Kazachstania africana: KAFR_0F04270
Help
Entry
KAFR_0F04270 CDS
T02487
Symbol
KAFR0F04270
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K15163
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, fungi type
Organism
kaf
Kazachstania africana
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
kaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
kaf03021
]
KAFR_0F04270 (KAFR0F04270)
Transcription machinery [BR:
kaf03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
KAFR_0F04270 (KAFR0F04270)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Med12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
13884489
NCBI-ProteinID:
XP_003958157
UniProt:
H2AXC2
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(834474..838835)
Genome browser
AA seq
1453 aa
AA seq
DB search
MSPSKYLLNPPEELHPYTAIANDKYKNKVPSDQESKLIYPDFGPWKHKKEEDQILLNFVS
KGYYVSSKVNFESISARSSLHESLPNLSNELASQFSKVLKIREQEINKISSSDNNPASID
SLRVFNPLAGPGFVLPNRVTLTDNRKELWLQELSSPHTSLHKISKFIPHGLKRRQVIEQC
YVKQIPLRRAIWLLKTCYSIEAHALQVKYLNTNSNSKSEWDLNRLINDPNTDLEKISESI
SSPLYKEWTDNFVYILEKLVFEMNQYYNDAAKLKKWKTELNYFLKLLGNCYSLDLLNKEV
FHHWLIEFISKIELFEFLPTALHILTIFWDKLINSSNLPDKSFSLQCNNSTHSTNNNFLV
SKITDILLYKYYVVSNAKSMINDESYIINDVRKNTKIKESILSILRNLIWKLFQRSTLDI
FLFNASSWDLYKPYIFEIISLKWASSSTVNKGEIKKKLELISYRNETLRSNSLLATSSSA
ASSPSNTSNWDADYSNIFKSSSKDPNLKVIRIQFADISFTKKLDDNSTAFDWAQYIDQNP
LQKTQILQLILWAIHPSRTFHYESMQLVAKILLLQINSSLADNFPEYEIEDLIWSVVFQI
AKLNSTNLKLLVCLKSLYKILNILIIYGIIKVPTYIRKLISSGIMYLQDSGDKFLHVNLI
INLKISPLMKSQFNMVLRNVIEYDPSFYEQYNFDTLLKAAESNKERLLSGDYDGSSHLNL
PQSSKIMLAEACLNHLCSGSSPEPVSSSMIMRMFNLFWLDLDVLYHFYKWIEFIVYHQLL
ADIDAMETLIDILIKYQKLFSQFVNDHILFTKTFIYIYSKILKGSDALHYNILSFVKFWK
FFMKNFPVALIIDNDLKHELSEIYEEEKNKLKKLQEDDEFVHSLFKCLNDIDFHVSNCAK
LFQLNIKVIISDSNETEIRQKSRYNLLLLMSANSREYNKLMSIFLKRKSFQEKDLIKLIS
AKLLTMEQISSTLGISFVLDLLTYNSKNDVRSEIFYQFHEEEFIKSNLKSILISCQLDLS
KRYTTFIGLVTTYGPISQYSRIVTTVLMKTLKQRPTMASQIMNDILNFNCRNQDVQASTV
DDGEDDDTEDEVSIDEPLLYETYSMLDFTNLWVFQAFTGYQFSKILEKNETQEDIDEYLK
EFLYKIFDVTELNELTSELFDEINQIEWIDKIVQLVENDFFENILLDSGENKLSREYLIL
IVDTTTSLSRKFTKLTSANSSLFFKCFDKCERIISKFVESDNLQPIALQLDVSIKILTIH
QNSVLETIVQGLKTESERDRINKFVTNLFKLFEKVSFSLKLKLLLYEILSSLKSYCYYVA
TLGETSIDDENVSIVPQGRSNSKMQNDFKVPENLINLPPFQVSSFMKVSDDNTDSSVALN
LGITPTKDVDYSNDHGRWFIYDKKSKRYVCKFKNVPYNNIKNYQNDTDPVNSFNNGCYNL
SLFDASYENKNPH
NT seq
4362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaccaagtaaatatttactaaacccaccagaggaattgcatccatatactgcgata
gcaaatgataaatataagaacaaggtcccatcagatcaagaatcaaagctgatatatccc
gattttggaccatggaaacacaagaaagaagaagatcagatactcttaaatttcgtctcc
aagggatattacgtatcatcaaaagtaaatttcgaaagtatctcagctagatcgtctcta
catgaatcacttccaaatttgtctaatgagctagcatcacaattttcgaaggtcttgaag
attcgagaacaagaaataaataagatatcttcctctgataacaatcctgcttctattgat
agtcttcgagtttttaatcccctagcaggtcccgggtttgtattgcctaacagagtcact
ttaaccgacaatagaaaggagttgtggttgcaggagttgagctctcctcacacttcatta
cataaaatttccaaatttataccgcatgggcttaagaggcgacaagttatcgaacaatgc
tacgtaaaacagatacctttaaggagggcaatttggcttttaaagacatgctattccatt
gaagctcacgccttacaagttaaatatttgaacacaaattccaactcaaagtctgagtgg
gatttgaatcgactcattaatgatccaaacactgacctggaaaagatctcagaatcaatt
tcatcacccttgtataaggaatggactgataattttgtttatattcttgaaaaactagtt
tttgaaatgaaccaatattacaatgacgctgctaaactaaaaaaatggaaaactgagcta
aattactttttaaaactattaggcaattgttacagtctcgatctccttaataaagaagta
tttcatcactggctgatagagttcatttctaaaatcgaacttttcgaatttttgcccaca
gctttgcatattttaactatattctgggataaactaatcaattcaagtaacttgcctgat
aaatcattttcattacaatgtaataattccactcactcgaccaataataattttttggtc
tctaagatcactgacatattgctttacaagtattatgtggtttcaaatgccaaatctatg
ataaatgacgaaagttatattataaatgatgtcagaaaaaataccaagataaaggaatca
atattatccattttgcgtaatttaatatggaaactttttcagaggagtacgttagatatc
tttttattcaacgcatcgagttgggatctctataaaccctatatttttgaaataataagt
ttaaagtgggcctcaagtagcactgtaaataaaggggaaattaagaagaagttggagtta
attagttatagaaatgaaacattaaggagtaacagtttgttggctacatctagttcagca
gcttcttccccttctaacacctcaaattgggatgcagattattcgaatatattcaaatca
tcctcaaaagatccaaatttgaaagtgatcagaatacaattcgctgatatatcatttacc
aagaaattagacgataactctacagctttcgattgggcacaatacattgatcaaaatccg
ttacagaagacacaaattttacagttaattctatgggcaattcatccatcccgtacattt
cattatgaatcgatgcaattagttgctaaaatactgcttttgcaaatcaattcatcgctt
gccgacaactttcctgaatatgagatagaagatttgatttggtcagtagtttttcaaatt
gcaaaattgaattccacaaaccttaagttattagtatgtttgaaatccctatacaaaata
ttgaacattctaattatttatggcattatcaaagttccaacgtatatcaggaagcttatc
agttcgggcatcatgtatttgcaagattcaggtgataaatttctccatgttaatcttatt
atcaatttgaagatttcacctttaatgaaaagtcagttcaacatggtactaagaaacgtg
atcgaatatgatccatctttttatgagcaatataactttgatacattattgaaagctgct
gaatcaaacaaggaaaggctgctttcgggagattatgatggttcgtctcacttgaattta
ccacaaagtagtaagattatgcttgcggaggcgtgtttaaatcatttatgttcaggcagt
tcgcctgaaccagtcagcagctcaatgataatgaggatgtttaatcttttttggctcgat
ttagatgtgttgtaccatttttataaatggattgaattcatcgtctaccatcaactgctg
gcagatattgacgccatggagacattaattgatattttgataaaatatcagaagttattt
tcacaatttgttaacgatcatattttattcacaaagaccttcatttacatatattccaaa
atccttaagggcagtgatgcattacattacaacattctgtcattcgtgaagttctggaaa
tttttcatgaagaattttccagtagctttaattattgataacgatctaaagcatgaatta
tcagagatttacgaggaggagaaaaataaattaaaaaaattacaagaggacgatgagttt
gtccatagtttattcaaatgccttaatgatattgatttccatgtgtcgaattgtgcaaaa
ttattccaattgaacatcaaggttattatttctgattcaaatgaaacagaaataagacag
aaatcaagatataacctgttattattaatgagtgcaaattcccgggaatataataagctt
atgtcaatttttttgaaaagaaagagcttccaagaaaaggacttaatcaaacttatatct
gcaaagttattaacaatggaacaaattagtagtacactagggatttcatttgttttagac
cttctgacctataattcaaaaaatgatgtaagaagtgaaattttttaccagtttcatgaa
gaggaatttatcaagagtaatctcaaatctattttgatttcttgtcagttggatcttagt
aaacgttatacgacgtttattggcttagtaacgacgtatggaccaatttctcaatactcc
cgaattgtaacgacagttctgatgaagactttaaagcaacgtcccactatggcatcccaa
ataatgaatgacatattgaattttaactgtaggaaccaagatgtacaagccagcactgta
gatgatggtgaagatgatgacacagaagatgaagtaagtatcgacgagccattgctgtat
gaaacatattcgatgctggattttacaaatttgtgggttttccaagcgtttactggctat
caattttccaagatccttgaaaagaatgaaacacaggaagatattgatgaatatttgaaa
gagtttctttacaagatatttgatgtgaccgaattgaatgaacttacatctgagttattt
gatgaaattaatcaaattgaatggattgataaaattgttcaattagttgaaaatgatttt
tttgaaaatatattactagatagtggtgagaataagctatcaagggagtatctcattctt
attgttgatacaacgactagtctatcgaggaaatttaccaaacttacatcggcaaactca
tcacttttctttaagtgttttgataaatgtgaaaggattatttctaaattcgtggaatcc
gataatttacagcctattgcattacagctcgacgtttcaattaagattcttaccatacat
caaaattctgttcttgaaaccatcgttcaggggctcaagacagaatcagaaagagacaga
ataaataaatttgtcaccaatttatttaaactatttgaaaaagtttcatttagtctaaaa
ttaaaattactcttatatgaaatattatcttcattgaaatcgtattgctactatgtggcc
acgctgggggagacaagtatagatgatgaaaatgtctcaatagttcctcaaggtcgttca
aacagtaagatgcagaatgatttcaaggttccagaaaatttgataaatctaccacctttc
caagtctcatcattcatgaaggtttcagatgataatacagatagttctgttgcattaaat
ctgggtataactccgacaaaggatgtagactactcaaatgatcatggtagatggttcatt
tacgacaaaaaatcaaaacggtacgtttgcaaattcaagaacgttccatacaacaacatc
aagaattatcagaacgacactgatccagtaaactccttcaacaacggatgctacaacctc
agtctcttcgatgcaagctacgagaataagaaccctcattag
DBGET
integrated database retrieval system