Flavobacterium endoglycinae: J0383_04835
Help
Entry
J0383_04835 CDS
T08015
Name
(GenBank) DUF11 domain-containing protein
Organism
fen
Flavobacterium endoglycinae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
DUF11
Cadherin_3
Cadherin_5
CHU_C
CARDB
RCC1
NPCBM_assoc
TRAP_beta
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSW90145
LinkDB
All DBs
Position
complement(1098940..1107690)
Genome browser
AA seq
2916 aa
AA seq
DB search
MIKNYFNLYSGSNLQKAIALFFVFFACSQFLNAQCAIPITGCSGTNLSNFGADSNNDASS
IEYDNFVSSFHSTIVRTSDGSLQVWGERMANNGTSNVLSPRVINRTNYPALSASATPLKA
ALGSSSANNTQGILLATDGLYAWSTEGAVLHADITSSTSFQKITIGGNTNGLPSGVVPGD
VKMMFATYGTLAITTCSGDVWVISQTASVRGNGSAGDALNWYKVTTADTGNPDLTGVVAC
RGNYNGLMALKSDGTVYVWGNNVLLGNNTAIIASQNRAVQMTLPASITPKMIGSTGNLTE
RSYYVLATDGNLYALGENSGRQLGNWATADRLSWVQPKYTSANGTEMNNIKWISVQEHDT
EYGAVNVINSNYNLYAFGQNDYNLLGTSANPANPIMPSGISASDRILAVETGGHTSMIVK
SCETKFGYAGHRIRGSMGDGTNDTTQEATYTFATADVQICGAESNPVIQPISTGGGPDSK
YCIDDPVLLNPTPAGGTLTFVSGPGTLSGNTLTFTGAGIVSVQYSVTTSCGGTIVTTRNF
EGAVCPADLEVTKTVNNATPSVGSDVIFTVTAKNNGPYKATGITVTDVLPSGYTLVSAVP
SSGTWSAPDWTVGSLANGASSTLAVTATVNPTGSYANTATISGNNPDNTTGNDSATATPL
IQTNLSVTKNISNTTPNVGSMVTFTITASNAGPSAATGVKVTDVLPSGYTFVSATPSTGT
WAGTEWTIGNLAIGASTTLTMEAIINATGSYVNTASISGEQDDPTQGNNAGTVTPVINQP
PSADSAVNSPIASSAGASSVNTLTASDTDGTIVSYTVVSLPLHGILALNGTPVSAGQVLS
PLEASQLTYDPAGDFTGDDTFTFTALDNLNAVSNTAVITIPVGNNAPSADSAVNAPIASS
AGASALNALTASDTDGTIASFTITALPVHGILALNGIAVIAGQVLSPLEASQLTYDPAGN
FTGDDSFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNASIASSAGASAVNALTASDT
DGTIASFTIVSLPLHGTLALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGNFTGDDTFTFTALDN
LNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNAPIASSAGASAVNALTASDTDGTIVSFTITALPL
HGTLALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGDFTGDDTFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPV
GNNAPSADSAVNASIASSAGASAVNALTASDTDGTIASFTIVSLPLHGTLALKGTPVSAG
QVLSPLEASQLTYDPAGNFTGDDSFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNAS
IASSAGASAVNALTASDTDGTIASFTIVSLPLHGTLALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYD
PAGNFTGDDSFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNASIASSAGASAVNALT
ASDTDGTIASFTIVSLPLHGTLALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGNFTGDDTFTFT
ALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNAPIASSAGASAVNALTASDTDGTIASFTIV
SLPLHGTLALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGDFTGDDSFTFTALDNLNAVSNTAVV
TIPVGNNAPSADSAVNASIASSAGASAVNALTASDTDGTIASFTIVSLPLHGTLALNGTP
VSAGQVLSTLEASQLTYDPAGNFTGDDSFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSA
VNASIASSAGASAVNALTAFDTDGTIVSYTVVSLPLHGILALNGTPVSAGQVLSPLEASQ
LTYDPAGNFTGDDTFTFTALDNLNAVSNTAVVTIPVGNNAPSADSAVNAPIASSAGASAV
NALTASDTDGTIVSFTIVSLPLHGTLALNGTPVSAGQVLSTLEASQLTYDPAGNFTGDDS
FTFTALDNLNAVSNTAVITIPVGNNAPSADSAVNAPIASSAGASAVNALTASDTDGTIVS
FTITALPVHGILALNGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGDFTGDDTFTFTALDNLNAVSN
TAVITIPVGNNAPSADSAVNAPIASSAGASSVNALTASDTDGTIASFTITALPLHGTLAL
NGTPVSAGQVLSPLEASQLTYDPAGDFTGDDTFTFTALDNLNAVSNTAVITIPVGNNAPS
ADSAVNAPIASSAGASSVNALTASDTDGTIASFTITALPLHGTLALNGTPVSAGQVLSPL
EASQLTYDPAGDFTGDDTFTFTALDNLNAVSNTAVITIPVENNAPVANNDTNLPVLASAG
PTAVNALTATDTDGTIVSFTIVTLPVHGTLALNGIAVIAGQVLSPLEAGQLTYDPSGTFS
GNDSFTFTATDNNGAVDTTPAVVIIPIEKRNLTAVRDEIGTVVGINEQLELINVFDNDTV
DNNPLTPNEVNLTIITPDPSNVLTLQPDGTAVLIPNAPAGTYTLTYEICEKTNAANCATA
TVTVTVVAPVMSIEAESYCSDNTPYVRYSVKAENFAPSGLLTIRWIDSANRVVATQNDMP
LNGTVLWPGAVVDAGNKPTDWPGWIFQNGQWQQGNDGFELTRPSVTMQFTLNPTQSVTVN
YPLASAGCNASPVFGIEAVNEDDTVAADGINGSLEVINVLDNDTLNGFPVNAQDVILTAQ
NFPQGITLNPDGTIDVAPGTAGGDHNLTYQICEKANPNNCSSATVHLFVEVPAVALIMEV
KVNDENGNGNVEAGETLTYTFVVKNTGNVPLSNIQISDLLPGVIITGGPITLAVGQSDTS
TFTGTYTLTQADINAGSVTNQASVSGLSPLGVTTSDTSDSKELNGNNPTVIELDGCSIKI
YNAVSLNGDGMNERFYIRGIECYPDNTVQIFNRWGVLVFEREHYNNNDIVFKGYSEGRTT
VKGSEGLPEGTYYYILRYKSDTAKTKQEAGYLYLTK
NT seq
8751 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaactactttaatttatacagcggatcaaatttacaaaaagcaattgctttg
ttttttgtgttttttgcatgcagccagttcttaaatgcgcagtgcgcaattcccataaca
ggctgttcgggtaccaatttatctaattttggagccgattcaaataatgatgcctcatct
attgaatacgataattttgtatcgagttttcacagtaccattgtaagaacttcagacggc
tctcttcaagtatggggggagagaatggcaaataatggaacttctaatgtattgtcacca
cgtgtcataaacagaaccaattatccggctttaagtgcaagtgctacgcctttgaaagcg
gccttggggagcagttctgcgaataatactcagggaatactgctggcgacagatggatta
tatgcgtggtcaacagaaggagcagttcttcatgcggacatcacttcaagtacctccttt
caaaagataaccataggaggtaataccaatggtcttccaagcggagttgttcctggtgat
gttaagatgatgtttgcaacttatggaacactagcaattactacctgtagcggtgatgta
tgggtaatttcccagactgcaagtgttagaggtaatggtagtgccggtgatgctttgaac
tggtacaaagtgacaactgccgatacaggaaatcctgatctgacaggtgttgttgcctgc
aggggtaattacaacggtcttatggctttaaagtcagatggtaccgtttacgtttgggga
aataatgttcttctaggaaataatacagcaatcatagctagtcagaacagagcggtacaa
atgaccttgcctgcatctataacccctaaaatgattggttctacaggtaacctaaccgag
agatcttactatgttctggcaactgatggaaatttgtatgctttgggagaaaacagtggg
agacagctaggaaattgggcaacagcggacagactgtcttgggtacagcccaaatataca
tctgctaatggcacagagatgaataatataaaatggatcagtgtgcaagagcatgatact
gagtatggcgctgtaaatgtgattaacagtaattacaatttatatgcttttggacaaaat
gattataatttacttggaaccagtgctaatcctgcgaaccctattatgccgagtggtatt
tctgcttcagaccgtattttagctgttgaaacaggagggcatacctctatgatagtgaaa
agctgtgagaccaaatttggttatgcagggcatcgaatcagaggaagtatgggagatgga
acaaatgatacgacccaagaagcaacttatactttcgctactgccgatgtacagatctgc
ggtgcagagtccaatccggtgatccagccaatttcaacaggaggaggtcccgattcaaaa
tattgtatagatgatccagtccttttaaatccaacacctgcaggaggtacgttaaccttt
gtgagcggtcctggaaccttatcaggcaatacgcttacttttacgggagcaggaattgtt
tcagtacagtattcagtaaccacttcatgcggcggaacaattgtaaccaccagaaatttt
gaaggtgccgtatgtcccgcggatctagaagttacaaaaacagtaaataatgctacgcca
agtgtaggaagcgatgttatatttacagtgacagctaaaaataatggtccttacaaggcg
actggtattacagtaacggatgtacttccttcaggatatactcttgtgagcgcagtacct
tcatcaggtacatggtctgcgcctgattggacagttggttctcttgctaacggagcaagc
agtacattggcagtgacagcaacagttaatcctacaggttcatatgctaatactgcgact
atttcaggaaataatcctgataatacaacaggtaacgattcggctaccgcgacaccttta
attcagactaatctttcggtaactaaaaatattagtaatactactccaaatgttgggagt
atggttacttttaccattacagcttcaaatgctggaccaagcgccgctacaggagttaaa
gtaaccgatgtgcttccttcaggttatacttttgtaagcgcaacgccttcgacaggaaca
tgggctggaacagaatggaccattggcaatctggctatcggagccagcacaacccttaca
atggaagccataataaatgcgacagggtcttatgtaaatacggcatcgatttccggagag
caagacgacccaactcaaggaaataacgcaggtacagtaacaccagttattaatcagccg
ccttcagcggattcggcagtgaattcccctatcgcttcatcagcaggagcttcctcagta
aatactcttacagcttctgatacagacggcacgattgtttcttatacggtggtttctctt
cctctgcacggaattctggcactgaacggaacaccggtttctgcggggcaggtgctttcg
cctttggaggcatcgcagcttacgtatgatcctgcgggtgattttacgggtgatgatact
tttactttcacggcacttgacaatttaaatgcggtatccaatacggcggttataacaatc
cctgtggggaataatgcgccttcagcagattcggcagtgaatgcccctattgcttcatca
gcaggagcttcagcattaaatgcccttacggcttctgacacggacgggacgattgcttcc
tttacaattactgcgttgccggtacatggaattctggctttaaacggaatagcagttatt
gcaggtcaggtgctgtcgcctttggaagcatcgcagcttacgtatgatcctgcggggaat
tttacaggagatgacagtttcaccttcacggcacttgataatttaaacgcggtatccaat
acggcagttgtaacaattcctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtgaat
gcttccatcgcttcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcccttacggcttctgataca
gacggaactattgcttcgtttacaattgtttctttaccgttgcatggaactttagcttta
aacggaacaccggtttctgcgggtcaggtattgtcgcctttggaggcgtcgcagcttacg
tatgatcctgcggggaattttacgggagatgatacatttaccttcacggcacttgataat
ttaaatgcagtatccaatacggcagttgtaacaatccctgtggggaacaatgcgccttca
gcagattcggcagtgaatgcccctatcgcttcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcc
cttacggcttctgatacagacggtacgattgtttcctttacaattactgccctgccgtta
catggaactttagctttaaacggaacaccggtttctgcagggcaggtattgtcgcctttg
gaggcatcgcagcttacgtatgatcctgcgggtgattttacgggagatgatacatttacc
tttacggctcttgataatttaaatgcggtatccaatacggcagttgtaacaattcctgtg
gggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtgaatgcttccatcgcttcatcagcagga
gcttcagcagtaaatgcccttacggcttctgatacggacgggacaattgcttcgtttaca
attgtttctttaccgttgcatggaactttagctttaaaaggaacaccggtttctgcgggt
caggtattgtcgcctttggaggcgtcgcagcttacgtatgatcctgcggggaattttaca
ggagatgacagtttcaccttcacggcacttgataatttaaatgcggtatccaatacggca
gttgtaacaattcctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtgaatgcttcc
atcgcttcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcccttacggcttctgatacagacgga
actattgcttcgtttacaattgtttctttaccgttgcatggaactttagctttaaacgga
acaccggtttctgcgggtcaggtattgtcgcctttggaggcgtcgcagcttacgtatgat
cctgcggggaattttacaggagatgacagtttcaccttcacggcacttgataatttaaat
gcggtatccaatacggcagttgtaacaattcctgtggggaacaatgcgccttcagcggat
tcggcagtgaatgcttccatcgcttcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcccttacg
gcttctgatacggacgggacaattgcttcgtttacaattgtttctttaccgttgcatgga
actttagctttaaacggaacaccggtttctgcgggtcaggtattgtcgcctttggaggcg
tcgcagcttacgtatgatcctgcggggaattttacgggagatgatacatttacctttacg
gctcttgataatttaaatgcagtatccaatacggcagttgtaacaatccctgtggggaac
aatgcgccttcagcagattcggcagtgaatgcccctatcgcttcatcagcaggagcttca
gcagtaaatgcccttacggcttctgatacagacggaactattgcttcgtttacaattgtt
tctttaccgttgcatggaactttagctttaaacggaacaccggtttctgcgggtcaggta
ttgtcgcctttggaggcgtcgcagcttacgtatgatcctgcgggtgattttacgggagat
gacagtttcaccttcacggcacttgataatttaaatgcggtatccaatacggcagttgta
acaattcctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtgaatgcttccatcgct
tcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcccttacggcttctgatacggacgggacaatt
gcttcgtttacaattgtttctttaccgttgcatggaacattagctttaaacggaacaccc
gtttctgcggggcaggtgctgtcaactttagaggcatcgcagcttacgtatgatcctgcg
gggaattttacaggagatgacagtttcaccttcacggcacttgataatttaaatgcggta
tccaatacggcagttgtaacaattcctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggca
gtgaatgcttccatcgcttcatcagcaggagcttcagcagtaaatgcccttacggctttt
gatacggacggtacaattgtttcttatacggtggtttctcttcctctgcacggaattctg
gcactgaacggaacaccggtttctgcagggcaggtattgtcacctttggaggcgtcgcag
cttacgtatgatcctgcggggaattttacgggagatgatactttcaccttcacggcactt
gacaatttaaatgcagtatccaatacggcagttgtaacaatccctgtggggaacaatgct
ccttcagcggattcggcagtgaatgcccctatcgcttcatcagcaggggcttcagcagta
aatgcccttacggcttctgatacggatggcacgattgtttcctttacaattgtttcttta
ccgttgcatggaacattagctttaaacggaacacccgtttctgcggggcaggtgctgtca
actttagaggcatcgcagcttacgtatgatcctgcggggaattttacaggagatgacagt
ttcaccttcacggcacttgacaatttaaatgcggtatccaatacggcggttataacaatc
cctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtgaatgctcccatcgcttcatca
gcaggagcttcagcagtaaatgcccttacggcttctgatacagacggtacgattgtttcc
tttacaattactgcgttgccggtacatggaattctggcactgaacggaacaccggtttct
gcgggtcaggtgctttcgcctttggaggcgtcgcagcttacgtatgatcctgccggtgat
tttacaggagatgatactttcacctttacggcacttgataatttaaacgcggtatccaat
acggcagttataacaatccctgtggggaacaatgcgccttcagcggattcggcagtaaat
gcccctatcgcttcatcagctggagcttcatcagtaaatgctcttacggcttctgatacg
gacgggacaattgcttcgtttacaattactgctttgccgttacatggaacattagcttta
aacggaacaccggtttctgcagggcaggtattgtcgcctttggaggcatcgcagcttacg
tatgatcctgcgggtgattttacgggagatgatacctttacctttacggctcttgataat
ttaaatgcggtatccaatacggcagttataacaatccctgtggggaacaatgcgccttca
gcggattcggcagtaaatgcccctatcgcttcatcagctggagcttcatcagtaaatgcc
cttacggcttctgatacggacgggacaattgcttcgtttacaattactgctttgccgtta
catggaacattagctttaaacggaacacccgtttctgcaggtcaggtgctttcgccttta
gaggcatcgcagcttacgtatgaccctgcgggtgattttacgggagatgatacttttacc
tttacggctcttgataatttaaatgcggtatccaatacggcagttataacaatccctgtg
gagaacaatgcgcctgtggctaataatgatacaaacttgccagttctggcaagcgcaggt
ccgacggctgttaacgctttaacagctaccgatacagatggaactattgtttcctttaca
attgttactttgcctgtacatggaactttggcattaaacggaatagcagttattgcaggg
caggtattgtcgcctttggaggcaggacagcttacgtatgatcctagtggcactttttca
ggaaatgattcctttacatttacggcaacagataacaacggtgctgtagacacaacaccg
gcagtagtcataattccaattgaaaagagaaaccttacagctgtaagggacgagattgga
acagtcgtaggtattaatgaacagttggaactgatcaatgtttttgacaatgatactgtg
gacaacaatccattaactccgaatgaggtgaatcttactataattactcctgatccatcc
aatgtgctgacattacagcctgacggaacagcggtattaattccgaatgctccagcggga
acgtatacattgacttatgagatctgcgaaaaaacgaatgctgcaaactgtgctacagct
acagttaccgttacagttgttgctccggtaatgagtatagaagcagagagttattgttca
gataatactccatatgtgagatacagcgtgaaagcggagaattttgccccttcaggactg
ttgaccatcagatggattgacagcgcgaatcgtgttgtagccacacagaatgacatgcct
ttaaacggaacggttttatggcctggtgctgtagtggatgcagggaataaaccaacagac
tggcctggatggatattccagaatggacaatggcagcagggcaatgacggatttgaattg
accagaccatctgttaccatgcagtttactcttaatccgactcagtcagttactgtaaat
tatcctttggcttcagcaggttgtaatgcttcacctgtctttggaatagaggcggttaat
gaagacgatacggttgctgctgacggaatcaatggctctttggaggtaatcaatgtttta
gacaacgataccttaaacggttttccagtaaatgcccaagatgtgattctaacagctcag
aatttcccgcagggtataacacttaatcctgacggaacaattgacgtagctccaggaact
gccggaggggatcacaatctaacctaccaaatttgtgaaaaagcgaatcctaataactgc
agcagtgcaacggttcacttgtttgttgaagtaccagctgtggcgcttattatggaagta
aaagtaaatgacgagaacggaaacggcaatgtggaggcaggtgaaacgctaacttacacc
tttgtcgttaaaaatactggaaatgtgccgttgagcaatatccagatttcagatctgctg
cctggagttataattacaggcggaccgataacactagctgtaggacagagcgatacgtca
acttttacaggaacctatacacttacacaagcagatattaatgctggttcagtaaccaat
caagcttccgtttcaggactcagcccacttggtgtcactacatcagatacatcggattcg
aaagaactaaacggaaataatccaactgtgatagaactggatggatgcagtattaaaatt
tataatgcggtttcgttaaacggagacggtatgaatgagagattttatatcagaggtatt
gagtgttatcctgacaatacagttcagattttcaaccgctggggagttctggtatttgaa
agagaacattacaacaacaatgatattgtttttaaaggatactcagaaggaagaacaaca
gtgaaaggatcagaaggactgcctgaaggaacttactattatatcctgagatataagagt
gatactgccaagactaaacaggaagcaggctatttatatctgaccaaataa
DBGET
integrated database retrieval system