Flavobacterium psychrophilum Z2: AMR72_07655
Help
Entry
AMR72_07655 CDS
T04556
Name
(GenBank) SprA protein
Organism
fpsz
Flavobacterium psychrophilum Z2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM48778
LinkDB
All DBs
Position
complement(1735960..1743276)
Genome browser
AA seq
2438 aa
AA seq
DB search
MKTEYSKDFCINFKFALSVVFLFFGVALQAQVTEEEEESRDTIKGYNTGKVEIANPKSIV
EAYTYDPVTNRYIYTNKFEGFNITYPIILTPEQYQELVLRDSMRSYFQEKSNAMDGKGTE
EQQKNLLPRYYVNSSFFETIFGSNTIDIKPTGSVELDLGMRYTKQDNPSISPRNRRTFTF
DFDQRISMSLQGKVGTRLAVSANYDTESTFAFQNLVKLEYTPTEDDIIQKIEVGNVSFPL
SNSLVRGAQSLFGVKVALQFGKTTVTGIFSEQKSQTKTVTAQGGGTLQDFSLFALDYDAD
RHFFLSQFFRNEYDYSLRRYPQVDSRVTITRMEVWVTNRQNRINAAENNSRNIIAIQDLG
EGRLQKRGTTTDITNQAVKFGNIPNFFETPGAAPNQPPQNKNNKFDPAQIGTTGWLNQSV
RQIVTVGASSFANVSAREGRDYSKLENARKLTSSEYTYHEKLGYLSLNQRLNNDEVLAVA
YQYTIGNDVYQVGEFGTDGVDATVVDQTNPSGNIPITQTLVLKLLKSNLVNVDEPTWDLM
MKNIYQVPGGFQLSQEDFRFNILYTDPSPLNYISAVPNTTLPVDDPATEDDEGVADTPLL
RVFNVDRLNYTNDPQRGGDGFFDWVPGTTIDPQNGRIIFPVVEPFGEHLFDKMLAEGEVP
ADYNGPESSFNPNQRQYVYRRMYNSTPADALQDSQKNKFQLRGRFKSTGGDGISLGAFNV
PQGSVVVTAGGRILVEGVDYTVNYQLGKVQILDPSLQASNTPIEVSVENNSVFGQQTRRF
AGFNVEHKFSDKFLVGATMINMSERPFTNKTNYGQESVNNTIYGFNTNFATEVPFFTRLV
NKLPNMDTDVPSNFSFRGEVAYLKPGASKADQFDGEATTYVDDFEGSQSTIDMRSAQGWS
LSSVPSDLFPQGVPDGLPSGFNRAKLAWYSIDPVFYAQSQRPDGISTDDLNSNRTRRVYY
DELYPETDVAPGQTRVVNTLDLTYYPQERGPYNYNSVLPAQNFTFNEGQATQNWAGIMRA
ISSTNFEQTNVEYMQFWVMDPYYGPDSDVASPNNTGVLEINLGELSEDILKDNRKQFENG
LPEANGNQPVFSTEWGDVPVSQSLIYAFDTNTANRAVQDVGFDGLTDDEERAKFQSIGFG
GLDDPAGDNYQFYLAASGNVLDRYKNYNGTQGNSPVDVGNTNRGSTTLPDTEDINRDNTM
NTIDAYFKYTIPISQGMPLGQGYLVDERVTEGKGADGELVPVRWLLYKVPIQGGGEENIG
GINNRSIRFMRLVMKGFREDITLRFGALDLVRGEWRRYTGVFDPNDTDPTDPNTGFDVVS
VNVQENGSRKPIPYVTPPGVRREQLYNNNAVINQNEQSLSLRVYELPAGSGGGLEPNDAR
AVFKNVNVDMRQFKKLRMFLHAEPLVGSSWALGDDQMKAFLRFGNDFTDNFYQVELSLKV
TQILGKATYTPEEIWRVENELLVTLEALTKLKIQKLSGVLPPPDENGINFVSAQSLDSSL
SPDMTIGIKGNPNFGSIRTLMLGVKNGIDQPITGEVWFNELRLSDMDSQGGMAAVASMDT
NFADFATISATGRMSTIGFGSVEQSPNERSREDVKQYDIVTNVNVGKLLPKKWGVNIPFN
YGVGEEIITPEYDPFQQDVKLDQLIDVTPNQAEKDNLRDRAIDYTKRKSINFIGVKKERG
AEQKQRIYDPENLTVNYSFNQTEHHDYEIEDLIDQQLRTGVDYNFAFKPKPVEPLKNVGF
LKKSQYWKLLQDFNFNYLPANINFSTNIIRQYNRQQFRNVEVEGIPISPLYRRNYFFNYQ
YGFNYNLTKSVKLNYKVATSNIVRNYLDENGVPIQDYTIWEDFWNTGEANTHSQEYVVSY
ELPLNKLPFLSFMKATYNYTGNFNWQRSSDALSNVTRVVDGVDVNFDLGNIIQNANTHKL
NAAFNMDLLYKYVGLTGKKPAKTPNTPKVAPKPGEKITAAPKPTASGNTFVNGLIGVVTS
VKTISAVYSETNSMVLPGYLPSIGFFGSSKPTMGFVFGSQDDDVRYELAKRGYLTKDPEY
NQNFTQVNNKTLNLTAAVDLFPDFKIDLTANRGISDSYSEQYDVSADGTYNSLSPYTFGN
FEISTIMIGTAFSKSDVNSSAAFDQMRENRMVIAERLATSRYGSTEFPRYNGPGDLNAGS
EFSNANAGYPVGFGRNSQSVLLPAFTSAYTGQDAGKVSTGVFRSVPLPNWVIKYTGLMRY
KFFKDRFKRFSLQHQYKASYNVNSYRSNFEVTNPSEGSNGQDNNGVGNFYSKYIISNINL
SEQFSPLIRVDFEMKNSIKVLAEIRKDRTLNMSFDNNLLTEVKGNEYIVGLGYRIKDVII
NSSLADNPTNTIRSDINLKADFSLRKNETIVRYLDYDNNQLGGGQNIWSVKMTADYAFSK
NLTAIFYYDHSFSKAVISTAYPLTNIRAGFTIRYIFGN
NT seq
7317 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaacagaatactctaaagatttttgcattaactttaaattcgccctttctgtagta
tttttattttttggtgtggcactgcaggcgcaggttaccgaagaggaagaagaaagtcgt
gatactattaaagggtataataccggtaaggtagaaattgctaacccaaaaagcattgta
gaggcatatacctatgatcctgttacaaatcgctatatctacactaataagtttgaaggt
tttaatataacctatccgataatccttactcctgaacaataccaggaattagtattgaga
gactccatgcgtagttatttccaggagaaatctaacgcaatggatggcaagggaacggaa
gaacagcaaaaaaatcttttgccccgttactacgtaaattccagcttttttgaaaccata
tttggtagtaatactatagacattaagcctacaggatctgttgagctagatcttggtatg
cgctacacaaaacaggataacccgtctatttctccacgaaacagaagaacatttacattt
gattttgaccagcgtatctcgatgagccttcagggtaaagtaggtaccaggcttgcggtt
tcggcaaattatgataccgaatctacctttgctttccagaatcttgtaaaattagaatat
acacctacagaggatgatatcatccagaaaattgaagtaggtaacgttagttttccacta
tctaactcattagttagaggtgcgcaaagcctttttggtgttaaggtagcccttcagttt
ggtaaaacgaccgtaacgggtattttctcggaacaaaaatcgcaaaccaagaccgtaacg
gcacaaggtggcggtacactacaggacttctcactatttgcgcttgactacgatgccgac
aggcactttttcctatctcagttttttaggaatgagtatgattattcattgaggcgttat
ccacaagtagatagcagggtaactattacccgtatggaggtgtgggttaccaacaggcag
aaccgtataaacgctgccgaaaataattcaaggaatattattgccattcaggatttaggt
gaaggtagattacaaaaaagaggtacaacaacagatattacaaatcaggctgtaaagttt
ggtaatattcctaatttctttgaaactcctggtgctgctccaaaccagccccctcaaaat
aagaacaataaatttgaccctgcacagattggaactacggggtggttaaatcagagcgta
agacaaattgttactgttggtgcttcaagtttcgcgaatgtctctgccagagaaggtcgg
gattattccaaacttgaaaatgcaagaaagcttacatcgagcgaatatacctaccatgaa
aagctagggtatctttcgttaaaccaaaggcttaataacgatgaggttttagctgttgct
taccaatataccataggtaatgatgtgtatcaggtaggtgaatttggtacagatggtgta
gatgctacagttgtagatcaaactaacccgtcaggaaacattccaattacgcaaaccctt
gttctaaagttgcttaagagtaatcttgtaaatgttgatgagccaacatgggatttgatg
atgaaaaacatctaccaggttccgggaggtttccagctttcacaggaagatttcaggttt
aatatattatataccgacccgtctccgttaaactatatctcagccgtgccaaatacaact
ttgcctgttgatgatcctgcaactgaagatgatgaaggtgttgcagatacaccattattg
cgtgtatttaatgtagaccgtttaaactataccaacgacccgcaaaggggtggagatggt
ttctttgactgggtaccgggaacaactatagatcctcagaatgggcgtattatatttcct
gtcgtagaaccttttggagagcatttatttgataaaatgttagcggagggcgaagttcct
gcggactataatggtcctgagtcttcatttaaccctaatcagagacaatatgtatacagg
agaatgtacaacagtacacctgctgacgcattacaggatagccagaaaaacaaattccaa
cttagaggtcgttttaaatctaccggtggcgatggtatatcgctaggtgcatttaatgtt
ccgcaaggttctgttgttgttacagcaggcggaagaatacttgtagagggtgtagactat
acggtaaattaccagttagggaaggtacagatattagatccgtcacttcaggcatcaaac
acgcctatcgaggtttcggtagaaaacaactcggtatttggtcagcagacaaggcgtttt
gcaggatttaacgttgagcataaattcagcgataaattcctcgtaggtgctacgatgatc
aatatgtctgaaaggccgtttacaaataaaactaactacggacaggagtctgtaaataat
acgatatacggttttaataccaactttgctacagaggttcctttctttacacgattagtg
aacaagcttcctaatatggataccgatgtaccatctaacttctcgtttaggggagaggta
gcgtacttaaaaccgggagcttctaaagctgaccagtttgatggtgaagccactacttac
gtagatgattttgaaggttcgcaatctaccatcgatatgcgttctgcgcagggatggtcg
ctttccagtgtgccttcagacctgtttccacagggtgttccggatggtttgccttcagga
tttaacagggctaaacttgcctggtacagtatagaccctgtgttttatgcacagagccag
agaccggacgggattagtactgatgacctgaattccaacaggacaagacgtgtgtattat
gatgagctatatccggaaacagatgtagcaccggggcagacccgtgttgtaaatacactg
gatttaacgtattatccacaggaacgtggtccatataactacaacagtgttttaccggcg
caaaactttacgtttaatgaaggccaggctacacaaaactgggcaggtattatgcgtgct
ataagctcaaccaattttgaacagaccaatgttgagtatatgcagttttgggttatggac
ccttactatggaccagacagcgatgttgcttctccaaacaatacaggtgtgttagagata
aaccttggtgaactttctgaagatatacttaaagataatagaaagcagtttgagaatggt
cttcctgaagcaaatggcaaccaaccggtgttttcaacagaatggggagatgtgccggtg
tcgcaatcgcttatctatgcatttgatacgaacacagcaaaccgtgctgtacaggatgtt
ggttttgatggtttaacagatgatgaagaacgcgctaaattccagagtattggttttgga
ggccttgatgaccctgcaggagataactatcaattttatcttgcagcatcaggtaatgtg
ttagacaggtataaaaattataacggtactcaaggcaactcgcctgtagatgtgggtaat
actaacaggggatctactacgcttcctgatacggaagacatcaatagggataatacaatg
aatactattgatgcttactttaaatatacaattccaattagccagggtatgcctcttgga
caagggtatcttgttgatgagagagttactgaaggtaaaggtgctgacggtgagcttgtc
cctgtaagatggctgttatataaagtgcctatacaaggtggtggtgaagaaaatattggt
ggtataaacaaccgttctatccgttttatgaggttagtgatgaaaggcttcagggaagat
attacacttcgttttggtgcgcttgatcttgtaagaggagagtggagaagatacacaggt
gtattcgatcctaacgatacagaccctacagaccctaatacaggttttgatgtggtatct
gtaaacgtacaggaaaacggttcgcgtaagccaataccgtatgtaacgcctccgggagta
agaagagaacagttgtataacaataatgctgttatcaatcaaaatgagcagtcgttatca
ttaagagtatacgaactgcctgccggaagtggcggcggacttgagcctaacgatgcacgt
gcggtgtttaagaatgtaaacgtagatatgcgtcagtttaaaaagctgagaatgttcctg
cacgctgagccgttagtaggatcttcatgggcactgggtgatgaccagatgaaagccttc
ctgcgctttggtaacgattttacagataacttttatcaggtggagctatcgcttaaggta
actcagatacttggtaaggctacatacactccggaagaaatatggcgtgtagagaatgaa
ttgcttgtaacgcttgaagcgcttaccaaacttaaaatacaaaagttaagcggtgtattg
cctccacctgatgaaaatggaattaattttgtgtccgcacagtcgctggactcttcttta
agtcctgatatgaccattggtattaaaggtaatcccaactttggaagtatacgtaccctg
atgctgggtgttaaaaacggaatcgaccagcctattacaggtgaagtttggtttaacgaa
cttcgtctatctgatatggatagccagggcggtatggctgctgtggcaagtatggatact
aactttgctgattttgctacaatttctgccacaggtagaatgagtactattggttttgga
tcggtagagcaaagccctaacgaaagaagcagggaagatgttaagcaatatgatatagta
accaatgttaatgtgggtaaattgcttcctaagaaatggggcgttaacattccgtttaac
tatggtgttggagaggaaattattactcctgaatacgatccgttccagcaggatgttaag
ctggatcagcttatagatgttacgccaaaccaagcagagaaagacaatctgcgcgacagg
gctatagactatacaaaaagaaagagcattaactttattggtgttaaaaaggaaagaggc
gcagagcagaagcaacgtatttacgatcctgaaaacttaactgtgaattactctttcaac
cagacagaacaccacgactatgaaattgaagatctgatagatcagcaattaagaacaggg
gtagattataactttgcctttaaacctaaaccggtagagccgcttaaaaatgttggcttt
ttgaaaaagagccagtattggaaactgcttcaggattttaattttaattatcttccggca
aatattaatttcagtacaaacattatacgtcagtacaacaggcaacagtttagaaatgtt
gaggttgaaggaattccgattagtccgctatacaggagaaattacttctttaattatcaa
tacggattcaattataaccttaccaaatcggttaagctaaattataaagttgctacaagt
aacatagtaaggaattatcttgacgaaaacggtgtacctattcaggactacacaatctgg
gaagatttctggaacacgggtgaagctaatacgcattcacaagaatatgtggttagctac
gaattgccattgaataaactaccgttcttaagctttatgaaagcaacgtataattacacc
ggtaacttcaactggcagcgttcgtcagatgcgttatctaacgtaacacgtgtagtagat
ggagtagatgttaactttgatttgggtaatataatccagaatgcaaatacgcataaacta
aatgcggcattcaatatggatttactatataagtacgttgggctaacaggtaaaaaacct
gctaaaacgcctaacacgccaaaagttgcacctaagccgggtgagaaaattacagctgct
cctaaaccgacagcttcgggtaacacatttgtaaatgggcttattggtgttgtaacaagt
gttaagaccatttcggctgtttattctgaaactaacagtatggtgcttccgggttacctt
ccttctattggtttctttggtagttctaaaccaacgatgggatttgtttttggtagccag
gatgatgatgttcgttatgagttggcaaaaagaggttatcttactaaagatccggaatac
aaccagaactttacgcaggtaaataacaaaacgcttaatcttacggcagctgtagattta
ttccctgattttaaaatagatcttaccgcaaacagaggaataagtgatagttattcagaa
caatacgatgtaagtgcagacggtacatataactctttatcgccatatacatttggtaat
ttcgagatatctaccattatgataggtacggcatttagtaagagtgatgtaaatagctct
gctgcgtttgaccaaatgagggaaaacagaatggttattgcagaacgacttgcaactagt
cgatatggttcaacagaatttccaagatacaatgggcctggtgatctgaatgcaggaagt
gaatttagtaatgccaatgcgggttaccctgtagggtttggtcgtaacagccagtcagta
ttgcttccggcatttacatctgcttatacagggcaggatgcaggtaaagtatctacaggt
gtgtttagaagtgttccgttgcctaactgggtaattaagtatacaggacttatgcgctat
aaattttttaaggacaggttcaaacgtttctcgcttcagcatcagtataaggcatcatac
aatgttaattcatacaggtctaactttgaagtcactaatccttcagaaggcagcaatggt
caggataataatggggtaggtaacttttatagcaagtatatcatatccaacatcaacctc
tcagagcaattcagcccgctcatacgtgttgactttgagatgaagaactctataaaagta
ctggctgaaatacgtaaagacagaacgcttaacatgagttttgacaataaccttcttacc
gaggttaagggtaacgaatatatcgtaggtcttggttaccgtattaaagatgttatcata
aattcatcactggccgataacccaacgaataccattagaagtgacatcaaccttaaagca
gatttcagcttaaggaaaaatgaaacgatagtgcgttaccttgattatgataacaaccag
cttggtggaggacagaacatatggtcggttaagatgacggcagattacgctttcagtaaa
aaccttaccgctattttctattatgaccattcattctctaaggcagttatatcaacagcg
tatccgttaactaacatccgtgcaggatttaccatcaggtatatttttggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system