KEGG   Gossypium hirsutum (upland cotton): 107910345
Entry
107910345         CDS       T04793                                 
Name
(RefSeq) BEACH domain-containing protein B-like isoform X1
Organism
ghi  Gossypium hirsutum (upland cotton)
SSDB
Motif
Pfam: Neurobeachin NBCH_WD40 DUF4704 Beach WD40 PH_BEACH DUF4800 DUF1088
Other DBs
NCBI-GeneID: 107910345
NCBI-ProteinID: XP_040944429
LinkDB
Position
D02:16165704..16191290
AA seq 3249 aa
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DBGET integrated database retrieval system