Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_2798
Help
Entry
Lacal_2798 CDS
T01533
Name
(GenBank) putative signal transduction histidine kinase
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
His_kinase
Y_Y_Y
HATPase_c
DUF4261
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH02637
UniProt:
F6GCJ8
LinkDB
All DBs
Position
complement(3104689..3107592)
Genome browser
AA seq
967 aa
AA seq
DB search
MSRFIIYILFLINICLVQAQNPVFVPMSNVSKLPDVEFYDVIEDQQHYIWLAADKGLYRY
NGKNYKHFSHPKQRGNSLFQLKFDAKNRLWCNNIYGQLFYVENSSLKLFYDASKLVNGQL
ANFEILENSIRLFTVIGIFDIDKSTKKVTEVFKGMCITNAKDGNNNYTFVINFEGDLERH
RLYKFDSNTDTKILEITSSNRIQSPRIFAFKNIVFFTYKSSSGNLIYRIDKTKNTSKKVI
TPARLKNEIFYNVLNIENEYWFLTSSGVFVYRFENEIFTFKEQLFKTESITDVQVDFNNN
YWFTTLDNGVFVVPNLNVRRTSLEFIDAKITASLALQNNQFVLGTNDGKLLFYNHNQLTK
TLQLPGKKIIGKLFFDAQSEKLIVSINASESFVVNLKNDEILDVNNQFSVAKTFSKIDVN
TLFYGNYRQGIVYKNPFNNPKQQILKESRVKASVVSNNHLFVSYIDGLYKYNTQTFNAEE
ITFNSKSLLVNTLTKTNGTVWVATQHNGLLKYENNTLKPSGIKLPENLQINAIYADGLVL
WISTDAGLFQYHTKTHQLKSLSAQDGLNTAVNDFLILQNQIIVNLPKAFYTLPKSGTLFK
DLKTAKVRVEAIKINDRDTVVKNNYKLPHNYNKIGLAFNSNGFQSNQHVNYQYRVKEIDT
SWQNLPVNTHFVNFNSLSSGTYTFELKAQNLSAKQAVFATPITFIIAKPFWETYWFYGLV
IATIIGLVWLYFRWRLQQKEVQRIAEIDRILTDKKITNLRLENLRSQMNPHFIFNALNSI
QDYIISNEKELASSYLVKFSRLIRMYLDYSQQNEITLEEELNALKLYLELEKVRFEDELE
YKITIDNQLKTKQIKVPSLFIQPYVENALKHGLLHKLSDRKLHIKAKIIQQNKLEITVKD
NGIGRAQSEKLKRPNQQHKPFATKANEERVHLYKNKLKRDIAITTNDLYDENDVAAGTKV
VITMPIH
NT seq
2904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgttttattatttacatactatttttaataaacatttgtttggtacaagcgcaa
aatcctgtttttgtgcctatgtctaatgtttctaaacttccagatgttgagttttatgat
gtaatagaagaccaacaacactacatttggttagctgcagacaaaggtttataccgctat
aacggaaaaaactacaaacactttagtcatcctaaacaaagaggaaattctctttttcag
ttaaaatttgatgctaaaaaccgactttggtgcaacaatatttacgggcaattattttat
gttgaaaacagtagcttaaagctattttatgatgctagtaaattggtaaatggacaatta
gcaaattttgaaatactagaaaacagcatacgtttatttaccgttattggcatttttgat
attgataaaagcaccaaaaaagttaccgaagtgtttaaaggcatgtgtattactaatgct
aaagatggtaacaataactacacatttgtaatcaattttgaaggcgatttagagcgtcat
cgattatacaaatttgatagtaatacagatacaaaaatacttgaaatcacaagtagtaat
cgtatacaatcaccaagaatttttgcctttaaaaacattgttttttttacatataagagt
tctagtggaaatcttatttatagaatagataaaaccaaaaacacatcaaaaaaagtaata
acacctgctagattaaaaaacgaaattttttataatgttttaaatattgaaaatgagtat
tggtttttaaccagttctggtgtgtttgtttatcgttttgaaaatgaaattttcacgttt
aaagaacaactttttaaaacagaatctattaccgatgttcaagtagattttaataataat
tattggtttacaacactagataacggcgtgtttgtagttccaaatcttaatgttagacgt
acaagtttagaatttatagacgctaaaataacagcgtctttagcattacaaaacaatcaa
tttgttttaggaaccaatgatggtaaattactgttttacaatcacaatcagctaacaaaa
acactgcaattaccaggaaaaaaaatcatcggaaaacttttttttgatgcgcaaagcgaa
aaacttatagtaagtattaatgcttcagaatcgtttgtagttaatctaaaaaatgatgaa
attttagacgtaaataaccaattttcagttgctaaaacattttctaaaatagatgttaat
accttgttttatggtaattatcgtcaaggaattgtatataaaaatccgtttaataatcct
aaacaacaaattctaaaagaaagtcgtgtaaaagcttcggtggtttctaataatcattta
tttgtatcgtatatcgatggactttacaaatacaatacccaaacatttaatgcagaagaa
attaccttcaattctaaaagtttactggttaataccctaactaaaactaacggaacagtt
tgggttgcaacccaacacaatggattattaaaatacgaaaacaatacgctaaaaccttca
ggaataaagcttcctgaaaatcttcaaattaatgccatttatgccgatggtttagtgtta
tggatttcaactgatgctgggttatttcaatatcatacaaaaacacatcagcttaaatca
ttaagtgcgcaagatggtttaaatacagcagttaatgattttttaattcttcaaaatcaa
attattgtaaacttgcctaaagcattttatactttgccaaaatcgggtaccttgttcaaa
gatttaaaaactgctaaagttagggtagaagctataaaaattaacgatcgtgatactgta
gttaaaaacaactataaattacctcataattataataaaataggactagcttttaattct
aacggatttcaatctaatcaacatgttaattaccaatatcgtgtaaaagaaattgataca
agctggcaaaatttacctgtaaacactcactttgtaaactttaatagtttgtctagtggc
acatatacttttgagttaaaagcccaaaatttaagtgctaaacaagctgtttttgctaca
ccaataacctttataattgctaaaccattttgggaaacctattggttttatggtttagtt
atagcaacaataataggtttagtttggttatattttagatggcgattacaacaaaaagaa
gtacaacgcattgcagaaattgatagaattttaaccgataaaaaaataaccaatttaagg
ttagaaaatttacgttcgcaaatgaatccgcattttatatttaatgctttaaattctatt
caagattatatcatttctaatgaaaaggaattggcaagctcttatttagtgaagtttagc
cgcttaattcgcatgtacttagactatagtcagcaaaacgaaattactttagaagaagaa
ttaaatgctttaaaattgtatttagaattagaaaaagtgcgttttgaagacgaattggaa
tataagattactatcgataatcagttaaaaacaaaacaaataaaagtgccgtcattattc
attcagccgtatgttgaaaatgctttaaaacacggattgttacacaaattaagtgaccga
aaattacatattaaagctaaaattattcagcaaaataaattagaaattacagttaaagat
aacggcattggtcgcgcacaatccgaaaaattaaaacgaccaaaccaacagcacaaaccg
tttgctactaaagctaacgaagaacgtgtgcatctttataaaaacaaattaaagcgtgat
atagccataactaccaacgatttgtatgacgaaaacgacgtagctgcaggtacaaaagtg
gttatcaccatgccaatacattaa
DBGET
integrated database retrieval system
