KEGG   Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_04290
Entry
Q1W71_04290       CDS       T09245                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
fpec  Flavobacterium pectinovorum
Pathway
fpec01501  beta-Lactam resistance
fpec01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpec00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    Q1W71_04290
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    Q1W71_04290
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:fpec02000]
    Q1W71_04290
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:fpec01504]
    Q1W71_04290
Transporters [BR:fpec02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   Q1W71_04290
Antimicrobial resistance genes [BR:fpec01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    Q1W71_04290
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF DUF1077 DUF6286
Other DBs
NCBI-ProteinID: WKL49005
LinkDB
Position
complement(942743..945841)
AA seq 1032 aa
MSLSTTSIRRPVLTIVLNLLIILFGFIGYTFLGVREFPSIDPAQVSVRTNYTGANSDIIE
SQITEPLEKAINAIDGIRNITSSSNQGSSNITIEFNLDKNLEEAANDVRDKVSQAVRSLP
QDIDAPPVVSKADADSESIISMTVQSDSRSPLELSDYAENVISQRLETIPGVSGVQIWGQ
KRYAMRLWIDPIKLNAYNCTVSDVRDALNAQNVELPSGKLTGNNTELTVKTIGNLSKPEE
FNNIIIRTDGDKIVRLSDVGGAELGPENIETSLTSSGLPMIGLAIVPMPGANYLDISSEF
YKKYEALKKDLPKDIKLNIALDNTLFVKKSVLEVAETLGISIILVIIIIYLFFRDWAIAF
RPLIDIPVSLIATFFIMWLFGFSINVLTLLAIVLATGLVVDDGIVVTENIFKKVEEGMSP
IEAAIKGSNEIFYAVISISVTLAAVFLPVIFLEGFVGRLFREFGVVIGAAVLISAFVSLT
LTPMLNAYLMKGGEQKKSKFYIKTEPFFEKLNSGYADSLGRFMDKKWISFPILIVCFGLI
YLFFTILPKETAPYDDRSSVTMRMTTPEGSSYEYTNRFMQEMSKLVDDSIPEKKVSLVIT
AGGSGGSATNSGFIRLSLKEPDERARSQKDIADKLTKWTKKYPDAKTSVIQQPTISVNRR
GGLPIQYIIQAPTFDKLREKIPAFMEEVGKSDVFSTTDVNLKFNKPEINVSIDRAKAESL
GISIMDIAQTLQLSLSGQRFGYFIKNGKQYQVIGQFDQKDRSKPLDLTSMFVRNKSGQLI
QMDNVVKIQEQSNPPQLYHNNRYMSATVAAGLAPGKSISDGIEEMDRIKAKVLDQSFTTD
LSGESRDFVESSSNTSFAFGLALLLIFLILAAQFESFIDPLIIILTVPMAVAGALFSLWL
FNQTWNIFSQIGTVMLIGLVTKNGILIVEFANQLREQGKPKLEAILEASEARLRPILMTS
LAIALGALPIAMSLGAASTSRIGMGVVIVGGTIFSLALTLFVIPAIYLMWSKARKHYPEF
DHIDEYERESNK
NT seq 3099 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtttatcaaccacaagtataagaaggcccgttttaaccattgtactgaatcttttg
attattttattcggtttcattggttatacctttctgggtgttcgagaattcccttctatt
gatccggcgcaggtttctgttagaaccaactacaccggagccaattctgatattattgaa
tcacaaattacggaaccccttgaaaaagcaataaatgctattgatggaataagaaatatt
acttcgtcaagcaatcagggaagcagtaatattaccatcgaatttaatttagataaaaat
ttagaagaagctgcaaacgatgttcgagacaaagtttcgcaagccgttagaagtttacct
caggatattgatgcgccgccggtagtttctaaagctgatgctgatagtgaatctattatt
tcgatgacagttcagagtgacagccgaagccctttagaattaagtgattatgcagaaaat
gttatttcgcagcgtttagaaactattccaggagtaagtggtgttcaaatctggggacaa
aaacgttacgcaatgcgtttgtggatcgatccgataaaattaaatgcttacaattgtact
gtttctgatgttcgcgatgccttaaacgcacaaaacgtagaactaccttcaggaaaacta
acaggaaacaacacagaacttaccgtaaaaacaattggaaatctttctaaaccggaggaa
ttcaacaatattatcattcgtaccgatggtgataaaattgttcgcttaagtgatgttgga
ggtgccgaattaggtcctgaaaatattgaaacttctttaacatcgtccgggcttccaatg
attggtttagccatcgtgccgatgccgggagctaattatttagatatttcatctgaattt
tataaaaaatacgaagccttaaaaaaggatcttccaaaagatatcaaattgaatatcgca
cttgataatacactgttcgtaaagaaatcagtacttgaagttgccgaaacattgggaatt
tcgatcattctggtaattatcatcatttatttattctttagagactgggcaattgctttc
agacctttaattgacattcctgtttcgttaatcgctacgttttttatcatgtggcttttc
ggattctctatcaacgtattaactttattggcaattgttttggctacaggtttggtggtg
gatgacggaattgtggtaaccgaaaatatcttcaagaaagtcgaagaaggaatgtcgcca
attgaagctgcaataaaaggatcaaacgagattttttatgctgtaatttcgatttcggtt
acacttgctgcggtatttttacctgtaattttcttagaaggtttcgttggccgactcttt
agggaatttggtgtcgtaattggtgccgcggtattaatttctgcctttgtatccctgact
ttaacaccaatgttaaacgcctatttgatgaaaggcggcgaacagaaaaaatcgaaattc
tatattaaaacagaaccgttttttgaaaaattaaacagcggttacgcagattcacttggc
cgttttatggataaaaaatggatcagtttccctattttgattgtttgttttggattgatt
tatttgttttttaccattcttccaaaagaaacggctccatatgatgaccgtagttctgta
acgatgcgtatgaccactccagaaggttcttcttatgaatataccaaccgttttatgcag
gaaatgtcaaaattagttgatgattctattccggagaaaaaagttagtttagttattacc
gcgggaggttccggaggttctgcaacaaattcaggttttattagactttcactaaaagaa
ccagacgaaagagccagatctcaaaaagatatcgctgataaattaaccaaatggactaaa
aaatatccagacgctaaaacatctgtaattcaacagcctacaatttctgtaaacagacgt
ggcggacttccgattcagtatattattcaggctccaacttttgataaacttagagaaaaa
attcctgcttttatggaagaagtcggtaaaagtgatgttttttctacaactgatgtgaat
ctgaaattcaacaagcctgaaataaacgtaagtatcgatcgtgcaaaagccgaaagttta
ggtatatcaattatggatattgcgcagactttacagctttctttaagcggtcagcgtttt
gggtatttcattaaaaacggaaaacaatatcaggtaattggtcagtttgatcaaaaagac
cgttcgaaacctttggatttaacctcgatgtttgtgagaaacaaatccggtcaattgatt
cagatggataatgttgtaaaaatacaagagcaaagtaatccaccgcaattataccacaat
aaccgttatatgtctgcaacagttgccgcaggtttagcaccgggcaaaagtatcagcgat
ggtattgaggaaatggatcgaattaaagctaaagttctagatcagagttttacaaccgat
ttaagtggagaatcgcgagattttgtcgaaagtagttccaatacttctttcgccttcggg
ttggctttattattaatatttttgattctggctgctcaatttgagagttttatagatccg
ttaattattattttaactgttccaatggctgttgccggcgcattattctctctgtggcta
ttcaaccagacatggaatatttttagccagattggtaccgtaatgcttattggcttggta
accaaaaacggtattttgatcgtagagtttgccaaccagttgcgagaacagggcaagcca
aaacttgaggctattttagaagcttcggaagcgcgtttacgtccaattttgatgaccagc
ttagccatcgcactgggagctttaccaattgcaatgtcacttggagcggcttctacaagt
agaattggaatgggggttgtaattgttggaggaacaattttttcattagcattgacactt
tttgttattcctgcaatctatttaatgtggtctaaagccagaaaacattatccggaattt
gaccatattgacgaatacgaaagagaaagtaacaaataa

DBGET integrated database retrieval system