Helicobacter cetorum MIT 99-5656: HCD_06160
Help
Entry
HCD_06160 CDS
T02033
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
hcm
Helicobacter cetorum MIT 99-5656
Pathway
hcm00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
hcm01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hcm00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
HCD_06160
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
hcm01005
]
HCD_06160
Enzymes [BR:
hcm01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
HCD_06160
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
hcm01005
]
Core region
HCD_06160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI06234
UniProt:
I0ETG5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1314042..1315325)
Genome browser
AA seq
427 aa
AA seq
DB search
MKERLRVLFNADYVFTLIFALFFLTSFKKPLTQVLLIVLVVFLLLKCYLQASLKETFRIN
NLKKMPFKWLSVAFLGVFLSVFPNMFSMYDSQTFRYNLFALNMSLTYILGTLCLVFASRL
KIKLNQKIIFYSMCVANFFNGLLSLVQKFYFNMPRVQGFSTVKEYVVLVSVSILGCYVYA
LYSQDKKEKFYFTLSIFVGFLVVIFSATRSALIAFSATFLILSCFVLYFQKSLKQLIYMG
FVTLVLSGLYTQSGILEKKGAIEQSRVQSQSFEADLKRYAKKDADSSIGWRLERWKEALT
ILKLRPLFGMAASEKCQRLDEILSLSHSYRQKELILCIERYDNQLIHILATRGIIGLIIF
IAFCIILIKIFWNGLRQNALISFFILSVLTFYLIYGIGFDPFDFFITGSFFVGMVVMGVF
LRANSKV
NT seq
1284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaagagcgtttaagggtattattcaatgcagactatgtttttaccctgatttttgcc
cttttctttctcacttcatttaaaaagcccctaacacaagtcttattgatagttttggtg
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ccttttgacttttttattacaggaagtttttttgtaggaatggttgttatgggagtcttt
ttaagggcaaattctaaagtctaa
DBGET
integrated database retrieval system
