Ignatzschineria rhizosphaerae: MMG00_12625
Help
Entry
MMG00_12625 CDS
T08009
Name
(GenBank) fimbria/pilus outer membrane usher protein
Organism
ign
Ignatzschineria rhizosphaerae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Usher
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNM96027
LinkDB
All DBs
Position
complement(2767972..2769201)
Genome browser
AA seq
409 aa
AA seq
DB search
MYISSRRNKSRNKFFSGDISYGLTSDISVFGGIQHTTNSEFQAVNLGLGLNLHQFGAISF
DVTHSKSDIKGLNDRRTGQSYRFNYAKKFSAGTTLNFAGYRFSSSGFRGVSDYISLKQHI
RPENSGMTSHQPYYEKNRVSVSVSQYIEPADIYISKTISTEIYWNRPGNNSSYNILIGKT
IKTPGLFENTSLNLSLSQDKYDGGDNDKIIALFVTIPLGEDRDSLSYNGGYSSSSKRIDQ
QVRYNNHGLGGDYSIDVNTNNKRDFSGSIDYSLTGYYNTNTRYGTATTSFNHTKNYDSVR
AGYNGSMTLTQHRLATHGAAYGPETSRLILDAGAPNVQLGNDSSKLKSNTFGLIGVPSVS
PYSFVSYSVNNDNLPNDVQITDSVVNLAVDTGAIAYLSLGEFVEKQHYQ
NT seq
1230 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtatatatcctctcgtcggaacaaaagtaggaacaaatttttttcaggcgatatctct
tatggtttaacgagtgatatctccgtttttggtggtattcagcatactactaatagtgaa
ttccaggctgtaaaccttggtttaggtttaaacttacaccaatttggtgctatatcattt
gatgttacgcactccaaaagtgatattaaagggcttaatgatcgcagaacaggtcaaagt
tatcgttttaactatgcaaaaaaatttagcgccggaacaaccttaaacttcgcaggatat
cgcttctcaagtagtggttttagaggtgtaagtgattatattagtctaaaacaacatatt
cgaccagaaaactctggaatgactagccatcaaccttattatgaaaaaaatcgagtttca
gtaagtgtttctcaatatatagaacctgccgacatctatatttcaaaaacaatttcaaca
gaaatatattggaatagaccaggtaataactcaagttacaatatattaattggtaaaaca
ataaaaacacctgggctttttgaaaacacctctcttaacctttctctatctcaagataaa
tatgatggtggagacaatgataaaataatagccctatttgtcactattcctttaggagag
gacagagactcattgagttataacggaggctattcaagctctagtaagaggattgatcaa
caggttcgttataataaccatggtttaggtggggattattcaattgatgttaacacgaat
aataaaagagatttcagcggtagtatagattattcattaacaggatattacaacacaaat
acacgctatggtaccgctactacaagtttcaaccatactaaaaattatgattctgtcaga
gctgggtataatggctcaatgacattaactcaacataggctagcaactcatggagctgct
tatggaccagaaacatcacgattaatattagatgcgggcgcacctaacgtacagttagga
aatgatagtagtaaattaaagagtaatacttttggactaattggggtaccaagtgtttca
ccttactcctttgtcagttactccgtaaataatgataatttacctaacgatgttcaaatt
acagacagtgtcgttaacttagccgttgataccggcgcaatcgcttacctctctttaggg
gaattcgtggagaaacagcattatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
