Flavobacterium psychrophilum CSF259-93: FPSM_01738
Help
Entry
FPSM_01738 CDS
T03254
Name
(GenBank) PKD domain protein
Organism
fpc
Flavobacterium psychrophilum CSF259-93
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIJ38233
UniProt:
A0A076NX43
LinkDB
All DBs
Position
1920937..1924698
Genome browser
AA seq
1253 aa
AA seq
DB search
MKKIILFLVFSLVTINIYSQGTTCATATAFCGADINAPSLVFPSATTGTGLADGCLLSAP
RPAWFYLKVDRSGPLVYDIIQNRSFDSNGLPTGSQMDVDFAVWGPYASAVGNCSNRVNNC
PPCGNNTTSPGNYPRPAPGNLVDCSFDGAAVEHMTIPSATAGQFYLVMVTNYTGGTGFIK
LEQRPPILPTSGHTDCDIVCGVSLGPDRKECIGTPINITASFASPATSTATIPYQWSLDG
VPQPAYDNMQTITVNTPGTWSVKTTRPGGCYQVTSSMVYSNYLIPATQPNDIVLCTSSVP
PYIFPSINKNSEILGTLSASDYTITYHTSQAFANNGTAAIPFASLTNYLASSSPVTIYAR
IEDNISFCYTTKHFDLIVTTAPAGTFTYANPTYCTSIITPQPIIPVGLTSSGIFTTNPST
GLTINGTTGEITPSTSTPGNYTVKYEIAASPSCPLYSTSTTVTIATAQAITINCGITTTS
SITFDWTAAIGATGYNISYQVNTNPTVNIGAIGNVLTYLVSGLTPADTVVITVTPTGPLG
SCFSSSNKSCGANNCTPPTAAISYSLPSTPSTSFCESDTAPKLVNLTGTGLFAPGNYTAN
PNTLIINATTGTITPNGSPAANYTITYTIPSASAGCSPVTATTLVTIHALPTITGALNAC
IGTTTQLTGSGTANTTNPWISSNSAVATVSNTGLVTGVTVGNATITYKNSNGCDVTAIVT
INALPTITGTLNACVGTTTQLTGLGTANTTNPWVSDNIAIATVSNTGLVTGVTGGTAIIT
YTNSNGCATKATVIINALPTITGTLNACVGLTTQLTASGTANATNPWISSNNAIATVSNT
GLVTGVSVGSATITYKNSNGCDITAIVTVTLPTITGALNACIGTTTQLTGSGTANATNPW
ISSNSAVATVSSTGLVTGVTVGSATITYKNSNGCDVTAIVTINALPTITGTLNACVGTTT
QLTGLGTANTTNPWVSDNIAIATVSNTGLVTGVTGGTAIITYTNSNGCATKATVTINNPS
APGVITPITYCLNDITNPITATGSNLLWYATVTGGVGSTSAPTPLTTAVGNTNYYVSQTV
GTCESPRAVITSNISEPPATIVATPSNYFADLQTITVTVTPAGEYEYQIDNGAFQNSNIF
ANVSAGLHNITVRNECVSKSTTAYIVDYPRFFTPNGDGYHDTWNIPELKNQANAKVLIFD
RFGKLLTEIRPSGSGWNGTFNGKELPSTDYWFVVTYEENGITKEHKSHFSMKR
NT seq
3762 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataatattgtttttagtttttagtttagttactataaatatttattcgcaa
ggaacaacatgcgcaaccgcaaccgctttttgcggagcagatattaatgctccttccttg
gtattccctagtgcaacaacaggtactgggctagctgatggatgtttgctttcggcacct
agacccgcgtggttttacttaaaagtagatcgatcaggtcctttggtttatgatatcatt
caaaatagatctttcgatagtaatggtttgccaacaggatcacaaatggatgtcgatttt
gcagtttggggaccctatgcctcggcagtaggcaactgtagtaatagggttaacaattgc
cctccttgtggtaataatacaacttcaccaggaaattaccctagaccagctcctggaaat
ttagtagattgtagctttgatggtgcagcagtagaacacatgacaattcctagtgctact
gcgggccaattttatttagttatggttactaattatactggaggaacaggatttataaaa
ctagaacaaagacccccaattttaccaacttctggccatacagattgtgatatagtttgt
ggtgtttctttaggcccagatcgtaaagaatgtatagggactccaataaatattacagca
agctttgcctctccagctactagtacagctacaattccgtatcaatggtcattagacggt
gtaccacagccagcttatgataatatgcaaactataactgtaaatacaccaggaacttgg
tctgtaaaaaccactagacctggcggctgttatcaagttacaagtagtatggtgtatagt
aattatttaatacctgcaacacaacctaatgatattgttctttgcacaagctcggtacca
ccttatatatttccatcaataaataaaaatagcgaaattttaggaactctttcagcttca
gattacactattacatatcatacctctcaagcttttgcaaataatggcacggcggctatt
ccttttgcaagtttaactaattatttagcttcgtcttcaccagttacaatttatgctaga
attgaagataacatatcattttgttacactactaagcatttcgacttaattgtgactact
gcgccagccggaacatttacttatgctaacccaacatattgtacaagtattataacgcca
caacctataataccagttggtttaaccagcagcggaatttttacaacaaacccatcaact
ggattaacaataaatggaaccacaggagaaattacccctagtaccagtactccaggaaat
tatactgtaaaatatgagattgctgcatcgccttcttgtccgctatatagcacctctaca
acagttactattgctacggcacaagcaataacaataaattgtggtataactacaacttct
tcgataacatttgattggacagcagcaataggagctacaggctataatatatcttaccaa
gtaaacaccaatccaacagtaaatattggagcaattggcaacgtgctaacctatttagta
tcaggattaactccagcagacactgttgtaattacagtaacaccaactggaccattaggt
agttgtttttcatcaagcaacaaaagttgcggagcaaataattgtacaccacctactgct
gctatatcatatagtttacctagcacacctagcacctcattttgcgaatcagacacagca
cctaaattagttaatttaactggaacagggctttttgcaccaggtaattatactgcaaat
ccaaacactcttattattaatgcaactacaggaacaattactccaaacggaagtcccgca
gctaattatacaataacttatactattccatctgcatctgcaggttgttctccagtaaca
gctacaacattagttactatacatgcattacctacaattacaggtgctttaaacgcttgt
attggaactacaacccaacttacaggatcaggaaccgcaaacacaaccaacccttggatt
tcttccaatagcgcagtagccacagtaagtaacacaggattagtaacaggagttacggta
ggaaatgcaactattacttataaaaacagtaatggatgcgatgttacagccattgtaact
ataaatgcgctacctacaattacaggaactttaaatgcttgcgttggaacaacaactcaa
cttacaggattaggaactgcaaacacaactaacccttgggtgtctgacaatatcgcaata
gccactgtaagcaatacaggattagtaacaggcgtaacaggaggaactgcaataattact
tatacaaatagtaacggatgcgctactaaagcaacggtaattataaatgcactacctaca
attacaggaactttaaatgcttgcgttggattaacaacacaactaacagcttcaggaact
gcaaacgcaaccaacccttggatttcttctaataatgcaatagccacagtaagtaacaca
ggattagtaacaggagtttcggtaggaagcgcaactattacttataaaaatagtaatgga
tgcgatattacagctattgtaaccgtaacgttacctacaattacaggtgctttaaatgct
tgtattggaactacaacccaacttacaggatcaggaactgcaaacgcaaccaacccttgg
atttcttccaatagcgcagtagccacggtaagtagcacaggattagtaacaggagttacg
gtaggaagtgcaactattacttataaaaacagtaatggatgcgatgttacagccattgta
actataaatgcgctacctacaattacaggaactttaaatgcttgcgttggaacaacaact
caacttacaggattaggaactgcaaacacaactaacccttgggtgtctgacaatatcgca
attgccactgtaagcaatacaggattagtaacaggagttacgggtggaactgcaataatt
acctatacaaatagtaacggatgtgctactaaagcaacggtaactataaataatccatcg
gcaccaggagttataacaccaataacatattgtttaaatgatataacaaatccgattacc
gctacaggaagtaatttattgtggtatgcaacagtaacaggaggtgtaggttctactagt
gctccaacccctttaacaactgccgttggaaacacaaattattatgtaagtcaaactgtt
ggaacttgtgagagtccaagagcagtaatcacttctaatatttctgaacccccagcaact
atagttgcaaccccttctaattattttgcagatttacagaccataactgttaccgtaact
ccagcaggagaatatgaatatcaaatagataatggcgcttttcaaaacagtaacatattt
gcaaatgtgagtgctggtttacacaatataactgtaagaaatgaatgcgtatcgaaatct
acgactgcttatattgtagattatcctagattctttaccccaaatggagacggataccat
gacacatggaatatccctgaactaaaaaatcaagcaaatgctaaagttttaatttttgac
agatttggaaagttattaacagaaattagaccttctggaagtggttggaatggaactttt
aatggaaaagaactaccatcaacagattactggtttgtagttacgtacgaagaaaatgga
attacaaaagagcataaatcgcatttctcgatgaaacgataa
DBGET
integrated database retrieval system