Halobacteroides halobius: Halha_1544
Help
Entry
Halha_1544 CDS
T02401
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K13730
internalin A
Organism
hhl
Halobacteroides halobius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Flg_new_2
Flg_new
LolA
LRR_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGB41483
UniProt:
L0KBM0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1544875..1546191)
Genome browser
AA seq
438 aa
AA seq
DB search
MKGDKIISLTLILLLSLVLVGCLEANAASNKVKLTIYKLGKGEITPKVGTHTYKQGATIT
LKAVAKKGYSFNKWSSKGINELNKKVKNCELVLDQDLTITAVFSDGKTLNFVDYDIEQVL
RKKLQKWGKLNQHSNNILKEDVYGVKSLNIEGVEIESFQGLQFMPDLNYLDIRESKVTGN
LFPLAKSNNLRQLIIREKTKLKDISQLDLLTQLKDLTLENHQLTELSQISNLSQLSRLNI
SSSSLKSIKGIENFTKLKRFTLQNGKVADISTLSQLTNLKRITINDLPVKDISPLSNLNN
LKYLTLSELPVDESKDLTKVLKSMNNLKRLSLTDLKINRVDFLKGISQLSWLNLSRNSFS
NLEKLKEHILRINNLSTLWLSQLGLENIDFLLKLDLNELKEVYIRGNNLDLSKEAEDMKV
INKLKQKGVQVIYKWPWQ
NT seq
1317 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggtgataaaataatttctttaactttgattttactgttaagtttggttttagtt
ggttgtttagaagctaatgcagctagtaataaagttaaattaacaatttataaacttggt
aaaggagagattactcctaaagtaggaactcatacttataaacaaggtgctacaattact
ttaaaagcagttgctaaaaaagggtattcttttaataaatggtccagtaaggggattaat
gaattaaataaaaaggttaaaaattgtgaattagtattagatcaggacttaacaattaca
gcagtatttagtgatgggaaaacacttaattttgtggattatgatattgaacaagtactt
cgtaaaaaattacaaaaatggggaaaattaaatcagcactctaataatattttaaaggaa
gatgtttatggagtaaaatctttaaatattgaaggagtagaaatagaatctttccagggg
cttcaatttatgcccgatctaaattacctagatattcgagaaagtaaagtcaccggaaat
ttatttccattagcgaaaagtaataatttaaggcaactaataattagagaaaagacaaaa
cttaaagatataagtcagcttgatcttttaactcaacttaaagatcttactttagaaaat
catcagttgactgaactttctcaaattagcaacttaagtcagttaagtagacttaatatt
agtagttctagccttaaaagtattaaaggaatagaaaacttcactaaattaaagagattt
actttacaaaatggaaaagttgcagatataagtactctatcgcagctaactaatctaaaa
aggataactattaatgatctcccagtaaaggatataagccctttatctaatttgaataat
ttaaaatatttgactttatcagagcttccagttgatgaatcaaaagatctaactaaagta
ttgaaaagtatgaataatttaaaacgtctttcattgactgatttaaaaattaatagagtt
gatttcttaaaaggaatctcacaattaagttggcttaatctttctagaaattcttttagt
aatttagaaaaattaaaagaacacatacttcgaataaataacctaagtactttatggctt
agtcaattaggtctagaaaatattgattttctattaaaattagatttaaatgagttaaaa
gaagtatatattagaggaaacaaccttgatttatcaaaagaggcagaagatatgaaagtt
attaacaaattaaagcaaaaaggagtccaagttatttataaatggccctggcaataa
DBGET
integrated database retrieval system