Candidatus Jettenia sp.: L3J17_00220
Help
Entry
L3J17_00220 CDS
T07848
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
jet
Candidatus Jettenia sp.
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_toxin_N
Neuraminidase
VRP1
Retrotrans_gag
Catalase-rel
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJS17511
LinkDB
All DBs
Position
51948..59063
Genome browser
AA seq
2371 aa
AA seq
DB search
MAKQVENKKENLVLGRVVDRLNRPLVNLIVQAYDRDMRSEELLGECITDRDGKYEIGWSH
SQLSGRGKKTADIVIKVITREKKTLLFTSDMDAVRFNASPREEINVTIEAAIKPEVVEYD
YILKQVTYLAGKVAITDLQESKEHRDITFLSKEAEIPAEKIEHLVVAHRLQAESRIDAAF
FYALLRKNTLLKNDLAKPFHARLSIDINTEPLPLLYDAALIEEKTIQHDIKTAVKETLVS
AEVERESNKNIDMLRAYRKQAEEYYRNEHPRKLMRIISRFVLEDKIGEMGRIFEENKDNP
GAFFNKINSEIFFETAEKVNEAQASIALEELLGFENTIITQIKESHKIKKPEDLKRLAKL
NRAAWKEELTKLAARTDIAGRPLDTTSIDLLASSIVRKMEKAYPTAAFAAQLEREKKPVL
KNHKEIVAFLSKHEDFDLQHDNISIYLKDKKLTKKESEAIREELEVVQRIFKLVPHYGKT
NALRKLNIHSSYSITAAGETRFVHEIAPKAGIAPKEAKEIFKRAERTTTAAMMIAGELQD
TLRTMHMPAVEMKTLSLKLEAVSEDFPNLKSLFKLTDTCSCGHCRSVYSPAAYLVEILQF
LDKRSVTDLTTIPPTTAHLAKDVLFERRPDLGEIDLSCENANTPVPYIDLVCELLEGAIA
PDAGVNFTGVLSDGADPLKGKISNGLFTTLEAAGLPVTNQALIFETETTTGSAVTLPHYL
RDKKVVCKIINTGGNNYQVFRLRQTLSPAEELAAAPEYVNAVAYNTLKTTNYAFKLPFDL
DHTEAKAYFTRFDISRAKLMEDFQSAGNPTDKAIAAEKLGLTDAERNLIVTPKANLIDQQ
TYWNAPAQWDTPPVMGDVLDYMTRVDHFLDKTGLTYKDLDLLLSLRFIDPTKNLFIKHLD
ISCDTAKKEIANLDEAALDRIHRFLRLQKKTGWKLEVMDEIISQTKLGNGTLNDACLVKA
ANLLKLSEETGVKVEELIGFYGELPHTILKDDAPKPLYQQVFLNKAKNGFIDEGLLPEKV
DGTQLLNNFITSISVCLQIKEQDLNKLLPLLPDGNLSFSNLSSLFAASRLMRKMKLKADD
YVMLTNLTGLSVSNSPADTLDFVEAVNSLNKSPLKLADVTFMLQHEASNLADREIKDDKI
KQILEKLQKDYQNNFSTNKSLFNANMSAQEQKETLQNALSKLSDVGEEDVKTFIKFIDKD
WTSANDAKTFTDNKLNGLFDTSLIKAKIDALAAAPGPDISSEQKDLVKAFLDSIAGYQLQ
AGKQTILEQTLATTFKADLELVKIALKYAILKQPAPGTSFLSDILSADALIDVDITHTTP
VLPAITAGAFPDQYRALRLTHKLFPLVNSFKLENQDVEWFFKNNKDLGWFEWDSIPYQTG
QVAINYTRYIAFAEMIDLLKQLTPVPNPADAERPISFLTITAMLLPASGATRNQFIEAFS
LLTGYTKEDVDAIDAHLFPVFDLNNYKDAKAWKAVSDCAEHLRKLGSTVVQVQAYINPVL
TNAETNLLRTALKARYDEDTWLSTLKEIMNAIRPQKRDALVAYLLAENPEMKTENDLYDY
FLVDVEMESCMPSSRIVQAHGTIQLFVQRCLMGLEPKAAADVNNDKAWEQWKWMKNYRVW
EANRKVFVYPENWIEAELRDDKSFLFTELENELQQNELTEFTAEEALIRYLEKLDNIAFL
EVMATWYQTDIKTMHVFARTKGGDPAIYYYRRFEKERYWTPWEKVELDITGDHLLTFERN
NRLCLTWPVFSEEPDPNPQSTIPNSTAGTVVNNDKPKRKLKIQLAISEFANKKWQPKKIS
KDGILVPYSYFTSDDNLFKRDKYNLMYFELGQQVWLFSTSFEAEYINLNGIFTIAGCKGY
PELSFQGDQSFPDFFPDFKDTWLKSQRYNEQNLIPADDLSVRNAISFFNFYEILGKTPGT
FRLSYPHQFTLIDLIALLFQYLVTYAYGINKTAYSERRFIKIPLGTLLPYFKEDSKHAYV
IVPGFYKSKRDENSDEEVYVQRTGSDVMQLIEDIIALFKKYMAKYAENPDINALLQELVA
DNEYQEIVDELKVYAGLSYGEQFKNMYHPLICALRKTLYKDGIPELMKRETQLQKTSFNF
EQYYDPSSIVPKTYILEEAGVKTLSYPVEDLDFSSDGSYSGYNWELFFHVPFLLATRLTK
NQRFEEALTWFHYMFNPTGALDGNVPEKYWVTKPFYLTHTADYINQRIDTLLYRIADPNT
PERKELEFAIDEWRTKPFKPHVVARFRPVAYQKALLMKYIDNLTEWGDYLFRQDTMESIV
QATQMYILADKLLGPKPRIIPTPIKALYETYNQIEAKLDAFGNALIDLENILPDLSVLPE
GGAELPHLQLHYLCSTSAFRRTKRCWSIGTA
NT seq
7116 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaacaggtcgaaaacaagaaagaaaacctcgttctcgggcgggtggttgacagg
ctcaatcggcctttggtaaatctcatcgtgcaggcatacgacagggacatgcgcagcgag
gagctattgggtgagtgcatcactgaccgagacggaaaatacgagattggatggtctcac
agccagctcagcggaaggggaaagaaaacggcggatattgtcataaaggttattacccgt
gaaaagaaaaccctgctctttacctccgatatggatgcggtgcggtttaatgcctcgccc
cgggaagagatcaatgtcactattgaagcggctattaagcctgaagtggtggagtatgat
tatatactgaaacaggtgacttacttggccggaaaggtagctattaccgacttgcaagag
agtaaagaacatcgtgatattaccttcctgtcaaaagaagctgagatacctgccgaaaaa
atagagcatttagtagtcgcgcaccgcttgcaggctgagtcaagaattgatgcagctttc
ttctatgcccttttgcgcaaaaacaccctgttaaaaaacgaccttgcaaaaccttttcat
gcaagattgtccatcgatattaatactgaacccctgccactactgtatgatgctgctttg
attgaagaaaagaccatacagcacgatattaaaactgcagtaaaagagacgcttgtttct
gctgaagtggagcgtgagagcaataagaatatagatatgctccgagcctatagaaagcaa
gcagaagagtattatagaaacgagcatccaagaaaactaatgcgcatcatcagccgcttt
gtcctggaagataagatcggtgaaatgggtagaatctttgaggaaaacaaagacaaccca
ggtgctttcttcaataaaatcaatagtgaaatattttttgagacagccgaaaaggtcaat
gaagcccaggcatccattgcattagaagaactattaggttttgaaaatactattataaca
cagataaaagaatcacacaaaatcaaaaagcccgaagaccttaaaaggttagccaagcta
aacagagccgcctggaaagaagaattaaccaaactagctgccagaacagacattgctgga
aggccattggatacaacctcaatagacttgttggcctcttctatagttagaaaaatggaa
aaggcgtatcctactgctgccttcgccgcccaactggaaagggagaaaaaacccgttttg
aaaaaccataaggagattgttgcctttttatccaaacacgaggattttgacttgcagcac
gataatatatccatctacctgaaagataaaaaactaaccaaaaaagaaagcgaagccatt
cgggaagaattagaggtggtgcagcgtatttttaaactagtgccgcactatggtaaaacc
aatgcactgcgcaaactgaatattcattcatcctatagcattaccgctgcaggtgaaacc
cggtttgtacatgaaatagcacccaaggcaggaatagcccccaaagaagccaaagagatt
ttcaaaagagcagaacggaccacaacggctgctatgatgatagctggtgaacttcaggac
accctgcgaactatgcatatgcccgcagtggaaatgaagacattatcgttaaagctggaa
gcggtaagcgaagattttcccaatttgaaatcgcttttcaaactcaccgatacctgttcc
tgcgggcattgccgttcggtttatagtccggcggcatatttggttgaaattctccagttt
ttggataaaagaagtgtgacggatcttactacaattccgcccacaaccgcacatcttgct
aaagatgtcttgttcgaacgaagacccgatttgggtgaaattgatttaagctgtgaaaat
gccaatacacctgtgccttatatagatttagtatgtgaattattggaaggtgcaatcgcc
cccgatgcaggtgtgaattttacaggagtgctttcagacggagcagaccctttgaaagga
aaaatctccaatggattattcactacacttgaagcggcggggttgcctgtaactaatcag
gcattgatttttgagacggaaacaactaccggatcagctgtaacactgcctcattatttg
cgcgacaaaaaagtcgtttgcaaaatcatcaacacgggaggaaacaattaccaggtattc
cggttgagacaaacactgtcacctgccgaagagttagcggctgcgcctgaatatgtgaat
gcagttgcttacaatactttaaaaactaccaattacgcttttaagctaccttttgattta
gaccataccgaagccaaagcctatttcacccgctttgatatttcgagagcaaaactcatg
gaagattttcaatcggcgggaaaccctaccgataaagctattgcagcagagaagttggga
ttaaccgatgcggaaagaaatctgatcgtaacacccaaagccaatttgattgaccagcaa
acatattggaatgctcctgcccagtgggatacgccgcctgttatgggggatgttctggat
tatatgacaagggttgatcattttctggacaaaaccggccttacctacaaggatttggat
ttactactttctttaagatttattgatccgaccaaaaatcttttcattaagcatcttgac
attagctgtgataccgccaaaaaagaaatagccaatctagacgaggcagcattggatcgc
atacaccggtttctccgtttgcaaaagaaaacgggatggaaattggaagtaatggatgag
attatttcgcaaaccaaattgggcaacggaacattaaacgatgcctgcttagttaaagcc
gccaatttattaaagctgtcagaagaaacaggagttaaggtagaagagttgataggcttt
tatggggaacttccgcacactattctgaaagacgatgctcctaaacccctctaccaacaa
gtttttttgaacaaggcaaagaatggatttattgatgagggattgttgcctgaaaaagtg
gacggcactcaattgctgaacaattttataaccagcatctcggtttgcctgcaaatcaaa
gagcaggatttgaacaagttgctgccgctgctacctgatggcaaccttagcttttccaac
ctgagcagcctatttgctgcttcaaggttaatgaggaagatgaaactcaaagccgatgac
tacgtcatgctcaccaacttaaccgggctcagcgtatccaattcaccggcggatacattg
gattttgttgaagcagtgaatagcttaaataaatctcctctaaaacttgcagatgtcaca
ttcatgcttcaacatgaagcaagcaaccttgccgatagagaaatcaaagatgataagatt
aaacaaatactggagaaattgcagaaggactatcaaaataatttttcaacaaataaatct
ctctttaatgctaatatgtcggcccaggagcagaaagaaaccttgcaaaatgccctatcc
aaactgagcgatgttggtgaagaagatgtaaagacctttattaaattcattgataaagac
tggacttcggcaaatgacgcaaaaactttcaccgataataaattaaatggtttatttgat
accagtttaattaaggcaaaaattgatgccctggcagcggcacccggacccgatatcagc
agcgagcagaaggatttagtcaaagcgtttttggattccatagccggttatcagcttcaa
gcaggcaagcaaaccattcttgagcaaacacttgccacaactttcaaagcagatttagaa
ctggtaaagattgctttgaaatatgccatattgaaacaacctgctccgggcaccagcttc
ttatccgatattttaagtgctgatgcacttattgatgttgatattacacatacaacccct
gtattgccagccattaccgctggtgcatttcccgaccagtatcgtgctctcagacttacg
cataagttgtttcctctggtcaactctttcaaattggaaaatcaggacgtggagtggttt
ttcaaaaacaataaagacctgggttggtttgaatgggacagtataccatatcaaacaggg
caggtggcgattaattataccaggtatattgcctttgcagaaatgattgacctgttgaaa
caacttacacctgtacccaacccggcagatgcagagcgtccaatcagtttccttaccatt
acagcaatgcttttaccggcaagtggtgccacaaggaatcaatttattgaagcattttca
ttgctaacaggttacaccaaagaagatgtagatgcgatcgacgcacatttattcccggtg
tttgacctcaacaattataaagacgccaaagcgtggaaggctgtaagtgattgtgccgaa
catttgagaaaattaggttcaaccgttgttcaggtacaggcatatatcaacccggtattg
acgaatgctgaaacaaaccttttacgcactgcgctgaaagcaagatatgatgaagatacg
tggctgagcacactcaaagaaattatgaatgccattcgcccacaaaaaagagatgccctg
gtcgcttatttgttggctgaaaatcctgaaatgaaaaccgaaaatgatttgtatgattat
ttcctcgttgatgttgaaatggaatcctgtatgccctcatccaggattgtacaggcacac
ggtaccatccagctttttgtgcagcgttgtttaatgggattagagccaaaagcagcagcc
gatgtaaacaacgacaaagcctgggaacagtggaagtggatgaaaaactatcgggtatgg
gaagccaaccgcaaggtttttgtatatcccgaaaactggattgaagccgaactcagagat
gataaatcattcttgtttaccgaacttgaaaatgagttacagcaaaatgaattgaccgaa
tttacagcagaagaagcattaatccggtatcttgaaaaattagacaacatcgcatttctc
gaagttatggcaacatggtatcagaccgacattaaaaccatgcacgtatttgcccggacc
aaaggcggcgaccctgccatttattattacaggagatttgaaaaagaacgctactggaca
ccctgggaaaaagtggaattggatattacgggtgaccatctgttaacatttgagcgcaac
aatcgtttatgtttgacctggccggtgttcagtgaggagcctgatccaaatcctcagtct
accattcccaacagtactgcgggtactgtggttaataatgacaaacccaaacgaaaacta
aaaattcaacttgccatcagcgaatttgccaataagaaatggcagccgaagaaaatttcg
aaagatgggatacttgttccttattcatattttacttccgatgacaacctgtttaaaaga
gacaaatacaatttgatgtattttgagcttgggcaacaagtttggctttttagtacttcc
tttgaagcggaatatattaaccttaatggaatatttactatagcaggatgcaaaggatac
cccgaactttcgtttcaaggtgatcagtctttccctgattttttccctgattttaaagat
acatggttaaaatcacagcgttataacgaacaaaacttaataccggctgatgacctttct
gtcagaaatgcgatttcatttttcaatttttatgaaattttgggcaaaactcctggcaca
ttcaggttgtcgtatccgcatcaatttactttgatcgacctgattgctttactctttcaa
tatttggtgacgtatgcgtatggcatcaataaaactgcttatagtgaacgacgttttatt
aaaattccactaggtactttacttccctatttcaaggaagacagcaaacatgcttatgta
attgttcccgggttttataagtcgaaaagggatgaaaatagcgatgaagaggtatatgta
caaagaaccggctccgatgtgatgcagcttatcgaagacattatagcccttttcaagaaa
tacatggcaaagtatgctgaaaatcctgacatcaatgctttgctgcaagagctggtcgcc
gacaatgagtatcaagaaattgttgacgaactcaaagtgtatgcaggtttatcttatggg
gagcaatttaaaaatatgtaccatcccttgatttgcgctttgagaaaaacactctacaaa
gatggcattccggaattgatgaaaagggaaacccaattgcagaaaacatcattcaatttt
gaacagtattatgacccgagcagtattgttccgaaaacatacatacttgaagaagctggt
gtaaaaacgttgtcctaccctgttgaggatttggatttcagcagcgatggttcttacagc
ggatacaactgggaattgtttttccatgtgccatttttattggctacaagattgaccaaa
aaccaacgcttcgaagaagcacttacctggtttcattatatgttcaatcctactggcgcc
ttggatggcaatgtgcccgaaaaatactgggtaacaaaaccattttatctaacacacaca
gccgattatattaatcaacgcattgacacactgctatacagaatcgctgaccccaataca
cccgaaagaaaggaattggagtttgccattgacgaatggagaaccaagcctttcaaaccc
catgttgtagcaaggtttagacctgttgcctatcaaaaggcgttactgatgaaatacatt
gacaacctaaccgaatggggagattacttgtttagacaagataccatggagtctattgtt
caggccacgcagatgtatatccttgccgacaaattattgggtccaaaaccgaggattatt
ccaactcctattaaggccctttatgagacctataatcagatagaggctaagttagatgcc
tttggcaatgctttaattgatctggagaatattttgccagatttatcagtgttgcccgaa
ggcggcgctgaactgcctcacctccaattacattatctatgctctacttctgcattccgc
agaacgaaaagatgttggagtattgggaccgcatag
DBGET
integrated database retrieval system