Gossypium arboreum (tree cotton): 108475355
Help
Entry
108475355 CDS
T05776
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_1
LRR_4
LRRNT_2
LPAM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108475355
NCBI-ProteinID:
XP_017632805
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(58729742..58733103)
Genome browser
AA seq
1086 aa
AA seq
DB search
MNTLHSPISLFLFSCFLPLLLSFSPPQTHLPTQCLDDQRSPLLQLQHHLYYAPNFTFSSK
FELWDPNTDCCSWEGVTCDAYGHVIGLDLSYKNLSGSFHSIFNLHRLRRLNLAGNYFNTT
LFSYGFDKLQNLTHLNLSSSCFHGQIPVEISYLTRLVSLDLSNQDSCYLRYYTIIDPYNF
MYNYYELHPELQQPLKLEKPNFKTLIKNLRFLTELCLDSVDISTQSAKWCETTSLVLSNL
RVLSLSSCGLKGPLCSSLSRLSFLSKLILDGNPISYLPPNFLVNSSCLVSLSLSDCNLNG
HFPTGILLLPKIQSIDISGNDQLMGQLPEFPANNALQSLSLSHTNFSGKLPHSIGNLKFL
TYLELSYCNFFGPIPSSIANLSQLVNLYLGGNKLSGSIHYSLFTLPSLKTLYLGENQLVG
KIDDFPNAFSSFIEELYIGNNYLIGPIPKSVLQLPWLEWLYIEGNSFSFMKLDMSVRLNN
LRDLMLFNTSLLIESDNRSLTFPQLERLSLRSCNLTEFPEFIKRQDKLGSLDLSNNHIHG
FVPNWLWKSNLSLVDLSFNMIDFPKQLPLSDANFSFLMLKELYLASCNIGSFPEFIKTQD
KLVDLDLSNNHIHGVVPNWLWKSTLSWVDLSFNMIDFPKQLPLSDANFSFPLLKTLYLAS
CNISLFPEFIKTQDKLVDLDLSNNHIHGVVPNWLWKSSLSRVNLSFNVIDFPKQLPLSDL
NFSFSMLRELYLDSCNISSFPEFLKSQENLKYLKLSNNKISGAIPNWVWKKNLRYLFLAN
NHLSSLDQLLPNQSSTSLQGSFYFEASYNNLSGPIPNWLCNMSQLSAFYASYNNFNGPIP
NCLDNMSQLYTFDAFYNNLSGPIPNCLGNMSAMSWLGLQRNNFSRMLPKFSKTTQLQFLK
VSENRLVGKLPRSLAKCTQLLVLDVGSNMINDTFPFWFGKLPALKFFGELSIDFLQATRL
RSLKIGGNKLEGKLSRSLANCTALEVLDLGNNMVHDTFPFWLEKLPSLKVLVLQGNRFYG
TVSKIDTELGFPKLRILDIGSNHFSGDLCWEENEQPKQSESITGVLSLPITPVKIYGKHN
STKYVL
NT seq
3261 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacactcttcattcccctatttcactctttctcttctcatgcttccttcctcttctc
ttgtctttttcacctcctcaaactcatctcccaacgcaatgtcttgatgaccagagatct
cctctgctgcaattgcaacatcatctttactatgcccctaattttactttctcttccaaa
ttcgagctttgggatcccaacactgattgttgctcttgggaaggagttacttgtgatgct
tatggtcatgtcattggtcttgatcttagttacaaaaacctttcaggcagctttcactcc
atattcaatctccatcgtcttcggcgccttaatcttgctggaaactactttaataccact
ctgttttcatatgggtttgacaaactccaaaatctaacccatctcaatctttcaagctca
tgtttccatggccaaattccagtggaaatctcatacttaacgaggttagtctctcttgac
ctatcgaatcaagattcttgttatctgcgatactacaccattatcgacccatacaatttc
atgtacaactattatgaactacatcctgaacttcaacagcctcttaaattagagaaacca
aacttcaagacattaatcaagaatttgaggtttctcacagagctttgtttggatagtgtg
gacatttcaactcaaagtgctaaatggtgtgaaaccacatctcttgtactttccaacctg
cgtgtgttgagtctatcgtcctgcggtttgaaaggtccattatgttcttcactctcaaga
ctctcttttctttccaaacttatccttgatgggaacccaatatcttatttacctcccaat
ttcttggtaaattcctcttgtttggtttctcttagtttgagtgattgcaatttgaatggg
cattttccaaccggaattctcttattgccaaaaattcaaagcattgacatttcaggcaat
gaccaacttatgggtcagttgccagaatttccagcaaacaatgctttacagagtttgtcg
ctttctcatacaaatttcagtggaaaactaccccactcaattggtaatctcaagttcctg
acatatttagagctttcttattgcaatttttttggacccattccatcgtcaattgcaaat
cttagtcagctggtcaacctatatctaggggggaacaagctttctggatcaatacattat
tctttattcactcttccatcattgaagaccctgtatcttggagaaaatcaattggttggg
aaaatcgatgacttccccaatgcattttcttcttttattgaagaattatatataggcaat
aattatttaataggaccaatcccaaagtcagtccttcaacttccatggcttgaatggctt
tatattgaaggcaatagctttagttttatgaagcttgacatgtctgtccgactgaataac
ttgagggatctgatgttgttcaacacaagcttgttaattgaaagcgacaacagaagtctt
acttttccccaattagagagactaagcttaaggtcgtgcaaccttactgaatttccagaa
ttcattaaaagacaagacaagttgggttctctagatctttctaacaaccatatccatggt
tttgtgcccaactggttgtggaagagcaatctttcattggtagacctttcttttaatatg
attgattttccaaaacagcttcccttaagtgatgcaaacttctctttcctaatgttaaaa
gaattatatttggcctcatgtaacataggttcatttccagagttcatcaaaacacaagac
aagttggttgacttagatctttctaacaatcatatccatggtgttgtgcctaattggttg
tggaagagcactctttcatgggtagacctttctttcaatatgattgattttccaaaacag
cttcccttaagtgatgctaacttctctttcccattgttgaaaacattatatttggcctca
tgtaacataagtttatttccagagttcatcaaaacacaagacaagttggttgacttagat
ctttctaacaatcatatccatggcgttgtgcctaattggttgtggaagagcagcctttca
agggtaaacctttctttcaatgtgattgattttccaaaacagcttcccttaagtgattta
aacttctctttttcaatgttgagggaattgtatctggattcttgtaacataagctcattt
ccagagttcttaaagagtcaagaaaatttaaaatatctcaaactctcaaataataaaata
agtggtgcaataccaaactgggtgtggaagaaaaatttgcggtatctgtttcttgctaac
aaccatctctcatctttggaccaacttctacccaatcagagttcaacttctttacagggc
tctttctatttcgaagcatcttataacaatttgagtggcccaattccaaattggttatgc
aatatgagtcaacttagcgctttctatgcatcttataacaatttcaatggcccaattcca
aattgcttggacaatatgagtcaactttacactttcgatgcattttataacaatttgagt
ggcccaattccaaattgcttgggcaatatgagtgctatgagttggttgggtttgcaacga
aataacttcagtagaatgttaccaaaattttcaaaaacaacccaactgcagtttctcaaa
gttagtgagaatagattggtagggaagttgcccagatcattagcaaaatgcactcaactt
ctggttttggatgttggaagcaacatgataaatgatacattccctttttggtttggtaaa
ttgcctgcgctgaagttttttggtgaactatccattgatttccttcaagccactcgacta
aggtcactcaaaataggtgggaataaattggaagggaagctgtcgagatcattagccaat
tgcacagcacttgaggttctggaccttggaaataatatggttcatgatacattcccattt
tggttagagaagctaccttccttgaaggttcttgttttgcaaggaaacagattctatggc
acagtttcaaaaatcgacacggaacttgggtttccaaagctacgcatattggatattggt
tccaatcatttttcaggtgacttgtgttgggaagaaaacgaacaaccgaaacaaagcgaa
agcataaccggtgttctttctctccctataactcctgtcaaaatttatggcaagcacaat
agcacaaaatatgttctctag
DBGET
integrated database retrieval system
