Flavobacterium crocinum: HYN56_19110
Help
Entry
HYN56_19110 CDS
T06596
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fcr
Flavobacterium crocinum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fcr02000
]
HYN56_19110
Transporters [BR:
fcr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HYN56_19110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK06222
UniProt:
A0A2S1YQD2
LinkDB
All DBs
Position
complement(4309551..4312766)
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MKKYIWSILVVLFLTVSAYAQKRVTVSGTVRDNMGLIPGATIIVKNENTNTVTDFDGKFS
IPVNDPATAVLIVKFIGLTDETVAVKGRTSGITVQMKESNSELNEVVVIGYGTQKRKNLT
GAVASIKGTELAKVPTANVAEALTGRLPGVQVTTVDGSPGAEVKIRIRGGGSITEDNSPL
ILVDGFEVANLNDIPPTDIESVEVLKDAASTAVYGARGANGVIIVTTKVPKAGKVQVNIH
NYTQIKTLANHLDVMDPYEFVMLQYENARKGSSNPTAFYNQYGKANELYIYKGNKGTDWQ
DEIFGSNPIARYTDINVNGGSEKTKFKFTFVNQDQPGALVGTGMRQNYVYLIMNTKLTDN
LLFEYQTRLTNQTIDGSGTDGVSLLRALREAPTGGLEDYMTLPDDNTYFDPEDYQTKPRF
NPLEEAEKNYRKRITRIFNTQGALTWTIQKGLTLRSSFGYEYKYAEDGRFWGTDTRTATD
NNNLPVVYWSMTQSPRWQLNNVLNYGFKVKERHDFQLMIGQEIKDQESKAKFYRSRYFPD
DISGPKALDNLALGTPFDNGSLAESPNRIASFFGRANYGYDDRYLFTFTVRTDGSTKFGP
DNRWGVFPAGAFAWRISNESFLKESQTVSNLKLRLSYGASGNDRIKADLYAKYYGVSRDR
SIGWGEQNQYYYNFYNSQYLNNPNVKWETTYTANAGLDFGFFKERLTGTLDFYYNKVKDL
LVPSDIASVSGFTKMMTNVGQTSNKGVELALNGSVIRKKDFQVDLTFNIGYNKNKIDKLA
SGEQEWILSSGWAGTQLLNDDDYRAYVGGTKGLIYGFVNDGFYTMDDFESFDAVTRVWKL
KEGVANSKNLSGEPVPGSAKFKKLTPTDPSDPNSYVIGDKDRKVIGDTNPDFSGGFGVNA
VWKNFDLTAFFNFMYGFDVYNANKIMMTSFFQNNQNNFGMEVGLDKRWRNYDDMGNDLRY
SPELLAKQNENATMWNPVSIGRPIAMSYAVEDGSFLRLNTLSIGYTIPKQQSKAIGLSRV
RLYATGSNLFVWTNYSGYDPDINLETGLTPNIDYNAYPRTRNYAFGVQLSF
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatatatctggagcattttagtcgtactgtttttgacagttagtgcttatgct
cagaagcgtgttactgtaagcggtacagtaagggataacatggggcttattcccggcgca
accattattgtaaagaatgaaaatactaataccgttaccgattttgacgggaaattcagt
atcccggtaaatgacccggcaacagcagttttgattgtcaaatttattgggttaaccgat
gagactgtagcggtaaaaggacgtacttccggaattacagttcagatgaaagaatcgaac
agtgaattgaatgaagttgtcgttattggttacggtacacaaaaacgtaaaaacttaaca
ggtgccgttgccagtataaaaggaacggaactggcaaaagtgccaactgctaacgtggcc
gaagctttgacaggaagacttcccggagttcaggttactactgttgatggttcgccgggt
gcagaggtaaagattagaattcgtggtggaggatctattacagaagacaattcgcctttg
attttagtcgatggatttgaagttgcgaatctaaatgatattccgccaactgatattgaa
tcggtagaagttttaaaagacgcggcgtcaacagcggtttatggtgcgcgaggagcaaac
ggagttattattgttactactaaagtgccaaaagcaggaaaagttcaggtaaacattcat
aattatacccagattaaaacgcttgccaatcatttggatgtaatggatccgtatgagttt
gtgatgttgcagtatgagaatgcgcgtaaaggaagttctaatccaaccgcattttataat
cagtatggaaaagctaacgaattatatatttataaaggaaacaaaggtacagactggcag
gacgaaattttcggaagcaacccaattgccagatatactgatatcaatgtgaacggcgga
agcgaaaaaacaaaattcaaattcacgtttgtaaatcaggatcagcctggagctttagta
ggaacaggaatgcgtcagaattatgtttacctgattatgaataccaagctgacggataat
cttttgttcgaatatcagacgcgtttaaccaatcagactattgatggttctggtacagat
ggcgtgagtctccttagagctttacgcgaagcaccaacaggaggtttggaagattatatg
actttaccggatgacaacacttattttgatccggaagactatcaaacaaaacctcgtttt
aacccgttggaagaagcagaaaagaattaccgtaaacgtattacgagaatttttaataca
caaggagccttgacttggacaatccaaaaaggactgacattacgttcttcttttggttac
gaatacaaatatgcagaagacggacgtttttggggaaccgatacgcgtacggcaaccgat
aataacaatctaccagtagtatattggtcgatgacacaatcgccacgctggcagttgaat
aacgtattaaactacggattcaaagtaaaagagcgtcacgattttcagttgatgatcgga
caagagatcaaagatcaggaatctaaggctaaattttaccgttcccgttattttcctgac
gatatttcgggcccaaaagctttggataacttggcattaggaactcctttcgacaatggt
tcattggctgaatctccaaacagaatcgcttccttttttggaagagccaattacggttat
gatgatcgttacttatttacattcacggttcgtaccgatggttctacaaagtttggtccg
gataatagatggggcgttttccctgcaggagcttttgcctggagaatttcaaacgaaagt
ttcttaaaggaaagtcagactgtttctaatcttaaacttcgtttgagttatggagcttca
ggaaatgacagaattaaagccgatttatatgcgaaatattatggtgtttccagagatcgt
tctataggctggggagagcaaaatcaatattattataatttttacaacagtcagtatctg
aacaatccaaacgtaaagtgggagacaacttatacagctaacgcaggtcttgattttggt
ttcttcaaagaaagattaacaggaacacttgatttctattacaataaagtaaaagattta
ttggtgccttctgatatcgcttcggtttccggttttaccaaaatgatgacgaatgttgga
cagacttctaataaaggtgttgaattggcgcttaacggaagtgtaattagaaaaaaagac
tttcaggttgatctgactttcaacattggttacaacaaaaataaaattgacaaactggca
agcggagaacaggaatggattttaagttcgggctgggcaggaacgcagttattaaatgac
gatgattaccgtgcatatgtcggcggaacaaaaggtttgatttacggtttcgtaaatgac
ggattctatacaatggatgatttcgaatcttttgatgctgtaaccagagtttggaaacta
aaagaaggagttgccaactcaaaaaacctttcaggagagccggttccgggaagtgcaaag
tttaaaaaattaactccaactgatccttcagacccaaacagctatgtaattggagataaa
gacagaaaagtgatcggagatacaaatcctgatttctctggtggatttggtgtgaatgcc
gtttggaaaaacttcgatttaacagcattcttcaatttcatgtatggttttgatgtgtac
aatgctaataagattatgatgacttctttcttccaaaacaaccaaaacaattttggaatg
gaagtaggattggataaacgctggagaaattatgacgatatggggaatgatcttcgttat
tctcctgaattactggcaaaacaaaacgaaaatgctacgatgtggaatccggtaagtatt
ggtcgtccaattgcaatgtcttatgcagttgaagatggttctttcttaagattaaatacg
ctgagtattggttacacaattccaaaacaacaaagtaaagcaataggattaagccgagta
agattgtatgctacaggaagtaacttatttgtgtggacaaactattcaggatatgatccg
gatatcaatttagaaacaggtcttacaccaaacattgattataacgcttatccaagaacg
cgtaactacgcttttggagtacagctgtcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system