Haliovirga abyssi: HLVA_07930
Help
Entry
HLVA_07930 CDS
T09313
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K02063
thiamine transport system permease protein
Organism
haby
Haliovirga abyssi
Pathway
haby02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
haby00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
HLVA_07930
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
haby02000
]
HLVA_07930
Transporters [BR:
haby02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Thiamine transporter
HLVA_07930
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU50224
LinkDB
All DBs
Position
918602..920140
Genome browser
AA seq
512 aa
AA seq
DB search
MKKKSFSINMIVLIIWTIPFIFFLKDFFKVSELIKLFNYKLLKILYYTVLQSAISTVGAF
VISLAPAYFFSKKENLLSKLLGSTIVIPFFFPVVSAIVSFSIIFSFPLLKKIGLMYSFWA
IIIVHIFYNSPIYVKYLGEGLKKIPRNIIEEAEIIGAKKRDIFFKIELPILASAILKATF
LVFTYCFMSFAVVLALGGIKYSTFEVAIVTSLMGEFNFSKAFIYAFIQFLFLFLFNSLLN
RVGNENYELGMENKKEKKINVIILIISIFYLMFEFGVIIISVIYSFYDFFNSRFDFSAVN
RVFFGDISKKFRVYSSFWNSISISFFVAFIVVIFVYLILKNKNKFISKFVVAAISISPAF
LAMALLYMNILFDINFFILLFWGYLLITVPIGYSFLYQHITGFDKEIIEAAKLDGATNFK
MFYYIEAPILFPVFIGTFLQLFAIIYGEFTLAYAMQVQEYVPLVSILNYSLSSRRLFKES
AVISAVNIVIILSIFVISEMMISGEKKSRKEK
NT seq
1539 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaatctttttcaataaatatgattgtattaataatttggacaatacctttt
atattttttttaaaggatttttttaaagtatcagaattaattaaattatttaattataaa
ttgttaaaaattttatattatacagtattacagtctgcaatttcaacagtaggagcattt
gttatatcacttgctcctgcttattttttttctaaaaaagaaaatttattatcaaaatta
ttaggcagtacaatagtaataccatttttttttccagtggtatctgcaatagtctcattt
tctataatattttcatttccgttattgaaaaaaattggacttatgtatagcttttgggct
ataataattgttcatatattttataattctccaatttatgtgaaatatcttggggaggga
ttaaaaaaaataccaagaaacataatagaagaagctgaaattataggtgcgaaaaaaaga
gatatattttttaaaatagaattgccaatattagcttcagcaatattaaaagctactttt
ttagtttttacatattgttttatgagttttgcagttgttttagcattaggtggaatcaaa
tatagtacttttgaagttgcaatagtaacttctcttatgggagaattcaatttttcaaag
gcatttatatatgcttttattcagtttttatttctttttttgtttaacagtttattaaat
agagttggaaatgagaattatgaattaggaatggaaaataaaaaagagaaaaaaataaat
gtcattatattaattatatctatattttatttaatgtttgaatttggagtaataataatc
tctgttatatattcgttttatgatttttttaatagcagatttgatttttctgctgttaat
agagttttttttggagatatatcaaaaaaatttagagtatacagttcgttttggaattct
atttctatatctttttttgtggcatttatagtggttatatttgtatatttgatattaaaa
aacaaaaataaatttatttctaaatttgttgttgcagcaataagcatatcaccagctttt
ttagctatggctttgttatacatgaatatattatttgatattaatttctttattctatta
ttttggggatatttattaattacagttccaataggatactcttttttgtatcaacatata
acaggatttgacaaagagattatagaggcagcaaaattagacggtgcaacaaattttaag
atgttttattatattgaggcgcctatattatttccagtatttataggaacttttttgcag
ctatttgctattatatacggtgaatttacattagcatatgcaatgcaggttcaagaatat
gtgccacttgtatcaatattaaattatagtttatcttcacgtagattatttaaagaaagt
gcggtaattagtgcggtaaatattgttataatcttgtctatttttgttattagcgaaatg
atgattagtggggaaaagaaaagtagaaaagagaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
