Glycine soja (wild soybean): 114386824
Help
Entry
114386824 CDS
T06057
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g04780, mitochondrial-like
Organism
gsj
Glycine soja (wild soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
MRP-S27
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114386824
NCBI-ProteinID:
XP_028202680
LinkDB
All DBs
Position
15:complement(51219458..51227198)
Genome browser
AA seq
930 aa
AA seq
DB search
MLSMNKTSPRFWYINFLPHSILQRLYFPFKRATLQTASLATVKDSQTTFTKPPISYSKLL
SQCVASKSLTSGMELHAHLIKFGFSRDPSLRNHLVTLYSKCRRFGYARKLVDESSELDVV
SWSSLLSGYVQNGFVEEALLVFNEMCLLGVKCNEFTFPSVLKACSMKRDLNMGRKVHGMA
VVTGFESDGFVANTLVVMYAKCGLLDDSRRLFGGIVERNVVSWNALFSCYVQSELCGEAV
GLFKEMVRSGIMPNEFSISIILNACAGLQEGDLGRKIHGLMLKMGLDLDQFSANALVDMY
SKAGEIEGAVAVFQDIAHPDVVSWNAIIAGCVLHDCNDLALMLLDEMKGSGTRPNMFTLS
SALKACAAMGFKELGRQLHSSLIKMDAHSDLFAAVGLVDMYSKCEMMDDARRAYDSMPKK
DIIAWNALISGYSQCGDHLDAVSLFSKMFSEDIDFNQTTLSTVLKSVASLQAIKVCKQIH
TISIKSGIYSDFYVINSLLDTYGKCNHIDEASKIFEERTWEDLVAYTSMITAYSQYGDGE
EALKLYLQMQDADIKPDPFICSSLLNACANLSAYEQGKQLHVHAIKFGFMCDIFASNSLV
NMYAKCGSIEDADRAFSEIPNRGIVSWSAMIGGYAQHGHGKEALRLFNQMLRDGVPPNHI
TLVSVLCACNHAGLVNEGKQYFEKMEVMFGIKPTQEHYACMIDLLGRSGKLNEAVELVNS
IPFEADGFVWGALLGAARIHKNIELGQKAAKMLFDLEPEKSGTHVLLANIYASAGMWENV
AKVRKFMKDSKVKKEPGMSWIEIKDKVYTFIVGDRSHSRSDEIYAKLDQLGDLLSKAGYS
SIVEIDIHNVDKSEKEKLLYHHSEKLAVAFGLIATPPGGPIRVKKNLRICVDCHTFFKFV
CKIVSREIIVRDINRFHHFKDGSCSCGDYW
NT seq
2793 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtcaatgaacaaaacatctccaaggttttggtacatcaatttcctcccacatagt
attctccaacgtctctacttcccattcaaacgcgccactctacaaactgcttctctagcc
acagtaaaagattcacaaaccacgttcacaaaaccccccatatcctattccaagctctta
tcacaatgtgttgcttcaaagtccctaacttcaggtatggaactccatgcacacttgatc
aagtttgggttttcccgcgacccaagtctcaggaaccacttggtaactctgtattccaag
tgtcgtcgttttgggtatgcccgcaagctggttgatgaaagttctgaactagatgtggtt
tcttggtcttctttgctatctgggtatgtgcaaaatgggtttgtagaggaggcactgttg
gtttttaatgagatgtgcttgctgggtgttaagtgcaatgagtttaccttccccagtgtg
cttaaggcatgttcaatgaagagggatttgaacatggggaggaaggttcatgggatggct
gttgtcacagggttcgagtctgatgggtttgttgctaacacattggttgttatgtatgcc
aagtgcggcctgctggatgattctaggaggttgtttggtggaattgtggagcgaaatgtt
gtttcatggaatgccttgttctcttgttacgtgcaaagtgagttgtgtggtgaggctgtg
ggtttgtttaaggaaatggtgaggagtggaataatgcctaatgaattcagcatttccatc
atattgaatgcctgtgcaggcttgcaggaaggcgacctgggaaggaagattcatgggctt
atgctaaagatgggacttgatttggatcagttttctgcgaatgcgttggttgacatgtat
tctaaagcaggggagattgaaggtgcggttgctgtttttcaggacattgcacaccctgat
gttgtttcttggaatgcaattattgctggttgtgttcttcacgattgtaatgatttggct
ttgatgttgttggatgagatgaaaggctctggaactcgtccgaatatgtttacgctgtca
agtgctttaaaggcctgtgctgctatggggttcaaggagttgggtagacagttgcattct
agtttgataaagatggatgctcactcagatttgtttgctgctgttggacttgtagatatg
tattctaagtgtgaaatgatggatgatgcgagaagagcttacgattcgatgccaaagaag
gacattattgcatggaatgctttgatctccggttactcacagtgtggtgatcacttagat
gcagtctcacttttttctaaaatgttcagtgaagatatagatttcaaccaaactactttg
tcaacggttctcaaatctgtggccagcttgcaggcaattaaggtgtgtaagcagattcat
acaatttccatcaaatctggaatttattcagatttctatgtaataaacagtcttcttgac
acatatggaaaatgtaaccatatagatgaagcttcgaaaatatttgaagagcgcacttgg
gaagatttggtggcttacacatccatgataacagcatattctcaatatggggatggggag
gaggctttaaagctatatttacaaatgcaagatgcagatatcaagcccgatccatttatc
tgcagttcccttttaaatgcttgtgcaaatttgtcagcctatgagcaagggaaacaatta
catgtccatgccatcaagtttggatttatgtgtgatatttttgccagcaattctctggtt
aatatgtatgcgaaatgtggaagcatagaggatgctgatcgtgccttttctgagatacct
aacagaggaatagtctcctggtctgcaatgattggaggatatgctcagcatggccatggt
aaagaggctcttcggttgttcaatcaaatgcttagagatggtgtgccacccaaccatatt
actttagttagtgttctttgtgcatgcaatcatgctggtttggtaaatgagggaaaacaa
tattttgagaaaatggaggtaatgtttgggattaaacccacacaggagcattatgcttgc
atgattgatctccttggacgatcagggaaattaaatgaagcagtggagctagtaaactca
attccatttgaggctgatggctttgtttggggggcacttcttggagctgcgagaatccat
aaaaatatagagctcggtcagaaagctgccaagatgctttttgatcttgagccagagaaa
tctggtacccatgttctccttgcaaacatctatgcctccgcagggatgtgggaaaatgtt
gctaaggttagaaagttcatgaaagacagcaaggtgaagaaggagcctggaatgagttgg
attgagatcaaagacaaggtatacactttcattgttggagacagaagtcattctagaagt
gatgaaatatatgctaaactggatcagttgggtgaccttctaagtaaagctggatatagt
tccattgtagagatcgatatacataatgtggacaaaagtgaaaaggagaagctcttatat
caccatagtgagaaacttgctgtagcctttggattaattgctacgccacccgggggccct
ataagggtgaagaagaatctacgaatttgtgttgactgccacacctttttcaaattcgta
tgtaaaattgtttcaagggaaattattgtcagagatattaatagattccatcattttaaa
gatggatcatgttcctgtggtgattattggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
