Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_17235
Help
Entry
KMW28_17235 CDS
T07356
Name
(GenBank) DUF5060 domain-containing protein
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
DUF5060
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG01388
LinkDB
All DBs
Position
1:4360404..4362392
Genome browser
AA seq
662 aa
AA seq
DB search
MKFTKLFTLLFFVIHFTLTASTIQPEIIEITNNTTSLSTFEKFESIIKVKAEYTNPYDPQ
DIDVSANIKLPDGTTVDYPLFYKGVEGGVSEWGLRIAPKSEGSYSFTIKVITGDQNTTSE
EQTFSASDSEGLGFLHTVNNNFNNLVFDNGSGFRGFGLNMAWEARNNENPKYTYEFWFDL
FADHDINFVRTWVNAPWNLPIEWSNPTSDRYGDYDGIGYHPEGLERIEYMINEAEKNEMY
LMLAMDFHGALWVNNNDGWGNNFWNVHPYKELAGCVNPNDFFTFEEARRLYKNRLRYFVA
RWGYSTSVAAIEFFNEVDNTIIYSGQNVNPADVVEWHGIMGDYLKSIDYHNHILTTSISH
NQINGLFDVDELDMIQSHLYDYVDNMAQVITDMTNTHKKPYVVGEMGLDFMPPNNNDEAK
WIKDLQKTMWLGMFEKTSIIPMTWWWENYEVWNAYNKFEFLSEYTEKMTTNSDSERTDLS
FINSEDLNAKGILIRNRHGYVFVEGNGTNLRNITLQIDGLPENDYTFYVYNAYTYELKDE
IDVSASASGKFYIELKDISANEDIFIYLENKRGDITGVEDDLKKVGWNLYPNPVKSTLNY
KIDDVFNPINAQFFIYDLNGKVMAQAGLEQNSNINLDAFPSGMYIFKIVSDSFEDQKLFI
KQ
NT seq
1989 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtttactaaactatttactttattattttttgtaattcattttacactaacagcg
tccactattcagcctgagattattgagattactaacaacactacatctttaagtactttc
gaaaaattcgaatctattattaaggtgaaggcggagtatactaatccttacgaccctcaa
gacatcgatgtaagtgcgaacatcaaactgcctgatggaactactgtagattaccctctt
ttttataaaggagttgaaggaggtgtttctgagtggggtcttagaatagcaccaaaatca
gaaggtagttattcattcactattaaagtgattactggtgatcagaatacgacatcagaa
gaacaaactttctcggcatccgacagtgaaggtcttggttttttacatactgtaaataac
aacttcaataatctagtatttgataacggatctggatttagaggttttggtctaaacatg
gcctgggaagcaaggaataacgaaaaccccaaatacacttacgaattctggttcgatctt
tttgcagatcatgatatcaactttgtaagaacatgggtgaatgctccttggaacttaccc
attgaatggagtaacccaacttcggatcgttatggagattatgacggaattggttaccat
ccagaaggtcttgaacgcatcgagtatatgattaacgaagcggaaaagaatgagatgtat
ttaatgttagctatggatttccatggtgcactttgggtaaacaacaacgatggttgggga
aataacttctggaacgttcacccttataaggagttggcaggatgtgtgaatccgaacgat
ttcttcactttcgaagaagcacgaagactttataaaaataggctaagatattttgttgct
cgttgggggtacagtacttctgttgcagctattgagttttttaatgaggtggataacact
atcatttattctggacaaaatgtaaaccctgctgatgtggttgaatggcacggcattatg
ggtgactacctaaaatcgatagattatcataaccacatccttacaactagtatcagtcac
aatcagataaacggactatttgatgtcgatgagttggatatgattcaatctcatctttat
gactatgtagataacatggctcaagttatcactgacatgactaacacacataaaaagcct
tatgtagttggtgaaatgggattggattttatgcctcctaacaataacgacgaagcaaaa
tggatcaaagatctacaaaaaacgatgtggttaggtatgttcgaaaagacatcaattatt
cctatgacatggtggtgggaaaactacgaagtttggaatgcttacaataaattcgaattc
ctttctgagtatactgaaaagatgactactaactctgacagtgaacgtacagatcttagc
tttattaatagtgaagacttaaatgcaaaaggtattcttattagaaatcgacatggttat
gtatttgtagaaggtaacggcactaaccttaggaacatcactttacaaattgatggacta
cccgaaaacgattacacattctatgtttacaatgcttatacttatgagttaaaagacgaa
atagatgtatctgcaagtgcttcaggtaagttttatattgaattaaaagatatatcagcc
aacgaagatattttcatctatcttgaaaataaaagaggagatataacaggagttgaagat
gatctaaaaaaagtaggttggaacctctaccctaatccggtaaagtctactctgaactat
aaaattgatgatgtttttaatccaatcaatgcacagttttttatttatgatttaaatgga
aaagtgatggcacaggctgggttagaacaaaatagcaacattaatcttgatgcatttccc
agcggaatgtatattttcaaaatagtttctgattctttcgaggatcagaaattattcatt
aaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system