Haliovirga abyssi: HLVA_08820
Help
Entry
HLVA_08820 CDS
T09313
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
haby
Haliovirga abyssi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AsmA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU50313
LinkDB
All DBs
Position
1015055..1019368
Genome browser
AA seq
1437 aa
AA seq
DB search
MRDLIKKHKYAMLMPAFIIVIYIFTNLYITFKYQIQNTVKTLTKTYANLNINFVDMKIKN
INEVELKDFIFKSKKGKVLLKAPRVKINFNIFPFKLSTIKVIDGKINFEMYKNSKINFLT
EFENKESDSKENKEIPLNKIIFENSNINFQDFSKKNIISRDLKNSNGIISFYNGKIKIIA
EGSTKYKEKLNLNLTFDKKLKLLINIKNLLINENDMQYIGELSGINRYKGRGNITLTIED
KNINVKGDFHNASLHYNEIEDKIYNINGKFDYKNKRLNLYTFGYVSGKKYDLNLLYLNSK
LNIKISTKNITYNDVEKFKPIKNLNLKIKGKIEKANVDFNYINDKPYATIIAKSKKIFVF
ENELKNVNLKMVYDEKRLNIKNVEFSYSKDNLFSGELVGNAILTGKKIDGNIEIKKIKNI
YIESLTNLKGTFIGQLDKNIIEINLKNKEFGNIFIRNDFLKNSIEIKSKIIKKQKLKIEN
QELLTKGNLDINYNFKNLEFEKGSFNLEGEYKNISCFVNGTILSNIMRIKKLYIKNEIAF
GTLDGLFNLKTFFYKLNIKKSRINVKGSNIDLYTDGILTGKKEKFYYSGTISSEKGNYIG
NYSGLKGKINLSYNGIFKGNFLGELKKIEYNNFNFQDLSINISLNDKILSFKNISNRFVT
VLGDYNIDSKNMDLKYELTNYKLNDLKWLDAEGLNLYIKKINGKISGDFTNPKIYFDLKE
LNLKYKKNDILFSGNGEISDNILKLNKAKIDDNLITGKIDLINKNIDIHTNIFEENLNKY
YDFKIPDYLKYRILGDINIWGNIKNLKSVGELNIDSINYKDIKLPSLYCKFSYNKGNVFN
FLNSGIFDISNIEIRNYKNRKTALKGKGIANFKDKEFSLKIPDQNININNFGIDNINGQL
NVKYNFIYKNKNIEYELIANSDMLNIFDAKIINLENHIEGNNSELTLKILRLYYNSNKFE
AYGNLDMKNLKYNFRINAQKLRLKTFAFLLKDKLKLIDGEVDANIYLNDDSTYGTIKLNR
GSLITKDEKIVLKNISGIGVINKNKFSISKFYSDINGGDLSGSGNLELDVPDISNIMKYK
PKINNWDFNIKAENVKYYLNKNINVLFDTNLKIKNKNILGSLKIKSGEFSGIESGLKKDN
KNYSDIFKGLEVGLDVSISKEFKIHLANISILEDLEASISGNGNLTIENKKINFLGTIST
EEGVITVNNNDFKIENGFIVFDDPYLFFPELNPSISLLASTNIAGETIDAQLLGDLKSIK
LNLSSSSNLNYSDIISLLTFHKKIGELSPGGVVRDVLARQLNSEIVFNPLSKRIAKILGI
SKFKLYSNILEINDKEGELNLTNDIRLGATLDLGNSLYKNILFWNVKGKLSDEISGKIDY
YDVWLNYKINDQNNVSAGIKEEYSDDIGKSELHIGWNFKYKIYKWLDMINIFNIPKK
NT seq
4314 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagatttaattaaaaagcataagtatgcaatgcttatgccggcatttataatagta
atatatatatttactaatttatatattacatttaaatatcaaatacaaaatacagttaaa
acattaacaaaaacatatgctaatttaaatattaattttgtagatatgaaaattaagaat
attaatgaagttgagttaaaagattttatattcaaatcaaaaaaaggtaaagtgttatta
aaagctccacgtgtaaaaattaattttaatatttttccatttaaattatctacaataaaa
gtgattgatgggaaaattaattttgaaatgtataaaaattctaaaataaattttttaact
gaatttgaaaataaagaatcagattcaaaagaaaataaagaaataccattaaataaaatt
atatttgaaaattcaaacattaattttcaagattttagtaagaaaaatattattagtaga
gatttaaaaaattcaaatgggataatatctttttataatgggaaaataaaaataatagct
gaagggtctacaaaatataaagaaaaattaaatttaaacttaacatttgataaaaaacta
aaattattaataaatataaaaaatttacttattaatgaaaatgatatgcaatatattgga
gaattatcaggaattaataggtataaaggaagagggaacataacattaaccatagaagat
aagaatataaatgtaaaaggtgattttcataatgcatcattacattataatgaaattgag
gataaaatatataatataaatggaaaatttgattataaaaataagagattaaatttatat
acttttggatatgtaagtggtaagaaatatgatttaaatttattatatttaaatagtaaa
ttaaatattaaaataagtaccaaaaatataacatataatgatgtagaaaaatttaaacca
ataaaaaatttaaatttaaaaattaaaggaaaaatagaaaaagctaatgtagattttaat
tatattaatgataaaccttatgcaacaattatagcgaaatctaaaaagatttttgtattt
gaaaatgaattaaaaaatgtaaatcttaaaatggtttatgatgaaaaaagattaaatata
aaaaatgtagagtttagttattctaaagataatcttttttctggtgaattagtaggaaat
gcaattttaacaggaaaaaaaatagatgggaatatagaaataaaaaaaattaaaaatatt
tatattgaaagtttaacaaatttaaaaggaacttttatagggcaattagataaaaatatt
atagaaataaatttgaaaaataaagaattcgggaatatatttattagaaatgatttttta
aaaaatagtatagaaattaaaagcaaaataattaaaaaacaaaaattaaaaatagaaaat
caggagttattaacaaaagggaatttagatataaattataattttaaaaatttagaattt
gaaaaaggaagttttaatttagaaggagaatataaaaatattagttgttttgttaatggt
actatattatcaaatataatgaggataaaaaagttatatataaagaatgaaattgcattt
ggaactttagatgggctatttaatttaaaaacatttttttataaactgaatataaagaaa
tcaaggattaatgttaaggggtctaatatagatttatatacagatgggatattaacaggg
aaaaaagaaaaattttattatagtggaactatttcaagtgaaaaaggaaattatatagga
aattattctggtctaaaagggaaaattaatttatcatataatggtatatttaaaggaaac
ttcttaggagagttgaaaaaaatagaatataataattttaattttcaagatttaagtata
aatataagtttaaatgataaaatattaagttttaaaaatatttcaaatagatttgtaact
gttttgggtgactataacatagattctaaaaatatggatttgaaatatgaattaacaaat
tataaattaaatgatttgaagtggttagatgcagaaggattaaatttatatataaaaaaa
ataaatggaaagattagtggagattttacaaatcctaaaatatattttgatttaaaagaa
ttaaatttaaaatataaaaaaaatgatattttattttctggaaatggagaaatatcagat
aatatattaaaattaaataaagctaagatagatgataatttaattacaggaaaaatagat
ttaataaataaaaatatagatatacatacaaatatatttgaggaaaatttaaataaatac
tatgatttcaaaataccagattatttaaaatataggatattaggagatattaatatttgg
ggaaatattaaaaatttaaaatcagtaggagaattaaatattgattctattaattataaa
gatataaaacttccttctttatactgcaaattttcatataataaaggtaatgtttttaat
tttttaaatagtggtatatttgacatatcaaatatagaaattagaaactataaaaacaga
aaaacagcattaaaaggtaaaggaattgcaaattttaaagataaagagtttagtttgaaa
attcctgaccaaaatataaatataaataattttgggatagataatattaacggacaacta
aatgttaaatataactttatctataaaaataaaaacatagaatatgaattgatagctaat
tcagatatgttaaatatttttgatgcaaaaataattaatttagaaaatcatatagaagga
aataatagtgaattaactttaaaaattttaaggttatattataatagcaataaatttgaa
gcatatggaaatttagatatgaaaaatttaaagtataattttagaattaacgcccaaaag
ttaagattaaaaacatttgcatttttattaaaagataaattaaagttaatagatggagaa
gttgatgcgaacatatatttgaatgacgatagtacatacggaactattaaattgaataga
ggaagtttaataacaaaggatgaaaaaattgttttaaaaaatataagtggaattggcgtt
ataaataaaaataaattttctatttcaaaattttatagtgatattaatggtggggattta
agtggaagtggaaatttagaattagatgtaccggatatttcaaatataatgaaatataaa
ccaaaaataaataattgggattttaatataaaagctgaaaatgtaaaatattatttaaat
aaaaatataaatgtactgtttgacacaaatctaaaaattaaaaataaaaatatattaggt
agcctaaagataaaatccggcgaattttctggaatagaatcaggattaaaaaaagataat
aaaaattatagtgatatttttaaaggtttagaagttggattggatgtttctatatcaaaa
gaatttaaaattcatttagcaaatatatcaatattggaggatttggaagcatctatttca
ggaaatgggaatttaactattgaaaataaaaaaattaattttttaggaactatatcaact
gaagaaggagttataactgtaaacaataatgattttaaaatagaaaatgggtttattgtt
tttgatgatccatatctgttttttccagagttgaatccttctatctctttattagctagt
actaatatagcaggggaaacaatagatgctcaactacttggagatctaaaaagcataaaa
ttaaatttgagttcaagttctaatttgaattattcagatataatatctttattaactttt
cataaaaaaataggagaactttctcctggaggggttgtaagggatgttttagcaaggcaa
cttaattcagaaatagtatttaatccattatcaaaaaggattgctaaaatattaggaata
agcaaattcaaattatactcaaatatattagaaataaatgataaggagggagaactaaat
ttaacaaatgatattagattaggtgcaactttagatttgggaaattctttatataaaaat
attttattttggaatgtaaaaggaaaattatcagatgaaatatcagggaaaattgattat
tatgatgtttggcttaattataagataaatgatcaaaataatgtatcagctggtataaaa
gaagaatatagtgatgacattggaaaaagtgagctacatattggatggaactttaaatat
aaaatttataaatggttagatatgataaatatatttaatattcctaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
