Fulvivirga ligni: LVD16_17885
Help
Entry
LVD16_17885 CDS
T09288
Name
(GenBank) fibronectin type III domain-containing protein
Organism
flw
Fulvivirga ligni
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
PA14
He_PIG
Cadherin_5
Por_Secre_tail
Peptidase_S9
fn3_2
GLEYA
Pur_ac_phosph_N
Ig_2
Abhydrolase_2
Glyco_hydro_39_C
DLH
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII19715
LinkDB
All DBs
Position
complement(4259531..4265734)
Genome browser
AA seq
2067 aa
AA seq
DB search
MRNFTKIFLLLMLSFFGFSKLAMSQVPIPDSYPPNGDIYPWGYEVFGTNWDTSPYIPLIY
NRIPVRLLMPKGVTYDSATNTFSNPSGVKHRVILFLHGAGEDGTNNGHQLRHGGKQFLEA
RNNDEFDGFAIFPQNYSDYFGPTQISIIKGLLNNMEQKGLIDPYKVVINGLSAGGSGVWN
FVHTESKIAAAAIPISAANVETLNYIENFKYTPLYMCQGGQDKKPTPGTAFTVVDGIQAA
GGQIKLNYYEDLGHSTWYRMWAEDDFWPFVMSANKVNPLVLFGRNEFCPDETVESHMGLN
PGFEAYQWRKDGVVISGATTNEYVATEYGTYDARVKRNGVWSYWSPQPVVVSQKEPTVTP
PIALAGLQSTVIPAPNGQTTVKLELPEGYEEYLWKNAANNATVGTTRTIDVGVGQYVATV
TELYGCSSNYSAPFTVVNANGANKPPAASDVLGFAKSQTAIEIFWNQVESPVYNETAFEI
YRGTSEGGPYQLIALTAANSSSYLDENLLANTDYYYLIRAINNSGASASTNELHVRTDVD
AQGPTAPTNLRVEANTGSTVRLSWNASTDNVGVYRYDVYKNGTKVLAVEENSATVYGLNT
SSVYDFYVIARDITGNVSSASNHAFSRVNTSGLDYSFYDGGFYNVSQFINLVPNATGHVS
NVSIDDSPLDNNFGYKWEGYIYIPVTGNYTFETYSDDGSVMYIGGLDAAHLVVDNDGTHG
PRYRSGTVRLEKGAHSIMIAYFDKTGYYDYMSIWWSNTAHGVTNRVQIPDEAFIPSTSLP
GSAPAAATSLTFDEVGYKSVKINWVDNASNETKYQILRSETSAGPFEGVGEVAANATSFI
DTDLDAVKTYYYKVAAIGSYGVTTSAAASVSTIALPPAPTAPASLVANGVNSTSINLSWT
DASTTEDGFKIYRSAGNADNFLLIATLDANINTFNDTELLPAATYYYKVGAYNDGGIAYS
GEVNSQTVNTLPVIAEINDISVRFESTYTLPVEVTDADGDAVEITVSNLPSFAYLQDYGD
GSGMITFEPLFANVGTYSNIVVTATDQNGGEDTETFNLVVNSNHLPEVTAVADVNMNESE
SAAVSFSVTDADADDFTLSYVGLPDFAVITDNPDQSKTITFNPEYGDGGEYTITINATDV
NEGVGSSEFTLTVAKVLTNYTLLINFNSELPQTTGNWNNLTVEPAAGMDINGFITSQGTP
VSAGIHLTTAWGPQYTGVGAFGATTGNNSGVYPDNVMKTYYFASDNGSKVFDITGLNPEL
TYNFTFFGSRDGDGNRNTEYIINGETVVLNASHNVSSTVTISEVSPTEVGTVTVTVRKQS
GAVYGYLNALRVDAYYTNGEAPAAPIALEASSVSGTQVTLSWTDKSINETGFEIERSTDG
VSFSLVETVYPNETTYTDESLAGKTSYTYRVRAINGIGNSAYSNELEVTTLNSSPVLTVS
AEEVSVIEDETSQITFSASDADMDALTFSSINLPSFATLTSGATSGNVELAPGDGDSGEY
DFSLIVSDADGAGDTVSVHVSVSSVAITSTFVNFNLGYNEVSPWNNFDAQPAANTSLSNL
KDEDGITTSVAVTLMDKWQGTNNLGMMTGAGVYPDNVTRTSFWESSTSNRRIKLSGLDNS
KNYNLVFFGSRDGSGSRYADYTVGSSTVSLNASGNSTNVATIAGIAPDVNGEIIITVKKQ
ASSSYAYINALEIQSYSASDVPLAPSALVATSISKDEIKLDWVDNTGIEDGYELYRSVDG
GSYSLLATLNPNTTSFMDQGLSPNTPYSYKVRAFNASEVSAYSNEAYASTFAFFVGVNFN
DISGAPAPWNNLTVMYEGDVIYNLKDDSEMNTGFAIEMVKAFTGENPAGMQTGNDSGIYP
DEVLEGSYYLDPNADAEFKIKGLNFSYAYNFVFFATRNASGNRLTNYTINGETVSLNASL
NTSNTVQINNVVPDIDGNVNIKIATDPSASYGYLSSLVIQAFDVSGIDASAKKGVNGLNT
ELAEAGIVVYPTIVSDHVNVRFEEIPEGKVEFFIYDLQGKLVNNISEDKLSDSEYRLDLK
GSNLTEGMNMLKVIYGNESKVFRIIKR
NT seq
6204 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaattttactaaaattttcttattgctaatgctttccttttttggattcagcaaa
ttagcaatgtctcaagtacccatacctgatagttatcctccaaatggagacatctatcca
tggggctatgaagtatttggaacaaactgggataccagtccatatattccccttatttat
aaccgaattcctgtaagattattgatgcctaagggtgttacttatgattcggccactaac
acattttctaacccttctggagtgaagcatagagttattctatttttacacggagcagga
gaggacggaactaacaacggtcaccaactaagacatggaggaaagcaatttttagaagct
cgtaataatgacgagtttgatggctttgctattttcccacaaaattattcggactatttc
ggtcctactcagatcagcattattaagggtctacttaataatatggagcaaaagggtctt
attgatccttataaggttgttataaatggtttatctgctggtggtagcggagtatggaat
tttgttcatacggaatcaaaaatagctgcggcagctattcctatttctgccgccaatgtg
gaaacattaaattatattgaaaacttcaaatacactccgctatatatgtgtcagggaggt
caggataaaaagcctacccccggaaccgcatttactgttgtggatggcatacaagccgct
ggaggacaaatcaaacttaactactatgaagatctaggtcacagtacctggtacagaatg
tgggctgaggacgatttctggccgtttgttatgagtgcaaataaagtaaaccccctagtt
ttatttggtagaaatgaattttgcccagatgaaactgtggaatctcatatgggtttaaat
ccaggtttcgaggcttatcagtggagaaaggatggcgttgtaatatcgggtgctaccacc
aatgagtatgtggctacagaatatggtacttatgatgctagagtaaaaagaaatggtgtt
tggtcatattggtcaccacagcctgtggttgtaagtcagaaagagcctacagtaactcct
ccaattgctttggctgggttgcaaagtacagttattcctgctcctaatgggcagactact
gtcaaattagagttgcctgaaggatatgaagaatatctttggaaaaatgctgcaaataat
gccacagtaggaacaactagaacaatagacgttggagtgggacaatatgtagctactgta
actgagctttacggttgctcaagtaactattcagctccattcacggtcgttaatgccaat
ggtgctaacaagccgccggctgctagtgatgtactaggttttgctaagtcacaaacagcg
atagagatcttctggaatcaggtggaatcaccagtttacaatgagactgcattcgaaatc
tacagaggaacatccgaaggtggcccgtatcaattaatagctcttacagcggctaattca
tcttcatatttggatgaaaacctattagctaatacagattactactatttaattagagcc
atcaataatagtggggcatcagcttctactaatgagctgcatgtaagaacagatgttgat
gcacaaggtcctactgcacctactaatcttagagttgaagcaaatacaggcagcactgta
agactatcatggaatgcttctacagacaatgtaggcgtttacagatacgacgtttataaa
aacggtactaaagtgttagccgttgaagaaaatagtgcaacggtatatggcctaaacaca
agtagtgtttatgatttttatgtaattgcgagagatatcactggaaatgtttctagtgct
agtaatcatgcattctctagagtcaatacatctggtttggattacagcttctatgatggt
ggattctataacgtttctcaattcataaatcttgttcctaatgctacaggtcatgtaagt
aatgtctctatcgatgatagcccgttagataataacttcggttataaatgggaaggatat
atttatatacctgttactggtaactataccttcgaaacctattcggatgatggtagtgta
atgtacataggagggttagatgcagcacatttggtagttgataatgatggtactcatggt
ccaaggtatagatcaggaacagtgagacttgaaaaaggtgcgcattctattatgattgct
tactttgacaaaacaggatattatgattatatgtctatttggtggagtaacacagctcat
ggtgtaaccaaccgtgtacagattcctgatgaagcatttattccttctacttcacttcca
ggttctgctccagcagcagctacaagccttacttttgatgaagttggctataagtcagtt
aaaattaactgggtagataacgcttctaatgagactaaatatcaaatattaagatcagaa
acgtcagcaggtccatttgaaggagtaggagaagtagctgctaatgctacatcttttata
gatactgaccttgacgcagttaaaacttattattataaagttgcggctatcggtagttac
ggtgttactacatcggcagctgcttcagtaagtactatcgctttacctccagcacctact
gcaccggctagtctggtggccaatggagttaattcgacttcaatcaatttgtcttggacg
gatgccagcactactgaagatgggttcaagatctatagatcagcgggcaacgcggacaat
ttcttattgatcgcaacacttgatgctaatatcaatacatttaatgatacggaattactt
cctgctgctacctactattataaagttggagcatataatgatggtggtattgcctattca
ggagaggttaattcccaaacagtgaatacacttcctgttatcgcggagataaatgacatt
tccgtaaggtttgaaagtacctatactctacctgttgaagttacagatgctgatggtgat
gctgtagagattactgtatctaatttaccaagctttgcatacttgcaggattatggagat
gggtcaggtatgattacttttgaacccttattcgcaaatgttggaacttactcaaatatc
gtagttaccgctactgatcaaaatggtggtgaagacactgaaacgtttaatttagttgtc
aattctaatcacctaccagaagttacagcggtggcagatgtaaatatgaacgaaagtgaa
tcagcagcagtgagcttctcagtaacagatgctgatgctgatgatttcacactttcttat
gttggtcttcctgattttgctgtaatcaccgataatccagatcaaagcaaaaccataacc
tttaaccctgaatatggtgatggtggtgagtacacaattacaataaatgctactgatgtg
aatgaaggtgtaggatcatctgagtttactttaacggtggctaaggttcttacaaattat
actttattaatcaatttcaactctgagcttcctcagactacaggaaactggaacaattta
actgttgaaccggcagctggaatggatattaatggatttatcactagccagggtactcct
gttagtgctggtattcacttgacaactgcatggggtcctcagtatacaggagttggtgca
tttggagctactactggaaataattccggagtatatcctgataatgttatgaaaacctac
tatttcgctagcgacaatggaagtaaggttttcgatatcacaggccttaatcctgagtta
acatacaacttcacattcttcggaagtagagatggagatggaaatagaaacacagaatat
ataattaatggtgaaactgtagtacttaatgcatcacacaacgtgagcagcacagtaact
atcagtgaggtgtctccaacagaagtaggaacagttacagtaacagtaagaaaacaatct
ggtgctgtatacggatatcttaatgcattaagagtagatgcttactatactaatggtgaa
gctccagcggcaccgatagctttagaggcaagttctgtttcaggtacccaggtgactctt
tcatggactgataaatccattaacgaaactggttttgaaattgaaagatctacggatggg
gttagttttagtcttgttgaaactgtttatcctaatgagactacttatactgatgagtct
ctagccggaaagaccagctatacttacagagtaagagcaataaatggaataggaaattca
gcttattctaatgagctagaagtaacaaccttaaattcatcaccagtgcttacagttagc
gcagaagaagttagtgtaattgaggatgaaacttctcaaattacatttagtgcttcagat
gcagacatggatgccttgacattctcttcaatcaatttaccgtcattcgctactttgact
tcaggtgcgacaagtggtaatgttgagttggctcctggagatggtgattctggtgaatat
gatttctctcttattgtatcagatgctgatggtgctggtgatactgtaagtgtgcatgtt
agtgtgtcaagtgtggccatcacttcaacctttgtaaactttaacttgggatataatgaa
gtgtcaccatggaataatttcgacgctcagcctgcagcgaatacatcattaagtaacctt
aaggatgaagatggtataaccacttcagtagcagttacattaatggataaatggcaaggt
accaacaacttaggaatgatgaccggggcaggtgtttatcctgataatgtaacacgtaca
tctttctgggaatcatctacatctaatagaagaataaaactatctggacttgataattct
aaaaactacaatttagtattcttcggtagtagagatggtagtggatctagatatgcagat
tatactgtaggatcaagtacagttagcttgaacgcttcgggtaactctactaacgtagct
acaatagcaggtattgctcctgatgtaaatggtgagattatcattacagtgaagaagcaa
gcaagctcaagctatgcttacatcaatgctctagagatccaatcatatagtgcaagtgat
gtgccattggctccttctgctcttgtagcaacttctatttctaaggatgagattaaatta
gattgggttgataatactggaatagaagatggttatgaattgtatagatcagtagacgga
ggaagctacagtttattggctacattgaatccaaatacaacttcatttatggatcaaggt
ctatcaccgaatactccttacagctataaggttagagctttcaatgcgtctgaggtatcg
gcctattctaatgaggcgtatgctagtacatttgcattttttgtaggagttaacttcaat
gatataagtggagctcctgcaccatggaataacctaacggtaatgtacgaaggtgatgta
atctataacttaaaagatgattctgaaatgaataccggatttgccattgaaatggtaaaa
gcatttactggagagaaccctgcaggtatgcaaacaggtaatgattctggaatctaccct
gatgaagtattagaaggttcttattacctggatccaaatgctgacgctgagtttaagatt
aaaggattaaactttagctatgcttataactttgtgttctttgcaacaagaaatgctagc
ggtaatagattgactaattatacgatcaatggtgaaacagtttcattgaatgccagctta
aatacaagcaatacagttcaaattaataacgtagtcccagatattgacggtaacgtaaat
attaagattgctacagatccatcggcctcttacggatatctaagctcattagtgattcaa
gcgtttgatgtgtcaggtattgatgcgtctgctaagaaaggtgttaatggtttaaatact
gaactagctgaagcaggtatagtagtttatcctactattgttagtgatcatgtaaatgtt
aggtttgaagagattcctgaaggaaaagtagaattcttcatctatgatctacaaggtaaa
ttggtaaataatatctctgaagataagcttagcgattctgagtacagattggatttaaaa
ggttctaaccttacagagggtatgaacatgttaaaagtgatctacggaaatgagtctaaa
gtctttagaatcatcaagagataa
DBGET
integrated database retrieval system
