Helianthus annuus (common sunflower): 110879670
Help
Entry
110879670 CDS
T05101
Name
(RefSeq) uncharacterized ATP-dependent helicase YprA
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
MZB
Helicase_C
ResIII
ubiquitin
Rad60-SLD
CDT1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110879670
NCBI-ProteinID:
XP_021983877
LinkDB
All DBs
Position
9:173347281..173354935
Genome browser
AA seq
1223 aa
AA seq
DB search
MDERETEIEVRTLTGETITVSISSNRTIQDLKLLLKQIFPPAASPPNFHLLHKGTKLSLQ
SQISSNMISDGEFIVLIPFAKKDKQKSVDVSASETSFQNAHQCSTSSFAESAWSDMMQDL
SSLRQREIDGSESCPPVDVEGACSDTRNEADRRNFDSLLDEAVLVLNMLCDDDELDDNGC
EKFMLVLESVNCLYDLKSKSCMLRNANVRCGEMDYAAGSSYLCFCPSWLKVLLKAFYFLN
IYCAFLQVQQKKVTMLSLEGGLNRLSKFGPGFDYADLENLSLLCPKVIQFVDDETECKKS
NNMIVVVKSKLDTEYPVKGKKKLSTTRVVNAMKKREGSFKADLYAIVKSFMEKQGNEKIK
SCSVNDLLLHVNEKNDKETKTDAKQTKRNLSESSSAFSSEALCNATNPLLPTEMVEHLRA
GIGSQGQMVHVEEINGRIANFVEIPSYLSERMKCALKSSGVSKLYSHQVESIEASLAGKN
VVISTMTSSGKSLCYNLPVLEVLSQNLSACALYLFPTKALAQDQLRALLSMTVGFDVGLN
IGIYDGDTAQEDRLWLRDNSRLLITNPDMLHMSILPLHKQFERFLSNVRYVVIDEAHTYK
GAFGCHVALILRRFRRLCAHVYGSDPSFIFCTATSANPSDHAMDLASLPTMELIHKDGSP
SGPKLFVLWNPPLHMKTVTKRTRSKTNTIQYDRTVFAGRSSPILEISCLFAEIVQHGLRC
IAFCKTRKLSELVLSYTREILQKTAPNLVNSIFAYRAGYTAQDRRRIESEFFGGKICGVA
ATNALELGIDVGHIDVTLHLGFPGSIASLWQQAGRSGRREQPSLAIYVAFEGPLDQYFMK
YPHKLFRGPIECCHVDANNQQVLEQHLVCASLEHPLSVVHDEKYFGPSLKSSILSLKSKG
YVTTDPSRGPTAEIWNYIGHEKLPSHTVSIRAIESERYKIIDMKNDKLLEEVEESKAFFQ
VYDGAVYMQQGKTYLVKNLDLSTKIALCQEADLKYYTKTRDYTDIEVVNGHIAYPVKICN
IQKSKTNAQSNPCKVTTTWFGFRRIWKGSNRVFDTVNLSLPSYTYESQAVWIRVPQSIKT
AVETENYSFRGGLHAAGHALLHIVPLYIICNSSDLASECVNPHDTRYIPERILLYDSHPG
GTGISAQVQPIFTELLTGALELITSCCCSGDTGCPNCVQNLSCHEYNEVLHKDAATMIIK
GVLELEKSNFGDPCSSSNEGHSI
NT seq
3672 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgaaagagagaccgaaatcgaagtccgaaccctaaccggtgaaacaattacagtc
tcaatttcttcaaacagaacaattcaagacctcaaacttctcctcaaacagatatttcca
cccgcagcatcgcctccgaacttccacctgttacataagggtacgaaactaagtttgcag
agtcagataagtagtaatatgatttccgatggagagtttatcgttcttattccgtttgcg
aaaaaggacaagcagaaatcggtggatgttagtgcgagtgaaacgagttttcaaaatgca
catcagtgttccacttccagttttgctgagtcagcatggtcggatatgatgcaagatctg
tcttcgcttcgacaacgagagattgatggaagcgaaagttgtccgcctgttgacgttgaa
ggcgcgtgttcggacacgcggaacgaagcagataggaggaattttgatagtttgcttgat
gaggcagtattggttttgaacatgttatgtgatgatgatgagcttgatgataatggttgt
gagaagtttatgctggttttggagtccgttaactgtttgtatgatttgaaatccaagagt
tgtatgttaaggaatgcgaatgtacgatgcggtgaaatggattatgctgctggcagtagt
tatttgtgtttttgtccgtcttggctgaaggttttgttaaaggcgttttattttttgaac
atctactgtgcttttcttcaagttcagcagaaaaaagttaccatgcttagtttggaggga
ggcttgaaccggttaagtaagttcggaccgggatttgattatgctgatcttgaaaatctt
tctttgctttgccctaaggttatacaatttgttgacgatgagactgagtgtaaaaagtca
aataacatgattgttgtcgttaagtcaaaattagatactgagtacccagttaaaggcaag
aaaaaattgtctaccacaagagtagttaacgctatgaaaaaaagagaaggttccttcaaa
gcagatttatatgcaattgtcaaatcatttatggaaaaacaggggaatgagaaaatcaaa
tcatgttcagtgaacgatcttttgctgcatgtaaatgagaaaaatgataaagaaactaaa
actgatgctaagcaaacaaagagaaatttgtctgaatcctcaagtgctttttcatccgaa
gcattgtgtaatgcgacaaatcctttgctacctacagaaatggttgagcatctgagagca
ggcattggttctcaaggacagatggttcatgttgaagagattaacggccgaatagccaac
tttgtggagattccatcttatttatctgaacgaatgaaatgtgcgcttaaatcatcaggg
gtctcaaagttgtatagccaccaggtggagtcaattgaggcttctttggctggaaagaat
gtcgttatttcaactatgacgtctagtggaaagtcactttgttataatctaccggttctt
gaagtattatcgcaaaatctttcagcttgtgctctgtacctttttccaacgaaggcttta
gcacaagatcaactaagagcattactatctatgacagtaggttttgatgtaggtttaaac
attggaatatacgacggtgatactgctcaggaagatcgattatggttgcgcgataattct
agactgttgatcacaaatcctgatatgcttcacatgtcaatcttgccattacataagcag
tttgagcgattcttatctaacgtcaggtatgtggtaattgatgaagctcacacatataag
ggagcgtttggatgccatgtggctcttattttaaggcgctttcgccggctttgtgctcat
gtctatgggagcgatccatcattcattttttgcactgcaacatcagccaatcccagtgac
catgcaatggatcttgcgagtctaccaacaatggagttaattcacaaagacggcagccct
tcgggccccaaactgtttgtcctctggaatcctcctttacacatgaaaaccgtaaccaag
agaactagaagtaagacaaataccatccaatatgacagaaccgtttttgctggtcgttca
agtccaatcttggaaatttcatgtctttttgcagaaattgttcagcatggacttcggtgc
attgcgttttgcaaaacacgcaaactgtctgaacttgtattgagctatacgcgtgaaatt
cttcagaagaccgcacccaatcttgtaaattccatatttgcatatcgagctggctatact
gctcaggataggagaagaatcgagagtgagttttttggcgggaaaatttgcggtgttgct
gctacaaatgcacttgagttggggattgatgttgggcatattgatgtcaccctacatcta
ggttttcctggtagtatagctagcttatggcagcaagctgggaggtctggaagaagggaa
caaccgtcacttgctatatatgttgcatttgaaggacctcttgaccaatattttatgaag
tatcctcataaactattcagaggcccaatcgaatgttgccacgtggatgcaaacaaccag
caggtgcttgaacaacacttggtctgtgcatctcttgaacatccactaagtgttgttcat
gatgaaaaatactttggtccatctctaaaatcttccatactgtcacttaaaagtaaggga
tacgttactaccgatccctccaggggccccacggccgaaatttggaactacattgggcac
gagaaattgccttcccatactgttagcattcgtgcaatagagtcagagagatataaaata
atcgacatgaaaaacgacaaacttctagaagaagtagaagagagcaaagctttctttcag
gtgtatgatggtgctgtttatatgcagcagggaaaaacctatttagtcaagaatttggat
ttatctactaaaattgctttgtgtcaggaagccgacttgaagtattacaccaagactcgt
gattataccgatattgaagtagtaaacggtcacattgcctacccagttaagatttgtaac
attcagaaatcaaaaacaaacgcccaatcaaacccatgcaaagtaactactacatggttt
ggatttagacgtatatggaaaggaagcaaccgagtattcgatacagttaatttatcactt
cctagttatacatacgagtcacaggctgtctggatccgggtcccacaatcaataaaaaca
gctgtggaaacagaaaactattcgtttcgtggaggcttgcatgctgctggtcatgcactt
ctgcatatcgtgcctctatatataatatgcaactcatctgacttggcttcagagtgtgta
aatcctcatgacactcgttatattcctgaaagaattctactttatgattcccatcctgga
ggaacaggcatttcagcacaggttcaacctattttcactgaacttttaactggtgcattg
gaacttataacatcttgctgctgctctggggacactggttgccccaattgtgttcagaat
ctttcttgtcacgaatacaatgaagttttgcacaaagatgcagccacaatgatcattaag
ggtgttttagaactggagaaatcaaattttggagatccttgtagttcctctaacgagggt
cattctatataa
DBGET
integrated database retrieval system
