Formosa sediminum: FNB79_08520
Help
Entry
FNB79_08520 CDS
T06103
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fop
Formosa sediminum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LTD
Calx-beta
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO94024
UniProt:
A0A516GR74
LinkDB
All DBs
Position
complement(1938568..1942137)
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MKKRLLLLTLFIGGYLNAQINPGDMAFIGMNADGDDDFALVTFVDIPANTTIHFADKEWT
GTAFNSGEAAYSWLTGDEKIIAGSVISFNTISEIPSVNYGTINGEPGGLSSSSEAIFAYL
GTDVNTPTTFIAAVANATGAFGDLSNTGLTEGLTAITYSPDGVDIAVYNGMRTGLDQNGY
LLALNDMSNYDIQDTDEDDHNDGIAPESTFSTTPFTISSEDLTAPSVVSIKTTTNTTTEV
VFSENITQVSAETISNYSFTPALTISNISYNATSHTATLTHDGFIEGTGYMLTVTNIKDL
AENMQPSSFTSDYLFYNTITSGLIITEIMYNAPSDNSDALEFLEIYNTTTETISLGGLQV
KDESNFVFIFPEMNLEANAMVLLATDKTTADAFYGVNFLDMPQGISNALGNGGEVLQILN
TQDETIFAMEYSDDEPWPTAADGDGPSLELINPEINFNEGTNWAASTNLIGESLGEKVYA
SPGTFNTVSEVVPQLTFTKSIYNISEDAAEVNIQLDLSAASNSEITADINLVSELITATP
GTDFTFSTQTITIPANTTVYTLNIPLTDDSQIETDELFILQLSNINNATLGNFGTAGIYI
IDNDQDVISATDPLNINFKTSYTVDTAGSAEISAYDATTQRLFVLNSVGKTIEILNFSNP
ENLSTIKTIDLSTYGTEGPTSVAVYNGLVAASVSNGPEANGVVLLMDTNGENITQVTVGN
LPDNVSFSPDGTKLLTANEGQPNSDYSIDPEGSISIITATAGLGNITQNDVQTINFNAFD
AQLSELQANGVRITGPGATVSQDLEPEYITFSDNSKKAWVSLQENNALAIIDLDTNTITD
ILPLGLKDFSITENTFDASDDTDFIFMANWPVKGMYMPDAISYFELNGIGYVVTANEGDA
REYDAFEEEVKVGDNDYILDPIAFPNAGLLKLDENIGRLAVTNASGDTDNDGDFDEIHMF
GSRSFSIRNATTGALVYDSADDFERITASDPTYAELFNTSNSNNNFKNRSDNKGPEPEGI
TVANIAGKFYAFITLERVGGFMTYDITDPTNPTFIKYINNRTLGDNEGGDLGPEGIIYIA
PEDNTLNTGLIVLSNEVSSTISVYSLENITTLGVNEATEESHTFKVYPNPVQSNNIIYFN
TQVNVSLYDLQGRLVISKENVNTLNIPAVTSGTYILKTDKGSVKKIIIK
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacgtttacttttattaactctatttattggaggctacttaaatgcacaaatt
aatcctggagacatggcttttattggtatgaatgcagatggcgacgatgattttgcatta
gtgacttttgtagatatccctgcaaatacaaccatacattttgcagataaagaatggact
ggtactgcatttaattctggtgaagcagcttactcttggttaactggagatgaaaaaatt
attgccggatctgttatctcttttaatactattagcgaaattcctagtgtaaattacgga
actataaatggagaacctggtggtttatcgtctagtagtgaagctatctttgcttattta
ggcacagatgttaatacaccaactacatttattgctgcggttgccaacgctactggagct
ttcggagatttatcgaatactggccttacagaaggtttaacggcaattacatatagccca
gatggtgtagacattgctgtatataatggtatgagaactggattagaccaaaacggatat
ttattggccttgaatgatatgagcaattatgatatacaagacaccgatgaagatgaccat
aatgatggtattgcaccagagtctacttttagtactacgccgtttacaatttcttctgaa
gatctaactgcaccttctgtagtttccataaaaacgactaccaatacaactacagaggtt
gtgttttctgaaaatattactcaagtatcagcagaaacgatatcaaattatagctttact
cctgctttaaccatctctaatattagttacaatgcaacatctcatacagcaacattaact
catgatggttttattgaaggtactggatatatgttaaccgtaactaatattaaagactta
gcagagaacatgcaaccttcaagttttacaagtgattatttattttataatactatcacc
tcaggtcttataattacagaaataatgtataacgcaccttctgataattctgatgctcta
gaatttttagaaatatataatacaactactgaaacaataagtttaggaggccttcaagtt
aaagatgaaagtaactttgtttttatcttcccagaaatgaatttagaagccaacgctatg
gtattattagcgacagataaaacaacagcagatgctttttatggcgtaaactttttagat
atgccacaaggaatttcaaacgctttaggtaatggtggtgaagtattacaaattttaaat
actcaggacgaaactattttcgctatggaatatagtgacgatgagccttggcctacagcc
gcagatggcgatggtccctctttagaacttataaatcctgaaataaattttaatgagggt
acaaattgggctgcctccacaaacctaatcggagaatccttaggtgaaaaagtatatgca
tctccaggaacattcaatactgtttcagaggtagtacctcagcttacttttacaaaatct
atatataatatatctgaggatgccgctgaagttaatattcaattagatctttctgctgca
tctaattcagaaattacggccgatattaacttagtaagtgaattaattactgcaacacct
ggtacagattttacgttttcaacacaaactataaccatacctgcaaatacaacagtatat
acgttaaacattccacttacagatgattctcaaattgaaacagatgagttatttatttta
caactctctaatattaataatgccacactaggtaattttggcacagcaggtatttatatt
atagataacgaccaagatgttatttcggcaacagatccattaaatattaattttaaaaca
agctataccgtagataccgctggatctgcagaaattagtgcttacgatgcgactactcaa
cgtttatttgtcctaaactctgttggaaaaactatagaaattttaaatttttctaatcca
gaaaacctttctacaattaaaactattgatttatctacttacggaaccgaaggtccaaca
agtgtagctgtttataatggtttagtggctgcatcggtatctaacggacctgaagcgaat
ggtgttgtattattaatggatactaatggagaaaatattactcaagttactgtcggcaat
ttacctgacaacgttagtttttctccagacggaacaaaacttttaaccgctaacgaagga
caacctaactcagattatagtatcgatccagaagggagcatttctattataactgcaact
gctggcttaggcaatatcacccaaaacgatgtgcaaactattaactttaacgccttcgat
gcccagttaagtgaattacaagctaatggcgttagaatcactggacctggtgcgactgtt
tctcaagatctagaaccagaatatattacgttttcagacaattctaaaaaagcttgggta
agtttacaagaaaataatgctttagcgattatagacctagatacaaataccataacagac
atccttcctttaggtttaaaagattttagtattacagaaaatacttttgatgcttcagat
gatacagattttattttcatggcaaattggcctgtaaaaggaatgtatatgccagatgct
atttcatattttgaactaaatggtattggttatgttgttactgctaacgaaggtgatgcc
agagaatatgatgcttttgaagaagaagtaaaagttggagacaacgattatattttagat
ccaattgcatttccaaatgcaggtttattaaaattagatgaaaatattgggcgcttagct
gttactaatgccagtggagacacagataatgatggtgattttgatgaaattcacatgttt
ggatcccgttcttttagtattagaaatgccactacaggggctttagtttatgatagcgca
gatgattttgaacgcataacagcctcagatcctacttacgcagaattatttaacaccagt
aacagcaacaataattttaaaaatagaagtgataataaagggccagaaccagaaggtatc
acggttgcaaatattgcaggtaaattttatgcctttataactcttgaacgtgttggcggc
ttcatgacttacgatattacagatcctactaaccctacttttattaaatatattaacaac
cgtactttaggcgataatgaaggaggcgatttaggtccagaagggattatatatattgct
ccagaagacaacactttaaataccggattaatcgttttatctaacgaagtaagttctaca
attagtgtatattctttagaaaacatcacgacattaggtgttaatgaagccacagaagaa
tctcatacatttaaagtttatccaaacccagtacaatcaaacaacataatctattttaac
acccaagtcaatgtaagtttatacgatttacaaggaagattagtaatttctaaagaaaac
gtaaatacccttaacattcctgctgttacaagtggtacatatatattaaaaaccgacaag
ggatctgtaaaaaagattataataaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
