Flavobacterium columnare: FCOL_00710
Help
Entry
FCOL_00710 CDS
T01653
Name
(GenBank) ATP-dependent exodeoxyribonuclease
Organism
fco
Flavobacterium columnare
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
UvrD_C_2
PIF1
Viral_helicase1
NB-ARC
AAA_11
PhoH
UvrD_C
nSTAND3
AAA_22
SLFN-g3_helicase
AAA_16
Helicase_RecD
TsaE
NACHT
cobW
ResIII
AAA
ATPase_2
Thymidylate_kin
ABC_tran
T2SSE
AAA_14
SRP54
PYC_OADA
RsgA_GTPase
AAA_7
AAA_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW84993
UniProt:
G8X856
LinkDB
All DBs
Position
174911..176335
Genome browser
AA seq
474 aa
AA seq
DB search
MSSILFYSILRKKFPFQPTVKQDVFFGKVAEFVESSNKNELFVLKGYAGTGKTTLISTIV
NHLAEVQKKYVLLAPTGRAAKVIANYSEKQAFTIHKKIYFPKKGSGGGVRFTMQTNKHTN
TIFIVDESSMISDVDTDSTLYGSSSLLDDLMSYVYSGQNCKMIMIGDTAQLPPVNLDISP
ALNVETLSLNYDKEVYSIELDEVMRQEANSGILYNATELRELLKDHFVTAFQFKLKGFKD
IFRLTDGYDIQDAINQAYSNYSIEDTTFIVRSNKRANQYNQQIRSKILGKESELSVGDFL
MVVKNNYFWLKDSDEAGFIANGDIIEVLEIRSIKELYGFKFAVVKIRMVDYPNQRPLDTI
LLLDTITSESPSLTYEESNKLYQEVTKDYENERAQYKKYQKVKNNEYFNALQVKFSYAIT
CHKSQGGQWNIVFIEQPYLASDIDKDFVRWLYTAMTRAKDKLYLIGFKDEFFNI
NT seq
1425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttcgatattattttacagtattttacgaaaaaaatttccctttcaacctactgta
aaacaggatgttttttttggtaaagtggctgaatttgtagaaagttcaaataaaaatgaa
ctgtttgtgctaaaaggatatgcaggtactggtaaaactactttgatttccactatagta
aatcatttagcggaggttcaaaagaaatatgttttgttagcacctacaggtagagctgca
aaggtaattgctaattattctgaaaaacaagcatttacgatacataagaaaatttatttc
cctaaaaaaggcagtggaggaggtgttcgttttacgatgcaaactaataaacataccaat
actatttttattgtagatgagtcttctatgatttcagatgtagatacagattctacatta
tatggaagcagttcattgttggatgatttgatgtcgtatgtatattcgggacaaaattgt
aaaatgattatgataggcgatacggctcagttgcctcctgttaatttagatatttcgcct
gcgttaaatgtagaaacgttaagtttaaattatgataaggaggtttattcaatagaatta
gatgaagttatgcgtcaagaagctaattcaggaattttgtataatgctactgaattaaga
gaattattgaaggatcattttgttacagcctttcaatttaaattaaaaggctttaaagat
atttttagattaactgatggatatgatatacaagatgcaatcaatcaggcttatagtaat
tatagtatagaggacacaacctttattgttcgttctaataaaagagctaatcagtataat
caacagatacggtctaaaatattaggtaaagaaagtgagttatcggtaggtgacttttta
atggttgtgaaaaataattacttttggttgaaggattcagatgaagcgggttttattgcg
aatggtgatattattgaggttttagaaattcgttctataaaggaattatatggttttaaa
tttgcagttgttaaaataagaatggtagattatcctaatcaacgacctttggatactatt
ttgttattagatacgataacgagtgagtccccttcattaacttatgaagagtcaaataaa
ctgtatcaggaagtaacgaaggattatgaaaatgaacgagcacaatataaaaagtatcaa
aaagtaaaaaataatgaatattttaatgctcttcaagtaaaattttcgtacgctattact
tgtcataaatcacaaggaggacaatggaacatagtttttatagaacaaccttatttagct
agtgatatagataaggattttgtgcgttggttgtatactgctatgacccgtgcaaaagat
aagttgtatttgattggttttaaagatgaattttttaatatataa
DBGET
integrated database retrieval system