Flavobacterium panici: NLJ00_00315
Help
Entry
NLJ00_00315 CDS
T08520
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
fpb
Flavobacterium panici
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_1
His_kinase
TPR_2
TPR_10
TPR_8
TPR_MalT
SNAP
HATPase_c
TPR_19
TPR_11
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UUF14563
LinkDB
All DBs
Position
complement(59653..61584)
Genome browser
AA seq
643 aa
AA seq
DB search
MSQKLRQIIFFFFFLAGQLLNAQNAKIDSLKRVLIYTKVDTSKVNEYNKIADLYKEINPD
STLFYAQKATNLSLKSDFTFGLATAYVNKGNASIILGDYPNALKYFKTAQLEFKKVLKED
SGKKVKSGLARSYASSGVVYSEQSNQILALKNYEEALQLYQEIDEQANVSKALNNIGIIY
KSQLNYPKALEYLKKASKIQTETGEKNAAVTLTNIGAIYFETGQNKNAILYYNKAKKLFE
NTDNMRGYALLCNYLGDYYKKENDLKLANEYYTKSLNLYEELQNKFGASLSLYNIAGLLQ
DQKKYKEAMPFAEKSLAYAKEIGVLDQTYHSEKLLSELYEALNDPKAALEHYKNYVQARD
SIINETTSQKFALAEVNYEYRKKEALLSEKNKRQIQFVIFSILGALLLIALILVIYNRMQ
VKRQLTLKKEVAEYEQKALHLQMNPHFVFNCLSSISSFIVQNGTDSALKYLSKFSKLMRL
TLEYSKGSLIPIDKEIESLQNYLELEKLRFHDKFEFEIKSSERVEFNMGLPPLLIQPFVE
NAILHGIVPKDGTGKIEVDFDVEKEQLICTIKDDGIGLSESKHLKENSVTAHKSMALGIT
KKRLEIMESITSKSAQIEITELQSENKKTGTKVVLRLPVQYIP
NT seq
1932 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagtcaaaaactacgtcaaataattttctttttcttctttcttgcaggacagctattg
aatgctcaaaatgctaagattgacagcttgaaaagagtgctaatttatactaaagttgat
acttcaaaagtcaatgagtataataaaatagccgatttatataaagaaatcaaccctgat
tcgacattgttttatgctcaaaaagcaactaatctaagtttgaaatctgactttactttt
ggacttgctacggcttatgtcaataaaggaaatgcttcaattattttaggagattaccca
aatgctttaaaatattttaaaactgcccaattagaatttaaaaaggttttaaaggaagat
tcaggcaaaaaagtaaaaagcggtttggctcgttcttatgccagctcgggtgtggtttac
tcagaacaaagcaatcaaattttagctttgaaaaattacgaagaagcactgcagttatat
caggaaattgatgaacaggctaatgtttctaaagcactaaataatatcgggattatttat
aaatctcagttaaattatccaaaagcactagaatatttaaagaaagcatctaaaattcaa
actgaaacaggagaaaaaaacgctgctgttacgcttaccaatattggtgcgatttacttt
gaaacgggtcagaataaaaatgcgattttgtattataacaaagctaaaaagctttttgag
aatacagataatatgcgaggatatgcacttttgtgtaattatttaggcgattattataag
aaagaaaatgatttaaaactggctaatgaatattatacgaagtcattgaatttgtatgaa
gaattacagaataaatttggtgcttcactttccttatacaatatcgcaggtttgcttcag
gatcaaaaaaaatataaagaagcaatgccttttgcagagaaatcccttgcttatgcaaaa
gaaataggagtgctggaccagacgtatcattctgaaaaattattaagcgaattatacgaa
gctttaaatgatccgaaagcagcgttagaacattataaaaattatgttcaagcgcgagat
agtattatcaatgaaacaacaagtcagaaatttgctttggcagaagtgaattacgaatac
agaaaaaaagaagctttattatctgaaaaaaacaaaagacaaattcagtttgttattttc
tccattttaggcgctttacttttaattgctttgatattggtaatttataatcgaatgcag
gttaaacgtcagttgacattgaaaaaagaagttgccgaatacgagcaaaaagcgctgcac
ttacaaatgaatccgcattttgtatttaattgtttgagttcaatttctagttttattgtt
cagaacggaaccgattcggcattgaaatatttgtctaaattctccaaattaatgcgtctt
acacttgaatattcaaaaggttcattaattccgattgataaagaaattgaaagccttcag
aattatctggaattagaaaaactccgttttcatgacaaatttgaatttgaaattaaatca
agcgaaagagtcgaatttaatatgggattaccgcctttgctgattcagccttttgtagaa
aatgcgattcttcatggaattgtacctaaagatggaaccggaaaaattgaagttgatttt
gatgttgaaaaagagcagctaatctgtacgattaaagatgacggaattggtttatctgaa
tcgaaacatttaaaagaaaactcggttacggcgcataaatcaatggctttgggaattaca
aaaaaacgtttggaaatcatggaatctataacttccaaatctgcacaaatagaaatcacc
gaattacaatcagaaaataaaaaaacaggaacaaaagtcgttttgcgtctgcctgttcaa
tacataccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
