Flavobacterium cyclinae: LOS86_06530
Help
Entry
LOS86_06530 CDS
T08416
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
fcc
Flavobacterium cyclinae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS22274
LinkDB
All DBs
Position
1383046..1387536
Genome browser
AA seq
1496 aa
AA seq
DB search
MKIFFRIVFVLYVFFLGGTESFAQITINNTLYTPTQLVDGVLVPSTSGTIISNVQFRGVY
NSSNRYQVGYFSTATTTLAQLGFSNGIVLSTGNTSTIPLALGSNPRATQMATAYTSGTPG
ELRQTGTPAPPIIQDLDVLAGASNYFNGAILEFDFIPVENSVSFRYVFGSEEYSDNSGSI
NYQCSNYNDKFGFLISGPGISGGQGFSNDARNIARLGNGSEVSINSVNSGVVGSSGGAPS
ASNCLAANASWVQNTPTPEFLGTIDGTQLNGNTRILTATQTGLTPGQTYHIKLIITDVGD
ATYDSVVYLEAGSFTTEFSCDAGANQSLCDVTSTTLAAVSPATGTWSVISGSGTFVSNTD
PNTIVNGLAPGANVLRWTASDLSCFSEVTINVNLSPAVPTITTTPADCSSAGVSTITNYN
ASNTYTFSPVGPTVGAGGVVSGMTVGTIYTVTASLSGCTSAASATFSIDPQLPPTTPTIS
TTAPTCSSAGVSTITNYSASNIYTFTPVGPTVGAGGIISGMTVGTSYTVTADNGICLTPQ
SASFSIAAQLPTPAVPAITTTPADCSSAGVSTITNYNTSNTYTFSPVGPTVGAGGVVSGM
TVGTIYTVTASLSGCTSAASATFSIDPQLPPTTPTISTTAPTCSSAGVSTITNYSASNIY
TFTPVGPTVGAGGLISGMTVGTSYTVTADNGICLTPQSASFSNAAQLPTPAVPTITTTPA
DCSSAGVSTITNYNASNTYTFSPVGPTVGAGGVVSGMTVGTIYTVTASLSGCTSAASATF
SIDPQLPPTTPTISTTAPTCSSAGVSTITNYSASNIYTFTPVGPTVGAGGVISGMTVGTS
YTVTADNGICLTPQSASFSIAAQLPTPAVPTITSVAATCSASGSSTISNYNASNTYTFSP
VGPTVGAGGLISGMTFGTIYTVTASLGGCISTASASFSNAPQLSTPDEPTITSLAATCSS
AGSSTISNYNASNTYTFSPVGPTVGAGGLISGMTFGTSYTVTATNGGCTSLASASFSNDA
QLPTPTVPTITTTPADCSSAGSSTILNYIASNTYTFTPVGPTVGAGGLISGMTVGTSYTV
TATNGGCTSAASASFSNAAQLPTPVVPTITSVAATCSAAGSSTISNYNASNTYTFSPVGP
TVGAGGLISGMTVGTSYTVTATDGGCTSAASASFSNEAQLPTPAVPTITSVAADCSAAGS
STISNYNASNTYTFSPVGPTVGAGGLISGMTVGTSYTVTAINGGCTSAASASFSNAAQLP
TPAVPTITSVAADCSASGSSTISNYNASNTYTFTPVGPTVGAGGLISGMTFGTSYTVTAT
NGGCTSAASASFSNDAQLESPSVSITHGCNGLDYELIASETINATYQWFDGNGNLIGSSP
IIVIDNSDTYEVQVTLNGCMTNEYVTINNSFCSIPKGISPNNDGDNDSWDLSNLNIQKAQ
IFNRYGVEVYTKDNYTNEWEGRTNSGDELPTATYYYVLTFSNGTVKTGWVYLNRVN
NT seq
4491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatatttttcagaattgtttttgtattgtatgtgttttttttgggtgggacagaa
tcttttgctcaaattacaattaataatacattatacactccaacgcaattggttgatggt
gtattagttccttctacaagtggaactataatctcaaatgttcaatttaggggtgtttat
aatagttcaaatcgatatcaagttggttatttttctacagctactacaacattagcccaa
ttaggattttccaatggtattgtgttgtctactggaaatacgtcaacaattccccttgct
ttaggttcaaatcctagagcaactcaaatggctacagcatatacttcaggcacgccagga
gaattgagacaaacaggaacgccagcacctccaataattcaagatttagatgttttagca
ggggcaagtaattatttcaacggtgcaattttagaatttgattttatacctgtagaaaat
tcggtttcatttagatatgttttcggatctgaggaatatagtgataattctggatcaatt
aattatcaatgttcaaattataatgataaatttggatttttaatcagtggtccagggatt
tcaggtggtcaaggcttttctaatgatgccagaaatattgctcgattaggaaatggatct
gaagtttctatcaactcggttaattctggagttgttggttctagtggaggagctcctagt
gcatcaaactgtttagcagctaatgcttcttgggttcaaaatacacctactcctgaattt
ttaggtactattgatggaacacaattaaatggtaatacaagaattcttactgctactcaa
acaggcttaactccaggtcaaacctaccatatcaaattaattattactgatgtaggagat
gctacctatgatagtgttgtttatttagaagcgggaagttttactactgaattttcttgt
gatgcaggtgctaatcaatcgttatgtgatgtaacttcaactactttagctgctgtttct
ccagcaactggtacatggagtgtaatatctggttcaggtacatttgtatcaaatacagac
ccaaatactattgttaacggacttgctcctggggcaaatgttttaagatggactgcatct
gatttatcatgtttttctgaagttacaataaatgtgaatttatctcctgcagttcctaca
attacaacaaccccagcggattgttcatcagcaggagtatcaacaatcacaaattacaac
gcatcaaatacctatactttctcaccagttggaccaacagttggagctggtggagttgtt
tctggcatgaccgttggaacaatttatactgtaactgcttcattaagtggatgtacatct
gcagcatcagctacttttagtatcgacccacaattacctccaacaacgccaactatttca
acaacagcaccaacatgttcatctgctggagtgtcaacaatcactaattatagtgcttca
aatatttatacgttcacaccagttgggccaacagttggagcaggaggaattatttcagga
atgaccgttggaacaagttatacagttacagctgataatggtatttgtttgacccctcaa
tcagctagtttcagcattgcggcacaattaccgacacctgcagttcctgcaattacaaca
accccagcggattgttcatcagcaggagtatcaacaattacaaattacaatacttcgaat
acttatactttctcaccagttggaccaacagttggagctggaggagttgtttcaggtatg
accgttggaacaatttatactgtaactgcttcattaagtggatgtacatctgcagcatca
gctacttttagtatcgacccccaattaccaccaacaacgccaactatttcaacaacggca
ccaacatgttcatctgctggagtatctacaatcactaattatagtgcttcaaatatttat
acgttcacaccagttgggccaacagttggagcaggaggattaatttcaggaatgaccgtt
ggaacaagttatacagttacagctgataatggtatttgtttgacccctcaatcagctagt
tttagcaatgcggcacaattaccgacacctgcagttcctacaattacaacaactccagcg
gattgttcatcagcaggagtatcaacaattacaaattacaatgcttcgaatacctatact
ttctcaccagttggaccaacagttggagctggtggagttgtttcaggtatgaccgttgga
acaatttatactgtaactgcttcattaagtggatgtacatctgcagcatcagctactttt
agtatcgacccccaattaccaccaacaacgccaactatttcaacaacggcaccaacatgt
tcatctgctggagtatctacaatcactaattatagtgcttcaaatatttatacgttcaca
ccagttggaccaacagttggagcaggaggagttatttcaggaatgaccgttggaacaagt
tatacagttaccgccgataatggtatttgtttgacacctcaatcagctagtttcagtatt
gctgcacaattaccaacaccagctgtaccaacgattacttcagttgcagctacttgttct
gcatcaggaagttcaacaatttcaaattacaacgcatcaaatacgtatacattctcacct
gtaggaccaacagttggcgcaggaggattgatttcaggaatgacatttggaacaatttat
actgttactgcttcattaggtgggtgtatttcaacagcatcagctagttttagtaatgca
ccacaattgtcaacacctgatgagccaacgattacttcattagcggctacatgttcatca
gcaggaagttcaacgatttcaaattacaatgcatcgaatacatacacattttcaccagtt
ggaccaacagttggagcaggaggtttaatttctggaatgacatttggaacaagttataca
gtaacagcaaccaatggaggatgtacttcattagcatcagctagttttagtaatgatgcg
caattaccaacacctacagttcctacaattacaacaactccagcggattgttcatcagca
ggaagttcaacgatattaaattatattgcatctaatacatacacgttcacaccagttgga
ccaacagttggagcaggaggattgatttcaggtatgacagttggaacaagttatacagta
acagcaaccaatggaggatgtacttcagcagcatcagctagttttagtaatgcagctcag
ttaccaacaccagttgtaccaacgattacttcagtagcggctacatgttcagcagctgga
agttcaacgatttcaaattacaatgcatcgaatacatacacgttttcaccagttggacca
acagttggcgcaggaggattgatttcaggtatgacagttggaacaagttatacagtaaca
gcaaccgatggaggatgtacttcagcagcatcagctagttttagtaatgaagcacaatta
ccaacaccagctgtaccaacaattacttcagtagcagcagattgttcagcagcaggtagt
tcaacgatttcaaattacaatgcatcgaatacctatacgttttcaccagttggaccaaca
gttggcgcaggaggattgatttcaggtatgaccgttggaacaagttatacagtaacagca
attaatggaggatgtacttcagcagcatcagctagttttagtaatgcagcacaattacca
acaccagctgtaccaacaattacttcagtagcagcagattgttctgcatcaggaagttca
acgatttcaaattacaatgcatcgaatacatacacgttcacaccagttggaccaacggtt
ggcgcaggaggattgatttcaggtatgacatttggaacaagttatacagtaacagcaacc
aatggaggatgtacttcagcggcatcagctagttttagtaatgatgcgcaattagaatca
ccatctgtatcaattacccatggttgtaatggtttagattatgaattaatagcttctgaa
acgattaatgcaacttatcaatggtttgatggtaatggaaatttaattggttcatcacca
attatagttattgataattcagatacttatgaagtgcaagtaactttaaacggatgtatg
acaaatgaatatgtaacaataaacaattctttttgttctattccaaaaggtatctctcca
aataatgatggagataatgactcatgggatctttccaatttaaatattcaaaaagctcaa
atctttaatcgttatggtgtagaggtttatacaaaggataattatacaaatgagtgggaa
ggaagaacaaattcaggagatgaattaccaacagcaacttattattatgttcttacattt
tcaaatggaactgtgaaaactggatgggtttatttaaatagagtaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
