Fulvivirga maritima: LVD15_03520
Help
Entry
LVD15_03520 CDS
T09268
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fmm
Fulvivirga maritima
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
Por_Secre_tail
LRR_9
CHU_C
Ig_2
Ig_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII27514
LinkDB
All DBs
Position
complement(854695..857859)
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MVKYFLTLCFCGLFLKAAEAQTPAYKPDSLVLLNFHQQMMDSGWPAFWNTTKNVREWTGV
SYDYNSGKVYGVTLSGDWFNPHFTTDSLPAAIQVLSAMDSLVSLGVSHFNLKYLPEEMTD
LEDLKSLSLGYNSIETLPDFINELEQLEILLLGNNEFADLPDLSDLINLKVLSLSQNIHL
EQFPASILELESLIDLRLSYNSITGLPSSIDELQQLQKLYLQANGLISLPESVGNLSNLD
QLVLSNNQLTDLPSSINNLTKLERLDVNRNQLSALPADMSNLTNLIQIDISENKLTEFPE
SIVGLRGLRQITANKNQMEGEIPEDVFRINRLRLDVSDNNLSGELEVIDNNITERLLITN
NRYTFRDIINFYGQFNPSYIEFQPQQYIGTYRTLEPRAGEVLDVFIDNYIPASGNTYQWY
RADNIALTGATKYSTEDSIHISSYDASAHAGIYYCIIKNPSLPNLSLRSNVVRVLGNDNA
PELTYQDLIFREGGRAYLNIAAKDDFTPINELEFRFPEETEHFILKPDTLYSRSYAKFVL
PKTVNGYGKDTLTVEVEDEGGNVAIAQLTIEMLSDENANPEVSMDTIYMNLAQDAEPPCT
PGTTGCNAFYYFTSITYLKYFVTDDFTDYDRLTYRVLEADSLNGEVIPGKVYVQPIIRPD
GITLDANVLANQDTSVTITLQVMDPEGGVIQKSVTLMGEINPPNRNPEIEDITDQLISRG
ARSFSTLNLSEYSSDDYLSNNLLTWQISRSNVLKVNLSDSLLEVQPMYEDSSYTAQLEVY
VYEKTNYNRSSSTTVNYIIKEGIAISGMITDVADQPLENVELQGFDEPVFTSAAGYYEAH
VLEGWSGEVIPVKEDYLFSPESQEYNNLQSSLQDQDYQAEYIGSYTISGVISTAESGLGE
VLINGFTNEIYTDDVGYYSVEVPYDWNGTLTPELDGFSFEPTSRTYEQLTANLSNEDYQA
YHITGVEGRDAVQLLTVYPNPSSTSVTFMLSDAHFNDGIIEVYNTHGKKCGTIKVETDTS
RYEWKGAEQTPAGIYYAKLTVNGKAESVLKFIVE
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaagtattttttaaccctttgcttctgtgggctatttttgaaagcggcagaagca
caaactcctgcttataagccagatagcttagtattactcaattttcatcagcaaatgatg
gattcgggatggccggctttttggaataccacaaaaaatgttcgagagtggaccggagtt
tcatatgattataattctgggaaggtatatggggttacactttcaggtgactggtttaat
cctcactttacaacagatagtcttcctgccgccatacaagttttgagcgctatggattcg
ttggtaagtttaggtgtttcccattttaatctaaaatatttacccgaagagatgactgac
ctagaggatctgaaaagtttgagtcttggttataatagcattgaaactttgccagatttt
attaatgagttagaacaattagagatactattacttggtaataatgaatttgctgatctt
ccagatctctcagatttgatcaatctgaaggtattaagtcttagccaaaatattcattta
gagcaatttccagcatctatattagaattagaatcattaattgatttgcgtctatcttac
aattccattacgggactcccttcttcaatcgatgaattacaacagttacaaaagttatat
ttacaggctaatggactaatttcattgcctgaatctgtaggtaacttatcaaatttagat
caattggtattatccaataatcaacttacagacttgccttcatctatcaataatctcaca
aagcttgagcgattagatgtaaacagaaatcaactttctgctcttcctgcggatatgtca
aatttaaccaatctaattcagatagatatttctgaaaataaacttaccgaatttccggaa
agcatcgttgggctgcgaggtcttagacagattacagcgaataagaatcaaatggaggga
gaaattccggaagatgtttttagaataaacagactacgtttagatgtaagtgataataat
ctttccggggagctggaggtaatagataataatatcaccgagcgtcttttaattactaat
aatcgatacacctttcgagatattataaatttttacggacagtttaacccttcttacatt
gagtttcaaccacaacaatatattggcacctatagaaccttagaacccagagcaggagag
gtgttggatgtttttattgataattatatacccgcatcaggaaatacttatcagtggtat
agagctgataatattgctctgacaggagcaacaaaatattctactgaagacagtatacat
atctctagttatgatgcttctgcccacgctggcatttattactgcattattaagaaccct
tctttacctaatttaagcttgaggagcaatgtagtaagggtattaggaaatgataatgct
ccagaattaacttatcaagatctgatatttagggagggaggaagagcctatctgaatatt
gccgcaaaggatgatttcactcctatcaatgaattggagtttcgctttccagaagaaact
gagcattttatacttaaaccagacactttatacagtcgtagttatgccaaatttgtttta
cctaaaaccgtaaatggttatggaaaagatacgctcactgtggaggttgaagatgaagga
ggaaatgtggctattgctcaactcactattgaaatgttatctgatgaaaatgctaatcca
gaggtaagtatggatacaatttatatgaatcttgcccaagatgcagaacctccttgtacg
cctggaactaccggttgtaatgcattttattattttaccagtattacgtatttgaaatat
tttgttaccgatgattttacagattacgaccgattaacttatagagtattggaggcagat
tcgctaaatggagaagtaataccaggcaaagtatatgtccagccgattattcgccctgac
ggaattacacttgatgctaatgttttagctaatcaggataccagcgtaaccataacccta
caagtgatggatccagagggaggagttattcaaaagtcagtgactctgatgggagaaatt
aaccctcccaatagaaatccagaaatagaggatataacagatcagttgataagtagagga
gccagatcattttccacattaaatttaagtgaatatagttcggatgattatttgagtaat
aatttattaacctggcaaattagtcgctcaaatgtattgaaggttaatttatccgatagc
ctgctggaagttcagcctatgtatgaggacagttcttacactgctcagttagaagtttat
gtatacgaaaaaactaactataatcgaagcagttccacaactgtcaattacattatcaaa
gaaggtatagcgatatcaggaatgattactgatgtagctgatcagcctttagagaatgta
gaactgcaagggtttgatgagccagtgtttacttcggctgccgggtattatgaagcacat
gttttagagggttggagtggcgaagttatacctgttaaagaagattaccttttctctcca
gagtcacaagaatataataaccttcagtcatcactacaggatcaggattatcaagcggag
tatattggcagttatactatttcgggtgttatatctactgccgaatctggtttaggagaa
gtgttaattaatggcttcactaatgaaatttataccgatgatgtcggctattattccgta
gaagtaccttatgattggaatggtactttaactcctgaattagatggatttagctttgag
ccaacaagtaggacttatgagcagcttactgccaatttaagtaatgaagactatcaggct
tatcatattactggtgtagaaggaagagatgcggtacagcttttgacggtgtatcccaac
ccttcatctactagtgtcacatttatgctttctgatgcacacttcaatgacggaataata
gaagtatacaacactcacggtaagaagtgcggaaccattaaggtggagacagacaccagc
aggtatgaatggaaaggtgcagaacaaacccctgcaggcatttattacgctaagcttact
gttaatgggaaagcagaaagtgtattgaagtttatcgttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
