Gossypium hirsutum (upland cotton): 107923868
Help
Entry
107923868 CDS
T04793
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33B isoform X1
KO
K27472
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33
Organism
ghi
Gossypium hirsutum (upland cotton)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ghi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ghi03021
]
107923868
Transcription machinery [BR:
ghi03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
Other mediators
107923868
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Xpo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107923868
NCBI-ProteinID:
XP_016709516
UniProt:
A0A1U8L4F0
LinkDB
All DBs
Position
A11:13526329..13535833
Genome browser
AA seq
1328 aa
AA seq
DB search
MAVSVQAASPVWESVLEQTKSAQDKNRDPLLWAVQLSSSLNSAGISLPSIDLAHLLVSHI
CWDNHVPITWKFLEKALTVKFVPSMLVLALLSTRVFPNRKFHPAAYRLYMELLRRHAFSL
KCQINGPNYQKIMKSVGDVLHLSQIFGVKVSEPGLLLVEFVFSIVWQLLDASLDDEGLLE
LTPEKRSIWPTVTQDMEIDSVDNFNEKRSEHHDVLCKGNTTMAIEIIGEFLQNKVTSRIL
FLARRNMPSHWGTFIQQLRVLAAKSVALRNAKHITPEALLNLTSDMHKVVSRKCKTISQQ
EFNAVIGSGSLTTSSGQCHGTSPSAHWLPIDLFLEDAMDGSQVAATGAVESLTGLVKALQ
AVNGTTWHDTFLGLWIAALRLVQRERDISEGPVPRLDTCLCMLLSITPLVVANIVEEEES
ELIDGSDCSPTNQIKEKQATGRCRQDLISSLQMLGDYEALLTPPQPVRSVANQAAAKAIM
FVSGLTVGNGYYECMSINDMPMNCSGNMRHLIVEACISRNLLDTSAYVWPGYVNARANIP
RNVPVQVTGWSSLMKGSPLTPTLINALIATPASSLAEIEKIYEIATKGSDDEKISAASIL
CGASLVRGWNIQEHTILFITSLLSPPVPADYSGNESHLISYGPFFNILLVGISPVDCVQI
FSLHGLVPLLAGTLMPLCEVFGSTSPNVSWTLPTGEELTSHAVFSNAFTLLLRLWRFNHP
PFENAMGDATPVGSQLTPEYLLLVRNSKLSDFGKSPKDHMKLKRMSKNLNISLELLFMDS
FPKLKSWYRQHQECIASTLSGLVQGTTVHQIVDALLNMMFRKISRGGQSLTSTTSGSSNS
PASGAEDVSMRLKVPAWDILEGAPYVLDAALTACAHGRLLPRDLATGLKDLADLLPATLA
TIVSYLSAEVTRGIWKPVFMNGTDWPSPSANLFMVEQQIKKIIAATGVDVPSLAIGGSSP
AMLPLPLAALVSLTITYKLDKASERFIVLIGPALSSLAESCPWPCMPIIASLWAQKVKRW
SDFLVFSASRTVFHHNIDAVVQLLRSCFTLIPGLSPSTIYSNGGVGALLGHGFGSHFSGG
MSAVAPGILYLRVHRSVRNIMFMTEEIVSLLMSSVRDIANSGLFRENLEKLKKAKFGLRY
RQVSLGAATTQVRLAASLGASLVWLSGGLSLVQLLIQETLPSWFLSAHNPDQDGGEPGGL
VAMLSGYALAYFVVLCGTLVWGVDSSSPTSKRRPKVLGAHLEFLASAIDGKISLGCEHAT
WHAYVTGFVSLMVGCTKKWVLDVNVDVLRRLSNGLRQWNEEELAIALLGLGGTEATASAA
ELIIEIGP
NT seq
3987 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggtttccgtacaggcggcgagtccggtatgggagtcggtgctggagcagaccaag
tcggcccaggacaagaacagagatccacttctctgggctgttcagctcagttctagtctt
aactcggctgggatttctttgccttcaatcgacctggctcacctccttgtctcccacatc
tgctgggataatcacgtgcccatcacgtggaagttcctagagaaggccttgactgtcaaa
ttcgtgccttcaatgctcgtcctcgccctcctatctaccagggtctttccaaatcgtaag
tttcatcctgcagcatatcggctctacatggaactcctcaggagacatgccttctcactt
aaatgtcaaatcaatggaccaaattatcagaagattatgaaatcagtaggtgatgttctt
catctttcccagatatttggtgttaaagtgtctgaacctggtctgcttttagttgaattt
gttttttcaattgtatggcaactgcttgatgcatcactagatgatgaagggttactagaa
cttacaccagaaaagagatcaatatggcccacagtaactcaagacatggaaatagatagt
gttgataactttaatgagaagagaagtgagcaccatgatgtgctgtgtaaaggaaacact
acaatggctattgagatcattggggagtttttgcaaaataaagtaacttcaaggattctt
ttcttggcacggaggaacatgccttcgcattggggaactttcattcagcaattaagagtt
cttgcagcaaagtcagtggcattgaggaatgcaaaacatataactccagaggccctactt
aatttgacgtctgatatgcataaagttgtgtctaggaagtgtaaaacaatatcacaacag
gagtttaatgctgtcattggttctgggtctttaacaacttcatctggtcagtgtcacggg
actagtccatctgcacattggcttcctattgatctgtttcttgaggatgctatggatgga
tcacaggtggctgcaactggtgctgttgaaagtcttaccggtttggtcaaggctttacag
gctgtaaatggtacaacatggcatgatacatttcttggtctatggattgcagctttgagg
cttgttcaaagggaaagggacattagtgagggtcctgtacctcgccttgacacatgcttg
tgcatgttgttgtcaattacaccacttgtggtggccaatattgttgaggaagaggaaagt
gaattgattgatggaagtgattgcagcccaaccaatcaaataaaagagaaacaagccaca
ggaagatgtcgtcaggatttaatttccagcttacagatgttgggtgattatgaggcttta
ttgaccccacctcaaccagttcgttcagtagccaatcaggctgctgccaaagctatcatg
tttgtttctggtctcactgttggtaatggatactatgagtgcatgagcattaatgacatg
cccatgaattgctctgggaacatgcggcatctgattgttgaggcttgtatttctagaaat
ctattggacacatccgcatatgtttggcctggttatgtaaatgcacgtgcaaatataccc
cgtaatgttcctgttcaagtgactggttggtcatcactgatgaaaggatcccctctaact
cccacgttgataaatgctctgattgcaactccagcttctagcttagcagagatcgagaaa
atatatgagattgcaaccaaaggttcagatgatgagaagatttctgctgctagcattctt
tgcggggcttctctagttcgtggttggaatatacaggaacacaccattctcttcattaca
agcttgttgtcgccaccagttcctgctgattattctgggaatgagagtcatttaatcagt
tatggtccattttttaatattcttctcgttggaatatcacctgtagattgtgtccagata
ttctctttacatggcttggttccactgcttgctggtacattgatgcccctttgtgaggtt
tttgggtcaacttctcccaatgtgtcatggacacttccaacaggggaggagctgactagt
catgcggtcttcagcaatgcatttactcttctactgagattatggaggtttaatcatcca
ccttttgaaaatgcgatgggagatgcaacaccagtgggatcccaactaactcctgaatat
ctgttgttggttcgaaactctaaattatcagattttgggaaatcaccaaaggatcatatg
aagcttaaaagaatgtcaaaaaatttaaatatctccttggaactcttatttatggattcc
tttcccaagctaaaaagctggtaccggcagcatcaagagtgtattgcttccaccctgtca
ggacttgtacaagggaccaccgtccatcagattgttgatgcactcctcaatatgatgttc
aggaagataagcaggggtggtcagtctttaacttctacaacttctggaagtagtaattct
cctgcatctggagctgaagatgtatctatgagactaaaagtgcctgcatgggatatcctg
gaaggagctccctatgtgcttgatgcagctctgacagcatgtgcgcatggaagacttttg
ccccgtgacctggcaacaggactcaaagatcttgctgatctccttccggctaccctggca
accattgtcagctacttatctgctgaagtaacacgaggtatatggaagccagtttttatg
aatggaacagattggccgagtccctcagcaaatttattcatggttgagcaacaaatcaaa
aaaattatagctgctactggtgttgatgtcccaagccttgccataggggggagctctcca
gccatgcttcctctgcccttggctgcccttgttagcctcactataacctataaacttgat
aaagcttctgaacgtttcattgtgttaattggcccagcattgagttcgctagctgaaagt
tgtccctggccatgcatgcccatcatagcctctttatgggctcagaaggttaagcgttgg
agtgatttccttgtgttctctgcttctcgtaccgtcttccaccacaacattgatgctgta
gtccaacttctcaggagttgcttcacattgatccctggattaagcccctctaccatttac
agcaatggtggagttggtgcactcctcggccatggatttggctcccatttctctggggga
atgtctgcagttgccccagggattctgtacttacgagtgcatcgatcagtcagaaatatc
atgtttatgacagaagaaatcgtctctcttttaatgtcttctgtaagagatattgccaat
agtgggttattcagggagaatttggagaaactgaaaaaggcgaagtttggattgagatat
agacaagtttctcttggtgcagcaacaacacaagtccgacttgctgcatcacttggggca
tcattggtttggctatccggtggattaagcttggtccagttgttaatccaagaaacatta
ccgtcttggtttctatcagcccataatccagatcaagatggtggggaacctggaggtcta
gttgccatgctgagcggctatgcacttgcatactttgtagtgctttgtggtaccttggtg
tggggtgtggattcctcctcaccgacatcaaaacggcgaccaaaggtccttggggcgcat
ttggaatttcttgcgagcgcaatagatggcaaaatatcacttggatgtgagcatgccact
tggcatgcgtatgtaacagggtttgtgagcttgatggtaggttgtactaagaagtgggtt
ttggacgtcaatgttgatgttttgagaaggttaagcaatggattgaggcagtggaatgag
gaagaactggctatcgcattgttgggacttggtggtaccgaagccaccgcctccgcagct
gaactgattattgaaattggaccgtag
DBGET
integrated database retrieval system
