Fervidobacterium nodosum: Fnod_0538
Help
Entry
Fnod_0538 CDS
T00579
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
fno
Fervidobacterium nodosum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF6849
Porin_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABS60401
UniProt:
A7HKG8
LinkDB
All DBs
Position
complement(593775..596432)
Genome browser
AA seq
885 aa
AA seq
DB search
MAGKFRRLFLFAVISLFLLISLVSFAGVLHFEHADVVYPDLRYIDTAIRVGNIFESVRQD
VINLVGYDPGRITIILQDKGTVSNGYTQVLLHKTIVLYTWPTEGYMGFYLPLEDWYTYLI
IHEFTHMCHLSYQDELGKFISLITGIPYLPQLSSPFVEGTTVFAESSFSLSSGRLNNPFF
SSGLYYYSLPNFPSFSYKETMPLDDYRGGLLYYNFTAGFYKYLADTYGIDSVKKFLNVTS
QTNIPFLTFGATQTAQDPYESVFGKKFDELYTDWIMSLTKLDYIQGKLVYNLRNSLILRV
DSAWKELALLRQTSGPVSSYVGTIESGLVFIDDTKFKQTRDISLNADEVKIDGNNIYALQ
PSQFLDKVEKKLWLVNQNKVIASGYITSFGVNKGEVYVSLYDPVSLKSKVKSLSNDLFEY
TYYGYIKNMDVSEKYIALLTLDNNIIILDRKYKEVAKIKDRNMKGPYVKLQDNKVLFSRI
EGNYIIPYYYDIENGKFYKLAEKTLLSDFTIHNNELYYVSYTPYGNTGGNGVYKKEIQLQ
ELSELPNENPPSKINITQHKYVDGDEIAFRINQFLKPVTWAPMYSYTQLEDSSLIYTLYM
IFTFTNIENDTAFVLTPILDIAQNDPESLDFQILGYRQFVGFLKMGDYYGISASYIYPSN
DYGISAELLLGSFDLSPKTSVYALLGINSRSSKDYNLDSVFSLISGISAPSIKLNTLSFG
LYMPTYIFSRPVQFRNWVILSNDDYTKLFDIDSVYFEHSVVFALNTDTSFLGLLQWNLSQ
PENIYYDTSLAFTLFKDSAELFGGNVLFRNSGLTIGFANPAGIHGIYTQFFVETYLAGMK
LYPNAGVFVQLMDLYGLPAPDFQGIVYIGLGNSPHMLNILSGMPY
NT seq
2658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggtaagtttaggagattgtttttgtttgccgtgatttctctttttttgttaatt
tcgttagtatcgttcgctggtgtgttacattttgagcatgcggatgtggtttatccagat
ttgaggtacatcgatacggctataagggtggggaatatatttgaaagtgtccgtcaggat
gttattaatcttgttgggtacgaccctggaagaatcactattatcttgcaagataagggg
actgtgagcaatgggtatacacaggttttgctccataaaacaatagttctttacacatgg
ccaacggaagggtatatgggattttatctgccgttggaagattggtatacgtatttgatt
atccatgaatttacgcatatgtgtcacctttcgtatcaagatgagcttggcaagtttata
agtctgataacgggtatcccttatcttccacagttgtcaagtccttttgttgaaggtacg
actgttttcgccgagagttctttctcgctttcatccggaaggttaaataatccgttcttt
tcatcgggattgtattattactctttaccgaatttcccatcgttttcgtataaagaaaca
atgcctttagacgattaccgtggaggattgttgtattacaatttcacagcagggttttat
aaataccttgccgatacttacggaattgatagtgtaaagaaatttttgaatgtaacatcc
caaactaatataccattcttaaccttcggagcaactcagacggctcaagatccatacgag
tcggtatttggtaagaagtttgacgagctttacacagattggattatgtcacttacaaaa
ttagattacatccaaggaaagttggtttacaatctcagaaactcgttgatactaagagtt
gattcagcatggaaagaactcgcacttttaagacagacctctggtcctgtttcttcttac
gttggaactattgagagtggtttagttttcatagatgacacaaagtttaaacagacaagg
gatatctcgttgaacgcagatgaggttaaaatcgatggaaataacatctacgcacttcaa
ccttcgcaatttttagataaagttgagaaaaaactctggcttgtaaatcaaaataaagtt
atcgcttcaggatatataacgtctttcggagttaacaaaggtgaagtttacgtaagtttg
tacgacccagtatctttaaaatcgaaggttaaatctttgagcaatgatttgtttgaatac
acttactatggttacataaagaatatggatgtttcagaaaagtacattgcgttgttgact
ttggataataatattataattctcgataggaaatacaaagaagtagctaagattaaggat
agaaacatgaaaggtccttacgtaaagcttcaggataataaggtgcttttctcaaggatt
gagggaaattacataattccgtattactatgatattgaaaatggtaaattttacaaactt
gcagagaaaactcttctttctgacttcacaattcacaacaacgagctttactatgtgagc
tacaccccgtacggtaataccggaggtaacggagtatacaaaaaagagatacaattgcaa
gagctatcagaactaccaaacgaaaatccaccatcgaaaattaatataactcagcataag
tatgttgatggtgatgaaatagcatttaggatcaatcaatttctcaaaccggtcacctgg
gctccaatgtattcttatacgcaacttgaagatagcagtcttatttacacgctgtatatg
attttcacatttactaatatagaaaacgatactgcttttgttctaacacctatattggac
atcgcccagaatgaccctgaaagccttgatttccaaattttaggttacagacagtttgtt
ggttttcttaagatgggggattattatggtatatcggcaagttacatttatccatctaac
gattacggtatctcagctgaactattgcttggttcatttgacttatcaccaaaaacgagt
gtttacgctttactgggtataaattctaggtcaagcaaagattacaatttagatagtgta
tttagtttaattagtggcatctctgcgccgtcgataaaattgaatacactgagttttgga
ttatatatgccaacctatattttctcaagacctgtgcaatttaggaattgggttatttta
agcaacgatgattatacaaaactttttgacatagacagtgtttactttgaacattcagtc
gtatttgcccttaacacagatacaagctttttgggactcttgcaatggaatttatctcag
ccagagaatatttattatgatacgtccttggcatttacacttttcaaagattcagcggaa
ttgtttggaggcaatgtactctttagaaactcaggtctaacaatagggtttgcaaatcca
gcaggtatccatggtatttacacgcagttctttgtcgaaacttaccttgcgggtatgaaa
ttatatccaaatgctggtgtgtttgttcaattgatggatttgtatggtttgccagcgcct
gatttccaagggatagtttatataggtttgggtaattcaccacatatgcttaatattttg
tcaggtatgccgtattga
DBGET
integrated database retrieval system
