Hymenobacter volaticus: MUN86_00180
Help
Entry
MUN86_00180 CDS
T09412
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
hvl
Hymenobacter volaticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
PA14
Por_Secre_tail
GLEYA
Cadherin_5
Big_9
NPCBM_assoc
TcfC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOQ66387
LinkDB
All DBs
Position
47329..56238
Genome browser
AA seq
2969 aa
AA seq
DB search
MRTILRFAVLLLAWLTLLRTDAWAQACTTTSTLNYANANTGDRRTATQTVGGTSFTFSNY
TSSVPANQTNTFSVGTNNTYVSGQTLIWQLDNQGNSNPNSSSVTLTFARPVSNLTFQFQD
IDSDVNFIDDLVFEAYVNGSTTPATLDATNFTTSTNNEHVSGGRVRGKGGNVAAGNANGN
LTARMPANVTKLVLNYNNSAAYTANTSRLQTLGINSISWCAQADVYAQFTAAPDNGATGQ
SLTYTAQFGNNGPDVIATGVIRQVTIPNGATVTNNGGGTVFGNTITFPQVSIASGASTSV
TYTYTAPTTASEYNNVATISTATQSSEPTANNTATSKVLVAPAADPCATALNTLIFGNRA
NPEDWKAHAQEGVPTSTAITKIGTSNYSFNNTPGTLQIGTLNNERILVWSNNFTEANGST
SVQFNFSRPVSDFSVEVADIDANAGIVLTSDFTDQVVFAGANGTTPVTPTLSSTGDVTVV
GATATGVDDNNASTSATVRASFPRLITTLTITYRNGNAALDNPNAQTIGIRSMTWCRSAP
IANDITNGSLPGGIGATPITGLSASTEGAVQSYTVTALPAAGQGVLYVNGTVLNTTTFPG
LTLTPTQAAQLSFAPAATFSGNATFTYTVTDDKGIGDATPATYVVPVTATGASGTAAGCA
TPGRDLSVVGLTVNPDAYYPSAATQTLAPTATSIVVGAATGAQTDIAIGDLLLVIQMQGA
DIDITNTSAYGDGVPGGAANGNKDDVNFIAGQYEYVVANSAVTATAGGTIQLASPLKFGY
QNAAATTATGQRRFQVIRVPQYINLTLGATITPTPWNGSTGGILAIDVAGQTNLNGFNLD
VSGAGFRGGAGRVQTGANGNDLSYVTTTESGNNAQKGEGTAGTPRYVNSGNTTLVDNLLD
GYPNGGSASRGAPGNAGGGGNNNVDNAGGGGGANGGAGGRGGNNFFSNQPIGGEPGAGFS
VVNSNRLVLGGGGGAGTTNNGTGTPANGFASSGRAGGGIAILRTGSVTGNGSILANGAAA
NSNVADDGSGGGGAGGSILVTATNTAGLAEVTLTANGSAGGTNTGIATSATGQHGPGGGG
GGGVVLANGAVKATSTSGGANGTTTGAFAFGASSGQAGVVNTQISNSIANSTTGANCLSD
VATTLSTTQTAVLAGASITYTAQVQNLGPQPATTVASKVQLPAGLQLTTANLPDGGTYDN
NTGLVTLPSITSLANGATQTYRIVFNAPNYSTTIQGVASSTSVSLDGTTTNNDGSQSNAR
VTTVVTLPVNGCAGTPYGSTASSGLYTEFYAGYFADNMGYFAANTPALTRVDGTINFPNA
RWGNIVPPASGTVSNPDRFSTRHRGSINIATTGSYTFYLTSDDASYLWLDGAALAATPTV
ASAAISNPGNHAVVTVQKTVTLSAGPHNLLIFYGEDGGDNNLVLEYSSTTANIARQVVPN
SVLCASLANVPPVALNVTNSPAIPTNAGPTTIASLAGSDQDGTVTNYAIASLPTAAQGVL
RLGNTALTVGQVITAAQAAQITFQPTLGFIGNATFTFSAIDNGGLYSNDVATYTIPVSGA
SDVSTTLAGPTILNAGLPSGTYTATYTNNGPGVASGVTQKVTIPAGATNVLVNGMTYVPT
GNVIDFGMVNTLASGVTNTFTYSFTAPVTSGSVTQISNVTTTSNQGANPGPDAATLNVTI
NPVADVVTTITGSAASVAGGQPASFTVTFTNNGPSTASNVVGTVQLPVGLTGVTATNSGT
YDPNTGVVSYASATYTNGTSNSSVISFTMPGNGAVTATSTINTTTNEAGQTANDVATATI
NGTASFDVTTSITGPATTVAGTMTTYSVLTINNGPSTATSIGQTVQLPTGLTNVFVSNGG
TYNTANGVVTFPTLDAIASGVKVNNTVSFVAPAFVAPATTFPISATVSGDTNTANNTAYL
NGSATPANVAVTSASTTNANIYTTITTPSADAQPGAPITFTVVAGNKGANTATSVVERVA
LPAGLTGVAITGPNGASSANYDATTGVVTLPTTSLVSGATNTYTITVNAPSSGMIAAVAS
ISAATNDVMVADNVATTDVTVNTPLDVATTISGPTKVNAGQTVTYTVTTTNNGMVPAANV
VQTVNIPAGLTSVSLSGNGTYDPNTGIVTFPTIASQASGNTVLNSISYDAPAINSSMIIA
SVTSSSPDNVKANNSAAVTTTVDAISDVTVVISGPTSIVQGNQIDYLVVTTNNGPSIANS
VVTRVQLPAGLGAITLSDPTNSSYNNATGVVTFPTIAAQRAGQEGTITNVIRFIAPAGVS
QINATASVSTTSEEATYSNNTSSIVTTEVAPTTARTDLRTTVTSTPATLIAGQSASLSVT
TTNGGGGAATGVVQRVALEVGLNITSISNGGLYDPVTGVVTFPAISLASGATRTNTIVLA
VPGTTPLQVRALVTGDQSDQDASNNSFFLNLTVNARADVTTTVSGPTTAAAGDAVTYSVV
TLNSGPSLGSDVVQRVTIPANLTNVVVSNGGTYAASTGVVTFATITSQGTGASGQVMNLI
SFTAPSSSYTVVGNVSTSTTETLTTNNSSTVTVAPASLAPIANSVVNALQTPEGNTAGPL
SLSALSGTDANGNNTIENYRITSIPADTQGVLSLNGTAVVVGQLVSAANAANLKFDPAAG
FVGNAFFGYNAIDNSGLVSAAPALYTIPVGQDLNSVYTLTPAKGNTNPYVNGDIIANVFD
ANSGVYNNAAPQAVTDTGVRTATLTSGTLPAGTTLDPVTGIISVTNRLLLVGGSYPVTIT
TVDGNGGTNPNTFTIIIGSRPLPVELKEFAVRAVKVDALLDWSTASEKNSDRFEIERSLD
GTTFVKIGTVRSQGTTQATTDYAFTDAGIGAKAQGVVYYRLRQVDTDGTASYSPVRTVRF
EAQAAVTAKLSVFPNPATSSDRVVTLDLSTLPKGTYQASLLDATGRLIGTYSVEGGVNKV
VEVQTLPTGTYLVVVRGNGLNLSQRLIKE
NT seq
8910 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaacaatcttacgatttgcagtcttgcttcttgcttggctgacactactgcgaacg
gatgcttgggcacaggcatgtactacaactagtacgctgaactatgccaacgccaataca
ggtgaccgaagaacagcaacccaaacggttggcggtacctccttcacgttcagcaactac
accagcagtgttccggcaaatcaaaccaacactttctcggttggtactaacaacacctat
gtcagcgggcagacgttgatttggcagttagataaccaaggaaattctaaccctaatagc
tcttcggttacgcttacatttgcgcgtcctgtcagtaatctaacttttcagtttcaggat
attgactccgatgtcaatttcattgacgacctggtgtttgaagcgtatgtcaacggaagc
actactccggctacgttggatgccaccaacttcaccactagcaccaataacgagcatgta
agcggaggtagagtacggggtaagggtggtaacgtggccgctggcaatgctaacggcaac
ctgactgcccgtatgcccgccaacgtaaccaagctggttcttaactacaacaactcagct
gcttacacagccaacacgagccgcttacaaaccttaggcatcaactcgatcagctggtgt
gctcaagccgatgtgtatgctcagttcacagctgcaccagacaatggagctactggacaa
agtcttacgtacaccgcgcagtttggcaacaacggtcctgatgtcatcgctacgggagta
atacgccaagtgacaataccaaatggtgctacagtaactaataacggtggtggtaccgtt
tttggtaataccatcacgtttccgcaggtttctatagcatcaggcgcaagtacttctgtt
acgtacacgtacacagccccaactactgcctctgagtacaacaacgttgctaccatctcg
acagcaacgcagagtagtgagcccacggcaaacaacacggccactagcaaagtacttgtg
gcaccagctgccgatccttgcgcgacggcgctcaacacgctgatttttggtaatcgtgcc
aacccagaagattggaaagctcatgcacaagaaggagtaccaacttccacagctatcacc
aaaatcggcacaagcaactactcgttcaacaatacacctggtacactccagattggtacg
ctaaacaatgagcggatattagtttggagcaataatttcactgaagccaacggcagtact
tctgtgcagttcaacttcagccggcctgttagtgactttagcgtagaggtagctgatatt
gatgcgaatgcgggaatagtgcttacctctgacttcacagatcaggtggtttttgccggg
gctaatggtactactcctgtaactccaacgcttagttctactggtgacgtgacggttgtg
ggagctacggctaccggtgtagatgacaataatgccagtaccagtgctaccgtacgggca
tcctttcctcgcttgatcactaccctaacaataacctacagaaacggtaatgctgctcta
gacaatcctaatgcacaaaccattgggattcggagtatgacgtggtgccgctcagcgcca
atagcaaatgatataacaaatggtagcctccccggcggtattggtgccactcctatcacc
gggttgagcgctagtacggaaggtgcggtgcagtcctataccgttacggcgctgcctgct
gcagggcaaggtgttttgtatgtgaatggcaccgtcctgaatacgacaaccttcccgggc
ttaactctaacgcctactcaagccgcacagctttcctttgccccggctgctacgttcagc
ggcaacgcaacgttcacgtacacagtaacggatgataaagggataggggatgctacccca
gcaacgtacgtcgtccccgtaacggctacaggtgccagcggcaccgcagcaggttgcgct
actcctggtagagatctttcggtcgttggcctaactgtaaaccctgatgcttattaccct
agcgctgccactcagactctggctccaactgctacctctattgtagtaggtgctgccact
ggcgcccaaaccgatattgcaattggtgatctgcttctggttattcagatgcaaggagct
gatatagacatcaccaataccagcgcttacggcgacggtgtgcctggtggtgccgccaac
ggcaataaagacgacgtaaatttcattgcgggccagtatgaatacgtagtggcaaacagc
gctgtgacggctactgccggcggtactattcagctagctagcccgctgaagttcggttac
caaaacgctgcagcaaccaccgcaactggtcagcgccgattccaagtaattcgggtgccg
cagtatatcaacctgacattaggtgctaccattacccctacgccctggaacggctcgacg
ggtggcattctggccattgacgtagcaggccaaaccaatcttaacggcttcaacctcgat
gtatcgggggcgggcttccgcggaggagcaggtcgggttcaaacgggtgccaatggcaac
gatttatcgtatgttaccaccacagagtctggcaacaacgcccagaaaggagaaggtaca
gctggtaccccgcgctatgtgaatagtggtaacactacgctagtagataatcttttggat
ggctacccgaacggcggcagcgctagccgcggtgcccctggcaacgctggtggcggcggc
aacaataacgtagacaatgctggtggtggtggtggcgccaacggtggcgctggtggccgc
ggcggcaacaacttcttcagcaaccaacctattggtggtgagccaggcgccggtttctcg
gtagttaacagcaatcgcctcgtgttaggtggcggcgggggcgctggcacgacaaacaac
ggaacgggtacgcccgctaacggatttgctagcagtggcagagctggtggtggtattgcc
atcctgcggacgggttcggtaacgggcaacggttctatcctcgccaacggtgcagccgct
aacagcaacgttgctgatgatggcagcgggggcggtggtgctggtggttccatcttggta
acggctacgaacactgctggtctagccgaagtcacgttgacggctaacggtagcgctggt
ggtaccaacacgggtattgcaactagtgctactggtcagcacggccccggtggcggtggc
ggtggtggcgttgttctggctaatggtgccgtaaaggccacttcaacctcaggcggtgca
aacgggacaaccactggagcttttgctttcggtgcctcttctggtcaagcgggtgtagta
aacacgcagatcagcaacagcattgctaacagcacaaccggcgctaattgcttgtcggat
gtggcaactacgctgagcacgactcagacggcagtattggctggtgctagcatcacgtat
acggcgcaagtacaaaacctaggtcctcagccagctactacggtagcatctaaagtgcag
ttgccagctggtttgcagcttactacggccaacttgcctgacggaggtacttacgacaac
aacacgggcctggtgactttgccatctataacttcactggcaaatggagctacgcagacg
taccgcattgtcttcaatgcgcctaactacagcaccactattcagggagtagcgagcagc
acttcggttagcctcgacggaacgacaaccaacaacgacggcagccagagcaatgctcga
gttactacggttgtgacgcttccagttaacggctgcgccggaactccttatggctcaacc
gccagcagtgggttgtacacggaattctatgccggctactttgccgataacatgggctat
ttcgcggccaacacccctgcgctaactcgggttgatggtactatcaacttccctaatgcg
cggtggggtaacattgtgccgccagctagcggtactgttagcaacccagaccggttcagc
acccgtcatcggggcagcatcaacatcgccacgactggtagctacacattctacctgact
tctgatgatgcttcctatttgtggttggatggagctgcactagcagcaacaccaactgtc
gcaagtgcagctatcagcaaccctggtaaccacgcggtagttactgttcagaaaacggta
acgctatcggctggtccgcacaacctgcttatcttctacggcgaagatggtggcgacaac
aacttggttctggaatactctagcacaacggcaaacattgcccggcaagttgttccaaac
tcggtgctgtgcgctagcttggctaacgtacccccagttgctcttaacgtaacgaactcg
ccagctattccgaccaacgctggaccaacgaccattgcttcgctggctggtagtgaccaa
gacggcacggttaccaactacgctattgcctctctgccaacagcggctcagggtgtgctg
cgcttaggtaacacggctttgacggtaggccaggttatcacggccgcgcaggcggcgcag
attactttccaacccaccttgggtttcattggcaatgccactttcacgttctcggccatc
gataacggcgggctgtattccaatgacgtagccacctacacgattccagtaagtggtgct
tctgatgtatcgactacgttggctggccctacgattttgaatgctggcttgccttcgggc
acatacactgccacgtacacgaacaatggtcccggagtagcttctggcgtaacgcagaag
gtaaccattccagccggcgcaacgaacgttctcgttaatggtatgacttacgtgcctacc
ggcaacgtgattgatttcggtatggttaacactcttgctagcggtgttaccaacacgttt
acgtatagcttcacagcaccagttaccagcggttctgtaacgcaaatcagcaacgtaacg
accacttcgaaccaaggagccaacccaggacctgacgccgctacgctcaacgttaccatc
aatccggtagcagatgtagtcactacaataacaggttcggctgcttcagttgccggtggg
caaccagcttcgtttacggtgacgttcaccaacaacggcccctctacggccagcaatgtg
gtgggcacagtccagctgccagtaggtctaacaggtgttactgctaccaacagcggaacc
tacgacccaaatacgggcgtggtatcatatgcctcggcaacctacactaacggcacgagc
aacagctcggtgatttccttcacaatgccaggtaatggtgccgtgacagctacctcaacc
atcaacacgacgaccaatgaagccggccagaccgctaacgatgtggctactgctacaatc
aacggaacggcatcgtttgatgtaacgacgagcatcacgggtcctgctaccacagtagcc
ggcaccatgacaacgtacagcgtactgaccatcaacaacggaccttctacggctactagt
atcggtcagacggtgcagttgccaaccggcttgaccaacgtgtttgtctcgaatggcggt
acgtacaacaccgcaaatggtgtagtgacgttcccgacgttggatgccattgctagcggc
gtgaaagtgaataacacggttagcttcgtagcgccagctttcgtagcaccagctactact
ttcccgatttcggctaccgttagtggcgacacgaacactgctaataacacggcgtatctc
aatggtagtgcaacacctgccaacgtagcggtaacatcagcttctactaccaacgcgaac
atatacacgaccatcacgacgccgagcgccgatgcgcagcctggtgctcctattaccttc
acggtagtagccggcaacaaaggtgcgaatacggctaccagcgtagtggagcgggttgcg
ttgccagctggtttgactggagttgccatcacgggtcctaacggcgcaagcagcgctaac
tacgacgctaccacgggtgttgtaacattgccaaccacttcgttggtctcgggcgcaacc
aatacttacactatcacggtgaatgctccttcttcgggcatgatagccgcggtagccagt
atttcggccgcaaccaatgatgtgatggtagccgacaacgtcgctactaccgatgtaaca
gtaaacacgcctctggatgtagcaacgactatcagcggaccaaccaaggtgaatgctggt
cagacggtaacctacactgtgaccacgaccaacaatggcatggtgccagcagctaacgtg
gtgcagaccgtgaacattccggctggcctaaccagcgtgagcctgtctggtaacggtacc
tatgatcctaataccggtatcgtaacgttcccgactattgctagccaagcaagcggcaac
actgtactgaattctatttcgtacgatgcgccggccatcaattcgtctatgattattgcc
tcggtgacgtcttcttcaccagacaatgttaaggccaacaacagcgcggccgtaacgact
actgttgatgctatttccgatgtaaccgtagttatcagtggtccaactagcattgtgcaa
ggcaaccagattgattacctggtggttacgaccaacaatggtccatcaatagcgaacagc
gttgtcacgcgggtgcagctgccggctggcctgggagcaataaccctttccgatccaacg
aacagctcctataacaacgcgacgggtgtagttacattccctactatagcagcgcaacgt
gccggtcaagaggggaccataacgaatgttattcggttcatcgcgccagctggagtgagt
caaatcaacgcgactgctagcgtgtcaacgacgagcgaggaagctacttacagcaacaac
acttcgagtatcgtgacgacggaagtagcgccgacgactgctagaaccgatctacgcacg
accgttacttctacgcctgcgaccttgatagctggtcagtcagcttcgctgtcggtaaca
actaccaacggtggcggcggcgcagcaacgggggttgtacaacgtgttgcgctagaagta
gggttgaacatcacttctatctccaatggaggcttgtatgacccagtaacgggtgtcgta
acgttcccggctatctccttagcatcgggtgctacccgtaccaataccattgtgttggca
gttcctggcactacgccgctgcaagtgcgggcactcgtaacgggcgaccagtcagatcag
gatgcgagcaataactctttcttcctgaacctaactgttaacgcacgtgccgacgtgacc
actactgtgagtggcccgacaacagcagctgccggcgatgccgttacgtattcggtggta
acactgaatagcggtccatctctcggaagcgacgttgtgcagcgggttactattccagct
aacctaacgaacgtagtggtttcgaatggcggtacttacgctgcaagcaccggtgttgta
accttcgctaccattactagccaaggcactggagcaagcggacaggtaatgaacctgatt
agctttacggccccaagcagctcatacacggtagtaggcaacgtgagcactagcaccacc
gagacgctgacaaccaacaattcgtcgacggtgacagtggcgcctgctagcctagcacca
atagccaattcggttgtgaatgcgctgcagacgccggaaggcaatacggcgggtccgctg
tctctctcagcgttgagcggtaccgatgcaaatggcaacaacaccattgagaattaccgc
atcacctccatcccggctgatacccaaggcgttctttcgctgaatggtactgccgtggta
gttggccagttggtgagtgccgcaaatgctgcaaacctcaagtttgatccggcagccggt
tttgtaggtaatgctttctttggctacaatgcgattgacaatagcggactggtatcagcg
gcacctgctctctataccatcccagtaggtcaggacttgaactcggtgtacaccctgact
ccagcaaaaggcaataccaacccgtacgtgaatggcgatatcattgccaacgtgtttgat
gccaacagcggtgtgtacaacaatgctgcgccacaagcagtaaccgacacaggtgttcgg
acggctacgctcacgagcggtacgctaccagccggtactacgctggatccggttacaggt
atcatcagcgttaccaaccgcttgctgctagtaggtggtagctacccagtaaccatcacg
acggtggatggtaatggcggcaccaacccgaataccttcaccatcatcattggttcgcgt
ccgctgccagtggaactgaaggaattcgcagtacgcgccgtgaaagtagacgccctgctc
gactggagcacggcttcggagaagaacagcgaccggtttgaaatcgagcgtagcctcgac
ggtacaaccttcgtgaagatcggtacggtacgcagccagggtaccacccaagcaactact
gactacgccttcaccgatgctggtatcggggctaaagcgcagggtgttgtatactaccgc
ttgcgtcaggtagacaccgacggcacggcttcttactcgccggttcgcacggtgcgattc
gaagcgcaagccgccgttactgccaagctgagcgtgttcccgaaccccgctacttcttcc
gaccgggtagtaacgctcgacttgagcacgctgccaaaaggcacgtaccaagcctcgttg
ctcgacgccactggtcgtctgattggcacttactcggtagagggtggtgtaaacaaagta
gttgaggtgcagacactgccaaccggtacctacctagtcgtggtacgtggcaacggcctg
aacctgagccagcgcctgatcaaggaatag
DBGET
integrated database retrieval system