Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 105845983
Help
Entry
105845983 CDS
T01080
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC105845983
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Ion_trans_2
Lig_chan
ITGAX-like_Ig_3
TGF_beta
IRK
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105845983
NCBI-ProteinID:
XP_047136704
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(30851499..30969883)
Genome browser
AA seq
1616 aa
AA seq
DB search
MKQKLSTILLVCFVSCVFGGLIYEVCKDSLPSEACFDCTDSVMNQFCQLTCNMCANINGT
NKSVSTTSIPFGQPRSGLKYLITYNDFQNCFLDVRISDGNIYCNPTNRTEFYLVDVPSTI
SLTSTVPNATVSLDSVKTFNTDIILLFNQNIQNLPLTSIFTYKVNLFSNVDVSSLNFSIE
NSNNCNVYNNLTMSIYLLVSQDNLVNSIYEWQKLYNFSMLYLSKKPFVDFVLQQGYNSIG
LVNLFKNAKRSYHGVVNFISIIVIFKNILQNDVYCEVNQNNVALLISYGKDKLFQGAVSF
QSAKDNKYLRHSGMAIKLDDISPTDYAGDRSYYVHQKDSFFSIQSAHPAYLLYFIGKNGD
NFEILQNANVPAFTLVVTDLMIKKIESINKYTVNITIILSVPVWNSTADFKIKCKDPNDV
NLYLKQLNLYLNPVINYVADISSLQSYTLYKFSAGVKNEFGFYVYGQIFSYRTGEDVPVG
YPHNFTVKVVNFTTLFLSWAEVETLMRKGIILNYIYSCNNTEDSLSNKVDNSTFNVTVYN
LNPDTIYQCSVAACTIVGCGVQAFVFNITLDGIPSGPPLNFIVAPFSFSSLLLSWDKVEY
LKRNGTIISYKYLCSNEINTWYTVDKNTFQVIVGNLSLNTTYNCTITACTWVGCGVQLSL
FNTTLNGSPEESANITFIHNINSSSINVSWNDITLSKWVIQENQLYCLDIENSSQIVKTE
CVEYTAKRNIIINGLDPYTNYAVLVYCKNKVGVGFKDNNKKKSVFTDELPPLVSPRNISV
DSNSTNSILLQWKPLDKNEYYGVLSGYSIIVKAVYSESDFKLQSKRKRRGLDMQIYNGSL
LLEWKTNLSNPNATFFNITNLFGNTIYIINISANTKYQGKFSSGVEIKTKEGVPLLSAVN
LQCDIITYCSISIHWQPTPPGYLQGILIGYTLSYQKVDTEEIQYESLNTESTSYKVINLD
AFTNYNIVLVAFTKDGGGKNSQLTCITDETVPIKAPTGLTATSYYYPDKTNVSWIHLNQS
DWRGRPLGYTIAYKLLKQGNIDIPNQRWVMINITYTNQSMHQLENLRLYSQYTLKIAGYN
RIGIGSFSGVINFVTCHILNPVVEINYITLPPFASLNKSSQFPPEGIMIAPTEHSLKQCA
GICSSFSKNISFVYTKVQKTSLEFVKMSSNKIKLPVTVPVQVHNSSYSSTVQLSGFVFLF
IPSNRSVQLTENEKIVFKNTASSLATLLIYILLNCLFGVILFYCQYQNSRRKSHCFTLSG
IFEEIYFSIITITTVGYGDKIPLTFCGRVLLIIWTFMGIVLTSICVGNIISALTVDVVSS
VIDLYPKYTVIAKLESPEYIWANKISSINLIKDKNFSSHLDVLDGLRAGQAKYAIFDQYT
VEAYRVVMMQFNIKIAKVLNTDSSYYGVSLGGNYSLLQSCMNSLLKNSSAMVASAMYDFK
MDAMQQTNSTHLKLIKTQVQLFSIQSPILKMMLCGMVYVLLSLLIAGSVYEILRIKWIKK
PRVAPSLDKKLAYLQEMKNLSQEYLIEFRNMIERLQIKTDILLYRHAEQRCKLRNKFSKL
YGVNFKYVTLNDLGVSLEQIAEFREEIKRRPKKTCWQRFSEYAVKKLSWLRIKIFK
NT seq
4851 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcagaaattatctaccattcttttggtttgttttgtaagctgtgtgtttggaggt
ttaatatatgaagtttgcaaagacagtttacccagtgaagcatgctttgattgcacagat
tctgttatgaatcaattttgtcaattaacatgcaatatgtgtgctaacataaatggtaca
aataaatctgttagtacaactagcattccttttggtcaacctcgatctggcttaaaatat
ttaattacttacaatgattttcaaaactgctttttggatgtgcgcatcagtgatggtaat
atttactgtaatccaactaatcggaccgagttttatctagtggatgtaccatcaacaata
tctctgacatcaactgttccaaatgcaacagtctctttggattcggttaaaacttttaat
actgacataattttgttatttaaccagaatatacagaatcttccattaacctctatattt
acttataaagttaatttgttttcaaatgttgatgtttcaagtttgaatttttcaattgaa
aattctaataattgtaatgtttataataaccttacgatgagcatctatttgcttgtgtct
caagacaatctagttaatagtatatatgaatggcaaaagttgtataatttttcaatgtta
tatctctctaagaaaccatttgtagattttgttttacagcaaggatacaatagtattggt
ttagtgaatctctttaaaaatgcgaaaagaagttatcatggagttgtgaattttattagt
attattgtaatatttaaaaatattttacaaaatgatgtttattgtgaagtcaaccaaaat
aatgttgcattgcttatatcatatggaaaagataaattatttcaaggagcagtttctttt
caatctgccaaagataacaagtatcttcgacatagtggtatggctattaaacttgacgat
atttcaccaacagattatgcaggtgatagatcatattatgtccatcaaaaggattcattt
ttttcaatacagtcagcacatccagcttatcttttatattttattggaaaaaatggcgat
aattttgaaatattgcaaaatgcaaatgttccagcatttactcttgttgtaactgatttg
atgattaaaaagatcgaaagcatcaacaaatatactgttaatataacaataatcttatct
gttccagtttggaattcaacagcagattttaaaattaagtgcaaagatccaaatgatgtc
aatttatatctaaaacaactaaatttatatctaaaccctgttataaattacgtagctgat
atttcttcactccaaagctacacattgtataaattttctgcaggtgtaaaaaatgaattt
ggtttttatgtttatggtcaaatattttcctatcgaacaggtgaagatgttccagttgga
tatccacataattttactgttaaagtagtcaactttacaactttatttttatcatgggct
gaagttgaaactttaatgagaaagggaattatattaaattatatttattcatgtaacaac
actgaagatagtttatcaaacaaagttgacaacagtacatttaatgtaacagtgtacaat
ttaaatccagatacaatttaccagtgctctgttgcagcatgtaccatagttggctgtggt
gtacaggcatttgtttttaacatcacattagatggaattcctagtggtcctccactaaat
tttattgttgcacctttcagtttttcatctttattattatcatgggataaagttgaatat
ttaaaaagaaatggaactattatttcttataaatacttatgtagcaatgaaataaatact
tggtacactgttgataaaaatacatttcaagtaatagtaggcaacttatctttgaataca
acttataattgcacaattacagcatgtacatgggttggctgtggtgttcaattatcttta
tttaatacaactttaaatgggtcaccagaggaaagtgcaaacattacttttattcataac
attaactcatcatcaatcaatgtcagctggaatgatatcacattatcaaaatgggttata
caagaaaatcaattatattgtttagatatagagaacagttcacaaattgtaaaaacagaa
tgtgttgaatacactgcaaaacgtaatattataattaatggacttgatccttatacaaac
tatgcagtgttggtatattgcaaaaataaagttggagttgggttcaaagacaataataaa
aaaaaatcagtttttacagatgaattgcctccattggtttctcctagaaatatatcagtt
gattcaaatagcacaaacagcatattgttacaatggaaacctcttgataaaaacgagtac
tatggtgttttatcaggttacagtattatagttaaagctgtttattcagaatcagatttt
aaattacaaagtaaaagaaagagacgtggtcttgacatgcaaatatataatggaagcttg
cttttagaatggaaaacaaatttaagcaatcctaatgcaacattcttcaacatcacaaat
ttgtttggaaatacaatttatataatcaacatatctgctaacacaaaataccaaggaaaa
tttagctctggagttgaaatcaaaaccaaagaaggagttcctcttttatctgctgtcaat
cttcaatgtgatataataacttactgttctatttctatacattggcaaccaactccacct
gggtaccttcaaggtatacttataggctatacattgtcctatcaaaaagttgacacggaa
gaaattcaatatgaatccttaaatacagagtccacaagttataaagtaatcaatttagat
gcatttactaattataatatagtgttggttgcttttactaaagatggcggtgggaaaaat
tcacaattaacatgcataactgatgagacagtacctataaaagcccctactggtttaaca
gccacatcatattattacccagataaaacaaatgtttcatggatccacttaaatcaaagt
gattggagaggaagacctcttggttacactatagcatataagcttcttaaacaaggaaat
atagacattcctaatcaacgttgggtaatgatcaatataacttatacaaatcaatcaatg
caccaacttgagaacttacggctatattctcagtatactcttaaaatagctggttacaat
aggataggtattggatcatttagtggtgttattaattttgtaacatgtcatatcttaaat
cctgttgttgaaataaattacattactttaccaccatttgcaagtttaaataagtcctca
caatttccacctgaaggtataatgattgcaccaacagaacattccttgaaacaatgcgct
ggtatttgttcctctttttcaaaaaacatttcttttgtttatacaaaagtgcaaaaaact
agcttagagtttgtaaaaatgagttcaaataaaataaaacttcctgtcacagtacctgta
caagttcataatagctcttattcgtcaacagtacagctttctggttttgtatttttgttt
attccaagtaatagatctgttcagctgactgaaaatgaaaaaatagtttttaaaaatact
gcaagtagtttggcaacacttttaatctacattttgttaaattgtttatttggtgtcatc
ttgttttattgtcaatatcaaaattctcgaagaaaaagtcattgttttactttgagtggt
atatttgaagaaatatacttttcaattataactattacgactgttggttacggtgacaag
attcctttaacattttgtggcagagtgctgttaataatttggacatttatgggtattgtc
ttaacttcaatatgtgttggaaatataatttcagctctgacagttgatgttgttagttca
gttattgatttatatccaaaatatactgttattgcaaagttagaatcgcctgagtatata
tgggctaataagatatcatcaataaatcttatcaaagataagaacttttcaagtcattta
gatgttttagatggattaagagcaggtcaagcaaagtatgccatttttgatcagtacaca
gttgaagcttatcgagttgttatgatgcaatttaacataaaaattgcaaaagttttaaat
actgacagttcttattatggagtgtcattgggtggaaattattctctacttcaatcttgt
atgaatagtttattaaaaaacagctcagctatggttgcttctgcaatgtatgattttaaa
atggatgctatgcaacaaaccaactcaacacacttgaagttgattaaaactcaagttcaa
ctttttagtattcaatcaccaatcttaaagatgatgctgtgtggcatggtatatgttcta
ctaagtcttttgattgctggtagtgtatatgaaattttaagaataaagtggattaaaaaa
cctcgtgttgcacccagtttagataaaaaacttgcatacttacaagaaatgaaaaatctt
tctcaagaatatctaattgaatttcgtaatatgattgaaaggctccagataaaaactgat
atacttctttatagacacgctgaacaaagatgtaaactgagaaataaattttcaaagtta
tacggggtaaactttaaatatgtaaccctaaatgatcttggtgtgtccttggagcagatt
gccgagtttagagaggaaattaagcgtcgcccgaagaaaacttgctggcaaagattttcg
gagtacgcagtgaagaaactgtcgtggttgcgtatcaaaatttttaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
