Geminocystis sp. NIES-3709: GM3709_3789
Help
Entry
GM3709_3789 CDS
T04142
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
gen
Geminocystis sp. NIES-3709
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3854
JmjN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAQ67024
UniProt:
A0A0D6AX21
LinkDB
All DBs
Position
pGM3709_04:complement(7226..11404)
Genome browser
AA seq
1392 aa
AA seq
DB search
MSQIKPDFPLLQLITHKNSEQRLTKASNSRLKTNLLPSAECPLASSNKFPSPALLRNHPD
KRYLPQKQGYFWATRQTIISIAKTLNIPHKLPIDEKGNWHLEAISAMSPLEKYLWCLENG
AFDVFAFKTIKYETPTGSGTPFIYLNIPIRVLEEIATEYDLTLPDSYKTWQVGDKWEWIK
NHPQIPLFITEGIKKAASLISHGKIAIASFSITTHSEKATEKKSSWVTNLKPELLWILEG
QKANRLIYLVFDAADVKESSRQAVKRETKKIAKKLKKYGIVKIITWEDESCKGIDDFIAK
HGIKGLNKIIDNATNFNKLWQKEIANFGRQLTPNIIINQRYLSADLISKARRKGVKLLCV
KSQQNSGKSYSYAESLKQERERQKAFNRGQKEQDEGQWMKDNAQSKYLFPLNFKPEQNPN
NEYNNSEFFHENLLIKENKYSDFLSSNVETKENKNSDFVKNNRENIENKNSKFISQKLEY
NKIPNSDLSNDNEDEESEYLKQKLAQQEINDAKQSKLNLEIEDKIKQDLSTFSDEQNNSH
KSPTINQNNQSLDVDPNNQLSNINLNHQSLNHHQSLNHHQSSDINQNRQFENINQNNQPL
NHHQSSSINQNNQSLDVNQNHEFKNINNNNQFLNINENNQRLTVNHNNQLVNITENNQSS
NNNHLPSAIRPLPSSPNLLPSAVSSLPSLGEKVKIKVGSDIYDSIILGYNCETKKYQCQF
NTGFIERDLSQIIDNKSSLLPDKLITYALTHRQSLAWNLADKFQLDCYLSNVIDFENNGI
VACADSALLIPENQQFNDMVIDEAEQVSWHLLASLTDISKNRITKIVRIGKHGKMVIKAN
GMITIFDADLSDIAVKFYQFLFDISPEDTLVVDNIYKSFENIRDCYIYDNVESLRSQIIE
AIRDNKRIIIHTSGQKESSTHGTINIEKEILEIFPELETRIYRLDKESLGDSTHLSYQIL
SNLDRLKKAQIVIASSCINTGVSLDEEIVGTFDGVFGIFYGNFPLTDFEQAIERYRGDCH
RHIYIKNASSERINIGSYKYSDLLNNIMGQTNNIQKLLQDDFDCDLGMDLVKYYCKFAAR
INNDYIHLKSNFISHLEDKGYTILDGNKLNKSEVKELKEIYQSIRDESENNFQEKVLEKE
IPTETRLEELEKSKTKTKEENIEQYKGQLAKKYRTNKITRELIGLDREGYYPKLLLRFWL
SVGVDLVMKRDKRVLAKYAHKNDNQGYAIDFNRQSHSTQTVLLHHIGLDKVIDNILNIQS
QEILILLLSMQVNPTWFKCIDINKLGGLITETDVIPYLSFKDSPMIKTAFKQVLDIDLDK
NHTPIQLLRMILKRIGYNIKKGSRLGSRNDRKRYYYITSCISDELADEIFTNWLYYELLE
NDNFENEQKQVA
NT seq
4179 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccaaattaaaccagattttcctttactacaactaatcactcataagaattcagaa
caaagactaacaaaagctagtaattcaagactcaaaactaaccttctgccctctgctgaa
tgccctctggcttcttcaaataaatttccttctcccgcccttttaagaaatcatccagat
aagcgttatttaccccaaaaacagggttatttctgggcaaccagacaaactatcattagc
atagctaaaacccttaatatcccccataaactgccgatcgatgagaaaggtaattggcac
ttagaagcgatctctgccatgtcaccccttgaaaaatatctctggtgtttggaaaatgga
gcttttgacgtttttgcttttaagacaatcaagtacgaaacccccacaggtagtggtaca
ccttttatttatcttaatatcccgatccgagttttagaagagattgccaccgaatatgat
ttaactctcccagacagctataaaacgtggcaggtgggcgataaatgggagtggataaag
aatcaccctcagatacccctattcatcactgagggcatcaaaaaagccgcttctttaatt
tctcatgggaaaatcgctattgcttctttcagtatcaccactcactcggaaaaagcgacg
gaaaagaaatcctcatgggtgactaacctaaagcctgaattactctggatacttgaaggg
caaaaggcaaatagattaatttatctagtttttgatgcggcggatgttaaagaatcttct
cgtcaagcggttaaaagggaaactaaaaaaattgctaaaaaacttaaaaaatacggcatt
gttaaaattattacttgggaagatgaatcctgtaaaggtattgatgattttattgctaaa
cacggtattaaaggcttaaataaaattatcgataatgctactaattttaataagttatgg
caaaaagaaattgctaattttggtcgccaattaactcctaatattattattaatcaacgg
tatttatctgctgatttaattagtaaagctcgacgaaaaggagtaaaacttttatgcgtt
aaatctcaacaaaatagtggtaaatcttattcttatgctgaatctttaaaacaagaacgg
gaaaggcaaaaagcattcaacagagggcagaaggaacaagacgaaggacaatggatgaag
gacaacgcacaaagtaaataccttttccctttaaattttaaacctgaacaaaatcctaat
aatgaatataataatagtgagtttttccatgaaaatttattaataaaagaaaataaatac
tctgattttttaagttctaatgtagagactaaagaaaataaaaattctgattttgtaaaa
aataatagagaaaatatagaaaataaaaactcaaaatttatttctcaaaaattagaatat
aacaaaattcctaattctgatttgtctaatgataacgaagatgaagaatcagaatatctc
aaacaaaagttagctcaacaagaaattaacgatgctaaacaatctaaattaaacctagaa
atagaagataaaattaaacaagatttatctactttttccgatgagcaaaataacagtcat
aaatccccaactattaatcaaaataatcaatctttagatgttgatccgaataatcagcta
tcaaatatcaatctcaatcatcaatcattaaatcatcatcaatcattaaatcatcatcaa
tcttctgatattaaccaaaaccgtcaatttgaaaatattaatcagaataatcaaccctta
aaccatcatcaatcttctagtattaatcaaaataatcaatctttagatgttaaccaaaat
catgaatttaaaaatattaataacaataatcaattcttaaatattaatgaaaataatcaa
cgattaactgtcaaccataacaatcaattagtcaatattactgagaataatcaatcatca
aataataaccatctgccctctgccatccgccctttaccttcttcacctaaccttttgccc
tctgccgtctcctctctgccttctttgggtgagaaggtaaaaattaaagttggttcggat
atttatgattcaattatacttggttataattgtgaaactaaaaaatatcaatgtcaattt
aatactggttttattgaacgagatttaagtcaaattattgataataaatcttctctttta
cctgataaattaatcacttatgctttaactcaccgacaatctttggcatggaatttagcg
gataaatttcaacttgattgttatttatctaatgttattgattttgaaaataatggtatt
gttgcttgtgctgatagtgctttattaatccctgaaaatcaacaattcaatgatatggta
attgatgaagctgaacaagtttcatggcatttattagcttctttaactgatattagcaaa
aacagaattaccaaaattgtccgcattggtaagcatggaaaaatggttattaaagctaat
ggaatgattactatttttgatgctgatttatctgatattgcggttaaattttatcaattt
ttatttgatatttcccctgaagatactctcgtagttgataatatttataaatcttttgag
aatattcgagattgttacatttatgataatgttgaatctttaagaagtcaaattattgag
gctattagagataataaaagaattattattcatactagcggacaaaaggaaagcagtact
catggtactattaatatcgagaaagaaatcttagaaattttccctgagttagagacaaga
atctatcgtcttgataaagaatctttgggagattctactcatttaagttatcaaatttta
tctaatttagacaggttaaaaaaggctcaaattgtcattgcttctagttgtattaatact
ggagttagtcttgatgaggagattgtaggcacttttgatggtgtttttggtatcttttat
ggtaatttccctctcacagattttgaacaagcgatcgagcgctatcgtggtgattgtcac
cgtcatatttatatcaaaaatgctagtagtgaacgcattaatattggcagttataaatat
agcgatttacttaataatatcatgggtcaaactaataatattcaaaagttactccaagat
gattttgattgtgatttagggatggatttagttaaatattattgtaaatttgcagccaga
attaataatgactatattcatttaaaatctaattttatctcccatttagaggataaaggc
tatactattcttgatggtaataagctgaataaatctgaggtaaaagagttgaaagaaatt
tatcaatctattcgagatgaatcagaaaataatttccaagagaaggttttggaaaaggag
attccaacggaaacaaggttagaagaattagaaaaaagtaaaacgaaaactaaggaggaa
aatattgagcaatataaggggcaattggcgaaaaaatatcgcactaataagataactaga
gagttaattggtttggatagagagggttattatccgaaattattgttgagattttggtta
tctgtaggggtagatttggttatgaaaagggataaaagagtcttagctaaatatgctcac
aagaatgataatcaaggttatgccatcgattttaaccgtcaaagtcattctactcaaact
gttttacttcatcatattggactagataaagttatcgataatattctcaatattcaaagt
caggaaatattgatacttttgctatccatgcaggttaatcccacttggtttaaatgtatt
gatataaataaattagggggtttaataacggaaacggatgttattccttatttatcgttt
aaggattctcccatgattaaaacggcgtttaagcaggttttagatattgatttagataaa
aaccatactcctattcagctattgaggatgatcttaaaaaggattggttataacattaaa
aaaggtagtcgtttgggtagtaggaacgatcgaaagcgatattattatataactagctgt
attagtgatgagttagctgatgagatttttactaattggctatactatgagttgctggaa
aatgataactttgaaaatgagcaaaaacaagtcgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
