactttcagttggacacgcggtgcacaaacgggt
atatcggaattatcaagtagtggaaccggttcgatatctgaggttctaagaaatacaaca
gatgcatcaatcggagttatatacaactatacattgacgacactttcgaattgtgtttca
acaggtacaattacggttgatgtaaaaccagttccatcatctgcggtttctatcaatgga
gctagtacagtttgtagagggagtgaaattgattatagcactacagctataacaaatgct
acaggttatagatggactttaccggatggaagtattacagatacaaattcaacgacactt
agtattaactatgctattatgacaagttcagggaacttaagtgtagcaggtttgaatgag
tgtggagtaggtgtttcttctccagcagtggcaattacggtattggcaccaccagttttg
agtagtccattaaccgctactgtttgttcaggaatagcaaatacatatataggtcagagt
tcagataatagttcagttttgaaatgggtcagaagagcggcaacaggaataagtccagct
ccattatccacattatctgccaatggcaatataaatgaggtattaactaataccactagt
gcacctattgatgtttattatgattacacattaactttaaatggttgtactaatactcag
agtgtaaaggttacagttaatcctaaatctcaattaacgagttcattgacaccagcggct
gtttgttcaggttcaacatttagttataccccatcaactaatgtaacaggaacaactttc
agttggacacgcggtgcacaaacgggtatatcggaattatcaagtagtggaaccggttcg
atatctgaggttctaagaaatacaacagatgcatcaatcggagttatatacaactataca
ttgacgacactttcgaattgtgtttcaacaggtacaattacggttgatgtaaaaccagtt
ccatcatctgcggtttctatcaatggagctagtacagtttgtagagggagtgaaattgat
tatagcactacagctataacaaatgctacaggttatagatggactttaccggatggaagt
attacagatacaaattcaacgacacttagtattaactatgctattatgacaagttcaggg
aacttaagtgtagcaggtttgaatgagtgtggagtaggtgtttcttctccagcagtggca
attacggtattggcaccaccagttttgagtagtccattaaccgctactgtttgttcagga
atagcaaatacatatataggtcagagttcagataatagttcagttttgaaatgggtcaga
agagcggcaacaggaataagtccagccccattatcaacattatctgtcaatggtaatata
aatgagacattaactaataccactagtgctcccattgatgtttattatgattatagttta
agtttaaatggttgtatcaatactcagagtataaaggttacggttaatcctatatcaaaa
ttatcaagtacattgactccacctactgtttgttcgggagtttcttttgaatatacacca
aattttactgtatcgggtactacctttagttggagtagatctgcacaggctggtatatcg
gaattatcaagtagtggaaccggttcgatatctgaggtattaaccaatacaacaaatgca
tcagtaggagtagattatatttttagtttaacaagtccctcaggatgtacatttacagaa
acagttcgcgttaatgttacaccactaccatcagctccgattactataacaggcgacaaa
acagtttgtattggtattcaaaggacatataatataactgctattcctaatgctacttct
taccgatggacattacctaacggtagtactacagataccaatatcacctcacttatagta
gattattcagtagtaactagttcgggtaatttaagcgttgcaggtgtcaattcctgtgga
gttggagttgctaagacagaagttataaccgtacttgctccaccagctttaagcagttca
ttaactgctacggtttgttcaggaagtccatttgcatatacagctacaagttctaatagt
agttctacaatgagttggtctagagcggttgtacctggtatttccaatgtatcagctaca
tcaattacaggtaatataagtgagacattggtcaatactactagtttgccaatagaggtt
gtttatgtatatactttaacattaaatggttgtaccaatactcagatagtaacagttacg
gttaatccgaatgatttacttttaaatatcccgagtgctgtagaattatgttcaggtgct
acatttaattttacgcccactacaagtatagatggatctatattcagttggaatagaggc
acagttgtaagaataacaccaactattaatgagaggttagataataatggaactacacct
ataaacgttgtttataattataagttaacaacagcagagggttgtataagtccaaatagg
agttttacggtaaaagtaaatccttcacctaaattaattaacattccaacaacctctttt
tgtacaacatcaaaccaatccgtaacatttacatataatcctacagccaatataccagga
gttaatatttcttggaccagagctgccaaagatgaaatccaagaatcatcaagttcagga
ataaatagtgaaatttcagaaacacttacaagtacttcaactactaaaactgtttttgct
gattattcctttgttcttgatgatactgttaatggttgtgatgcaacagatagtttttcg
gtaagattagagaaaatacctgacgggatacccgtaattgaaggagatcaaatggtttgt
gcaggaagcagcaataatagatataaagcgagtttcagcacaaatacttctagatatgta
tggacattacctaatggtaacgaaattacaacctcttcggatactattaatctaaatttt
ccaaccacgaccacttcttattttttaaaagttgaaggtataaatacatgtgggagaagc
actatttcggatagttatcctattacggtaattcctccgcctacattaagtagtcccaaa
acggctagcatatgttcaggttctttatttgcttatacaccgaatagttcggatggaaat
gctagatatacttggagtaggcctgcgattgatggtatttcaaatccacaatcaacagat
attactggaaatatcgaagaagtattagtgaatacaactaatttaccgattgatgtactt
tataggtttacaatatttacaacaggaggttgtaaaaatatccaagatttgattgttaca
gttaaaccaacgcctaacttaatcgagcctactttagatcaagttgcttgttcaggaaat
gtatatagttatataccaagttttagtttgccagtaacaacatttaattggacaagagtt
gctgttgtaggaattactccttttacacctccagtagtagcttcagtgagttcattaaca
gaaaccttaactaatactacatcttcaccaattgaggttgtttatcaacttacggctaca
agtggtggttgtagtaagacatcggagttaagggttttagttcaaccttcaccatcggca
gctggaacaattacaggtccaacaataatttgttcagggtcattaaatcaagagtttaga
gttcctgtaataccaaatgcaactacatatgactggacgttgccaacaggcgcagttatc
acagatggtttaaatacaaatgttatcaaagttaattttggtagcggagttgcatcgggt
aatgttgttgtcaaaggattaaattcgtgtggagaaggtataagtactacattaccaatt
acaatagttccattacctacattgagtagtccacaaacggctaatatttgttcaggttct
gaatttacctacaccccaattagttcggatagcagtacagcttttagatggagtagagct
acaatgataggtatttccaatccaagtgctacaggtacaggagtaatagttgagacatta
atcaacacaactggtcttccgataaatgttgtttatgagtatgaattagaaaatgaacaa
ggatgtatatcgacacaacaagtcacggttacagttaaaccaacgcctaacttaatcgag
cctactttagatcaagttgcttgttcaggaaatgtatatagttatataccaagttttagt
ttgccagtaacaacatttaattggacaagagttgctgttgtaggaattactccttttaca
cctccagtagtagcttcagtgagttcattaacagaaaccttaactaatactacatcttca
ccaattgaggttgtttatcaacttacggctacaagtggtggttgtagtaagacatcggag
ttaagggttttagttcaaccttcaccatcggcagctggaacaattacaggtccaacaata
atttgttcagggtcattaaatcaagagtttagagttcctgtaataccaaatgcaactaca
tatgactggacgttgccaacaggcgcagttatcacagatggtttaaatacaaatgttatc
aaagttaattttggtagcggagttgcatcgggtaatgttgttgtcaaaggattaaattcg
tgtggagaaggtataagtactacattaccaattacaatagttccattacctacattgagt
agtccacaaacggctaatatttgttcaggttctgaatttacctacaccccaattagttcg
gatagcagtacagcttttagatggagtagagctacaatgataggtatttccaatccaagt
gctacaggtacaggagtaatagttgagacattaatcaacacaactggtcttccgataaat
gttgtttatgagtatgaattagaaaatgaacaaggatgtatatcgacacaacaagtcacg
gttacagttaaaccaacgcctaacttaatcgagcctactttagatcaagttgcttgttca
ggaaatgtatatagttatataccaagttttagtttgccagtaacaacatttaattggaca
agagttgctgttgtaggaattactccttttacacctccagtagtagcttcagtgagttca
ttaacagaaaccttaactaatactacatcttcaccaattgaggttgtttatcaacttacg
gctacaagtggtggttgtagtaagacatcggagttaagggttttagttcaaccttcacca
tcggcagctggaacaattacaggtccaacaataatttgttcagggtcattaaatcaagag
tttagagttcctgtaataccaaatgcaactacatatgactggacgttgccaacaggcgca
gttatcacagatggtttaaatacaaatgttatcaaagttaattttggtagcggagttgca
tcgggtaatgttgttgtcaaaggattaaattcgtgtggagaaggtatagcattttcatta
cctgttactatctatcaaaacgcaatggttagtttagtttcaggaaatccaaacacaaca
ttgtgcatggggtcttcatttgttacccctattaaatatgctatatcaccttcaacagaa
gagttgaaattgactggtaaattgcctgcgggtgttgattttacatcatcaacaggaata
atcacaggtactccaactgagagtggttcttttccatttacaatcacatctacttcaaac
tgtagtaatagtttgtcaggaattattgtagtgaatccattacaatcgattgctaaattg
tctggaacagttaatcaaatcgcttgtatcaacaccgagatagatccaatcgtttattca
attgctaaaggaacaacaggtgtgttaataaatccagtattgcctttaggaatagtagca
actgtagatgaagttaatggattagtttcaatttctggaacaccaactgtagcaacaagt
ttagcacaaaactatgtgataacgacacaaggtagttgtggttcacctgctagtacaact
atcagttttgatataaaaccggcagtgatattggattttataagtccaacagcaacatta
aatcaagcagtttgtttaaatggtccaattatacctattcgattcagtgtcggtggtggc
gccactggaattattacacctgttttaccagctggtttaactatttctcaagatccacta
actttggtttacaccatacaaggtaatccaaccgccaatggtacatttacaatcccaata
acaacaacaggatgtaccaaaacggagataattacaatttcaaacgttaatactgccgta
tcaattgatttattgtcagcctctggaacagatcaacaaactttatgtcagactaatttt
aattctccaatagtaccaattcagtatactattgttggtgcaacttcagtacaagttttg
ggtttgccttcaggagtcaattttgtatatgattcagctataagtaagctagttattagt
ggtactccaatacaaacaggaatatttaattatacaattacttccttgccatgtagtatt
ataaaaactggagttcttaaagtttcaattccaatgtttatttcaagcgagtctgttaaa
aatgttagttgtagtaaagttaatgatggagaaattgcagttacgattattggaggtgtg
cctttgtcgggctcatattcggttcaatggactggacctaataattttcaacaaaataga
ttgaatataactggacttcaagcaggggaatatactttaacaggaagagatgcaataggt
tgcttaatcccctcaaaaaaatacacaatattacctgcatcgccaataaatatctcactt
gtttctactacaaatattagttgtaacggttctttaggttgtgcaaacctaaattatacg
ggtggaacgggtatttatactaatttcgttttacagtttttagacccttcattacaaatg
tggacatcagtaccgaatccttcaaataattatttcaacgtttgtaatcttaaagcaggt
ttgtataggattgcagttacagatagtaattcttgtaccacagaaccttttcaattcacc
atttatgattatggatcactgaaaattgattctgtaaatttagataataaactatgctct
acctctggtggtaaggtaagagtttcactttctactttggatccaaatcttacatttttt
tataataatgtagtagttccttttacaaaaattggaaataaactttatgaattatctatt
agtaatcctacttctcctacaggtaatattaaagttacaaataatgaaaactgttgggat
acaattacattaaatacaactgtaattaatcctagcttaagttttacttcattgaattta
actacttatggaaatgtttctgttaatgaaagcattaagtttactaatggtttaacagcc
actactattcctccagagtacgattacttagtttgggattttggagacaatagtccgttg
aaggtgttttataaccctgaggatattaacccaaatagtgatggagagagtttgacgact
gtatttcattcttatgcaaaggatggactgtacactgtaacattgatagcctataatcaa
tttggttgttctaaatcaataacagaagtaattaccgtggggcaaggtgctagtataatg
gctccaactgccttctcaccaaacaatgatggaattaacgatttgtttagaccttcattg
ttaggattaaaagaagtgaatgtaaatatttatgatcattggggtaatctaatttatgag
attacttccgataccgcttcacttccaaccgattggggttggaatggtctcgagaatggc
aagtcggaacctgttaatggaacctatcgttattacatcatggctaaaactatcaatgat
ttaattattgaaaaagagggtcagtttattttaattaaataa

DBGET integrated database retrieval system