Hevea brasiliensis (rubber tree): 110667113
Help
Entry
110667113 CDS
T05150
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g12100, mitochondrial isoform X1
Organism
hbr
Hevea brasiliensis (rubber tree)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR_1
PPR
PPR_3
PPR_long
MRP-S27
ATP13
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110667113
NCBI-ProteinID:
XP_021683536
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MRRDGKLPSLASLSMLLNSLVDSKQFGKVLVLFTDIVESGFRPDTAMYGKAVQAAVKLGD
VKRGMELLDSMKKRGVRTNVFVYNVLIGGLCKEKRIRDAQKLFDEMRRRNLVGSTVTYNT
LIDGYCKVGEVDAAFKMRERMKEENVAMNLITFNSLLSGLCKMKRMEEAREMLKEMEVNG
LVPDGFTYSIFFDGLLKSADWNGAMDLYELASGKGIKIDNYTGSILLNGLCREGKVENAE
EILKRLTQNGLVPDEVIYNTIVKGYCRKGDINKAITTIEQMESLGLKPNCITFNSLIDKF
CEMQKMNEVEEWVKKMAEKGVAPRVETFNTLINGYGKLCTFDRCFQILEEMEEIGVKPNV
VTFGSLINCLCKDGKILEAEIVLRDMIGRGVLPNAQIYNMIIDGSCAVGKLKDALRFFDE
MLRSEIGPTLVTYNALINGLCKKGRLMEAEDLLPQITRSGYSPDVITYNSLISGYANAGN
APKCLELYELMKKLGIKPTVNTFHPLINGCSKEGIELVETLFTEMLQLNLAPDRVVYNTM
IHSHAEIGSLQKAYELYHEMVDKGVQTDNMTLHCLILGHLRQGELSEIKDLVDSMKAKGL
APKADTYNILIKGYCDQKDFGGAYVWYREMMENNFLPSVSICKELIAGLKQEGKLKEVLV
ICSEMNVKGMEDWFSNEELSAVPTM
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggagagatggtaagcttccttcacttgcttctttgagtatgttacttaattctttg
gtggactcgaagcaatttggtaaggttcttgttttgtttacggatattgtggagtccggt
tttaggcctgatacagctatgtatggtaaggcggtgcaggccgcagtgaaattgggggat
gtaaagaggggcatggagttgctggattccatgaaaaagagaggagtaagaactaacgtg
tttgtttacaatgttttgattggtgggttatgtaaggagaagaggataagagatgcacag
aagctgtttgatgaaatgaggaggaggaatttggtggggagtactgtcacttataatacg
cttattgatggatattgtaaggttggggaggtggatgcagcatttaaaatgagagagagg
atgaaggaagagaatgtggcgatgaatctcattactttcaactcattgcttagtgggctt
tgtaagatgaagagaatggaggaggcaagagagatgctgaaagagatggaagtgaatggt
cttgtgcctgatggatttacttacagtatattttttgatgggcttttgaagagtgctgat
tggaatggtgctatggatttgtacgagttagctagtggaaaaggaattaagattgataat
tacactggtagcattttgttgaacgggttatgtagagaaggaaaagttgagaacgcagag
gagattttgaagaggcttacacaaaatgggcttgttccagatgaggttatctataacact
attgtgaaggggtattgtcgaaaaggtgacattaataaggccattacgactatcgaacaa
atggaaagtttggggttgaagccgaattgcattacgttcaattctttgattgataagttc
tgtgaaatgcagaagatgaatgaggtagaggaatgggtaaagaagatggcagagaaggga
gttgcgccaagagtggaaacatttaacacccttatcaatggttatggaaagttatgcact
tttgataggtgcttccagattcttgaagaaatggaagagattggggtaaagccgaatgtt
gtgaccttcggttctctcataaattgtttatgcaaggatggaaagattctcgaggcagaa
atagtccttagggatatgattggaagaggggttttgcctaatgcacagatatacaatatg
attatcgatgggagttgtgcggtggggaaattgaaagatgcattaaggttctttgacgag
atgttgagaagtgaaataggcccaacccttgtaacatataatgcacttattaatgggctc
tgcaagaagggaagattgatggaagctgaagacttgcttccccaaattactaggagtggt
tatagtcctgatgtgatcacatacaactcattaatctctgggtatgcaaacgcaggaaat
gccccaaaatgtcttgagctatatgaacttatgaaaaagttgggcataaaacctactgta
aatacatttcatccgctaataaatggatgcagcaaagaagggatagagcttgtagagaca
ctatttactgaaatgttacagttgaatttggctcctgatcgagttgtgtataatacaatg
attcatagtcatgcggaaattggaagtcttcaaaaggcatatgaattgtatcatgagatg
gtagacaagggagttcaaacagacaatatgactcttcattgtttgattctgggtcatctc
agacagggagagttgtcagaaattaaagatcttgttgacagtatgaaggctaagggatta
gcccctaaagctgatacatataacattctgattaagggttattgtgaccaaaaggatttt
ggtggagcatacgtttggtatagagaaatgatggaaaataatttcctccctagtgttagc
atttgcaaggagcttattgctggccttaaacaggaggggaagttgaaagaggtcctagtt
atatgctctgaaatgaatgttaaaggaatggaagattggttctctaatgaagagctatct
gctgttcctacgatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system