Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100198779
Help
Entry
100198779 CDS
T01080
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat protein soc-2 homolog isoform X1
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_1
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100198779
NCBI-ProteinID:
XP_047124382
LinkDB
All DBs
Position
15:complement(26558449..26602731)
Genome browser
AA seq
607 aa
AA seq
DB search
MVRRKRFGLYEIEEIWKMSKNYSNTQITEEEESKLLEKKLKSLKVEDEDDDAFLPSTHTV
KDVSNSHITGAFIDTKDKSDHSRHVRIDVKDDGIKKTKRKSTKGDKESSSIVKGLMKCKE
ESSKMLNLSKLGIVNMPKEIKELTGLTQLFLYGNKISKLPPEIGLLMNLETLLLNENSIS
SLPAEIVNCKKLQMLDLRHNKIKEIPPVLYSLVSLKQLLLRFNRLTTVEPEIGNLTHLTM
LSLRENRLKHIPDTIGNLKSLVTLDLAKNHLESLPPEIGKCIEMNTLDLAHNELRDLPDS
IGKLTALSRLGLRYNQLTSLPSSICQCTLLQEINIESNGISSLPSGLLLSSKLCDSITLS
RNEFENFPSDGPKQFASVTSLVFDHNKIKKIPFGIFSKAQFLTKLNLKDNLIAELPLDFG
TWANLDELNLGTNQLTVLPDDIKWLVNLEVLILSNNQLKRIPRSIGNLRKLRVLDLDENN
LECLPNEIEYLKSLEKLLLQSNKLATLPATIGHLKKLSYLSVGENDLTVLPPEIGALESL
EQLFLNDNKNLHALPHTLVLCQNLTIMNIDACPLSSLPQEIVANGPSVVIQYLRFEGPYN
GNNTLPT
NT seq
1824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaggagaaaaagatttggtctgtatgaaatagaagaaatctggaagatgtcaaaa
aattattcgaatactcaaattacagaagaagaagagtctaaattacttgaaaaaaaatta
aagtcattaaaagtagaagatgaagatgatgatgcattcttaccttctactcatacggtg
aaagatgtatccaacagtcatattacaggagcatttattgatacaaaagataagtctgat
catagcaggcatgtaagaattgatgtaaaagatgatggtattaagaagactaaaagaaaa
tctaccaaaggtgataaagaatctagttctattgttaaagggcttatgaagtgcaaagag
gaaagcagtaaaatgctaaatttatctaagttagggattgtcaatatgccaaaagaaata
aaagagttaactggtttgactcagttgtttctatatgggaataaaataagtaaactacca
ccagagatcggtcttcttatgaatttggaaacattgctccttaatgagaacagcatttca
tctttaccagctgaaattgtaaattgtaaaaaacttcaaatgttggatttacgtcataac
aaaattaaagagattccccctgttttatacagcttagtttctttaaaacagttacttctt
cgatttaacaggcttacgacagttgaacccgaaattggaaacctaactcatttgacaatg
ttaagtttgcgtgaaaatcgccttaagcatataccagataccattggcaatttaaaaagc
ttagtaacattggatttggcaaaaaatcacttagagtctttaccaccagaaattggtaaa
tgcatagaaatgaacactttggatctcgctcacaatgagttgcgagatcttcccgattct
ataggaaaactaactgcattatcaaggcttggtttaagatataatcagttgacttcatta
cccagcagtatttgtcaatgtactttacttcaagaaattaatatcgaatctaatggcatc
tcaagtttaccgagtggattgcttttgtcatcaaagttatgtgattcaattacattatca
agaaatgaatttgagaattttccaagtgatgggccaaaacagtttgcttctgttacctca
ctggtgtttgatcacaataaaattaaaaaaattccatttggcatcttttcaaaagctcag
ttcttaacaaagttgaatttgaaagataatttaattgctgaacttccgcttgattttggt
acatgggctaacttggatgaattaaatttaggaacaaatcagttaacagttctaccagat
gatataaagtggttggtaaacttagaagttcttattttgagtaacaatcaacttaagagg
attcctcgatctattgggaatcttcgcaagctaagggtattagatcttgatgaaaataat
ttggaatgtcttccaaatgaaattgagtatttaaaatcccttgagaagctgttgctgcaa
tctaacaaacttgctaccttaccagctactattggacatttaaaaaaactttcatactta
agtgttggtgagaatgatctgacagtacttccaccagaaataggagctctggaatcacta
gagcaactttttctcaacgataataaaaacttgcacgcacttcctcatacacttgtactt
tgtcaaaatttgactattatgaatattgatgcttgtccattatcatcacttcctcaagaa
attgttgctaacggaccttcggttgtgattcaatatttgcgctttgaaggaccttacaat
ggaaacaacaccttacctacatga
DBGET
integrated database retrieval system
